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PDBsum entry 4hcb
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Pore analysis for: 4hcb calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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4hcb
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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15 pores,
coloured by radius |
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17 pores,
coloured by radius
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17 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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2.78 |
2.78 |
30.1 |
0.51 |
0.03 |
10.0 |
83 |
|
0 |
3 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
|
DA 6 C DA 7 C DA 8 C DA 9 C DA 10 C DA 11 C
|
 |
|
2 |
 |
1.29 |
1.29 |
36.8 |
-0.71 |
-0.37 |
14.0 |
77 |
3 |
1 |
0 |
2 |
2 |
0 |
0 |
DA 4 C DA 5 C DA 6 C DA 7 C DA 8 C DA 9 C DA 10 C
DA 11 C
|
|
3 |
 |
1.29 |
1.29 |
37.1 |
-0.69 |
-0.20 |
16.5 |
73 |
5 |
2 |
0 |
3 |
3 |
0 |
0 |
DA 4 C DA 5 C DA 6 C DA 7 C DA 8 C
|
|
4 |
 |
1.97 |
1.98 |
37.9 |
-1.12 |
-0.50 |
14.8 |
75 |
5 |
0 |
0 |
2 |
1 |
0 |
0 |
DA 4 C DA 5 C DA 6 C DA 7 C DA 8 C DA 9 C DA 10 C
DA 11 C
|
|
5 |
 |
1.90 |
1.90 |
39.5 |
-0.91 |
-0.44 |
13.9 |
77 |
6 |
0 |
1 |
4 |
3 |
0 |
0 |
DA 4 D DA 5 D DA 7 D DA 8 D DA 9 D DA 10 D DA 11 D
|
|
6 |
 |
1.24 |
1.37 |
55.4 |
-0.44 |
0.01 |
15.1 |
76 |
6 |
4 |
2 |
8 |
3 |
0 |
1 |
SO4 503 A DA 9 C DA 10 C DA 11 C
|
|
7 |
 |
1.82 |
2.07 |
55.4 |
-1.40 |
-0.43 |
17.4 |
72 |
7 |
3 |
3 |
3 |
5 |
2 |
0 |
DA 3 D DA 4 D DA 5 D DA 6 D DA 7 D DA 8 D
|
|
8 |
 |
1.84 |
2.07 |
55.9 |
-1.41 |
-0.43 |
16.3 |
76 |
6 |
3 |
4 |
2 |
4 |
2 |
0 |
DA 3 D DA 4 D DA 5 D DA 6 D DA 7 D DA 8 D DA 9 D
DA 10 D DA 11 D
|
|
9 |
 |
1.25 |
1.41 |
55.8 |
-0.52 |
0.02 |
15.4 |
79 |
6 |
4 |
2 |
9 |
2 |
0 |
1 |
SO4 506 B DA 0 C DA 9 D DA 10 D DA 11 D
|
|
10 |
 |
1.25 |
1.36 |
57.3 |
-0.28 |
0.03 |
13.6 |
77 |
5 |
2 |
2 |
7 |
2 |
0 |
1 |
SO4 503 A DA 6 C DA 7 C DA 8 C DA 9 C DA 10 C DA
11 C
|
|
11 |
 |
2.24 |
2.24 |
63.1 |
-2.30 |
-0.65 |
20.0 |
80 |
5 |
7 |
4 |
2 |
1 |
3 |
0 |
SO4 506 B DA 0 C
|
|
12 |
|
1.26 |
1.38 |
65.2 |
-0.76 |
-0.06 |
18.4 |
76 |
9 |
2 |
3 |
10 |
3 |
0 |
1 |
SO4 503 A SO4 504 A DA 8 C
|
|
13 |
|
1.39 |
1.87 |
74.0 |
-1.01 |
-0.29 |
13.4 |
83 |
5 |
4 |
5 |
4 |
3 |
1 |
0 |
GOL 501 B DA 5 D DA 6 D DA 9 D DA 10 D DA 11 D
|
|
14 |
|
1.43 |
1.87 |
81.7 |
-1.02 |
-0.37 |
14.6 |
80 |
10 |
3 |
4 |
6 |
3 |
0 |
0 |
DA 4 D DA 5 D DA 6 D DA 7 D DA 8 D DA 9 D
|
|
15 |
|
1.80 |
1.88 |
83.3 |
-1.22 |
-0.36 |
16.1 |
77 |
7 |
7 |
4 |
4 |
4 |
3 |
0 |
SO4 506 B DA 0 C DA 3 C DA 4 C DA 5 C DA 6 C DA 7
C DA 8 C DA 9 C DA 10 C DA 11 C
|
|
16 |
|
1.21 |
1.39 |
146.2 |
-2.08 |
-0.33 |
26.9 |
80 |
13 |
7 |
5 |
6 |
4 |
3 |
0 |
SO4 505 B DA 0 C
|
 |
17 |
|
1.19 |
1.32 |
188.3 |
-1.44 |
-0.30 |
17.5 |
79 |
13 |
12 |
9 |
11 |
8 |
6 |
0 |
SO4 506 B DA 3 C DA 4 C DA 5 C DA 6 C DA 7 C DA 8
C DA 9 C
|
|
|
|
|
|
|
|
|
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|
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 |
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Residue-type_colouring |
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|
Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program