Ligand clusters for UniProt code P00423

Ligand clusters for P00423: Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial from Bos taurus

		Top 6 (of 17) ligand clusters Cluster 1. 3 ligand types 48 ligands Cluster 2. 3 ligand types 46 ligands Cluster 3. 2 ligand types 49 ligands Cluster 4. 2 ligand types 2 ligands Cluster 5. 1 ligand type 7 ligands Cluster 6. 1 ligand type 1 ligand
Representative protein: 1v54D

Structures

PDB		Schematic diagram
1v54D
5x1bD
2dysD
5xdxD
5zcoD
		more ...

Cluster 1 contains 3 ligand types

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Ligand		Description
		1. Ligand: PGV × 43 (1r)-2-{[{[(2s)-2,3-Dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy) phosphoryl]oxy}-1- [(Palmitoyloxy)methyl]ethyl (11e)- Octadec-11-Enoate PDB codes: 1v54(D), 1v55(D), 2dyr(D), 2dys(D), 2eij(D), 2eik(D), 2eil(D), 2eim(D), 2ein(D), 2zxw(D), 3abk(D), 3abl(D), 3abm(D), 3ag1(D), 3ag2(D), 3ag3(D), 3ag4(D), 3asn(D), 3aso(D), 3wg7(D), 3x2q(D), 5b1a(D), 5b1b(D), 5b3s(D), 5iy5(D), 5w97(D), 5wau(D), 5x19(D), 5x1b(D), 5x1f(D), 5xdq(D), 5xdx(D), 5z84(D), 5z85(D), 5z86(D), 5zco(D), 5zcp(D), 5zcq(D), 6j8m(D), 6juw(D), 6nkn(D), 6nmf(D), 6nmp(D).
		2. Ligand: CQX × 3 (2s,3s,4s,5s,6r)-2-(2-Decoxyethoxy)-6-(Hydroxymethyl) oxane-3,4,5-Triol PDB codes: 6jy3(D), 6jy4(D),
		3. Ligand: DMU × 2 Decyl-Beta-D-Maltopyranoside PDB codes: 6juw(D), 7coh(D).

Cluster 2 contains 3 ligand types

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Ligand		Description
		1. Ligand: TGL × 43 Tristearoylglycerol PDB codes: 1v54(D), 1v55(D), 2dyr(D), 2dys(D), 2eij(D), 2eik(D), 2eil(D), 2eim(D), 2ein(D), 2zxw(D), 3abk(D), 3abl(D), 3abm(D), 3ag1(D), 3ag2(D), 3ag3(D), 3ag4(D), 3asn(D), 3aso(D), 3wg7(D), 3x2q(D), 5b1a(D), 5b1b(D), 5b3s(D), 5iy5(D), 5w97(D), 5wau(D), 5x19(D), 5x1b(D), 5x1f(D), 5xdq(D), 5xdx(D), 5z84(D), 5z85(D), 5z86(D), 5zco(D), 5zcp(D), 5zcq(D), 6j8m(D), 6juw(D), 6nkn(D), 6nmf(D), 6nmp(D).
		2. Ligand: DMU × 2 Decyl-Beta-D-Maltopyranoside PDB codes: 6juw(D), 7coh(D).
		3. Ligand: EDO × 1 1,2-Ethanediol PDB code: 5b3s(D).

Cluster 3 contains 2 ligand types

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Ligand		Description
		1. Ligand: DMU × 46 Decyl-Beta-D-Maltopyranoside PDB codes: 1v54(D), 1v55(D), 2dyr(D), 2dys(D), 2eij(D), 2eik(D), 2eil(D), 2eim(D), 2ein(D), 2y69(D), 2zxw(D), 3abk(D), 3abl(D), 3abm(D), 3ag1(D), 3ag2(D), 3ag3(D), 3ag4(D), 3asn(D), 3aso(D), 3wg7(D), 3x2q(D), 5b1a(D), 5b1b(D), 5b3s(D), 5iy5(D), 5w97(D), 5wau(D), 5x19(D), 5x1b(D), 5x1f(D), 5xdq(D), 5xdx(D), 5z84(D), 5z85(D), 5z86(D), 5zco(D), 5zcp(D), 5zcq(D), 6j8m(D), 6juw(D), 6nkn(D), 6nmf(D), 6nmp(D), 7coh(D).
		2. Ligand: EDO × 3 1,2-Ethanediol PDB codes: 5z84(D), 5zco(D), 5zcp(D).

Cluster 4 contains 2 ligand types

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Ligand		Description
		1. Ligand: EDO × 1 1,2-Ethanediol PDB code: 6juw(D).
		2. Ligand: FME × 1 N-Formylmethionine PDB code: 5wau(D).

Cluster 5 contains 1 ligand type

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Ligand		Description
		1. Ligand: EDO × 7 1,2-Ethanediol PDB codes: 5b3s(D), 5xdq(D), 5xdx(D), 5z86(D), 5zcq(D).

Cluster 6 contains 1 ligand type

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Ligand		Description
		1. Ligand: EDO × 1 1,2-Ethanediol PDB code: 5b3s(D).