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PDBsum entry 3b6f
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Pore analysis for: 3b6f calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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3b6f
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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30 pores,
coloured by radius |
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30 pores,
coloured by radius
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30 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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2.81 |
2.81 |
27.1 |
-0.30 |
-0.51 |
3.7 |
92 |
|
1 |
0 |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
|
DT -40 I DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -
30 I DT 33 J DC 34 J DC 35 J DA 36 J DA 37 J DA
38 J DT 39 J
|
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|
2 |
 |
1.34 |
1.34 |
27.5 |
-1.09 |
-0.73 |
11.5 |
83 |
3 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DT 46 I DT 47 I DG 48 I DC -49 J DC -48 J DA -
47 J DA -46 J DA -45 J DA -44 J
|
|
3 |
 |
3.66 |
3.69 |
28.3 |
-1.54 |
-0.74 |
17.5 |
87 |
2 |
1 |
2 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DC -14 I DG 61 I DG 62 I DT -66 J DC -65 J DG -
56 J DT 19 J
|
|
4 |
 |
1.56 |
1.56 |
28.6 |
-1.30 |
-0.72 |
14.0 |
83 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DA -
17 I DT 57 I DG 58 I DC 59 I DA 60 I DG 61 I DG
62 I DC -58 J DA -57 J DG -56 J DA -55 J DT -
54 J DA -53 J DT 19 J DT 20 J
|
|
5 |
 |
1.57 |
1.57 |
40.4 |
-1.09 |
-0.50 |
12.9 |
88 |
3 |
0 |
3 |
2 |
0 |
1 |
0 |
DT 57 I DG 58 I DC 59 I DA 60 I DG -56 J DA -
55 J DT -54 J DA -53 J DT 19 J DT 20 J
|
|
6 |
 |
2.95 |
3.25 |
42.4 |
-1.71 |
-0.67 |
18.7 |
82 |
4 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DA 60 I DG 61 I DG 62 I DG 65 I DA 66 I DT 67 I D
A 68 I DT 69 I DC -65 J DC -64 J DA -63 J
|
|
7 |
 |
1.57 |
1.57 |
48.6 |
-1.01 |
-0.61 |
12.2 |
95 |
3 |
0 |
3 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DT 57 I DG 58 I DC 59 I DA 60 I DG 61 I DG 62 I
DT -66 J DC -65 J DG -56 J DA -55 J DT -54 J DA -
53 J
|
|
8 |
 |
1.57 |
1.57 |
63.9 |
-0.78 |
-0.53 |
11.0 |
90 |
2 |
1 |
3 |
4 |
1 |
1 |
0 |
DC -
25 I DT 50 I DT 57 I DG 58 I DC 59 I DA 60 I DG -
56 J DA -55 J DT -54 J DA -53 J
|
|
9 |
 |
1.38 |
1.38 |
66.2 |
-1.83 |
-0.54 |
21.0 |
81 |
7 |
0 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
DG -
35 I DA 37 I DA 38 I DT 39 I DA 40 I DC 41 I DT
46 I DT 47 I DG 48 I DC -49 J DC -48 J DA -
47 J DA -46 J DA -45 J DA -44 J DT -42 J DT -40 J
|
|
10 |
 |
1.37 |
1.37 |
74.5 |
-0.90 |
-0.53 |
12.1 |
86 |
4 |
0 |
2 |
3 |
1 |
1 |
0 |
DC -25 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DT 50 I DT -
54 J DA -53 J DC -49 J DC -48 J DA -47 J DA -
46 J DA -45 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J
|
|
11 |
 |
1.39 |
1.39 |
77.1 |
-1.37 |
-0.69 |
15.0 |
87 |
6 |
0 |
3 |
1 |
0 |
1 |
0 |
DC -25 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DT 50 I DG -
56 J DC -48 J DA -47 J DA -46 J DA -
45 J DT 19 J DT 20 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J
|
|
12 |
|
2.73 |
2.73 |
81.9 |
-1.70 |
-0.44 |
20.2 |
80 |
8 |
1 |
0 |
2 |
2 |
0 |
0 |
DA -45 I DA -44 I DG -43 I DT -42 I DT -40 I DT -
36 I DG -
35 I DA 37 I DA 38 I DT 39 I DA 40 I DC 41 I DA -
44 J DT -42 J DT -40 J DT -
36 J DA 37 J DT 39 J DA 40 J DC 41 J
|
|
13 |
|
2.51 |
2.51 |
87.6 |
-1.59 |
-0.59 |
18.1 |
85 |
8 |
0 |
3 |
2 |
1 |
1 |
0 |
DG -35 I DC -
25 I DA 37 I DA 38 I DT 39 I DA 40 I DC 41 I DT
50 I DG -56 J DA -46 J DA -45 J DA -44 J DT -
42 J DT -
40 J DT 19 J DT 20 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J
|
|
14 |
|
2.97 |
2.98 |
90.2 |
-1.98 |
-0.55 |
23.2 |
81 |
8 |
0 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
DG -35 I DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -
30 I DA 37 I DA 38 I DT 39 I DA 40 I DC 41 I DA -
46 J DA -45 J DA -44 J DT -42 J DT -
40 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J DT 33 J DC 34 J DC
35 J DA 36 J DA 37 J
|
|
15 |
|
1.33 |
1.33 |
89.9 |
-1.35 |
-0.56 |
15.9 |
87 |
7 |
0 |
1 |
2 |
1 |
0 |
0 |
DT -40 I DA -33 I DA -32 I DA -
31 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DC -49 J DC -
48 J DA -47 J DA -46 J DA -
45 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J DA 37 J DA 38 J DT
39 J
|
|
16 |
|
2.50 |
2.51 |
93.6 |
-1.10 |
-0.43 |
15.2 |
84 |
7 |
0 |
2 |
4 |
2 |
1 |
0 |
DG -35 I DC -
25 I DA 37 I DA 38 I DT 39 I DA 40 I DC 41 I DT
50 I DT -54 J DA -53 J DC -52 J DA -46 J DA -
45 J DA -44 J DT -42 J DT -
40 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J
|
|
17 |
|
2.46 |
2.59 |
94.1 |
-1.22 |
-0.60 |
14.2 |
88 |
8 |
0 |
4 |
3 |
1 |
1 |
0 |
DT -40 I DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -
25 I DT 50 I DG -
56 J DT 19 J DT 20 J DA 29 J DG 30 J DA 37 J DA
38 J DT 39 J
|
|
18 |
|
1.84 |
2.02 |
98.7 |
-1.52 |
-0.69 |
17.0 |
85 |
7 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -
30 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DC -52 J DA -
47 J DA -46 J DA -45 J DA -
44 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J DT 33 J DC 34 J DC
35 J DA 36 J DA 37 J
|
|
19 |
|
2.45 |
2.60 |
100.0 |
-0.84 |
-0.45 |
12.2 |
87 |
7 |
0 |
3 |
5 |
2 |
1 |
0 |
DT -40 I DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -
25 I DT 50 I DT -54 J DA -53 J DC -
52 J DA 29 J DG 30 J DA 37 J DA 38 J DT 39 J
|
|
20 |
|
2.44 |
2.64 |
100.2 |
-1.68 |
-0.68 |
18.8 |
86 |
9 |
2 |
4 |
1 |
1 |
0 |
0 |
DG -56 I DA -55 I DA -45 I DT -36 I DG -
35 I DA 37 I DA 38 I DT 39 I DA 40 I DC 41 I DA -
44 J DT -42 J DT -40 J DT -36 J DG -35 J DC -
25 J DA 40 J DC 41 J DT 50 J
|
|
21 |
|
2.25 |
2.91 |
101.1 |
-1.81 |
-0.47 |
19.8 |
84 |
12 |
2 |
10 |
2 |
6 |
1 |
0 |
DG -56 I DA -55 I DC -25 I DT 50 I DG -56 J DC -
25 J DT 19 J DT 20 J DA 29 J DG 30 J DT 50 J
|
|
22 |
|
1.62 |
1.62 |
112.5 |
-1.27 |
-0.71 |
13.8 |
85 |
8 |
1 |
2 |
1 |
0 |
1 |
0 |
DC -
25 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DT 50 I DT 57 I DG
58 I DC 59 I DA 60 I DG -56 J DA -55 J DT -
54 J DA -53 J DA -47 J DA -46 J DA -45 J DA -
44 J DA 29 J DG 30 J DT 31 J
|
|
23 |
|
2.10 |
2.10 |
112.0 |
-1.72 |
-0.64 |
21.2 |
71 |
6 |
1 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DC -5 I DT -4 I DG -3 I DG -2 I DA -
1 I DA 0 I DT 1 I DG 65 I DA 66 I DT 67 I DA 68 I
DT 69 I DT 70 I DG 71 I DA 72 I DT 73 I DA -
73 J DC -65 J DC -64 J DA -63 J DT -4 J DG -
3 J DG -2 J DA -1 J DT 0 J DT 1 J DC 2 J DC 3 J
|
|
24 |
|
1.30 |
1.30 |
112.8 |
-1.56 |
-0.75 |
17.4 |
85 |
12 |
3 |
4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DG -56 I DA -55 I DA -45 I DT -36 I DG -
35 I DA 40 I DC 41 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DC -
49 J DC -48 J DA -47 J DA -46 J DA -45 J DT -
36 J DG -35 J DC -25 J DA 40 J DC 41 J DT 50 J
|
|
25 |
|
1.97 |
2.10 |
115.3 |
-2.17 |
-0.60 |
26.5 |
73 |
7 |
1 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DC -5 I DT -4 I DG -3 I DG -2 I DA -
1 I DA 0 I DT 1 I DG 61 I DG 62 I DT 69 I DT 70 I
DG 71 I DA 72 I DT 73 I DA -73 J DT -66 J DC -
65 J DT -4 J DG -3 J DG -2 J DA -
1 J DT 0 J DT 1 J DC 2 J DC 3 J
|
|
26 |
|
1.56 |
1.56 |
128.8 |
-1.36 |
-0.70 |
15.1 |
87 |
7 |
1 |
2 |
1 |
0 |
1 |
0 |
DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -30 I DC -
25 I DT 50 I DT 57 I DG 58 I DC 59 I DA 60 I DG -
56 J DA -55 J DT -54 J DA -
53 J DA 29 J DG 30 J DT 33 J DC 34 J DC 35 J DA
36 J DA 37 J
|
|
27 |
|
1.91 |
2.15 |
134.1 |
-1.92 |
-0.58 |
20.8 |
85 |
15 |
3 |
9 |
3 |
3 |
1 |
0 |
DG -56 I DA -
55 I DG 65 I DA 66 I DT 67 I DA 68 I DT 69 I DC -
65 J DC -64 J DA -63 J DC -25 J DT 50 J
|
|
28 |
|
1.38 |
1.38 |
173.0 |
-2.08 |
-0.48 |
25.6 |
82 |
20 |
3 |
6 |
7 |
3 |
0 |
0 |
DG -2 I DA -
1 I DA 0 I DT 1 I DT 46 I DT 47 I DG 48 I DC -
49 J DC -48 J DA -47 J DA -46 J DA -45 J DT -
4 J DG -3 J DG -2 J DA -1 J DT 0 J
|
|
29 |
|
2.28 |
2.25 |
174.5 |
-2.03 |
-0.50 |
24.0 |
83 |
17 |
5 |
8 |
8 |
2 |
1 |
0 |
DA -33 I DA -32 I DA -31 I DC -30 I DG -2 I DA -
1 I DA 0 I DT 1 I DT -4 J DG -3 J DG -2 J DA -
1 J DT 0 J DT 33 J DC 34 J DC 35 J DA 36 J DA 37 J
|
 |
30 |
|
1.75 |
2.08 |
179.8 |
-1.31 |
-0.51 |
14.3 |
81 |
8 |
2 |
6 |
6 |
1 |
1 |
0 |
DA -
67 I DC 6 I DT 7 I DG 8 I DA 9 I DA 10 I DC 11 I
DT 19 I DT 20 I DG 21 I DA 22 I DG 65 I DA 66 I
DT 67 I DA 68 I DT 69 I DC -65 J DC -64 J DA -
63 J DA -19 J DA -18 J DA -17 J DG -16 J DG -
15 J DC -14 J DA -13 J DT -12 J DG -11 J DA -
1 J DG 61 J DG 62 J
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
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Residue-type_colouring |
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Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program