spacer
spacer

PDBsum entry 3d5d
Go to PDB code: 
Top Page protein dna_rna metals Protein-protein interface(s) pores links
Pore analysis for: 3d5d calculated with MOLE 2.0 PDB id
3d5d
Pores calculated on whole structure Pores calculated excluding ligands
View options
MOLEonline 2.0 manipulation
and
visualization
with HETATM:
without HETATM:
 
30 pores, coloured by radius 30 pores, coloured by radius 30 pores, coloured as in
list below
Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown.
Pores
Free R
Length
HPathy
HPhob
Polar
Rel Mut
Residue..type
Ligands
Radius
1 1.12 1.12 152.2 -0.65 -0.66 7.3 67 4 0 0 2 2 0 0  C 867 A U 913 A C 914 A C 915 A C 2284 A C 2285 A
U 2296 A C 2297 A A 2298 A G 2299 A G 2300 A C
2301 A G 2303 A G 2304 A G 2307 A G 2308 A A 2309
A A 2310 A A 2311 A U 2312 A C 2313 A C 2314 A G
2315 A C 2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319 A A 2320
A G 2321 A A 2322 A G 2323 A C 2324 A G 2325 A C
2326 A A 2327 A A 2328 A G 2329 A G 2330 A G 2331
A U 2332 A G 2384 A C 2386 A U 2387 A G 2389 A U
2390 A MG 3153 A MG 3158 A MG 3230 A MG 3296 A MG
3479 A MG 3499 A MG 3527 A A 13 B G 16 B C 17 B C
60 B
2 1.62 1.62 171.6 -1.39 -0.63 16.3 82 10 6 2 3 1 3 0  G 1017 A U 1033 A G 1034 A U 1035 A G 1037 A C
1038 A G 1042 A C 1043 A A 1050 A G 1051 A U 1081
A U 1082 A U 1083 A A 1085 A A 1086 A C 1102 A A
1103 A C 1104 A U 1105 A U 1113 A G 1114 A G 1115
A C 1116 A G 1117 A U 1142 A G 2525 A G 2526 A A
2530 A G 2532 A U 2656 A A 2657 A C 2658 A G 2659
A A 2665 A C 2666 A C 2667 A G 2668 A G 2735 A G
2736 A G 2737 A A 2750 A C 2752 A A 2753 A A 2758
A G 2759 A C 2760 A G 2761 A G 2762 A G 2763 A MG
3042 A MG 3056 A MG 3496 A
3 1.34 1.38 170.8 -0.68 -0.71 7.4 80 4 1 1 2 0 0 0  G 248 A C 249 A C 376 A C 377 A C 378 A U 387 A G
388 A G 389 A A 390 A G 399 A G 400 A G 1856 A G
1857 A G 1858 A C 1881 A C 1882 A C 2078 A U 2079
A G 2090 A G 2094 A C 2095 A U 2096 A G 2187 A C
2188 A U 2189 A G 2190 A C 2196 A C 2283 A C 2284
A C 2285 A C 2394 A C 2395 A G 2396 A G 2413 A G
2421 A A 2422 A U 2423 A C 2424 A A 2432 A A 2433
A A 2434 A MG 3107 A MG 3151 A
4 1.49 1.49 173.1 -1.04 -0.66 11.8 77 6 3 3 3 2 0 0  C 865 A A 866 A C 867 A C 903 A C 904 A U 905 A G
906 A A 1028 A G 1031 A A 1032 A U 1033 A G 1042
A C 1043 A A 1050 A G 1051 A U 1081 A U 1082 A U
1083 A A 1085 A A 1086 A C 1102 A A 1103 A C 1104
A U 1105 A G 1114 A G 1115 A C 1116 A G 1117 A C
1118 A C 1119 A G 1120 A C 1121 A G 1122 A U 2296
A C 2297 A A 2298 A G 2299 A G 2300 A C 2301 A G
2303 A G 2304 A G 2307 A G 2308 A A 2309 A A 2310
A A 2311 A U 2312 A C 2313 A C 2314 A G 2315 A C
2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319 A A 2320 A A 2750
A C 2752 A A 2753 A MG 3153 A MG 3158 A MG 3479 A
MG 3527 A A 13 B G 16 B C 17 B C 60 B G 69 B G 76
B U 77 B A 78 B G 89 B i:A A 89 B i:B C 91 B G 92
B C 93 B G 100 B A 101 B G 102 B MG 367 B
5 1.22 1.22 178.2 -0.63 -0.73 5.8 74 3 0 1 0 2 0 0  U 703 A G 704 A A 705 A G 728 A C 730 A C 731 A C
732 A G 759 A C 1672 A U 1673 A C 1675 A G 1695 A
G 1696 A G 1697 A G 1699 A C 1765 A U 1766 A C
1942 A U 1944 A U 1955 A U 1956 A C 1979 A G 1980
A A 1981 A C 1982 A C 1983 A G 1984 A G 1985 A C
2461 A U 2462 A C 2463 A U 2491 A U 2492 A C 2520
A C 2521 A U 2522 A G 2523 A G 2525 A G 2526 A U
2528 A A 2530 A G 2532 A A 2533 A A 2534 A G 2535
A G 2536 A U 2537 A C 2538 A U 2552 A G 2553 A U
2554 A U 2555 A C 2556 A G 2557 A G 2567 A C 2568
A G 2569 A G 2582 A A 2602 A U 2604 A U 2605 A C
2606 A G 2607 A U 2656 A A 2657 A C 2658 A G 2659
A A 2665 A C 2666 A MG 3037 A MG 3579 A MG 3617 A
6 1.12 1.12 177.2 -0.82 -0.72 7.6 69 6 1 1 1 1 0 0  A 821 A U 822 A G 823 A A 824 A G 836 A G 947 A G
948 A C 949 A G 950 A C 951 A A 960 A C 961 A U
963 A C 964 A C 965 A G 966 A C 967 A G 968 A U
969 A G 979 A C 985 A G 1003 A G 1025 A U 1026 A
A 1028 A G 1031 A A 1032 A U 1033 A G 1042 A C
1043 A A 1050 A G 1051 A U 1081 A U 1082 A U 1083
A A 1085 A A 1086 A C 1102 A A 1103 A C 1104 A U
1105 A G 1114 A G 1115 A C 1116 A G 1117 A C 1118
A C 1119 A G 1120 A C 1121 A G 1122 A C 1123 A C
1145 A G 2029 A C 2260 A G 2270 A G 2271 A C 2284
A C 2285 A U 2357 A G 2358 A C 2359 A A 2360 A A
2361 A G 2362 A C 2363 A G 2384 A G 2389 A U 2390
A G 2428 A A 2750 A C 2752 A A 2753 A MG 3466 A
MG 3583 A G 86 B G 87 B G 89 B i:A
7 2.82 3.13 192.7 -1.03 -0.69 13.1 79 9 5 1 3 0 3 0  A 14 A G 1017 A U 1033 A G 1034 A U 1035 A G 1037
A C 1038 A G 1042 A C 1043 A A 1050 A G 1051 A U
1081 A U 1082 A U 1083 A A 1085 A A 1086 A C 1102
A A 1103 A C 1104 A U 1105 A U 1113 A G 1114 A G
1115 A C 1116 A G 1117 A U 1142 A G 2625 A C 2626
A G 2627 A A 2632 A G 2633 A G 2634 A C 2635 A U
2636 A U 2637 A G 2638 A A 2639 A G 2736 A G 2737
A A 2738 A A 2750 A C 2752 A A 2753 A A 2758 A G
2759 A C 2760 A C 2768 A C 2769 A G 2770 A C 2771
A C 2772 A C 2773 A C 2774 A A 2775 A A 2776 A C
2804 A G 2805 A G 2807 A G 2812 A A 2813 A C 2827
A C 2888 A C 2889 A G 2891 A MG 3042 A MG 3056 A
MG 3215 A MG 3496 A MG 3585 A MG 3604 A
8 1.21 1.21 200.2 -0.94 -0.64 12.8 79 12 5 1 5 1 2 0  A 14 A G 2525 A G 2526 A A 2530 A G 2532 A G 2625
A C 2626 A G 2627 A A 2632 A G 2633 A G 2634 A C
2635 A U 2636 A U 2637 A G 2638 A A 2639 A U 2656
A A 2657 A C 2658 A G 2659 A A 2665 A C 2666 A C
2667 A G 2668 A G 2735 A G 2736 A G 2737 A A 2738
A G 2759 A C 2760 A G 2761 A G 2762 A G 2763 A C
2768 A C 2769 A G 2770 A C 2771 A C 2772 A C 2773
A C 2774 A A 2775 A A 2776 A C 2804 A G 2805 A G
2807 A G 2812 A A 2813 A C 2827 A C 2888 A C 2889
A G 2891 A MG 3215 A MG 3585 A MG 3604 A
9 1.18 1.18 203.9 -0.51 -0.76 5.4 74 2 1 0 1 0 0 0  C 2078 A U 2079 A G 2246 A G 2253 A C 2254 A G
2255 A C 2258 A C 2283 A C 2284 A C 2285 A G 2421
A A 2422 A U 2423 A C 2424 A A 2426 A A 2432 A A
2433 A A 2434 A A 2435 A G 2436 A U 2437 A C 2461
A U 2462 A C 2463 A U 2491 A U 2492 A U 2493 A G
2494 A C 2520 A C 2521 A U 2522 A G 2523 A G 2525
A U 2528 A A 2530 A A 2531 A G 2532 A A 2533 A A
2534 A G 2535 A G 2536 A U 2537 A C 2538 A U 2555
A C 2556 A G 2557 A G 2567 A C 2568 A G 2569 A C
2594 A A 2600 A C 2601 A A 2602 A G 2603 A MG
3028 A MG 3151 A MG 3310 A MG 3363 A MG 3617 A
10 2.17 2.17 224.9 -0.48 -0.77 4.3 61 1 0 0 0 1 0 0  U 703 A G 704 A A 705 A G 728 A C 730 A C 731 A C
732 A G 759 A G 1022 A U 1023 A A 1027 A A 1028 A
G 1031 A A 1032 A U 1033 A G 1042 A C 1043 A A
1050 A G 1051 A U 1081 A U 1082 A U 1083 A A 1085
A A 1086 A C 1102 A A 1103 A C 1104 A U 1105 A G
1114 A G 1115 A C 1116 A G 1117 A C 1118 A C 1119
A G 1120 A C 1121 A G 1122 A C 1123 A C 1124 A G
1125 A A 1126 A A 1127 A C 1672 A U 1673 A C 1675
A G 1695 A G 1696 A G 1697 A G 1699 A C 1765 A U
1766 A C 1942 A U 1944 A U 1955 A U 1956 A C 1979
A G 1980 A A 1981 A C 1982 A C 1983 A G 1984 A G
1985 A C 2461 A U 2462 A C 2463 A C 2464 A C 2465
A C 2466 A C 2477 A C 2480 A G 2481 A U 2491 A U
2492 A C 2520 A U 2537 A C 2538 A C 2539 A U 2552
A G 2553 A U 2554 A U 2555 A C 2556 A G 2557 A G
2567 A C 2568 A G 2569 A G 2582 A A 2602 A U 2604
A U 2605 A C 2606 A G 2607 A A 2741 A C 2742 A A
2750 A C 2752 A A 2753 A MG 3037 A MG 3579 A MG
3630 A
11 1.68 1.86 219.8 -0.54 -0.63 7.8 77 8 3 3 5 3 1 0  C 40 A G 154 A C 155 A C 184 A U 185 A G 186 A G
187 A G 205 A U 206 A G 219 A G 220 A U 235 A C
236 A C 237 A C 238 A U 239 A A 255 A C 270 A i:V
G 270 A i:U G 382 A U 383 A C 393 A A 394 A U 395
A G 424 A G 425 A C 433 A A 590 A C 591 A G 592 A
G 593 A U 594 A C 595 A G 596 A U 597 A A 608 A A
609 A i:A G 656 A U 657 A C 658 A C 659 A G 660 A
C 936 A U 937 A G 938 A C 2284 A C 2285 A G 2354
A C 2356 A U 2357 A C 2359 A A 2360 A G 2362 A C
2363 A C 2364 A G 2384 A U 2390 A MG 3236 A MG
3506 A
12 2.09 2.27 225.6 -0.48 -0.74 4.7 69 2 1 0 1 1 0 0  U 703 A G 704 A A 705 A G 728 A C 730 A C 731 A C
732 A G 759 A C 1672 A U 1673 A C 1675 A G 1695 A
G 1696 A G 1697 A G 1699 A C 1765 A U 1766 A C
1942 A U 1944 A U 1955 A U 1956 A C 1979 A G 1980
A A 1981 A C 1982 A C 1983 A G 1984 A G 1985 A C
2078 A U 2079 A G 2246 A G 2253 A C 2254 A G 2255
A C 2258 A C 2283 A C 2284 A C 2285 A G 2421 A A
2422 A U 2423 A C 2424 A A 2426 A A 2432 A A 2433
A A 2434 A A 2435 A G 2436 A U 2437 A U 2492 A U
2493 A G 2494 A U 2552 A G 2553 A U 2554 A U 2555
A C 2556 A G 2582 A C 2594 A A 2600 A C 2601 A A
2602 A G 2603 A U 2604 A U 2605 A C 2606 A G 2607
A MG 3028 A MG 3037 A MG 3125 A MG 3151 A MG 3310
A MG 3363 A MG 3579 A
13 1.46 1.50 227.5 -0.58 -0.62 7.0 72 5 2 1 3 2 1 1  A 229 A U 271 A i:D G 271 A G 272 A G 273 A i:A G
273 A i:B C 273 A i:D C 273 A i:E C 273 A i:C U
273 A i:F C 273 A i:G A 276 A A 363 A i:G G 363 A
i:D U 363 A i:F G 363 A i:E G 363 A i:C A 363 A i:
B G 363 A i:A C 404 A U 405 A G 406 A G 407 A C
416 A C 417 A G 418 A C 419 A C 420 A A 633 A C
634 A A 643 A C 2283 A C 2284 A C 2285 A U 2348 A
G 2397 A U 2398 A G 2400 A U 2401 A C 2402 A C
2403 A C 2404 A G 2405 A U 2408 A G 2409 A G 2410
A A 2411 A C 2417 A A 2418 A U 2419 A C 2420 A G
2421 A A 2422 A MG 3021 A MG 3148 A MG 3300 A MG
3329 A MG 3491 A MG 3593 A
14 1.68 1.68 259.5 -0.93 -0.73 8.4 79 7 2 3 0 2 0 0  G 189 A C 678 A C 679 A G 680 A G 776 A A 777 A U
1808 A C 2065 A C 2066 A G 2069 A G 2070 A A 2071
A G 2072 A C 2073 A C 2081 A A 2082 A G 2083 A U
2086 A G 2087 A G 2088 A U 2089 A G 2094 A C 2095
A U 2096 A G 2187 A U 2189 A G 2190 A G 2191 A G
2192 A C 2196 A A 2225 A C 2226 A A 2227 A C 2229
A G 2230 A C 2231 A U 2232 A C 2240 A A 2241 A G
2242 A U 2243 A U 2244 A U 2245 A G 2246 A G 2252
A G 2253 A U 2437 A U 2438 A C 2461 A U 2462 A C
2463 A U 2491 A U 2492 A U 2493 A G 2494 A C 2520
A C 2521 A U 2522 A G 2523 A G 2525 A G 2526 A U
2528 A A 2530 A G 2532 A A 2533 A A 2534 A G 2535
A G 2536 A U 2537 A C 2538 A U 2555 A C 2556 A G
2557 A G 2567 A C 2568 A G 2569 A A 2600 A C 2601
A A 2602 A U 2656 A A 2657 A C 2658 A G 2659 A A
2665 A C 2666 A MG 3045 A MG 3074 A MG 3394 A MG
3549 A MG 3571 A MG 3599 A MG 3605 A MG 3617 A MG
3618 A
15 2.07 2.15 261.9 -0.64 -0.69 6.7 66 5 3 0 1 2 1 0  A 14 A C 2078 A U 2079 A G 2246 A G 2253 A C 2254
A G 2255 A G 2256 A C 2258 A C 2283 A C 2284 A C
2285 A G 2421 A A 2422 A U 2423 A C 2424 A A 2426
A A 2432 A A 2433 A A 2434 A A 2435 A G 2436 A U
2437 A U 2491 A U 2492 A U 2493 A G 2494 A G 2509
A C 2510 A C 2512 A G 2513 A G 2545 A U 2546 A U
2547 A U 2555 A C 2556 A C 2568 A G 2569 A C 2571
A C 2573 A C 2594 A A 2600 A C 2601 A A 2602 A G
2603 A C 2620 A A 2621 A C 2622 A G 2623 A G 2624
A G 2625 A C 2626 A G 2627 A A 2632 A G 2633 A G
2642 A G 2643 A G 2644 A C 2676 A G 2677 A C 2678
A C 2773 A C 2774 A A 2775 A G 2777 A C 2804 A G
2805 A G 2807 A G 2812 A A 2813 A A 2826 A C 2827
A C 2888 A C 2889 A G 2891 A MG 3028 A MG 3058 A
MG 3151 A MG 3310 A MG 3363 A MG 3432 A MG 3526 A
16 1.58 1.58 285.1 -0.61 -0.69 6.8 75 8 1 1 2 2 2 0  G 154 A C 155 A A 182 A C 183 A C 184 A U 185 A G
186 A G 187 A G 205 A U 206 A A 207 A G 219 A G
220 A U 235 A C 236 A C 237 A A 255 A C 270 A i:V
G 270 A i:U G 382 A U 383 A C 393 A A 394 A U 395
A G 424 A G 425 A C 433 A G 668 A A 676 A C 678 A
A 751 A C 790 A C 795 A C 796 A G 798 A G 799 A A
800 A G 801 A A 2058 A A 2059 A A 2062 A C 2063 A
A 2451 A C 2452 A C 2461 A U 2462 A C 2463 A U
2491 A U 2492 A U 2493 A G 2505 A U 2506 A C 2507
A C 2520 A C 2521 A U 2522 A G 2523 A G 2525 A G
2526 A U 2528 A A 2530 A G 2532 A A 2533 A A 2534
A G 2535 A G 2536 A U 2537 A C 2538 A U 2555 A C
2556 A G 2557 A G 2567 A C 2568 A G 2569 A C 2573
A U 2584 A U 2585 A C 2586 A A 2602 A U 2609 A C
2610 A U 2611 A U 2656 A A 2657 A C 2658 A G 2659
A A 2665 A C 2666 A MG 3234 A MG 3378 A MG 3506 A
MG 3617 A
17 2.18 2.14 296.2 -0.75 -0.53 10.8 77 13 1 0 6 2 2 0  G 85 A C 86 A U 90 A A 91 A G 92 A C 93 A G 95 A
G 96 A C 97 A G 98 A U 99 A G 101 A C 455 A C 456
A A 460 A C 461 A C 462 A A 470 A A 471 A A 472 A
G 474 A U 475 A A 479 A A 480 A G 481 A G 508 A C
509 A A 751 A C 790 A G 1259 A U 1312 A U 1323 A
C 1333 A G 1334 A A 1614 A A 1616 A A 2058 A A
2059 A A 2062 A C 2063 A C 2078 A U 2079 A G 2246
A G 2252 A G 2253 A C 2254 A G 2255 A C 2258 A C
2283 A C 2284 A C 2285 A G 2421 A A 2422 A U 2423
A C 2424 A A 2426 A A 2432 A A 2433 A A 2434 A A
2435 A G 2436 A U 2437 A A 2451 A G 2505 A U 2506
A U 2585 A C 2586 A C 2594 A A 2600 A C 2601 A A
2602 A U 2609 A C 2610 A U 2611 A MG 2961 A MG
3028 A MG 3038 A MG 3125 A MG 3151 A MG 3310 A MG
3363 A MG 3432 A MG 3599 A
18 2.80 2.80 286.1 -0.42 -0.73 5.1 81 3 2 1 4 1 1 0  C 40 A G 154 A C 155 A C 184 A U 185 A G 186 A G
187 A G 205 A U 206 A G 219 A G 220 A U 235 A C
236 A C 237 A C 238 A U 239 A A 255 A C 270 A i:V
G 270 A i:U G 382 A U 383 A C 393 A A 394 A U 395
A G 424 A G 425 A C 433 A A 590 A C 591 A G 592 A
G 593 A U 594 A C 595 A G 596 A U 597 A A 608 A A
609 A i:A G 656 A U 657 A C 658 A C 659 A G 660 A
A 821 A U 822 A G 836 A C 837 A U 922 A C 935 A C
936 A U 937 A G 938 A G 947 A G 948 A C 949 A G
950 A C 951 A A 960 A C 961 A U 963 A C 964 A C
965 A G 966 A C 967 A G 968 A U 969 A G 979 A C
985 A G 1003 A G 1025 A U 1026 A A 1028 A G 1031
A A 1032 A U 1033 A G 1042 A C 1043 A A 1050 A G
1051 A U 1081 A U 1082 A U 1083 A A 1085 A A 1086
A C 1102 A A 1103 A C 1104 A U 1105 A G 1114 A G
1115 A C 1116 A G 1117 A C 1118 A C 1119 A G 1120
A C 1121 A G 1122 A C 1123 A C 1145 A G 2029 A G
2270 A U 2357 A C 2359 A A 2750 A C 2752 A A 2753
A MG 3466 A MG 3506 A MG 3583 A G 86 B G 87 B G
89 B i:A
19 2.17 2.13 290.9 -0.42 -0.49 7.2 77 11 0 0 6 2 1 0  G 48 A U 50 A G 51 A A 53 A G 54 A G 55 A A 56 A
C 65 A C 66 A U 67 A G 68 A C 69 A U 108 A G 109
A G 110 A A 111 A U 112 A G 113 A G 145 A G 146 A
U 147 A C 436 A G 438 A G 458 A U 459 A A 460 A C
461 A C 462 A A 470 A A 751 A C 790 A G 1259 A U
1312 A U 1323 A C 1333 A G 1334 A A 1614 A A 1616
A A 2058 A A 2059 A A 2062 A C 2063 A C 2078 A U
2079 A G 2246 A G 2252 A G 2253 A C 2254 A G 2255
A C 2258 A C 2283 A C 2284 A C 2285 A G 2421 A A
2422 A U 2423 A C 2424 A A 2426 A A 2432 A A 2433
A A 2434 A A 2435 A G 2436 A U 2437 A A 2451 A G
2505 A U 2506 A U 2585 A C 2586 A C 2594 A A 2600
A C 2601 A A 2602 A U 2609 A C 2610 A U 2611 A MG
2911 A MG 3028 A MG 3038 A MG 3052 A MG 3125 A MG
3151 A MG 3310 A MG 3363 A MG 3432 A MG 3550 A MG
3599 A
20 1.57 1.57 303.8 -0.73 -0.72 7.7 78 5 3 1 2 3 1 0  C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G 854 A G 855 A C
856 A C 857 A G 859 A C 914 A C 915 A G 916 A A
917 A A 918 A G 919 A G 920 A G 921 A U 922 A G
950 A A 959 A C 961 A C 967 A G 968 A C 985 A C
986 A U 1026 A A 1027 A U 2028 A G 2029 A U 2296
A C 2297 A A 2298 A G 2299 A G 2300 A C 2301 A G
2303 A G 2304 A G 2307 A G 2308 A A 2309 A A 2310
A A 2311 A U 2312 A C 2313 A C 2314 A G 2315 A C
2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319 A A 2320 A G 2331
A U 2332 A U 2457 A G 2458 A A 2459 A U 2460 A C
2461 A U 2462 A C 2463 A C 2464 A C 2480 A G 2481
A G 2482 A G 2485 A G 2486 A G 2487 A A 2488 A C
2520 A C 2521 A U 2522 A G 2523 A G 2525 A G 2526
A U 2528 A A 2530 A G 2532 A A 2533 A A 2534 A G
2535 A G 2536 A U 2537 A C 2538 A U 2656 A A 2657
A C 2658 A G 2659 A A 2665 A C 2666 A MG 2946 A
MG 2950 A MG 3054 A MG 3153 A MG 3158 A MG 3162 A
MG 3219 A MG 3221 A MG 3369 A MG 3470 A MG 3473 A
MG 3479 A MG 3527 A MG 3590 A MG 3617 A MG 3641 A
A 13 B G 16 B C 17 B C 60 B G 82 B G 83 B C 84 B
G 85 B G 86 B G 87 B C 88 B G 89 B i:A MG 761 B
21 2.92 2.92 297.6 -0.74 -0.78 7.5 81 6 3 2 2 1 1 0  C 39 A C 40 A G 48 A U 50 A G 51 A A 53 A G 54 A
G 68 A C 69 A U 108 A G 109 A G 110 A A 111 A U
112 A G 113 A G 145 A G 146 A U 147 A A 181 A A
182 A C 183 A A 207 A C 238 A U 239 A C 433 A C
435 A C 436 A G 438 A C 451 A G 452 A G 458 A A
590 A C 591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G
596 A U 597 A A 608 A A 609 A i:A G 656 A U 657 A
C 658 A C 659 A G 660 A G 668 A G 799 A A 821 A U
822 A G 836 A C 837 A U 922 A C 935 A C 936 A U
937 A G 938 A G 947 A G 948 A C 949 A G 950 A C
951 A A 960 A C 961 A U 963 A C 964 A C 965 A G
966 A C 967 A G 968 A U 969 A G 979 A C 985 A G
1003 A G 1025 A U 1026 A A 1028 A G 1031 A A 1032
A U 1033 A G 1042 A C 1043 A A 1050 A G 1051 A U
1081 A U 1082 A U 1083 A A 1085 A A 1086 A C 1102
A A 1103 A C 1104 A U 1105 A G 1114 A G 1115 A C
1116 A G 1117 A C 1118 A C 1119 A G 1120 A C 1121
A G 1122 A C 1123 A C 1145 A G 2029 A G 2270 A U
2357 A C 2359 A A 2750 A C 2752 A A 2753 A MG
3052 A MG 3466 A MG 3550 A MG 3583 A G 86 B G 87
B G 89 B i:A
22 1.16 1.51 315.1 -0.48 -0.69 6.4 81 7 3 1 8 1 2 0  C 40 A G 154 A C 155 A C 184 A U 185 A G 186 A G
187 A G 205 A U 206 A G 219 A G 220 A U 235 A C
236 A C 237 A C 238 A U 239 A A 255 A C 270 A i:V
G 270 A i:U G 382 A U 383 A C 393 A A 394 A U 395
A G 424 A G 425 A C 433 A A 590 A C 591 A G 592 A
G 593 A U 594 A C 595 A G 596 A U 597 A A 608 A A
609 A i:A G 656 A U 657 A C 658 A C 659 A G 660 A
G 836 A A 849 A C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G
854 A G 855 A C 856 A C 857 A G 859 A C 914 A C
915 A G 916 A A 917 A A 918 A G 919 A G 920 A G
921 A U 922 A C 923 A C 935 A C 936 A U 937 A G
938 A U 2296 A C 2297 A A 2298 A G 2299 A A 2310
A A 2311 A U 2312 A C 2313 A C 2314 A G 2315 A C
2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319 A A 2320 A G 2331
A U 2332 A U 2357 A C 2359 A MG 2946 A MG 2950 A
MG 3162 A MG 3221 A MG 3470 A MG 3473 A MG 3479 A
MG 3506 A MG 3608 A MG 3624 A A 13 B G 16 B C 17
B C 60 B
23 1.56 1.56 319.7 -0.77 -0.72 8.4 79 8 3 0 3 1 3 0  A 14 A C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G 854 A G
855 A C 856 A C 857 A G 859 A C 914 A C 915 A G
916 A A 917 A A 918 A G 919 A G 920 A G 921 A U
922 A G 950 A C 961 A C 967 A G 968 A C 985 A C
986 A G 1022 A U 1023 A U 1026 A A 1027 A A 1127
A A 1128 A A 1129 A U 1133 A C 1135 A G 2027 A U
2028 A G 2029 A U 2296 A C 2297 A A 2298 A G 2299
A G 2300 A C 2301 A G 2303 A G 2304 A G 2307 A G
2308 A A 2309 A A 2310 A A 2311 A U 2312 A C 2313
A C 2314 A G 2315 A C 2316 A C 2317 A G 2318 A G
2319 A A 2320 A G 2331 A U 2332 A U 2457 A G 2489
A A 2541 A G 2625 A C 2626 A G 2627 A A 2632 A G
2633 A G 2634 A C 2635 A U 2636 A U 2637 A G 2638
A A 2639 A G 2736 A G 2737 A A 2738 A U 2739 A A
2740 A C 2767 A C 2768 A C 2769 A G 2770 A C 2771
A C 2772 A C 2773 A C 2774 A A 2775 A A 2776 A C
2804 A G 2805 A G 2807 A G 2812 A A 2813 A C 2827
A C 2888 A C 2889 A G 2891 A MG 2946 A MG 2950 A
MG 3105 A MG 3153 A MG 3158 A MG 3162 A MG 3215 A
MG 3221 A MG 3470 A MG 3473 A MG 3479 A MG 3527 A
MG 3585 A MG 3604 A A 13 B G 16 B C 17 B C 60 B G
82 B G 83 B C 84 B G 85 B G 86 B G 87 B G 89 B i:
A MG 761 B
24 2.56 2.56 321.4 -0.54 -0.78 5.5 85 3 2 1 2 1 0 0  C 40 A C 41 A G 43 A C 238 A U 239 A C 263 A C
264 A A 265 A G 266 A C 267 A G 271 A i:C C 271 A
i:B U 271 A i:D G 272 A G 273 A i:A G 273 A i:B C
273 A i:D C 273 A i:E C 273 A i:C U 273 A i:F C
273 A i:G A 276 A C 280 A G 281 A G 353 A G 354 A
U 362 A G 363 A i:A A 363 A i:B G 363 A i:C G 430
A C 591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G 596 A
U 597 A A 608 A A 609 A i:A G 609 A i:B C 610 A C
611 A G 612 A U 613 A G 656 A U 657 A C 658 A C
659 A G 660 A A 821 A U 822 A G 836 A C 837 A U
922 A C 935 A C 936 A U 937 A G 938 A G 947 A G
948 A C 949 A G 950 A C 951 A A 960 A C 961 A U
963 A C 964 A C 965 A G 966 A C 967 A G 968 A U
969 A G 979 A C 985 A G 1003 A G 1025 A U 1026 A
A 1028 A G 1031 A A 1032 A U 1033 A G 1042 A C
1043 A A 1050 A G 1051 A U 1081 A U 1082 A U 1083
A A 1085 A A 1086 A C 1102 A A 1103 A C 1104 A U
1105 A G 1114 A G 1115 A C 1116 A G 1117 A C 1118
A C 1119 A G 1120 A C 1121 A G 1122 A C 1123 A C
1145 A G 2029 A G 2270 A U 2357 A C 2359 A A 2750
A C 2752 A A 2753 A MG 3021 A MG 3075 A MG 3148 A
MG 3300 A MG 3325 A MG 3371 A MG 3466 A MG 3583 A
G 86 B G 87 B G 89 B i:A
25 1.58 1.58 322.1 -0.77 -0.77 8.2 82 7 4 2 3 2 1 0  C 39 A C 40 A G 48 A U 50 A G 51 A A 53 A G 54 A
G 68 A C 69 A U 108 A G 109 A G 110 A A 111 A U
112 A G 113 A G 145 A G 146 A U 147 A A 181 A A
182 A C 183 A A 207 A C 238 A U 239 A C 433 A C
435 A C 436 A G 438 A C 451 A G 452 A G 458 A A
590 A C 591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G
596 A U 597 A A 608 A A 609 A i:A G 656 A U 657 A
C 658 A C 659 A G 660 A G 668 A G 799 A G 836 A A
849 A C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G 854 A G
855 A C 856 A C 857 A U 858 A G 859 A C 914 A C
915 A G 916 A A 917 A A 918 A G 919 A G 920 A G
921 A U 922 A C 923 A C 935 A C 936 A U 937 A G
938 A U 2296 A C 2297 A A 2298 A G 2299 A G 2300
A C 2301 A G 2303 A G 2304 A G 2307 A G 2308 A A
2309 A A 2310 A A 2311 A U 2312 A C 2313 A C 2314
A G 2315 A C 2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319 A A
2320 A G 2331 A U 2332 A U 2357 A C 2359 A MG
2946 A MG 2950 A MG 3052 A MG 3153 A MG 3158 A MG
3162 A MG 3221 A MG 3470 A MG 3473 A MG 3479 A MG
3527 A MG 3550 A MG 3608 A MG 3624 A A 13 B G 16
B C 17 B C 60 B
26 1.60 1.60 345.9 -0.59 -0.77 6.4 84 4 3 1 3 2 0 0  C 40 A C 41 A G 43 A C 238 A U 239 A C 263 A C
264 A A 265 A G 266 A C 267 A G 271 A i:C C 271 A
i:B U 271 A i:D G 272 A G 273 A i:A G 273 A i:B C
273 A i:D C 273 A i:E C 273 A i:C U 273 A i:F C
273 A i:G A 276 A C 280 A G 281 A G 353 A G 354 A
U 362 A G 363 A i:A A 363 A i:B G 363 A i:C G 430
A C 591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G 596 A
U 597 A A 608 A A 609 A i:A G 609 A i:B C 610 A C
611 A G 612 A U 613 A G 656 A U 657 A C 658 A C
659 A G 660 A G 836 A A 849 A C 850 A U 851 A G
852 A G 853 A G 854 A G 855 A C 856 A C 857 A G
859 A C 914 A C 915 A G 916 A A 917 A A 918 A G
919 A G 920 A G 921 A U 922 A C 923 A C 935 A C
936 A U 937 A G 938 A U 2296 A C 2297 A A 2298 A
G 2299 A G 2300 A C 2301 A G 2303 A G 2304 A G
2307 A G 2308 A A 2309 A A 2310 A A 2311 A U 2312
A C 2313 A C 2314 A G 2315 A C 2316 A C 2317 A G
2318 A G 2319 A A 2320 A G 2331 A U 2332 A U 2357
A C 2359 A MG 2946 A MG 2950 A MG 3021 A MG 3075
A MG 3148 A MG 3153 A MG 3158 A MG 3162 A MG 3221
A MG 3300 A MG 3325 A MG 3371 A MG 3470 A MG 3473
A MG 3479 A MG 3527 A MG 3608 A MG 3624 A A 13 B
G 16 B C 17 B C 60 B
27 1.36 1.35 379.1 -0.57 -0.72 5.7 75 5 3 0 4 2 2 0  U 703 A G 704 A A 705 A G 728 A C 730 A C 731 A C
732 A G 759 A C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G
854 A G 855 A C 856 A C 857 A G 859 A C 914 A C
915 A G 916 A A 917 A A 918 A G 919 A G 920 A G
921 A U 922 A G 950 A A 959 A C 961 A C 967 A G
968 A C 985 A C 986 A U 1026 A A 1027 A C 1672 A
U 1673 A C 1675 A G 1695 A G 1696 A G 1697 A G
1699 A C 1765 A U 1766 A C 1942 A U 1944 A U 1955
A U 1956 A C 1979 A G 1980 A A 1981 A C 1982 A C
1983 A G 1984 A G 1985 A U 2028 A G 2029 A U 2296
A C 2297 A A 2298 A G 2299 A A 2310 A A 2311 A U
2312 A C 2313 A C 2314 A G 2315 A C 2316 A C 2317
A G 2318 A G 2319 A A 2320 A G 2331 A U 2332 A U
2457 A G 2458 A A 2459 A U 2460 A C 2461 A U 2462
A C 2463 A C 2464 A C 2465 A C 2480 A G 2481 A G
2482 A G 2485 A G 2486 A G 2487 A A 2488 A U 2491
A U 2492 A C 2520 A U 2537 A C 2538 A U 2552 A G
2553 A U 2554 A U 2555 A C 2556 A G 2557 A G 2567
A C 2568 A G 2569 A G 2582 A A 2602 A U 2604 A U
2605 A C 2606 A G 2607 A MG 2946 A MG 3037 A MG
3054 A MG 3162 A MG 3219 A MG 3221 A MG 3470 A MG
3473 A MG 3479 A MG 3579 A MG 3590 A MG 3630 A MG
3641 A A 13 B G 16 B C 17 B C 60 B G 82 B G 83 B
C 84 B G 85 B G 86 B G 87 B C 88 B G 89 B i:A MG
761 B
28 1.27 3.22 397.4 -0.76 -0.39 13.6 74 17 9 4 25 5 1 0  C 865 A A 866 A C 867 A C 903 A C 904 A U 905 A G
906 A A 1028 A G 1031 A A 1032 A U 1033 A G 1042
A C 1043 A A 1050 A G 1051 A U 1081 A U 1082 A U
1083 A A 1085 A A 1086 A C 1102 A A 1103 A C 1104
A U 1105 A G 1114 A G 1115 A C 1116 A G 1117 A C
1118 A C 1119 A G 1120 A C 1121 A G 1122 A U 2296
A A 2305 A C 2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319 A A
2320 A A 2750 A C 2752 A A 2753 A MG 3496 A A 13
B G 16 B C 17 B C 31 B C 32 B G 33 B U 34 B U 35
B A 45 B A 46 B A 58 B A 59 B C 60 B G 69 B G 76
B U 77 B A 78 B A 89 B i:B G 89 B i:A C 91 B G 92
B C 93 B G 100 B A 101 B G 102 B MG 367 B
29 1.38 1.43 477.8 -0.76 -0.53 12.5 75 20 11 3 24 5 2 0  C 34 A G 35 A G 36 A C 39 A C 40 A G 54 A U 67 A
G 68 A G 85 A C 86 A G 88 A G 89 A U 90 A A 91 A
G 92 A C 97 A G 98 A U 99 A G 101 A A 181 A A 182
A C 183 A A 207 A C 238 A U 239 A C 433 A C 435 A
C 436 A G 438 A C 451 A G 452 A C 455 A G 458 A A
590 A C 591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G
596 A U 597 A A 608 A A 609 A i:A G 656 A U 657 A
C 658 A C 659 A G 660 A G 668 A G 799 A G 836 A A
849 A C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G 854 A G
855 A C 856 A C 857 A G 859 A C 914 A C 915 A G
916 A A 917 A A 918 A G 919 A G 920 A G 921 A U
922 A C 923 A C 935 A C 936 A U 937 A G 938 A U
2296 A A 2305 A C 2316 A C 2317 A G 2318 A G 2319
A A 2320 A G 2331 A U 2332 A U 2357 A C 2359 A MG
2946 A MG 2950 A MG 2961 A MG 3162 A MG 3221 A MG
3470 A MG 3473 A MG 3502 A MG 3608 A MG 3624 A A
13 B G 16 B C 17 B C 31 B C 32 B G 33 B U 34 B U
35 B A 45 B A 46 B A 58 B A 59 B C 60 B
30 1.36 1.42 512.0 -0.68 -0.51 11.2 76 19 13 3 27 5 4 0  C 40 A C 184 A U 185 A G 186 A G 187 A G 205 A U
206 A G 219 A G 220 A U 235 A C 236 A C 237 A C
238 A U 239 A A 255 A A 270 A i:A G 270 A i:T A
270 A i:B G 370 A A 371 A G 372 A G 382 A U 383 A
C 393 A A 394 A U 395 A G 400 A A 401 A G 424 A G
425 A C 433 A A 590 A C 591 A G 592 A G 593 A U
594 A C 595 A G 596 A U 597 A A 608 A A 609 A i:A
G 656 A U 657 A C 658 A C 659 A G 660 A G 836 A A
849 A C 850 A U 851 A G 852 A G 853 A G 854 A G
855 A C 856 A C 857 A G 859 A C 914 A C 915 A G
916 A A 917 A A 918 A G 919 A G 920 A G 921 A U
922 A C 923 A C 935 A C 936 A U 937 A G 938 A G
2094 A C 2095 A U 2096 A G 2187 A C 2188 A U 2189
A C 2196 A U 2296 A A 2305 A C 2316 A C 2317 A G
2318 A G 2319 A A 2320 A G 2331 A U 2332 A U 2357
A C 2359 A MG 2946 A MG 2950 A MG 3162 A MG 3221
A MG 3470 A MG 3473 A MG 3608 A MG 3624 A A 13 B
G 16 B C 17 B C 31 B C 32 B G 33 B U 34 B U 35 B
A 45 B A 46 B A 58 B A 59 B C 60 B

Residue-type_colouring
Positive Negative Neutral Aliphatic Aromatic Pro & Gly Cysteine
H,K,R D,E S,T,N,Q A,V,L,I,M F,Y,W P,G C

Acknowledgement
Pores were calculated by MOLE 2.0 program version 2.5.13.11.08 and visualized using Pymol 0.97rc.
spacer
spacer