PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   3   ABCa2b   CDJ[NAG]2[BMA]   1   2   yes    26410      6270      -20.3    15.3 
 3   ABCa2b   ABK[NAG]2[BMA]   1   1   yes    26430      6120      -18.6    12.5 
 3   ABCa2b   HLI[NAG]2[BMA]   1   3   yes    26430      6240      -16.2    12.4 
 2   6   A2B2C2a4b2   ACBDJK[NAG]4[BMA]2   2   –   yes    52080      13150      -43.7    20.2 
 3   ABCa2b   HLI[NAG]2[BMA]   1   3   yes    26430      6240      -16.2    12.4 
 3   6   A2B2C2a4b2   ACBDJK[NAG]4[BMA]2   2   –   yes    52080      13150      -43.7    20.2 
 6   A2B2C2a4b2   H2L2I2[NAG]4[BMA]2   3   –   yes    52450      12890      -30.0    7.8 
 4   6   A2B2C2a4b2   H2L2I2[NAG]4[BMA]2   3   –   yes    52450      12890      -30.0    7.8 
 3   ABCa2b   CDJ[NAG]2[BMA]   1   2   yes    26410      6270      -20.3    15.3 
 3   ABCa2b   ABK[NAG]2[BMA]   1   1   yes    26430      6120      -18.6    12.5 
 5   2   AB   AB   4   –   yes    19220      3500      -22.0    17.1 
 2   AB   CD   4   –   yes    19170      3480      -22.7    16.4 
 2   AB   HL   4   –   yes    19250      3330      -22.4    16.3 
 1   Aa2b   I[NAG]2[BMA]   5   –   yes    9550      530      5.6    -0.0 
 1   Aa2b   J[NAG]2[BMA]   5   –   yes    9510      510      6.2    -0.0 
 1   Aa2b   K[NAG]2[BMA]   5   –   yes    9350      490      5.9    -0.0 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 6   4   A2B2   ACBD   6   –   no    37660      7710      -49.7    -7.0 
 2   AB   HL   4   –   yes    19250      3330      -22.4    16.3 
 1   Aa2b   I[NAG]2[BMA]   5   –   yes    9550      530      5.6    -0.0 
 1   Aa2b   J[NAG]2[BMA]   5   –   yes    9510      510      6.2    -0.0 
 1   Aa2b   K[NAG]2[BMA]   5   –   yes    9350      490      5.9    -0.0 
  
PQS sets 1 to 6 of total 6 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]