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PDBsum entry 5ef5
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Pore analysis for: 5ef5 calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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5ef5
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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12 pores,
coloured by radius |
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12 pores,
coloured by radius
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12 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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1.79 |
1.79 |
50.4 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
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0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
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UNK 13 E UNK 14 E UNK 19 E UNK 22 E UNK 1532 E
UNK 4553 E UNK 4556 E UNK 4558 E UNK 4560 E UNK
4568 E UNK 4570 E UNK 4582 E UNK 4583 E UNK 4602
E UNK 4603 E UNK 4604 E UNK 4606 E UNK 4618 E UNK
4619 E UNK 4620 E UNK 4621 E UNK 4622 E UNK 4626
E UNK 4627 E UNK 4628 E UNK 4629 E UNK 4630 E
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2 |
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1.94 |
1.94 |
61.4 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 126 A UNK 128 A UNK 143 A UNK 144 A UNK 148 A
UNK 158 A UNK 161 A UNK 162 A UNK 163 A UNK 164 A
UNK 165 A UNK 166 A UNK 168 A UNK 177 A UNK 178 A
UNK 253 A UNK 257 A UNK 260 A UNK 264 A UNK 268 A
UNK 271 A UNK 272 A UNK 273 A UNK 277 A UNK 280 A
UNK 283 A UNK 284 A UNK 304 A UNK 306 A UNK 374 A
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3 |
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1.45 |
1.45 |
74.8 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 4549 E UNK 4550 E UNK 4551 E UNK 4552 E UNK
4553 E UNK 4555 E UNK 4556 E UNK 4560 E UNK 4593
E UNK 4594 E UNK 4595 E UNK 4597 E UNK 4602 E UNK
4604 E UNK 4606 E UNK 4621 E UNK 4622 E UNK 4682
E UNK 4726 E UNK 4727 E UNK 4728 E UNK 4729 E UNK
4730 E UNK 4746 E UNK 4747 E UNK 4767 E UNK 4768
E UNK 4770 E UNK 4771 E UNK 4772 E UNK 4773 E UNK
4774 E UNK 4775 E UNK 4825 E
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4 |
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1.48 |
1.48 |
87.3 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 12 E UNK 13 E UNK 14 E UNK 19 E UNK 4549 E
UNK 4550 E UNK 4593 E UNK 4594 E UNK 4595 E UNK
4596 E UNK 4597 E UNK 4598 E UNK 4603 E UNK 4605
E UNK 4617 E UNK 4618 E UNK 4619 E UNK 4620 E UNK
4626 E UNK 4630 E UNK 4631 E UNK 4643 E UNK 4645
E UNK 4664 E UNK 4682 E UNK 4684 E UNK 4688 E UNK
4726 E UNK 4727 E UNK 4728 E UNK 4729 E UNK 4730
E UNK 4732 E UNK 4733 E UNK 4735 E UNK 4746 E UNK
4747 E UNK 4767 E UNK 4768 E UNK 4770 E UNK 4771
E UNK 4772 E UNK 4773 E UNK 4774 E UNK 4775 E UNK
4776 E UNK 4778 E
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5 |
 |
1.90 |
1.90 |
100.7 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 80 A UNK 81 A UNK 208 A UNK 212 A UNK 215 A
UNK 219 A UNK 239 A UNK 249 A UNK 252 A UNK 253 A
UNK 273 A UNK 277 A UNK 281 A UNK 284 A UNK 288 A
UNK 291 A UNK 295 A UNK 310 A UNK 311 A UNK 315 A
UNK 318 A UNK 374 A UNK 35 E UNK 36 E UNK 37 E
UNK 38 E UNK 40 E UNK 45 E UNK 47 E UNK 49 E UNK
80 E UNK 82 E UNK 86 E UNK 90 E UNK 94 E UNK 97 E
UNK 101 E UNK 103 E UNK 104 E UNK 107 E UNK 117 E
UNK 118 E UNK 119 E UNK 120 E UNK 121 E UNK 126 E
UNK 127 E UNK 128 E UNK 129 E UNK 131 E UNK 160 E
|
|
6 |
 |
2.49 |
2.49 |
151.6 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 9 A UNK 10 A UNK 11 A UNK 14 A UNK 15 A UNK
16 A UNK 239 A UNK 241 A UNK 247 A UNK 250 A UNK
253 A UNK 273 A UNK 277 A UNK 340 A UNK 341 A UNK
344 A UNK 345 A UNK 349 A UNK 352 A UNK 374 A UNK
377 A UNK 378 A UNK 380 A UNK 381 A UNK 384 A UNK
387 A UNK 388 A UNK 390 A UNK 391 A UNK 394 A UNK
410 A UNK 429 A UNK 468 A UNK 469 A UNK 470 A UNK
471 A UNK 472 A UNK 474 A UNK 478 A UNK 516 A UNK
517 A UNK 557 A UNK 559 A UNK 3024 A UNK 3025 A
UNK 3029 A UNK 4539 A UNK 4540 A UNK 4541 A UNK
4542 A UNK 4545 A UNK 4546 A UNK 4584 A UNK 4585
A UNK 4586 A UNK 4587 A UNK 4592 A UNK 4593 A UNK
4635 A UNK 4657 A UNK 4674 A UNK 4680 A UNK 4722
A UNK 4724 A UNK 4764 A UNK 4766 A UNK 4770 A UNK
4809 A UNK 471 E UNK 475 E UNK 512 E UNK 555 E
UNK 1551 E UNK 1553 E UNK 1555 E
|
|
7 |
 |
1.90 |
1.90 |
171.9 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 80 A UNK 81 A UNK 208 A UNK 212 A UNK 215 A
UNK 219 A UNK 239 A UNK 249 A UNK 252 A UNK 253 A
UNK 273 A UNK 277 A UNK 281 A UNK 284 A UNK 288 A
UNK 291 A UNK 295 A UNK 310 A UNK 311 A UNK 315 A
UNK 318 A UNK 374 A UNK 410 A UNK 12 E UNK 13 E
UNK 14 E UNK 15 E UNK 16 E UNK 17 E UNK 18 E UNK
19 E UNK 20 E UNK 24 E UNK 26 E UNK 27 E UNK 29 E
UNK 30 E UNK 34 E UNK 35 E UNK 36 E UNK 37 E UNK
38 E UNK 40 E UNK 97 E UNK 128 E UNK 160 E UNK
161 E UNK 162 E UNK 251 E UNK 252 E UNK 255 E UNK
256 E UNK 376 E UNK 377 E UNK 378 E UNK 381 E UNK
385 E UNK 496 E UNK 497 E UNK 537 E UNK 538 E UNK
539 E UNK 580 E UNK 3032 E UNK 3035 E UNK 3036 E
UNK 3037 E UNK 3038 E UNK 4603 E UNK 4605 E UNK
4617 E UNK 4618 E UNK 4619 E UNK 4620 E UNK 4630
E UNK 4631 E UNK 4664 E UNK 4665 E
|
|
8 |
 |
1.85 |
1.85 |
172.9 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 126 A UNK 128 A UNK 143 A UNK 144 A UNK 148 A
UNK 158 A UNK 161 A UNK 162 A UNK 163 A UNK 164 A
UNK 165 A UNK 166 A UNK 168 A UNK 177 A UNK 178 A
UNK 265 A UNK 267 A UNK 268 A UNK 271 A UNK 294 A
UNK 299 A UNK 300 A UNK 304 A UNK 305 A UNK 306 A
UNK 307 A UNK 308 A UNK 310 A UNK 311 A UNK 35 E
UNK 36 E UNK 37 E UNK 45 E UNK 47 E UNK 49 E UNK
80 E UNK 86 E UNK 90 E UNK 94 E UNK 95 E UNK 96 E
UNK 97 E UNK 101 E UNK 103 E UNK 104 E UNK 107 E
UNK 117 E UNK 118 E UNK 119 E UNK 120 E UNK 121 E
UNK 126 E UNK 127 E UNK 128 E UNK 129 E UNK 131 E
UNK 160 E
|
|
9 |
 |
1.76 |
1.76 |
178.3 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 12 E UNK 13 E UNK 14 E UNK 15 E UNK 16 E UNK
17 E UNK 18 E UNK 19 E UNK 20 E UNK 24 E UNK 26 E
UNK 27 E UNK 29 E UNK 30 E UNK 34 E UNK 35 E UNK
45 E UNK 47 E UNK 49 E UNK 80 E UNK 82 E UNK 86 E
UNK 90 E UNK 94 E UNK 97 E UNK 101 E UNK 103 E
UNK 104 E UNK 107 E UNK 117 E UNK 118 E UNK 119 E
UNK 120 E UNK 121 E UNK 126 E UNK 127 E UNK 128 E
UNK 129 E UNK 131 E UNK 160 E UNK 161 E UNK 162 E
UNK 251 E UNK 252 E UNK 255 E UNK 256 E UNK 376 E
UNK 377 E UNK 378 E UNK 381 E UNK 385 E UNK 496 E
UNK 497 E UNK 537 E UNK 538 E UNK 539 E UNK 580 E
UNK 3032 E UNK 3035 E UNK 3036 E UNK 3037 E UNK
3038 E UNK 4603 E UNK 4605 E UNK 4617 E UNK 4618
E UNK 4619 E UNK 4620 E UNK 4630 E UNK 4631 E UNK
4664 E UNK 4665 E
|
|
10 |
 |
2.25 |
2.25 |
195.0 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 9 A UNK 10 A UNK 11 A UNK 14 A UNK 15 A UNK
16 A UNK 356 A UNK 390 A UNK 391 A UNK 394 A UNK
429 A UNK 468 A UNK 469 A UNK 470 A UNK 471 A UNK
472 A UNK 474 A UNK 478 A UNK 516 A UNK 517 A UNK
557 A UNK 559 A UNK 3024 A UNK 3025 A UNK 3029 A
UNK 4539 A UNK 4540 A UNK 4541 A UNK 4542 A UNK
4545 A UNK 4546 A UNK 4584 A UNK 4585 A UNK 4586
A UNK 4587 A UNK 4592 A UNK 4593 A UNK 4635 A UNK
4657 A UNK 4674 A UNK 4680 A UNK 4722 A UNK 4724
A UNK 4764 A UNK 4766 A UNK 4770 A UNK 4809 A UNK
12 E UNK 13 E UNK 14 E UNK 15 E UNK 16 E UNK 17 E
UNK 18 E UNK 19 E UNK 461 E UNK 464 E UNK 465 E
UNK 468 E UNK 469 E UNK 496 E UNK 497 E UNK 500 E
UNK 501 E UNK 504 E UNK 511 E UNK 512 E UNK 537 E
UNK 538 E UNK 539 E UNK 549 E UNK 550 E UNK 552 E
UNK 553 E UNK 555 E UNK 580 E UNK 1551 E UNK 1553
E UNK 1555 E UNK 3021 E UNK 3022 E UNK 3024 E UNK
3025 E UNK 3027 E UNK 3028 E UNK 3030 E UNK 3031
E UNK 3033 E UNK 4603 E UNK 4605 E UNK 4617 E UNK
4618 E UNK 4619 E UNK 4620 E UNK 4626 E UNK 4630
E UNK 4631 E UNK 4664 E UNK 4665 E
|
|
11 |
 |
1.71 |
1.71 |
242.5 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 126 A UNK 128 A UNK 143 A UNK 144 A UNK 148 A
UNK 158 A UNK 161 A UNK 162 A UNK 163 A UNK 164 A
UNK 165 A UNK 166 A UNK 168 A UNK 177 A UNK 178 A
UNK 265 A UNK 267 A UNK 268 A UNK 271 A UNK 294 A
UNK 299 A UNK 300 A UNK 304 A UNK 305 A UNK 306 A
UNK 307 A UNK 308 A UNK 310 A UNK 311 A UNK 12 E
UNK 13 E UNK 14 E UNK 15 E UNK 16 E UNK 17 E UNK
18 E UNK 19 E UNK 20 E UNK 24 E UNK 26 E UNK 27 E
UNK 29 E UNK 30 E UNK 34 E UNK 35 E UNK 36 E UNK
37 E UNK 95 E UNK 96 E UNK 97 E UNK 128 E UNK 160
E UNK 161 E UNK 162 E UNK 251 E UNK 252 E UNK 255
E UNK 256 E UNK 376 E UNK 377 E UNK 378 E UNK 381
E UNK 385 E UNK 496 E UNK 497 E UNK 537 E UNK 538
E UNK 539 E UNK 580 E UNK 3032 E UNK 3035 E UNK
3036 E UNK 3037 E UNK 3038 E UNK 4603 E UNK 4605
E UNK 4617 E UNK 4618 E UNK 4619 E UNK 4620 E UNK
4630 E UNK 4631 E UNK 4664 E UNK 4665 E
|
 |
12 |
|
1.69 |
1.69 |
239.7 |
-0.40 |
-0.80 |
3.4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
UNK 9 A UNK 10 A UNK 11 A UNK 14 A UNK 15 A UNK
16 A UNK 26 A UNK 29 A UNK 126 A UNK 128 A UNK
143 A UNK 144 A UNK 148 A UNK 158 A UNK 161 A UNK
162 A UNK 163 A UNK 164 A UNK 165 A UNK 166 A UNK
168 A UNK 177 A UNK 178 A UNK 257 A UNK 260 A UNK
261 A UNK 264 A UNK 266 A UNK 268 A UNK 269 A UNK
271 A UNK 272 A UNK 273 A UNK 304 A UNK 306 A UNK
355 A UNK 356 A UNK 360 A UNK 361 A UNK 362 A UNK
363 A UNK 365 A UNK 369 A UNK 370 A UNK 390 A UNK
391 A UNK 394 A UNK 395 A UNK 396 A UNK 398 A UNK
401 A UNK 402 A UNK 406 A UNK 429 A UNK 470 A UNK
471 A UNK 472 A UNK 474 A UNK 478 A UNK 516 A UNK
517 A UNK 557 A UNK 559 A UNK 3024 A UNK 3025 A
UNK 3028 A UNK 3029 A UNK 3030 A UNK 4539 A UNK
4540 A UNK 4541 A UNK 4542 A UNK 4545 A UNK 4546
A UNK 4584 A UNK 4585 A UNK 4586 A UNK 4587 A UNK
4592 A UNK 4593 A UNK 4635 A UNK 4657 A UNK 4674
A UNK 4680 A UNK 4722 A UNK 4724 A UNK 4764 A UNK
4766 A UNK 4770 A UNK 4809 A UNK 1551 E UNK 1553
E UNK 1555 E
|
|
|
|
|
|
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|
|
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|
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 |
Residue-type_colouring |
 |
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Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program