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Ligand clusters for UniProt code P00829

Ligand clusters for P00829: ATP synthase subunit beta, mitochondrial from Bos taurus

5 ligand clusters
Cluster 1.
5 ligand types
17 ligands
Cluster 2.
8 ligand types
53 ligands
Cluster 3.
1 ligand type
1 ligand
Cluster 4.
1 ligand type
5 ligands
Cluster 5.
1 ligand type
1 ligand
Representative protein: 1ohhD  
JSmol
 

Structures

PDB   Schematic diagram
1ohhD    
2xndD    
4yxwD    
4tt3D    
2jj1D    
 more ...

 

 Cluster 1 contains 5 ligand types

Use checkboxes to select ligands to display in RasMol, Jmol, or download as an SDF file.
Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description


 
1. Ligand: ATP × 3
Adenosine-5'-Triphosphate
PDB codes: 1e79(D), 1nbm(D), 2v7q(D).


 
2. Ligand: ADP × 2
Adenosine-5'-Diphosphate
PDB codes: 1h8e(D), 1w0k(D).


 
3. Ligand: ANP × 9
Phosphoaminophosphonic acid-Adenylate ester
PDB codes: 1e1r(D), 1ohh(D), 2jdi(D), 2jiz(D), 2jj1(D), 2jj2(D), 2ck3(D), 2wss(D), 4yxw(D).


 
4. Ligand: ATP × 2
Adenosine-5'-Triphosphate
PDB codes: 4tsf(D), 4z1m(D).


 
5. Ligand: ADP × 1
Adenosine-5'-Diphosphate
PDB code: 1w0j(D).

 

 Cluster 2 contains 8 ligand types

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description


 
1. Ligand: ADP × 14
Adenosine-5'-Diphosphate
PDB codes: 1bmf(D), 1cow(D), 1e1q(D), 1e1r(D), 1e79(D), 1efr(D), 1h8e(D), 1h8h(D), 1nbm(D), 1w0k(D), 2jiz(D), 2jj1(D), 2jj2(D), 2v7q(D).

_Mg
 
2. Metal: _MG × 24
PDB codes: 1bmf(D), 1cow(D), 1e1q(D), 1e1r(D), 1e79(D), 1efr(D), 1h8e(D), 1h8h(D), 1nbm(D), 1w0j(D), 1w0k(D), 2ck3(D), 2jdi(D), 2jiz(D), 2jj1(D), 2jj2(D), 2v7q(D), 2wss(D), 2xnd(D), 4asu(D), 4tsf(D), 4tt3(D), 4yxw(D), 4z1m(D).


 
3. Ligand: ANP × 2
Phosphoaminophosphonic acid-Adenylate ester
PDB codes: 1ohh(D), 2jdi(D).


 
4. Ligand: ADP × 8
Adenosine-5'-Diphosphate
PDB codes: 1w0j(D), 2ck3(D), 2w6e(D), 2wss(D), 4asu(D), 4tsf(D), 4tt3(D), 4z1m(D).


 
5. Ligand: ANP × 2
Phosphoaminophosphonic acid-Adenylate ester
PDB codes: 2xnd(D), 4yxw(D).


 
6. Ligand: AF3 × 1
Aluminum fluoride
PDB code: 1e1r(D).


 
7. Ligand: ALF × 1
Tetrafluoroaluminate ion
PDB code: 1h8e(D).


 
8. Ligand: BEF × 1
Beryllium trifluoride ion
PDB code: 1w0j(D).

 

 Cluster 3 contains 1 ligand type

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description


 
1. Ligand: DCW × 1
Dicyclohexylurea
PDB code: 1e79(D).

 

 Cluster 4 contains 1 ligand type

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description


 
1. Ligand: GOL × 5
glycerin
Glycerol
PDB codes: 1w0j(D), 1w0k(D), 2jiz(D), 2jj1(D), 2jj2(D).

 

 Cluster 5 contains 1 ligand type

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description

_Cl
 
1. Metal: _CL × 1
PDB code: 4yxw(D).

 

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