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PDBsum entry 3a0b
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Pore analysis for: 3a0b calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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3a0b
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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24 pores,
coloured by radius |
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30 pores,
coloured by radius
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30 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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3.88 |
5.77 |
54.6 |
0.97 |
0.85 |
8.9 |
78 |
|
5 |
0 |
4 |
11 |
4 |
1 |
0 |
|
CLA 1025 C CLA 1026 C CLA 1027 C CLA 1028 C CLA
1033 C CLA 1034 C CLA 1036 C DGD 1056 C DGD 1057 C
|
 |
|
2 |
 |
1.83 |
3.34 |
61.5 |
1.11 |
0.58 |
10.4 |
78 |
4 |
0 |
2 |
12 |
8 |
0 |
0 |
CLA 6025 c CLA 6029 c CLA 6030 c CLA 6031 c CLA
6033 c CLA 6036 c BCR 6054 c
|
|
3 |
 |
3.79 |
5.57 |
84.8 |
0.67 |
0.62 |
15.1 |
73 |
9 |
2 |
2 |
14 |
9 |
2 |
0 |
CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA 1014 B CLA
1015 B CLA 1018 B CLA 1019 B CLA 1020 B CLA 1021
B CLA 1022 B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1045 B BCR
1047 B BCR 1048 B MGE 1060 B MGE 1061 L
|
|
4 |
 |
3.61 |
4.11 |
88.3 |
2.01 |
0.85 |
6.0 |
76 |
6 |
0 |
3 |
22 |
8 |
0 |
0 |
CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA 1014 B CLA
1015 B CLA 1018 B CLA 1019 B CLA 1020 B CLA 1021
B CLA 1022 B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1045 B BCR
1047 B BCR 1048 B MGE 1060 B MGE 1061 L BCR 1046 t
|
|
5 |
 |
2.06 |
2.88 |
90.4 |
1.16 |
0.78 |
8.8 |
75 |
5 |
0 |
2 |
20 |
17 |
2 |
0 |
CLA 6006 a PQ9 6043 a LHG 6063 a CLA 6031 c CLA
6032 c CLA 6033 c CLA 6034 c CLA 6035 c CLA 6036
c DGD 6057 c BCR 6050 d MGE 6059 d BCR 6051 k
|
|
6 |
 |
1.76 |
3.30 |
94.4 |
2.43 |
1.02 |
3.5 |
73 |
2 |
0 |
1 |
22 |
9 |
3 |
0 |
BCR 1047 B BCR 1048 B CLA 6007 a BCR 6044 a CLA
6025 c CLA 6029 c CLA 6030 c CLA 6031 c BCR 6054
c DGD 6055 c BCR 1046 t
|
|
7 |
 |
1.73 |
3.50 |
102.2 |
1.59 |
0.78 |
5.8 |
75 |
5 |
0 |
2 |
26 |
15 |
2 |
0 |
CLA 6006 a PQ9 6043 a LHG 6063 a CLA 6025 c CLA
6029 c CLA 6030 c CLA 6031 c CLA 6032 c CLA 6033
c CLA 6034 c CLA 6035 c CLA 6036 c BCR 6054 c DGD
6057 c BCR 6050 d MGE 6059 d BCR 6051 k
|
|
8 |
 |
2.78 |
5.04 |
115.4 |
2.18 |
0.91 |
3.6 |
75 |
4 |
0 |
2 |
40 |
19 |
4 |
0 |
CLA 1024 B BCR 1048 B CLA 6003 a CLA 6006 a PHO
6039 a PQ9 6043 a DGD 6057 c CLA 6004 d CLA 6005
d PHO 6038 d PQ9 6042 d BCR 6050 d MGE 6059 d MGE
6061 d MGE 6062 d BCR 1046 t
|
|
9 |
 |
2.75 |
3.02 |
119.7 |
1.72 |
0.71 |
4.2 |
76 |
5 |
1 |
5 |
37 |
21 |
5 |
0 |
CLA 6003 a CLA 6006 a PHO 6039 a PQ9 6043 a DGD
6057 c CLA 6004 d CLA 6005 d PHO 6038 d PQ9 6042
d BCR 6050 d MGE 6059 d MGE 6061 d MGE 6062 d
|
|
10 |
 |
1.70 |
1.98 |
124.9 |
0.16 |
0.31 |
13.9 |
77 |
8 |
3 |
5 |
11 |
11 |
1 |
0 |
LHG 1063 A CLA 1028 C CLA 1032 C CLA 1033 C CLA
1034 C CLA 1035 C DGD 1056 C DGD 1057 C
|
|
11 |
 |
2.45 |
3.15 |
128.6 |
1.60 |
0.62 |
6.0 |
74 |
5 |
0 |
1 |
27 |
13 |
1 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1016 B CLA 1018 B CLA 1020 B CLA 1023 B CLA 1024
B BCR 1048 B CLA 1008 D BCR 1050 D HEM 1040 E CLA
1017 H BCR 1049 H UNK 11 N UNK 14 N UNK 15 N
|
|
12 |
|
1.75 |
3.31 |
130.0 |
1.26 |
0.66 |
7.9 |
75 |
5 |
2 |
3 |
23 |
11 |
5 |
1 |
CLA 1021 B CLA 1022 B BCR 1045 B BCR 1047 B MGE
1061 L CLA 6007 a BCR 6044 a CLA 6025 c CLA 6029
c CLA 6030 c CLA 6031 c BCR 6054 c DGD 6055 c BCR
1046 t
|
|
13 |
|
1.77 |
3.24 |
141.3 |
2.05 |
0.87 |
5.3 |
77 |
6 |
0 |
2 |
29 |
11 |
3 |
0 |
CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA 1014 B CLA
1015 B CLA 1018 B CLA 1019 B CLA 1020 B CLA 1021
B CLA 1022 B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1045 B BCR
1047 B BCR 1048 B MGE 1060 B MGE 1061 L CLA 6007
a BCR 6044 a CLA 6025 c CLA 6029 c CLA 6030 c CLA
6031 c BCR 6054 c DGD 6055 c BCR 1046 t
|
|
14 |
|
2.42 |
3.98 |
153.5 |
1.82 |
0.81 |
5.8 |
73 |
6 |
1 |
2 |
38 |
22 |
2 |
0 |
CLA 1003 A CLA 1006 A PHO 1038 A PHO 1039 A PQ9
1043 A CLA 1012 B CLA 1015 B CLA 1019 B CLA 1021
B CLA 1022 B BCR 1045 B BCR 1047 B MGE 1060 B DGD
1057 C CLA 1004 D CLA 1005 D PQ9 1042 D BCR 1050
D MGE 1062 D HEM 1040 E MGE 1059 J MGE 1061 L
|
|
15 |
|
2.11 |
3.30 |
156.2 |
0.86 |
0.26 |
4.4 |
81 |
7 |
2 |
14 |
29 |
12 |
8 |
1 |
CLA 6006 a PQ9 6043 a CLA 6010 b CLA 6011 b CLA
6016 b CLA 6017 b DGD 6057 c CLA 6004 d CLA 6008
d BCR 6050 d MGE 6059 d DGD 6058 h
|
|
16 |
|
2.40 |
3.72 |
162.0 |
-0.03 |
0.25 |
8.9 |
78 |
15 |
3 |
20 |
19 |
23 |
3 |
0 |
CLA 6010 b CLA 6011 b CLA 6012 b CLA 6013 b CLA
6016 b CLA 6017 b CLA 6018 b CLA 6019 b CLA 6020
b CLA 6021 b CLA 6023 b MGE 6060 b CLA 6008 d MGE
6061 d MGE 6062 d BCR 6049 h DGD 6058 h
|
|
17 |
|
2.24 |
3.29 |
162.1 |
1.16 |
0.61 |
9.5 |
72 |
7 |
6 |
4 |
28 |
20 |
4 |
0 |
CLA 1003 A CLA 1007 A PHO 1038 A BCR 1044 A CLA
1012 B CLA 1015 B CLA 1019 B CLA 1021 B CLA 1022
B BCR 1045 B BCR 1047 B MGE 1060 B DGD 1055 C CLA
1005 D PQ9 1042 D MGE 1062 D MGE 1061 L BCR 6046 T
|
|
18 |
|
2.27 |
3.24 |
172.9 |
1.62 |
0.71 |
8.2 |
73 |
9 |
5 |
3 |
38 |
18 |
3 |
0 |
CLA 1003 A CLA 1007 A PHO 1038 A BCR 1044 A CLA
1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA 1014 B CLA 1015
B CLA 1018 B CLA 1019 B CLA 1020 B CLA 1021 B CLA
1022 B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1045 B BCR 1047
B BCR 1048 B MGE 1060 B DGD 1055 C CLA 1005 D PQ9
1042 D MGE 1062 D MGE 1061 L BCR 6046 T BCR 6048 b
|
|
19 |
|
2.56 |
4.01 |
189.2 |
1.27 |
0.55 |
6.5 |
74 |
13 |
1 |
16 |
42 |
27 |
5 |
1 |
CLA 1024 B BCR 1048 B CLA 6003 a CLA 6010 b CLA
6011 b CLA 6012 b CLA 6013 b CLA 6014 b CLA 6015
b CLA 6016 b CLA 6017 b CLA 6018 b CLA 6019 b CLA
6020 b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR 6045 b BCR 6047
b MGE 6060 b CLA 6005 d CLA 6008 d PHO 6038 d PQ9
6042 d MGE 6061 d MGE 6062 d BCR 6049 h DGD 6058
h BCR 1046 t
|
|
20 |
|
2.42 |
2.58 |
192.3 |
1.31 |
0.51 |
7.9 |
75 |
7 |
8 |
7 |
39 |
19 |
5 |
0 |
CLA 1007 A BCR 1044 A CLA 1024 B BCR 1048 B BCR
6046 T CLA 6003 a CLA 6012 b CLA 6015 b CLA 6019
b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR 6045 b BCR 6047 b MGE
6060 b CLA 6005 d PHO 6038 d PQ9 6042 d MGE 6061
d MGE 6062 d BCR 1046 t
|
|
21 |
|
2.37 |
4.07 |
205.3 |
1.87 |
0.86 |
4.0 |
73 |
7 |
0 |
7 |
48 |
29 |
1 |
0 |
CLA 1003 A CLA 1006 A PHO 1038 A PHO 1039 A PQ9
1043 A CLA 1012 B CLA 1015 B CLA 1019 B CLA 1021
B CLA 1022 B CLA 1024 B BCR 1045 B BCR 1047 B BCR
1048 B MGE 1060 B CLA 1028 C CLA 1032 C CLA 1034
C DGD 1056 C DGD 1057 C CLA 1004 D CLA 1005 D PQ9
1042 D BCR 1050 D MGE 1062 D MGE 1059 J MGE 1061
L BCR 1046 t
|
|
22 |
|
2.07 |
2.70 |
211.7 |
1.23 |
0.56 |
8.3 |
77 |
17 |
1 |
15 |
41 |
21 |
3 |
1 |
CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA 1014 B CLA
1015 B CLA 1018 B CLA 1019 B CLA 1020 B CLA 1021
B CLA 1022 B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1045 B BCR
1047 B BCR 1048 B MGE 1060 B MGE 1061 L BCR 6046
T CLA 6010 b CLA 6011 b CLA 6012 b CLA 6013 b CLA
6014 b CLA 6015 b CLA 6016 b CLA 6017 b CLA 6018
b CLA 6019 b CLA 6020 b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR
6045 b BCR 6047 b MGE 6060 b CLA 6008 d MGE 6061
d BCR 6049 h DGD 6058 h BCR 1046 t
|
|
23 |
|
2.34 |
2.57 |
235.6 |
-0.71 |
0.00 |
15.9 |
76 |
13 |
10 |
11 |
24 |
12 |
12 |
0 |
BCR 1047 B BCR 1048 B CLA 6007 a BCR 6044 a DGD
6055 c BCR 1046 t
|
|
24 |
|
2.09 |
3.50 |
240.5 |
-0.16 |
0.06 |
13.6 |
78 |
8 |
21 |
8 |
41 |
14 |
7 |
1 |
BCR 1044 A CLA 6007 a BCR 6044 a CLA 6025 c CLA
6029 c CLA 6030 c CLA 6031 c BCR 6054 c DGD 6055 c
|
|
25 |
|
2.52 |
2.72 |
249.9 |
0.46 |
0.21 |
10.7 |
81 |
16 |
10 |
21 |
38 |
20 |
6 |
1 |
CLA 1007 A BCR 1044 A BCR 6046 T CLA 6010 b CLA
6011 b CLA 6012 b CLA 6013 b CLA 6014 b CLA 6015
b CLA 6016 b CLA 6017 b CLA 6018 b CLA 6019 b CLA
6020 b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR 6045 b BCR 6047
b MGE 6060 b CLA 6008 d MGE 6061 d BCR 6049 h DGD
6058 h
|
|
26 |
|
2.15 |
4.40 |
254.0 |
0.72 |
0.45 |
10.5 |
76 |
10 |
13 |
5 |
58 |
20 |
7 |
1 |
CLA 1007 A BCR 1044 A CLA 1025 C CLA 1026 C CLA
1027 C CLA 1029 C CLA 1030 C CLA 1031 C CLA 1033
C CLA 1036 C BCR 1054 C DGD 1055 C CLA 6007 a BCR
6044 a CLA 6025 c CLA 6029 c CLA 6030 c CLA 6031
c BCR 6054 c DGD 6055 c
|
|
27 |
|
1.96 |
3.08 |
254.0 |
-0.95 |
-0.10 |
19.0 |
78 |
14 |
10 |
9 |
19 |
11 |
8 |
0 |
CLA 6027 c CLA 6036 c CLA 6037 c BCR 6053 z
|
|
28 |
|
2.54 |
2.69 |
266.6 |
1.49 |
0.60 |
5.7 |
78 |
14 |
2 |
18 |
60 |
31 |
5 |
1 |
CLA 1003 A CLA 1006 A PHO 1038 A PHO 1039 A PQ9
1043 A DGD 1057 C CLA 1004 D CLA 1005 D PQ9 1042
D BCR 1050 D MGE 1062 D HEM 1040 E MGE 1059 J MGE
1061 L BCR 6046 T CLA 6010 b CLA 6011 b CLA 6012
b CLA 6013 b CLA 6014 b CLA 6015 b CLA 6016 b CLA
6017 b CLA 6018 b CLA 6019 b CLA 6020 b CLA 6021
b CLA 6022 b BCR 6045 b BCR 6047 b MGE 6060 b CLA
6008 d MGE 6061 d BCR 6049 h DGD 6058 h
|
|
29 |
|
2.40 |
2.58 |
270.7 |
1.11 |
0.49 |
7.7 |
79 |
17 |
2 |
18 |
53 |
26 |
7 |
1 |
CLA 1007 A BCR 1044 A CLA 1025 C CLA 1026 C CLA
1027 C CLA 1029 C CLA 1030 C CLA 1031 C CLA 1033
C CLA 1036 C BCR 1054 C DGD 1055 C BCR 6046 T CLA
6010 b CLA 6011 b CLA 6012 b CLA 6013 b CLA 6014
b CLA 6015 b CLA 6016 b CLA 6017 b CLA 6018 b CLA
6019 b CLA 6020 b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR 6045
b BCR 6047 b BCR 6048 b MGE 6060 b CLA 6008 d MGE
6061 d BCR 6049 h DGD 6058 h
|
 |
30 |
|
2.47 |
2.75 |
302.6 |
-0.10 |
0.18 |
15.0 |
77 |
16 |
10 |
8 |
34 |
18 |
14 |
0 |
CLA 6006 a PQ9 6043 a LHG 6063 a CLA 6025 c CLA
6026 c CLA 6027 c CLA 6028 c CLA 6032 c CLA 6033
c CLA 6034 c CLA 6036 c DGD 6056 c DGD 6057 c BCR
6050 d MGE 6059 d BCR 6051 k BCR 6053 z
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Residue-type_colouring |
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Positive
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Negative
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Neutral
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Aliphatic
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Aromatic
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Pro & Gly
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Cysteine
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H,K,R
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D,E
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S,T,N,Q
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A,V,L,I,M
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F,Y,W
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P,G
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C
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MOLE 2.0 program