PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=647-AC-F88)

Interfaces in PDB 6kya crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.89 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TLR8 IN COMPLEX TH1027

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`169`	`50`	`32220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`173`	`50`	`32252`	`1458.2`	`-17.1`	`0.021`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`144`	`47`	`32252`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`144`	`47`	`32252`	`1286.3`	`11.9`	`0.962`	`14`	`2`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`44`	`16`	`32220`	`x`	B	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`59`	`19`	`32220`	`477.8`	`8.7`	`0.918`	`8`	`2`	`0`	`0.000`
4	`4`		[NAG]B:903	`14`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`15`	`32220`	`229.5`	`5.0`	`0.410`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		[NAG]A:903	`14`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`15`	`32252`	`227.2`	`5.1`	`0.414`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`228.4`	`5.1`	`0.412`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		[DY3]A:901	`18`	`1`	`486`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`35`	`13`	`32252`	`226.9`	`-1.9`	`0.248`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		[DY3]B:901	`17`	`1`	`487`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`34`	`13`	`32220`	`221.2`	`-2.9`	`0.197`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`224.0`	`-2.4`	`0.222`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[NAG]A:908	`14`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`17`	`32252`	`222.2`	`6.5`	`0.558`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[NAG]B:908	`14`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`17`	`32220`	`222.0`	`6.6`	`0.553`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`222.1`	`6.6`	`0.556`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		[DY3]B:901	`17`	`1`	`487`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`8`	`32252`	`191.1`	`-1.0`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		[DY3]A:901	`16`	`1`	`486`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`8`	`32220`	`182.7`	`-1.5`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`186.9`	`-1.3`	`0.241`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		A	`27`	`7`	`32252`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`22`	`8`	`32220`	`191.1`	`-0.0`	`0.537`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[NAG]B:910	`13`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`14`	`32220`	`185.1`	`5.2`	`0.494`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NAG]A:910	`13`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`14`	`32252`	`185.1`	`5.8`	`0.539`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`185.1`	`5.5`	`0.517`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		[NAG]A:904	`11`	`1`	`351`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`32252`	`161.7`	`4.3`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]B:904	`12`	`1`	`350`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`32220`	`158.4`	`3.8`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`160.1`	`4.1`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		[NAG]A:915	`14`	`1`	`360`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`19`	`7`	`32252`	`153.6`	`3.8`	`0.313`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		[NAG]A:916	`11`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`32252`	`131.8`	`2.3`	`0.274`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		[NAG]B:911	`11`	`1`	`357`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`32220`	`130.1`	`3.9`	`0.413`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[NAG]B:916	`11`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`32220`	`129.9`	`2.0`	`0.221`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		[NAG]B:907	`10`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`32220`	`127.4`	`4.1`	`0.464`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[NAG]A:907	`9`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`32252`	`126.4`	`4.0`	`0.502`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`126.9`	`4.0`	`0.483`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`23`		[NAG]A:911	`9`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`32252`	`125.8`	`3.5`	`0.478`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`24`		[NAG]B:915	`12`	`1`	`368`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`32220`	`124.3`	`3.1`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`25`		B	`16`	`7`	`32220`	`x`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`15`	`5`	`32220`	`123.0`	`2.0`	`0.815`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
19	`26`		[NAG]A:902	`10`	`1`	`357`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`32252`	`121.3`	`3.4`	`0.420`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[NAG]B:902	`9`	`1`	`357`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`32220`	`120.8`	`3.1`	`0.430`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`28`		[NAG]B:902	`9`	`1`	`357`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`14`	`5`	`32220`	`106.6`	`2.7`	`0.359`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`29`		[NAG]A:915	`10`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`32252`	`105.1`	`1.9`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`30`		B	`15`	`4`	`32220`	`◊`	[NAG]B:915	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`10`	`1`	`368`	`104.7`	`1.6`	`0.229`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`31`		[NAG]A:909	`9`	`1`	`367`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`32252`	`102.9`	`2.4`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`32`		[NAG]B:909	`10`	`1`	`361`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`32220`	`90.4`	`2.5`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`33`		[NAG]A:902	`9`	`1`	`357`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`7`	`3`	`32252`	`83.6`	`1.9`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`34`		A	`10`	`4`	`32252`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`12`	`3`	`32252`	`80.6`	`-1.1`	`0.265`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		[NAG]B:909	`9`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]B:908	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`74.2`	`2.0`	`0.095`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`36`		[NAG]A:909	`9`	`1`	`367`	`cf`	[NAG]A:908	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`72.0`	`1.8`	`0.091`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[NAG]B:904	`10`	`1`	`350`	`cf`	[NAG]B:903	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`65.4`	`1.4`	`0.075`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[NAG]A:904	`10`	`1`	`351`	`cf`	[NAG]A:903	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`65.3`	`1.5`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`67.6`	`1.6`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		[NAG]B:911	`9`	`1`	`357`	`cf`	[NAG]B:910	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`68.3`	`1.5`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[NAG]A:911	`8`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:910	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`68.3`	`1.4`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`68.3`	`1.5`	`0.086`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		[BMA]A:905	`7`	`1`	`297`	`cf`	[NAG]A:904	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`351`	`60.7`	`1.2`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[BMA]B:905	`6`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]B:904	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`350`	`58.7`	`1.0`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.7`	`1.1`	`0.097`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`43`		[BMA]A:912	`6`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]A:911	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`362`	`58.1`	`1.1`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`44`		[BMA]B:912	`5`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]B:911	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`357`	`57.1`	`0.9`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`45`		[MAN]B:906	`6`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]B:905	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`294`	`57.0`	`2.6`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`46`		[MAN]A:906	`8`	`1`	`291`	`cf`	[BMA]A:905	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`297`	`56.8`	`2.4`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`47`		[MAN]A:914	`4`	`1`	`291`	`cf`	[BMA]A:912	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`290`	`56.5`	`2.7`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`48`		[MAN]B:914	`6`	`1`	`293`	`cf`	[BMA]B:912	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`291`	`56.3`	`2.8`	`0.289`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`49`		[MAN]A:913	`6`	`1`	`289`	`cf`	[BMA]A:912	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`56.2`	`2.7`	`0.252`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`50`		[MAN]B:913	`5`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]B:912	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`291`	`54.3`	`2.7`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`51`		[MAN]A:906	`5`	`1`	`291`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`32252`	`51.7`	`0.9`	`0.322`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
41	`52`		[MAN]B:906	`5`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`32220`	`45.0`	`0.8`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`53`		[NAG]B:909	`6`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`32252`	`36.8`	`1.8`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`54`		[BMA]B:905	`6`	`1`	`294`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`32220`	`35.7`	`1.1`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[BMA]A:905	`5`	`1`	`297`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`32252`	`31.6`	`1.1`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`33.6`	`1.1`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`56`		[NAG]A:907	`3`	`1`	`359`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`4`	`2`	`32252`	`34.3`	`1.3`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`57`		[BMA]B:912	`4`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`32220`	`32.5`	`0.6`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[BMA]A:912	`4`	`1`	`290`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32252`	`31.6`	`0.9`	`0.479`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`32.1`	`0.7`	`0.412`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`59`		[NAG]A:909	`1`	`1`	`367`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`32220`	`23.1`	`1.2`	`0.816`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`60`		A	`3`	`1`	`32252`	`◊`	[NAG]A:916	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`3`	`1`	`363`	`18.5`	`0.4`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`61`		B	`2`	`1`	`32220`	`x`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`1`	`1`	`32220`	`16.1`	`0.0`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`62`		B	`1`	`1`	`32220`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`32252`	`14.9`	`0.0`	`0.626`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`63`		[MAN]B:913	`3`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`32220`	`10.8`	`0.5`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[MAN]A:913	`2`	`1`	`289`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32252`	`10.1`	`0.4`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`10.5`	`0.5`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`65`		[MAN]A:914	`2`	`1`	`291`	`f`	[NAG]A:911	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`362`	`9.7`	`0.2`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`66`		[MAN]B:914	`1`	`1`	`293`	`f`	[NAG]B:911	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`357`	`9.5`	`0.1`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`67`		[MAN]A:913	`2`	`1`	`289`	`f`	[NAG]A:911	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`362`	`3.1`	`0.1`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`68`		[MAN]B:913	`2`	`1`	`290`	`f`	[NAG]B:911	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`357`	`2.6`	`0.1`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`69`		[MAN]A:906	`1`	`1`	`291`	`f`	[NAG]A:904	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`351`	`0.8`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`70`		[MAN]B:906	`1`	`1`	`290`	`f`	[NAG]B:904	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`350`	`0.1`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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