Ligand clusters for UniProt code P00430

Ligand clusters for P00430: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial from Bos taurus

		Top 6 (of 11) ligand clusters Cluster 1. 4 ligand types 54 ligands Cluster 2. 4 ligand types 4 ligands Cluster 3. 1 ligand type 11 ligands Cluster 4. 1 ligand type 1 ligand Cluster 5. 3 ligand types 9 ligands Cluster 6. 1 ligand type 9 ligands
Representative protein: 1v54L

Structures

PDB		Schematic diagram
1v54L
5wauL
3ag2L
6nmpL
5iy5L
		more ...

Cluster 1 contains 4 ligand types

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Ligand		Description
		1. Ligand: TGL × 43 Tristearoylglycerol PDB codes: 1v54(L), 1v55(L), 2dyr(L), 2dys(L), 2eij(L), 2eik(L), 2eil(L), 2eim(L), 2ein(L), 2zxw(L), 3abk(L), 3abl(L), 3abm(L), 3ag1(L), 3ag2(L), 3ag3(L), 3ag4(L), 3asn(L), 3aso(L), 3wg7(L), 3x2q(L), 5b1a(L), 5b1b(L), 5b3s(L), 5iy5(L), 5w97(L), 5wau(L), 5x19(L), 5x1b(L), 5x1f(L), 5xdq(L), 5xdx(L), 5z84(L), 5z85(L), 5z86(L), 5zco(L), 5zcp(L), 5zcq(L), 6j8m(L), 6juw(L), 6nkn(L), 6nmf(L), 6nmp(L).
		2. Ligand: EDO × 5 1,2-Ethanediol PDB codes: 5x1f(L), 5xdq(L), 5z84(L), 6juw(L),
		3. Ligand: CDL × 3 Cardiolipin PDB codes: 6jy3(L), 6jy4(L), 7coh(L).
		4. Ligand: DMU × 3 Decyl-Beta-D-Maltopyranoside PDB codes: 5z84(L), 5zcq(L), 6juw(L).

Cluster 2 contains 4 ligand types

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Ligand		Description
		1. Ligand: CHD × 1 cholic acid Cholic acid PDB code: 6juw(L).
		2. Ligand: DMU × 1 Decyl-Beta-D-Maltopyranoside PDB code: 7coh(L).
		3. Ligand: EDO × 1 1,2-Ethanediol PDB code: 5xdq(L).
		4. Ligand: UNL × 1 Unknown ligand PDB code: 5iy5(L).

Cluster 3 contains 1 ligand type

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Ligand		Description
		1. Ligand: DMU × 11 Decyl-Beta-D-Maltopyranoside PDB codes: 2eim(L), 2zxw(L), 3abl(L), 3ag2(L), 3asn(L), 5x19(L), 5xdq(L), 5xdx(L), 5z85(L), 5z86(L), 5zcp(L).

Cluster 4 contains 1 ligand type

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Ligand		Description
		1. Ligand: CQX × 1 (2s,3s,4s,5s,6r)-2-(2-Decoxyethoxy)-6-(Hydroxymethyl) oxane-3,4,5-Triol PDB code: 6jy3(L).

Cluster 5 contains 3 ligand types

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Ligand		Description
_Zn		1. Metal: _ZN × 1 PDB code: 2eim(L).
		2. Ligand: EDO × 7 1,2-Ethanediol PDB codes: 5x19(L), 5x1b(L), 5x1f(L), 5xdq(L), 5zco(L), 5zcp(L), 5zcq(L).
_Cd		3. Metal: _CD × 1 PDB code: 2eik(L).

Cluster 6 contains 1 ligand type

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Ligand		Description
		1. Ligand: EDO × 9 1,2-Ethanediol PDB codes: 5b3s(L), 5xdq(L), 5z84(L), 5z85(L), 5z86(L), 5zco(L), 5zcp(L), 5zcq(L), 6juw(L).