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PDBsum entry 8f4j
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Pore analysis for: 8f4j calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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8f4j
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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21 pores,
coloured by radius |
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30 pores,
coloured by radius
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30 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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3.85 |
4.58 |
43.2 |
2.18 |
0.91 |
4.1 |
76 |
|
2 |
0 |
1 |
13 |
7 |
0 |
0 |
|
CLA 602 B CLA 603 B CLA 608 B CLA 609 B CLA 610 B
LMG 621 B CLA 404 D LMG 409 D BCR 101 H
|
 |
|
2 |
 |
1.48 |
1.48 |
44.1 |
0.49 |
0.40 |
12.0 |
82 |
5 |
1 |
3 |
10 |
2 |
0 |
0 |
CLA 501 c CLA 502 c CLA 503 c CLA 507 c CLA 509 c
CLA 512 c CLA 513 c
|
|
3 |
 |
1.49 |
1.51 |
50.7 |
0.07 |
0.21 |
8.9 |
81 |
6 |
1 |
3 |
11 |
2 |
0 |
0 |
CLA 508 c CLA 509 c CLA 510 c CLA 511 c BCR 102 k
|
|
4 |
 |
1.35 |
1.66 |
57.5 |
-0.03 |
0.35 |
13.8 |
83 |
7 |
1 |
2 |
14 |
2 |
0 |
0 |
CLA 501 c CLA 502 c CLA 503 c CLA 507 c CLA 508 c
CLA 509 c CLA 510 c CLA 511 c CLA 512 c CLA 513 c
BCR 102 k
|
|
5 |
 |
2.68 |
2.68 |
59.6 |
-0.09 |
0.48 |
14.3 |
75 |
5 |
2 |
3 |
11 |
6 |
1 |
0 |
CLA 502 c CLA 504 c CLA 508 c CLA 509 c CLA 510 c
DGD 517 c DGD 518 c LMG 519 c STE 101 j
|
|
6 |
 |
3.96 |
4.98 |
61.2 |
0.11 |
0.66 |
14.6 |
78 |
7 |
2 |
2 |
12 |
5 |
1 |
0 |
CLA 501 c CLA 502 c CLA 503 c CLA 504 c CLA 508 c
CLA 509 c CLA 510 c CLA 512 c CLA 513 c DGD 517 c
DGD 518 c LMG 519 c STE 101 j
|
|
7 |
 |
1.72 |
1.91 |
67.9 |
0.02 |
0.40 |
10.8 |
76 |
6 |
2 |
3 |
14 |
6 |
1 |
0 |
CLA 502 c CLA 504 c CLA 508 c CLA 509 c CLA 510 c
CLA 511 c DGD 517 c DGD 518 c LMG 519 c STE 101 j
BCR 102 k
|
|
8 |
 |
1.86 |
2.90 |
85.7 |
2.38 |
0.85 |
2.7 |
70 |
1 |
0 |
0 |
20 |
9 |
1 |
1 |
CLA 607 A PL9 611 A CLA 608 B CLA 609 B LMG 621 B
DGD 517 C PHO 402 D CLA 403 D CLA 404 D BCR 405 D
LMG 407 D LMG 409 D LHG 101 E SQD 102 F STE 101 X
|
|
9 |
 |
2.01 |
2.55 |
109.6 |
1.10 |
0.66 |
7.4 |
74 |
5 |
1 |
3 |
19 |
12 |
2 |
0 |
CLA 608 a PL9 612 a CLA 504 c CLA 508 c DGD 517 c
DGD 518 c LMG 519 c PHO 401 d CLA 402 d BCR 404 d
LMG 409 d LHG 102 e SQD 101 f STE 101 j
|
|
10 |
 |
1.25 |
1.36 |
110.7 |
-1.93 |
-0.63 |
23.2 |
80 |
4 |
15 |
4 |
6 |
2 |
5 |
0 |
FME 1 m STE 102 t
|
|
11 |
 |
2.88 |
2.94 |
128.2 |
0.10 |
0.19 |
14.8 |
77 |
9 |
8 |
1 |
19 |
8 |
2 |
1 |
FME 1 M FME 1 T LHG 614 a CLA 601 b CLA 602 b CLA
603 b CLA 604 b CLA 605 b CLA 606 b CLA 608 b CLA
609 b CLA 610 b CLA 611 b CLA 612 b CLA 613 b BCR
616 b BCR 617 b STE 620 b STE 624 b CLA 101 h BCR
102 h LHG 101 l LMG 101 m
|
|
12 |
|
3.11 |
4.01 |
129.6 |
-0.21 |
0.11 |
13.9 |
75 |
7 |
7 |
3 |
19 |
10 |
2 |
1 |
CLA 602 B CLA 603 B CLA 604 B CLA 605 B CLA 606 B
CLA 607 B CLA 609 B CLA 610 B CLA 611 B CLA 612 B
CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B BCR 618 B LHG 622 B
BCR 101 H LHG 101 L LMG 101 M STE 104 t
|
|
13 |
|
1.26 |
1.35 |
130.6 |
-0.14 |
0.08 |
14.3 |
76 |
8 |
6 |
3 |
24 |
11 |
4 |
1 |
CLA 602 B CLA 603 B CLA 604 B CLA 605 B CLA 606 B
CLA 607 B CLA 609 B CLA 610 B CLA 611 B CLA 612 B
CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B BCR 618 B LHG 622 B
BCR 101 H LHG 101 L LMG 101 M FME 1 m FME 1 t BCR
101 t STE 102 t STE 104 t
|
|
14 |
|
1.28 |
1.28 |
141.0 |
0.52 |
0.28 |
11.0 |
75 |
7 |
6 |
3 |
27 |
9 |
5 |
1 |
CLA 610 a BCR 611 a DGD 617 a CLA 501 c CLA 502 c
CLA 503 c CLA 505 c CLA 506 c CLA 507 c CLA 509 c
BCR 515 c DGD 516 c LMG 522 c
|
|
15 |
|
1.26 |
1.34 |
153.9 |
-0.45 |
-0.02 |
13.7 |
77 |
9 |
8 |
6 |
21 |
11 |
5 |
1 |
LHG 614 a CLA 601 b CLA 602 b CLA 603 b CLA 604 b
CLA 605 b CLA 606 b CLA 608 b CLA 609 b CLA 610 b
CLA 611 b CLA 612 b CLA 613 b BCR 616 b BCR 617 b
STE 620 b STE 624 b CLA 101 h BCR 102 h LHG 101 l
FME 1 m LMG 101 m STE 102 t STE 104 t
|
|
16 |
|
1.29 |
1.35 |
157.5 |
0.70 |
0.33 |
9.7 |
76 |
5 |
6 |
5 |
35 |
16 |
6 |
0 |
CLA 606 A CLA 607 A PHO 608 A CLA 612 A CLA 604 B
CLA 607 B CLA 611 B CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B
BCR 618 B LHG 622 B CLA 403 D PL9 406 D LHG 408 D
LHG 101 L LMG 101 M FME 1 m FME 1 t BCR 101 t STE
102 t STE 104 t
|
|
17 |
|
2.81 |
5.42 |
158.0 |
0.98 |
0.42 |
9.6 |
78 |
6 |
8 |
5 |
30 |
13 |
3 |
0 |
CLA 606 A CLA 607 A PHO 608 A CLA 612 A SQD 616 A
DGD 617 A CLA 403 D PL9 406 D LHG 408 D LHG 101 L
FME 1 M FME 1 T BCR 101 T CLA 606 b CLA 613 b BCR
616 b BCR 617 b SQD 619 b STE 620 b STE 624 b STE
625 b LMG 101 m
|
|
18 |
|
2.01 |
2.64 |
162.0 |
1.67 |
0.84 |
3.9 |
72 |
5 |
0 |
2 |
35 |
20 |
2 |
0 |
CLA 608 a PL9 612 a CLA 601 b CLA 602 b CLA 607 b
CLA 608 b CLA 609 b STE 623 b CLA 504 c CLA 508 c
DGD 517 c DGD 518 c LMG 519 c PHO 401 d CLA 402 d
CLA 403 d BCR 404 d LMG 409 d STE 410 d LHG 102 e
SQD 101 f CLA 101 h BCR 102 h STE 101 j STE 101 x
|
|
19 |
|
2.18 |
4.40 |
167.9 |
0.46 |
0.26 |
12.8 |
76 |
6 |
11 |
3 |
27 |
8 |
2 |
1 |
CLA 610 a BCR 611 a DGD 617 a CLA 501 c CLA 502 c
CLA 503 c CLA 505 c CLA 506 c CLA 507 c CLA 509 c
BCR 515 c DGD 516 c LMG 522 c FME 1 m STE 102 t
|
|
20 |
|
2.15 |
4.36 |
171.5 |
2.09 |
0.80 |
5.7 |
77 |
9 |
0 |
2 |
38 |
16 |
1 |
2 |
CLA 601 B CLA 602 B CLA 603 B CLA 604 B CLA 605 B
CLA 606 B CLA 607 B CLA 609 B CLA 610 B CLA 611 B
CLA 612 B CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B BCR 618 B
LHG 622 B SQD 623 B BCR 101 H STE 103 H LHG 101 L
LMG 101 M CLA 610 a BCR 611 a SQD 616 a DGD 617 a
CLA 501 c CLA 502 c CLA 503 c CLA 505 c CLA 506 c
CLA 507 c CLA 509 c BCR 515 c DGD 516 c LMG 522 c
BCR 101 t STE 102 t STE 103 t
|
|
21 |
|
1.20 |
2.28 |
182.0 |
-0.77 |
-0.05 |
15.2 |
80 |
13 |
6 |
15 |
15 |
15 |
1 |
0 |
CLA 602 B CLA 603 B CLA 608 B CLA 609 B CLA 610 B
LMG 621 B BCR 101 H DGD 102 H
|
|
22 |
|
2.85 |
3.15 |
175.6 |
0.54 |
0.44 |
9.2 |
74 |
12 |
2 |
4 |
34 |
19 |
2 |
2 |
CLA 602 B CLA 603 B CLA 604 B CLA 605 B CLA 606 B
CLA 607 B CLA 609 B CLA 610 B CLA 611 B CLA 612 B
CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B BCR 618 B LHG 622 B
BCR 101 H LHG 101 L LMG 101 M LHG 614 a CLA 601 b
CLA 602 b CLA 603 b CLA 604 b CLA 605 b CLA 606 b
CLA 608 b CLA 609 b CLA 610 b CLA 611 b CLA 612 b
CLA 613 b BCR 616 b BCR 617 b STE 620 b STE 624 b
CLA 101 h BCR 102 h LHG 101 l LMG 101 m STE 104 t
|
|
23 |
|
2.18 |
4.37 |
190.0 |
0.10 |
0.19 |
13.2 |
76 |
12 |
10 |
4 |
33 |
11 |
3 |
0 |
CLA 609 A BCR 610 A LMG 613 A DGD 617 A CLA 501 C
CLA 505 C CLA 506 C CLA 507 C CLA 508 C CLA 509 C
CLA 510 C CLA 511 C CLA 512 C BCR 514 C DGD 515 C
STE 101 I BCR 103 K CLA 605 b STE 625 b
|
|
24 |
|
2.31 |
4.57 |
190.6 |
1.74 |
0.74 |
4.8 |
75 |
9 |
0 |
5 |
40 |
26 |
2 |
1 |
CLA 601 B CLA 602 B CLA 603 B CLA 604 B CLA 605 B
CLA 606 B CLA 607 B CLA 609 B CLA 610 B CLA 611 B
CLA 612 B CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B BCR 618 B
LHG 622 B SQD 623 B BCR 101 H STE 103 H LHG 101 L
LMG 101 M CLA 607 a CLA 608 a PHO 609 a CLA 613 a
SQD 616 a CLA 504 c CLA 508 c DGD 517 c DGD 518 c
LMG 519 c CLA 402 d BCR 404 d PL9 405 d LHG 406 d
LMG 409 d STE 101 j LHG 101 l BCR 101 t STE 102 t
STE 103 t
|
|
25 |
|
2.24 |
4.37 |
196.4 |
1.79 |
0.77 |
5.9 |
76 |
9 |
0 |
4 |
43 |
20 |
1 |
1 |
CLA 602 B CLA 603 B CLA 604 B CLA 605 B CLA 606 B
CLA 607 B CLA 608 B CLA 609 B CLA 610 B CLA 611 B
CLA 612 B CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B BCR 618 B
LMG 621 B LHG 622 B SQD 623 B CLA 404 D LMG 409 D
BCR 101 H LHG 101 L LMG 101 M CLA 610 a BCR 611 a
SQD 616 a DGD 617 a CLA 501 c CLA 505 c CLA 506 c
CLA 507 c CLA 509 c BCR 515 c DGD 516 c LMG 522 c
BCR 101 t STE 102 t STE 103 t
|
|
26 |
|
2.17 |
4.34 |
197.6 |
2.19 |
0.85 |
4.3 |
76 |
8 |
0 |
4 |
49 |
22 |
3 |
1 |
CLA 606 A CLA 607 A PHO 608 A CLA 612 A CLA 604 B
CLA 606 B CLA 607 B CLA 611 B CLA 613 B CLA 614 B
BCR 617 B BCR 618 B LHG 622 B SQD 623 B CLA 403 D
PL9 406 D LHG 408 D LHG 101 L LMG 101 M CLA 610 a
BCR 611 a SQD 616 a DGD 617 a CLA 501 c CLA 502 c
CLA 503 c CLA 505 c CLA 506 c CLA 507 c CLA 509 c
BCR 515 c DGD 516 c LMG 522 c BCR 101 t STE 102 t
STE 103 t
|
|
27 |
|
1.20 |
2.25 |
198.7 |
-0.75 |
-0.12 |
14.2 |
79 |
10 |
8 |
13 |
19 |
13 |
1 |
0 |
CLA 602 B CLA 603 B CLA 608 B CLA 609 B LMG 621 B
CLA 404 D LMG 409 D DGD 102 H
|
|
28 |
|
2.27 |
4.43 |
202.8 |
0.93 |
0.46 |
7.8 |
74 |
8 |
8 |
4 |
35 |
22 |
5 |
0 |
FME 1 M FME 1 T CLA 607 a CLA 608 a PHO 609 a CLA
613 a LHG 614 a CLA 603 b CLA 606 b CLA 610 b CLA
612 b CLA 613 b BCR 616 b BCR 617 b STE 620 b STE
624 b CLA 504 c CLA 508 c DGD 517 c DGD 518 c LMG
519 c CLA 402 d PL9 405 d LHG 406 d LMG 409 d STE
101 j LHG 101 l LMG 101 m
|
|
29 |
|
2.31 |
4.59 |
216.7 |
2.02 |
0.83 |
3.4 |
75 |
8 |
0 |
7 |
51 |
32 |
4 |
0 |
CLA 606 A CLA 607 A PHO 608 A CLA 612 A CLA 604 B
CLA 607 B CLA 611 B CLA 613 B CLA 614 B BCR 617 B
BCR 618 B LHG 622 B SQD 623 B CLA 403 D PL9 406 D
LHG 408 D LHG 101 L LMG 101 M CLA 607 a CLA 608 a
PHO 609 a CLA 613 a SQD 616 a CLA 504 c CLA 508 c
DGD 517 c DGD 518 c LMG 519 c PHO 401 d CLA 402 d
PL9 405 d LHG 406 d LMG 409 d STE 101 j LHG 101 l
BCR 101 t STE 102 t STE 103 t
|
 |
30 |
|
1.64 |
2.40 |
328.1 |
0.86 |
0.42 |
6.8 |
75 |
14 |
7 |
12 |
49 |
32 |
7 |
1 |
CLA 609 A BCR 610 A LMG 613 A DGD 617 A CLA 505 C
CLA 506 C DGD 515 C STE 101 I BCR 101 T CLA 607 a
CLA 608 a PHO 609 a CLA 613 a LHG 614 a CLA 603 b
CLA 605 b CLA 606 b CLA 610 b CLA 612 b CLA 613 b
BCR 616 b BCR 617 b SQD 619 b STE 625 b CLA 504 c
CLA 508 c DGD 517 c DGD 518 c LMG 519 c CLA 402 d
PL9 405 d LHG 406 d LMG 409 d STE 101 j LHG 101 l
LMG 101 m
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
|
 |
Residue-type_colouring |
 |
|
|
|
Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
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