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Ligand clusters for UniProt code P06899

Ligand clusters for P06899: Histone H2B type 1-J from Homo sapiens

4 ligand clusters
Cluster 1.
1 ligand type
2 ligands
Cluster 2.
1 ligand type
2 ligands
Cluster 3.
2 ligand types
14 ligands
Cluster 4.
1 ligand type
28 ligands
Representative protein: 5jrgD  
JSmol
 

Structures

PDB   Schematic diagram
5jrgD    
6k1iD    
5y0cD    
5b31D    
5b32D    
 more ...

 

 Cluster 1 contains 1 ligand type

Use checkboxes to select ligands to display in RasMol, Jmol, or download as an SDF file.
Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description


 
1. Ligand: PTD × 2
Pentanedial
PDB codes: 6t90(D), 6yov(D).

 

 Cluster 2 contains 1 ligand type

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description


 
1. Ligand: PTD × 2
Pentanedial
PDB codes: 6t90(D), 6yov(D).

 

 Cluster 3 contains 2 ligand types

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description

_Mn
 
1. Metal: _MN × 13
PDB codes: 3a6n(D), 3afa(D), 3ayw(D), 3aze(D), 3azf(D), 3azh(D), 3azj(D), 3azk(D), 3azn(D), 5b32(D), 6ipu(D), 6k1j(D), 6kvd(D).

_Mg
 
2. Metal: _MG × 1
PDB code: 6iq4(D).

 

 Cluster 4 contains 1 ligand type

Selection shortcuts: select all/none invert selection.
Ligand Description

_Cl
 
1. Metal: _CL × 28
PDB codes: 3a6n(D), 3afa(D), 3ayw(D), 3aze(D), 3azf(D), 3azg(D), 3azh(D), 3azi(D), 3azj(D), 3azk(D), 3azl(D), 3azm(D), 3azn(D), 5b0y(D), 5b0z(D), 5b31(D), 5b32(D), 5jrg(D), 5x7x(D), 5y0c(D), 5y0d(D), 5zbx(D), 6ipu(D), 6jr0(D), 6jr1(D), 6k1i(D), 6k1k(D), 6kvd(D).

 

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