The MEROPS Peptidase List

The Peptidase List (sometimes abbreviated PepList) is a selection of peptidases that are particularly thoroughly characterised.Many of them are the type peptidases of families in MEROPS and/or have published three-dimensional structures.When a peptidase is added to the list it is assigned an accession number in the form "PL00000", and a history of the use of each accession number is maintained.Please note that the equivalence to items in the EC List of IUBMB is only approximate.

The present content of the Peptidase List is as follows:See here for a description of this page.

ACCESION	HISTORY	MEROPS ID	NAME	Related EC entry
PL00001	05-March-2003	A01.001	pepsin A	EC 3.4.23.1
PL00002	05-March-2003	A01.003	gastricsin	EC 3.4.23.3
PL00003	05-March-2003	A01.004	memapsin-2	EC 3.4.23.46
PL00004	05-March-2003	A01.006	chymosin	EC 3.4.23.4
PL00005	05-March-2003	A01.007	renin	EC 3.4.23.15
PL00006	05-March-2003	A01.008	renin-2
PL00007	05-March-2003	A01.009	cathepsin D	EC 3.4.23.5
PL00008	05-March-2003	A01.010	cathepsin E	EC 3.4.23.34
PL00009	05-March-2003	A01.011	penicillopepsin	EC 3.4.23.20
PL00010	05-March-2003	A01.012	rhizopuspepsin	EC 3.4.23.21
PL00011	05-March-2003	A01.013	mucorpepsin	EC 3.4.23.23
PL00013	05-March-2003	A01.015	barrierpepsin	EC 3.4.23.35
PL00014	05-March-2003	A01.016	aspergillopepsin I	EC 3.4.23.18
PL00015	05-March-2003	A01.017	endothiapepsin	EC 3.4.23.22
PL00016	05-March-2003	A01.018	saccharopepsin	EC 3.4.23.25
PL00017	05-March-2003	A01.020	phytepsin	EC 3.4.23.40
PL00018	05-March-2003	A01.022	plasmepsin-1	EC 3.4.23.38
PL00019	05-March-2003	A01.023	plasmepsin-2	EC 3.4.23.39
PL00020	05-March-2003	A01.030	yapsin-1	EC 3.4.23.41
PL00021	05-March-2003	A01.031	yapsin-2
PL00022	05-March-2003	A01.040	nepenthesin	EC 3.4.23.12
PL00023	05-March-2003	A01.041	memapsin-1	EC 3.4.23.45
PL00024	05-March-2003	A01.046	napsin A
PL00025	05-March-2003	A02.001	HIV-1 retropepsin	EC 3.4.23.16
PL00026	05-March-2003	A02.002	HIV-2 retropepsin	EC 3.4.23.47
PL00027	05-March-2003	A02.003	simian immunodeficiency virus retropepsin
PL00028	05-March-2003	A02.004	equine infectious anaemia virus retropepsin
PL00029	05-March-2003	A02.007	feline immunodeficiency virus retropepsin
PL00030	05-March-2003	A02.008	murine leukemia virus-type retropepsin
PL00031	05-March-2003	A02.009	Mason-Pfizer leukemia virus retropepsin
PL00032	05-March-2003	A02.011	human endogenous retrovirus K retropepsin	EC 3.4.23.50
PL00033	05-March-2003	A02.012	retropepsin (human T-cell leukemia virus)
PL00034	05-March-2003	A02.013	bovine leukemia virus retropepsin
PL00035	05-March-2003	A02.015	Rous sarcoma virus retropepsin
PL00036	05-March-2003	G01.001	scytalidoglutamic peptidase	EC 3.4.23.32
PL00037	05-March-2003	G01.002	aspergilloglutamic peptidase	EC 3.4.23.19
PL00038	05-March-2003	A05.001	thermopsin	EC 3.4.23.42
PL00040	05-March-2003	A08.001	signal peptidase II	EC 3.4.23.36
PL00041	05-March-2003	A09.001	spumapepsin
PL00043	05-March-2003	A24.001	type 4 prepilin peptidase 1	EC 3.4.23.43
PL00044	05-March-2003	A26.001	omptin	EC 3.4.23.49
PL00045	05-March-2003	A26.003	plasminogen activator Pla	EC 3.4.23.48
PL00046	05-March-2003	C01.001	papain	EC 3.4.22.2
PL00047	05-March-2003	C01.002	chymopapain	EC 3.4.22.6
PL00048	05-March-2003	C01.003	caricain	EC 3.4.22.30
PL00049	05-March-2003	C01.004	glycyl endopeptidase	EC 3.4.22.25
PL00050	05-March-2003	C01.005	stem bromelain	EC 3.4.22.32
PL00051	05-March-2003	C01.006	ficin	EC 3.4.22.3
PL00052	05-March-2003	C01.007	actinidin	EC 3.4.22.14
PL00053	05-March-2003	C01.009	cathepsin V	EC 3.4.22.43
PL00054	05-March-2003	C01.010	vignain
PL00055	05-March-2003	C01.013	cathepsin X	EC 3.4.18.1
PL00056	05-March-2003	C01.017	zingipain	EC 3.4.22.67
PL00057	05-March-2003	C01.018	cathepsin F	EC 3.4.22.41
PL00058	05-March-2003	C01.026	ananain	EC 3.4.22.31
PL00059	05-March-2003	C01.028	fruit bromelain	EC 3.4.22.33
PL00060	05-March-2003	C01.032	cathepsin L	EC 3.4.22.15
PL00061	05-March-2003	C01.033	cathepsin L1 (Fasciola sp.)
PL00062	05-March-2003	C01.034	cathepsin S	EC 3.4.22.27
PL00063	05-March-2003	C01.036	cathepsin K	EC 3.4.22.38
PL00064	05-March-2003	C01.040	cathepsin H	EC 3.4.22.16
PL00065	05-March-2003	C01.041	aleurain
PL00066	05-March-2003	C01.050	histolysain	EC 3.4.22.35
PL00067	05-March-2003	C01.060	cathepsin B	EC 3.4.22.1
PL00068	05-March-2003	C01.070	dipeptidyl-peptidase I	EC 3.4.14.1
PL00069	05-March-2003	C01.073	peptidase 1 (mite)	EC 3.4.22.65
PL00070	05-March-2003	C01.074	CPB peptidase
PL00071	05-March-2003	C01.075	cruzipain	EC 3.4.22.51
PL00072	05-March-2003	C01.083	V-cath peptidase	EC 3.4.22.50
PL00073	05-March-2003	C01.084	bleomycin hydrolase (animal)	EC 3.4.22.40
PL00074	05-March-2003	C01.085	bleomycin hydrolase (yeast)
PL00075	05-March-2003	C01.086	aminopeptidase C
PL00076	05-March-2003	C01.098	CPC peptidase
PL00077	05-March-2003	C02.001	calpain-1	EC 3.4.22.52
PL00078	05-March-2003	C02.002	calpain-2	EC 3.4.22.53
PL00079	05-March-2003	C02.004	calpain-3	EC 3.4.22.54
PL00080	05-March-2003	C02.022	Tpr peptidase (Porphyromonas gingivalis)
PL00081	05-March-2003	C03.001	poliovirus-type picornain 3C	EC 3.4.22.28
PL00082	05-March-2003	C03.005	hepatitis A virus-type picornain 3C
PL00083	05-March-2003	C03.007	human rhinovirus 2-type picornain 3C
PL00084	05-March-2003	C03.008	foot-and-mouth disease virus picornain 3C
PL00085	05-March-2003	C03.020	enterovirus picornain 2A	EC 3.4.22.29
PL00086	05-March-2003	C03.021	rhinovirus picornain 2A
PL00087	05-March-2003	C04.001	nuclear-inclusion-a peptidase (plum pox virus)	EC 3.4.22.44
PL00088	05-March-2003	C04.004	tobacco etch virus NIa peptidase
PL00089	05-March-2003	C05.001	adenain	EC 3.4.22.39
PL00090	05-March-2003	C06.001	potato virus Y-type helper component peptidase	EC 3.4.22.45
PL00091	05-March-2003	C09.001	sindbis virus-type nsP2 peptidase
PL00092	05-March-2003	C10.001	streptopain	EC 3.4.22.10
PL00093	05-March-2003	C11.001	clostripain	EC 3.4.22.8
PL00094	05-March-2003	C12.001	ubiquitinyl hydrolase-L1
PL00095	05-March-2003	C12.003	ubiquitinyl hydrolase-L3	EC 3.4.19.12
PL00096	05-March-2003	C13.001	legumain (plant beta form)	EC 3.4.22.34
PL00098	05-March-2003	C13.004	legumain, animal-type	EC 3.4.22.34
PL00099	05-March-2003	C14.001	caspase-1	EC 3.4.22.36
PL00100	05-March-2003	C14.003	caspase-3	EC 3.4.22.56
PL00101	05-March-2003	C14.004	caspase-7	EC 3.4.22.60
PL00102	05-March-2003	C14.005	caspase-6	EC 3.4.22.59
PL00103	05-March-2003	C14.009	caspase-8	EC 3.4.22.61
PL00104	05-March-2003	C14.010	caspase-9	EC 3.4.22.62
PL00105	05-March-2003	C15.001	pyroglutamyl-peptidase I (prokaryote)	EC 3.4.19.3
PL00106	05-March-2003	C15.010	pyroglutamyl-peptidase I (chordate)	EC 3.4.19.3
PL00107	05-March-2003	C16.001	murine hepatitis coronavirus papain-like peptidase 1
PL00108	05-March-2003	C19.001	ubiquitin-specific peptidase 5	EC 3.1.2.15
PL00109	05-March-2003	C21.001	tymovirus peptidase
PL00110	05-March-2003	C24.001	rabbit hemorrhagic disease virus 3C-like peptidase
PL00111	05-March-2003	C25.001	gingipain RgpA	EC 3.4.22.37
PL00112	05-March-2003	C25.002	gingipain Kgp	EC 3.4.22.47
PL00113	05-March-2003	C26.001	gamma-glutamyl hydrolase	EC 3.4.19.9
PL00114	05-March-2003	C28.001	foot-and-mouth disease virus L-peptidase	EC 3.4.22.46
PL00115	05-March-2003	C30.004	porcine transmissible gastroenteritis virus-type main peptidase
PL00116	05-March-2003	C37.001	calicivirin	EC 3.4.22.66
PL00117	05-March-2003	C47.001	staphopain A	EC 3.4.22.48
PL00118	05-March-2003	C48.001	Ulp1 peptidase	EC 3.4.22.68
PL00119	05-March-2003	C50.001	separase (yeast-type)	EC 3.4.22.49
PL00120	05-March-2003	C55.001	YopJ protein
PL00121	05-March-2003	C56.001	PfpI peptidase
PL00122	05-March-2003	C60.001	sortase A (Staphylococcus-type)	EC 3.4.22.70
PL00123	05-March-2003	M01.001	aminopeptidase N	EC 3.4.11.2
PL00124	05-March-2003	M01.002	lysyl aminopeptidase (bacteria)
PL00125	05-March-2003	M01.003	aminopeptidase A	EC 3.4.11.7
PL00126	05-March-2003	M01.004	leukotriene A4 hydrolase	EC 3.3.2.6
PL00127	05-March-2003	M01.008	pyroglutamyl-peptidase II	EC 3.4.19.6
PL00128	05-March-2003	M01.010	cytosol alanyl aminopeptidase	EC 3.4.11.14
PL00129	05-March-2003	M01.011	cystinyl aminopeptidase	EC 3.4.11.3
PL00130	05-March-2003	M01.014	aminopeptidase B	EC 3.4.11.6
PL00131	05-March-2003	M01.016	aminopeptidase Ey	EC 3.4.11.20
PL00132	05-March-2003	M02.001	angiotensin-converting enzyme peptidase unit 1	EC 3.4.15.1
PL00133	05-March-2003	M02.002	peptidyl-dipeptidase Acer	EC 3.4.15.1
PL00134	05-March-2003	M02.004	angiotensin-converting enzyme peptidase unit 2	EC 3.4.15.1
PL00135	05-March-2003	M02.006	angiotensin-converting enzyme-2	EC 3.4.17.23
PL00136	05-March-2003	M03.001	thimet oligopeptidase	EC 3.4.24.15
PL00137	05-March-2003	M03.002	neurolysin	EC 3.4.24.16
PL00138	05-March-2003	M03.003	saccharolysin	EC 3.4.24.37
PL00139	05-March-2003	M03.004	oligopeptidase A	EC 3.4.24.70
PL00140	05-March-2003	M03.005	peptidyl-dipeptidase Dcp	EC 3.4.15.5
PL00141	05-March-2003	M03.006	mitochondrial intermediate peptidase	EC 3.4.24.59
PL00142	05-March-2003	M03.007	oligopeptidase F
PL00143	05-March-2003	M04.001	thermolysin	EC 3.4.24.27
PL00144	05-March-2003	M04.003	vibriolysin	EC 3.4.24.25
PL00145	05-March-2003	M04.005	pseudolysin	EC 3.4.24.26
PL00146	05-March-2003	M04.007	coccolysin	EC 3.4.24.30
PL00147	05-March-2003	M04.009	aureolysin	EC 3.4.24.29
PL00148	05-March-2003	M04.018	stearolysin
PL00149	05-March-2003	M05.001	mycolysin	EC 3.4.24.31
PL00150	05-March-2003	M07.001	snapalysin
PL00151	05-March-2003	M08.001	leishmanolysin	EC 3.4.24.36
PL00152	05-March-2003	M09.001	bacterial collagenase V	EC 3.4.24.3
PL00153	05-March-2003	M09.002	bacterial collagenase G/A	EC 3.4.24.3
PL00154	05-March-2003	M10.001	matrix metallopeptidase-1	EC 3.4.24.7
PL00155	05-March-2003	M10.002	matrix metallopeptidase-8	EC 3.4.24.34
PL00156	05-March-2003	M10.003	matrix metallopeptidase-2	EC 3.4.24.24
PL00157	05-March-2003	M10.004	matrix metallopeptidase-9	EC 3.4.24.35
PL00158	05-March-2003	M10.005	matrix metallopeptidase-3	EC 3.4.24.17
PL00159	05-March-2003	M10.006	matrix metallopeptidase-10 (Homo sapiens-type)	EC 3.4.24.22
PL00160	05-March-2003	M10.007	matrix metallopeptidase-11
PL00161	05-March-2003	M10.008	matrix metallopeptidase-7	EC 3.4.24.23
PL00162	05-March-2003	M10.009	matrix metallopeptidase-12	EC 3.4.24.65
PL00163	05-March-2003	M10.010	envelysin	EC 3.4.24.12
PL00164	05-March-2003	M10.013	matrix metallopeptidase-13
PL00165	05-March-2003	M10.014	membrane-type matrix metallopeptidase-1	EC 3.4.24.80
PL00166	05-March-2003	M10.015	membrane-type matrix metallopeptidase-2
PL00167	05-March-2003	M10.019	matrix metallopeptidase-20
PL00168	05-March-2003	M10.020	fragilysin	EC 3.4.24.74
PL00169	05-March-2003	M10.029	matrix metallopeptidase-26
PL00170	05-March-2003	M10.051	serralysin	EC 3.4.24.40
PL00171	05-March-2003	M10.056	aeruginolysin	EC 3.4.24.40
PL00172	05-March-2003	M11.001	gametolysin	EC 3.4.24.38
PL00173	05-March-2003	M12.001	astacin	EC 3.4.24.21
PL00174	05-March-2003	M12.002	meprin alpha subunit	EC 3.4.24.18
PL00176	05-March-2003	M12.005	procollagen C-peptidase	EC 3.4.24.19
PL00177	05-March-2003	M12.006	choriolysin L	EC 3.4.24.66
PL00178	05-March-2003	M12.007	choriolysin H	EC 3.4.24.67
PL00179	05-March-2003	M12.066	flavastacin	EC 3.4.24.76
PL00180	05-March-2003	M12.133	fibrolase	EC 3.4.24.72
PL00181	05-March-2003	M12.138	jararhagin	EC 3.4.24.73
PL00182	05-March-2003	M12.141	adamalysin	EC 3.4.24.46
PL00183	05-March-2003	M12.142	atrolysin A	EC 3.4.24.1
PL00184	05-March-2003	M12.143	atrolysin B	EC 3.4.24.41
PL00185	05-March-2003	M12.144	atrolysin C	EC 3.4.24.42
PL00186	05-March-2003	M12.145	atrolysin E	EC 3.4.24.44
PL00188	05-March-2003	M12.147	atroxase	EC 3.4.24.43
PL00189	05-March-2003	M12.158	russellysin	EC 3.4.24.58
PL00190	05-March-2003	M12.201	ADAM1 peptidase
PL00191	05-March-2003	M12.209	ADAM9 peptidase
PL00192	05-March-2003	M12.210	ADAM10 peptidase	EC 3.4.24.81
PL00193	05-March-2003	M12.211	Kuzbanian peptidase (non-mammalian)
PL00194	05-March-2003	M12.212	ADAM12 peptidase
PL00195	05-March-2003	M12.217	ADAM17 peptidase	EC 3.4.24.86
PL00196	05-March-2003	M12.221	ADAMTS4 peptidase	EC 3.4.24.82
PL00197	05-March-2003	M12.222	ADAMTS1 peptidase
PL00198	05-March-2003	M12.225	ADAMTS5 peptidase
PL00199	05-March-2003	M12.241	ADAMTS13 peptidase	EC 3.4.24.87
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PL00291	05-March-2003	S01.162	kallikrein-related peptidase 3	EC 3.4.21.77
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PL00295	05-March-2003	S01.173	kallikrein 13 (Mus musculus)
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PL00322	05-March-2003	S01.236	kallikrein-related peptidase 6
PL00323	05-March-2003	S01.239	plasminogen activator (Desmodus-type)
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PL00326	05-March-2003	S01.251	kallikrein-related peptidase 4
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PL00371	05-March-2003	S09.010	oligopeptidase B	EC 3.4.21.83
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PL00375	05-March-2003	S10.005	serine carboxypeptidase D	EC 3.4.16.6
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PL00379	05-March-2003	S12.001	D-Ala-D-Ala carboxypeptidase B	EC 3.4.16.4
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PL00386	05-March-2003	S21.001	assemblin	EC 3.4.21.97
PL00387	05-March-2003	S21.002	cytomegalovirus assemblin
PL00388	05-March-2003	S21.006	herpesvirus 8-type assemblin
PL00389	05-March-2003	S24.001	repressor LexA	EC 3.4.21.88
PL00390	05-March-2003	S24.003	UmuD protein
PL00391	05-March-2003	S26.001	signal peptidase I	EC 3.4.21.89
PL00392	05-March-2003	S26.002	mitochondrial inner membrane peptidase 1	EC 3.4.21.89
PL00393	05-March-2003	S26.003	signal peptidase SipS	EC 3.4.21.89
PL00394	05-March-2003	S26.010	signalase (animal) 21 kDa component	EC 3.4.21.89
PL00395	05-March-2003	S28.001	lysosomal Pro-Xaa carboxypeptidase	EC 3.4.16.2
PL00396	05-March-2003	S28.002	dipeptidyl-peptidase II	EC 3.4.14.2
PL00397	05-March-2003	S29.001	hepacivirin	EC 3.4.21.98
PL00398	05-March-2003	S30.001	potyvirus P1 peptidase
PL00399	05-March-2003	S31.001	pestivirus NS3 polyprotein peptidase
PL00400	05-March-2003	S32.001	equine arteritis virus serine peptidase
PL00401	05-March-2003	S33.001	prolyl aminopeptidase	EC 3.4.11.5
PL00402	05-March-2003	S41.001	C-terminal processing peptidase-1	EC 3.4.21.102
PL00403	05-March-2003	S41.002	C-terminal processing peptidase-2	EC 3.4.21.102
PL00404	05-March-2003	S41.005	tricorn core peptidase (archaea)
PL00405	05-March-2003	S49.001	signal peptide peptidase A
PL00406	05-March-2003	S50.001	infectious pancreatic necrosis birnavirus Vp4 peptidase
PL00407	05-March-2003	S51.001	dipeptidase E	EC 3.4.13.21
PL00408	05-March-2003	S53.001	sedolisin	EC 3.4.21.100
PL00409	05-March-2003	S53.002	sedolisin-B	EC 3.4.21.101
PL00410	05-March-2003	S53.003	tripeptidyl-peptidase I	EC 3.4.14.9
PL00411	05-March-2003	S53.004	kumamolisin
PL00412	05-March-2003	S53.006	physarolisin	EC 3.4.21.103
PL00413	05-March-2003	S55.001	SpoIVB peptidase	EC 3.4.21.116
PL00415	05-March-2003	T01.002	archaean proteasome, beta component	EC 3.4.25.1
PL00416	05-March-2003	T01.005	bacterial proteasome, beta component	EC 3.4.25.1
PL00417	05-March-2003	T01.006	HslV component of HslUV peptidase	EC 3.4.25.2
PL00418	05-March-2003	T01.010	proteasome subunit beta1c	EC 3.4.25.1
PL00419	05-March-2003	T01.011	proteasome subunit beta2c	EC 3.4.25.1
PL00420	05-March-2003	T01.012	proteasome subunit beta5c	EC 3.4.25.1
PL00421	05-March-2003	T03.001	gamma-glutamyltransferase 1 (bacterial-type)	EC 2.3.2.2
PL00424	05-March-2003	S66.002	murein tetrapeptidase LD-carboxypeptidase (Escherichia-type)	EC 3.4.17.13
PL00425	15-September-2005	M17.003	PepA aminopeptidase	EC 3.4.11.10
PL00426	15-September-2005	A22.001	presenilin 1
PL00427	11-May-2006	A01.019	polyporopepsin	EC 3.4.23.29
PL00428	11-May-2006	A01.037	canditropsin
PL00429	11-May-2006	A01.060	candidapepsin SAP2
PL00430	11-May-2006	C14.006	caspase-2	EC 3.4.22.55
PL00431	11-May-2006	C14.019	caspase DRONC (Drosophila melanogaster)-type peptidase
PL00432	11-May-2006	C19.016	ubiquitin-specific peptidase 7
PL00433	11-May-2006	C30.003	human coronavirus 229E main peptidase
PL00434	11-May-2006	C30.005	SARS coronavirus picornain 3C-like peptidase	EC 3.4.22.69
PL00435	11-May-2006	C58.002	AvrPphB peptidase
PL00436	11-May-2006	C60.002	sortase B	EC 3.4.22.71
PL00437	11-May-2006	M10.062	psychrophilic alkaline metallopeptidase (Pseudomonas sp.)
PL00438	11-May-2006	M12.131	acutolysin A
PL00439	11-May-2006	M29.005	aminopeptidase S (Staphylococcus-type)
PL00440	11-May-2006	M32.002	carboxypeptidase Pfu
PL00441	11-May-2006	M38.001	isoaspartyl dipeptidase (metallo-type)
PL00442	11-May-2006	M55.001	D-aminopeptidase DppA
PL00443	11-May-2006	M74.001	murein endopeptidase