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Summary for peptidase C25.003: gingipain RgpB
| Names | |
|---|---|
| MEROPS Name | gingipain RgpB |
| Other names | 50 kDa gingipain, Arg-gingipain B, gingipain R2, RgpB g.p. (Porphyromonas gingivalis) |
| Domain architecture |
|---|
| MEROPS Classification | |
|---|---|
| Classification | Clan CD >> Subclan (none) >> Family C25 >> Subfamily (none) >> C25.003 |
| Holotype | gingipain RgpB (Porphyromonas gingivalis), Uniprot accession P95493 (peptidase unit: 230-580), MERNUM MER0002270 |
| History | Identifier created: MEROPS 3.21 (12 May 1999) |
| Activity | |||
|---|---|---|---|
| Catalytic type | Cysteine | ||
| NC-IUBMB | Not yet included in IUBMB recommendations. | ||
| Proteolytic events | CutDB database (6 cleavages) | ||
| Cleavage site specificity | Explanations of how to interpret the following cleavage site sequence logo and specificity matrix can be found here. | ||
| Cleavage pattern | -/-/-/Rk -/-/-/- (based on 16 cleavages) | ||
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| Specificity matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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