PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=736-BB-I12)

Interfaces in PDB 6hrq crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.85 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SCHISTOSOMA MANSONI HDAC8 COMPLEXED WITH NCC-149

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`123`	`42`	`17219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`95`	`30`	`18868`	`994.8`	`-9.8`	`0.191`	`9`	`3`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`91`	`27`	`18427`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`114`	`36`	`17442`	`967.1`	`-11.0`	`0.101`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`115`	`37`	`18868`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`93`	`29`	`17219`	`907.3`	`-6.8`	`0.340`	`9`	`4`	`0`	`0.000`
	`4`		A	`84`	`28`	`17442`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`105`	`34`	`18427`	`830.0`	`-6.5`	`0.307`	`9`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`924.8`	`-8.5`	`0.234`	`9`	`4`	`0`	`0.000`
2	`5`		C	`44`	`12`	`18868`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`64`	`18`	`18427`	`550.1`	`-2.3`	`0.517`	`11`	`1`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`65`	`18`	`18868`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`46`	`13`	`18427`	`544.6`	`-2.4`	`0.524`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`547.3`	`-2.3`	`0.521`	`11`	`1`	`0`	`0.000`
3	`7`		D	`57`	`17`	`17219`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`49`	`14`	`18427`	`428.6`	`0.0`	`0.709`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
4	`8`		C	`35`	`12`	`18868`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`7`	`17442`	`325.4`	`-3.2`	`0.282`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		D	`28`	`7`	`17219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`35`	`12`	`18427`	`316.6`	`-3.2`	`0.296`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`321.0`	`-3.2`	`0.289`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
5	`10`		[GM5]A:504	`23`	`1`	`536`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`14`	`17442`	`298.8`	`-3.2`	`0.282`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
	`11`		[GM5]C:504	`23`	`1`	`533`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`48`	`14`	`18868`	`294.4`	`-3.4`	`0.266`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
	`12`		[GM5]B:504	`23`	`1`	`537`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`14`	`18427`	`284.1`	`-4.7`	`0.205`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
	`13`		[GM5]D:504	`23`	`1`	`534`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`13`	`17219`	`282.7`	`-4.5`	`0.193`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`290.0`	`-3.9`	`0.236`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
6	`14`		C	`30`	`12`	`18868`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`31`	`10`	`17442`	`295.6`	`0.5`	`0.717`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
7	`15`		C	`23`	`8`	`18868`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`8`	`17442`	`163.1`	`-1.0`	`0.508`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`16`		D	`15`	`6`	`17219`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`6`	`18427`	`127.3`	`-1.5`	`0.381`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`145.2`	`-1.2`	`0.445`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
8	`17`		D	`22`	`8`	`17219`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`20`	`5`	`17442`	`149.9`	`-0.1`	`0.637`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
9	`18`		[DMF]C:510	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`18868`	`146.7`	`2.2`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`19`		[GOL]B:517	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`18427`	`144.6`	`-0.8`	`0.502`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
11	`20`		[DMF]B:513	`5`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`18427`	`144.5`	`2.6`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[GOL]D:510	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`17219`	`143.3`	`-0.3`	`0.575`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
	`22`		[GOL]A:510	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`17442`	`142.2`	`-0.2`	`0.575`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
	`23`		[GOL]C:512	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`18868`	`139.5`	`-0.3`	`0.563`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`141.7`	`-0.3`	`0.571`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
13	`24`		[DMF]D:506	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`7`	`17219`	`143.0`	`2.4`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`25`		[DMF]D:505	`5`	`1`	`215`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`17219`	`143.0`	`3.2`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`26`		[DMF]B:514	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`7`	`18427`	`142.9`	`3.0`	`0.441`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[DMF]C:509	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`18868`	`141.2`	`3.0`	`0.438`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`142.0`	`3.0`	`0.439`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`28`		[GOL]D:511	`6`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`17219`	`142.6`	`-0.6`	`0.535`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
17	`29`		[DMF]A:506	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`17442`	`142.5`	`3.0`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`30`		[GOL]B:515	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`18427`	`142.1`	`-0.2`	`0.589`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
19	`31`		[DMF]A:507	`5`	`1`	`214`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`17442`	`141.8`	`3.0`	`0.431`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`32`		[DMF]B:507	`5`	`1`	`213`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`18427`	`141.1`	`3.3`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`33`		[DMF]C:511	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`18868`	`140.4`	`3.3`	`0.456`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`34`		[DMF]D:509	`5`	`1`	`214`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`17219`	`138.3`	`4.6`	`0.563`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`35`		[GOL]D:513	`6`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`17219`	`138.2`	`-0.9`	`0.518`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		[GOL]C:513	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`18868`	`138.1`	`-0.6`	`0.502`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
25	`37`		[GOL]D:515	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`17219`	`132.9`	`-0.4`	`0.525`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
26	`38`		[DMF]A:511	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`17442`	`130.4`	`3.6`	`0.468`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`39`		[DMF]D:508	`5`	`1`	`215`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`17219`	`129.5`	`3.7`	`0.489`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`40`		[DMF]A:509	`5`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`17442`	`128.3`	`3.2`	`0.450`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`41`		[GOL]D:512	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`17219`	`128.2`	`-0.6`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`42`		[DMF]B:508	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`18427`	`125.1`	`3.4`	`0.492`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`18868`	`122.1`	`3.5`	`0.490`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`123.6`	`3.4`	`0.491`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		[DMF]B:505	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18427`	`124.0`	`3.4`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`45`		[DMF]B:510	`5`	`1`	`214`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`18427`	`121.6`	`1.9`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`46`		[DMF]C:505	`5`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`18868`	`119.7`	`2.5`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`47`		[DMF]B:511	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`18427`	`115.1`	`3.0`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`48`		[K]B:502	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`18427`	`114.9`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	`49`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17442`	`114.6`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	`50`		[K]D:502	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17219`	`114.4`	`-108.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	`51`		[K]C:502	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`18868`	`113.9`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	*Average:*													`114.5`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
36	`52`		[DMF]A:508	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17442`	`114.4`	`2.6`	`0.402`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`53`		[GOL]D:514	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`17219`	`111.9`	`-0.6`	`0.460`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`54`		[DMF]C:508	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`18868`	`106.7`	`3.1`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`55`		[DMF]B:506	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`18427`	`103.4`	`1.7`	`0.354`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`56`		[DMF]B:509	`5`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`18427`	`102.3`	`1.7`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18868`	`100.7`	`2.0`	`0.353`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`58`		C	`14`	`6`	`18868`	`◊`	[GOL]B:516	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`1`	`215`	`98.0`	`0.3`	`0.649`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
43	`59`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17442`	`90.9`	`2.1`	`0.364`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`60`		[GOL]B:518	`6`	`1`	`214`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`18427`	`87.6`	`0.3`	`0.682`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`61`		[DMF]D:507	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`17`	`5`	`17442`	`87.1`	`2.3`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`62`		A	`16`	`7`	`17442`	`◊`	[DMF]B:512	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`215`	`84.9`	`2.3`	`0.404`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`63`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18427`	`81.7`	`1.9`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`64`		D	`12`	`4`	`17219`	`f`	[GOL]B:518	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`1`	`214`	`75.9`	`-0.6`	`0.478`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
49	`65`		[DMF]B:512	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`18427`	`70.2`	`1.6`	`0.306`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`66`		[GM5]A:504	`6`	`1`	`536`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`18427`	`69.2`	`1.7`	`0.662`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		C	`7`	`3`	`18868`	`◊`	[GM5]D:504	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`1`	`534`	`69.2`	`1.8`	`0.674`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[GM5]C:504	`7`	`1`	`533`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17219`	`67.8`	`1.8`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[GM5]B:504	`7`	`1`	`537`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17442`	`67.1`	`1.8`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`68.3`	`1.8`	`0.664`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`70`		[DMF]D:507	`4`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`17219`	`64.6`	`1.8`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`71`		[GOL]B:516	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`18427`	`54.4`	`-0.5`	`0.415`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`72`		D	`4`	`2`	`17219`	`f`	[DMF]B:508	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`216`	`48.4`	`0.1`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`217`	`f`	A	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`17442`	`32.4`	`-0.5`	`0.062`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`40.4`	`-0.2`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`74`		[GOL]C:513	`3`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`4`	`17219`	`44.2`	`-0.1`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`75`		[DMF]D:508	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`18427`	`39.2`	`0.4`	`0.188`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`76`		[GOL]D:511	`3`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`18868`	`38.9`	`-0.3`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`77`		[ZN]D:501	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17219`	`37.2`	`-25.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`78`		[ZN]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17442`	`37.2`	`-25.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`79`		[ZN]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`18427`	`36.9`	`-26.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`80`		[ZN]C:501	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`18868`	`36.8`	`-25.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`37.0`	`-25.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
58	`81`		[GM5]A:504	`4`	`1`	`536`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.3`	`-14.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`82`		[GM5]C:504	`4`	`1`	`533`	`f`	[ZN]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.2`	`-14.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`83`		[GM5]B:504	`4`	`1`	`537`	`f`	[ZN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.0`	`-13.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`84`		[GM5]D:504	`4`	`1`	`534`	`f`	[ZN]D:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.0`	`-14.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`31.1`	`-14.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
59	`85`		C	`5`	`2`	`18868`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`4`	`2`	`18427`	`30.7`	`0.4`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`86`		D	`3`	`1`	`17219`	`◊`	[DMF]B:509	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`217`	`29.9`	`1.2`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`87`		[GOL]B:518	`3`	`1`	`214`	`f`	[DMF]B:510	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`214`	`21.4`	`0.6`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`88`		[GOL]D:514	`3`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`17442`	`18.3`	`0.3`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`89`		C	`3`	`1`	`18868`	`f`	[DMF]B:505	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`216`	`16.7`	`0.2`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`90`		[DMF]C:505	`2`	`1`	`216`	`f`	B	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`18427`	`15.8`	`-0.1`	`0.244`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`91`		A	`2`	`2`	`17442`	`◊`	[GOL]B:517	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`217`	`14.9`	`0.2`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`92`		C	`2`	`1`	`18868`	`f`	[DMF]A:509	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`218`	`12.8`	`0.6`	`0.604`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`93`		D	`1`	`1`	`17219`	`f`	[DMF]B:510	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`214`	`7.3`	`0.1`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`94`		[GOL]B:515	`1`	`1`	`219`	`f`	[DMF]B:509	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`217`	`3.4`	`-0.1`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`95`		C	`1`	`1`	`18868`	`◊`	[GOL]D:512	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`219`	`1.9`	`0.1`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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