Evolutionary tools for genomic analysis
This page tells you a little about what we do, in the languages of people who have worked in the Group over the years. Our apologies that the text is getting a little out-of-date:
English – Chinese – Finnish – French – German – Hebrew – Hungarian – Italian – Nepali – Polish – Russian – Spanish – Ukrainian – Vietnamese
Our main interests are in methods for the analysis of DNA and amino acid sequences to study evolution. Past work has been on the theoretical basis of phylogenetic analyses of this data, aiming to understand and improve methods, and on the development of statistical methods that test the accuracy of current mathematical models. More recent work has concentrated on devising new, better, mathematical models and the application of these models and methods to comparative genomic data.
Chinese
我们的研究着眼于对DNA 和氨基酸序列进行分析的方法，以更加深入地了解生物演化。过往的研究重点在于对上述数据进行系统发育分析的理论框架，旨在深入理解并进一步改进研究方法。另一方面的重点在于开发统计学方法，以测试现有数学模型的准确性。最近的工作集中在设计新的、更好的数学模型，并将这些模型和方法应用于比较基因组数据。
Ryhmän pääasiallisia mielenkiinnon kohteita ovat menetelmät DNA- ja aminohapposekvenssien evoluution tutkimiseen. Aiempi työ on keskittynyt tämän aineiston fylogenia-analyysin teoriaan, käytettyjen menetelmien ymmärtämiseen ja parantamiseen, ja tilastollisten menetelmien kehittämiseen olemassa olevien matemaattisten mallien tarkkuuden määrittämiseksi. Viime aikainen työ keskittyy uusien ja parempien matemaattisten mallien kehittämiseen ja näiden mallien ja menetelmien soveltamiseen vertailevassa genomitutkimuksessa.
Nos recherches portent sur les méthodes d’analyses des séquences ADN et des séquences d’acides aminés pour étudier l’évolution. Nos travaux passés se sont intéressés aux bases théoriques de l’analyse phylogénétique de ces données, avec pour objectif la compréhension et l’amélioration des méthodes existantes ainsi que le développement de méthodes statistiques qui testent la précision des modèles mathématiques actuels. Plus récemment, nous avons concentré notre recherche sur la conception de nouveaux modèles mathématiques performants et sur l’application de ces modèles et méthodes aux données génomiques comparatives.
Der Kern unserer Arbeit besteht aus der Methodenentwicklung zur evolutionären Analyse von DNA und Aminosäuresequenzen. Die Auseinandersetzung fand hierbei auf der theoretischen Basis von phylogenetischer Analyse statt, mit dem Ziel, bereits vorhandene Methoden besser zu verstehen und fortzuführen; ebenso in der Entwicklung von statistischen Methoden, die die Genauigkeit bestehender mathematischer Modelle testen. Zuletzt lag der Fokus auf der Formulierung neuerer und besserer mathematischer Modelle und der Anwendung eben dieser auf vergleichende Genomdaten.
תחומי הענין של הקבוצה הן שיטות לניתוח של סדרות די.אנ.אי וחומצות אמינו לצורך הסקה אוולוציונית. עבודות
קודמות עסקו בבסיס התיאורטי של ניתוח פילוגנטי של מידע כזה במטרה לשפר את שיטות הניתוח, וכן בפיתוח שיטות סטטיסטיות
לבחינת הדיוק של המודלים המתמטיים האוולוציוניים בהם משתמשים. עבודות נוכחיות מתרכזות בפיתוח מודלים מתמטיים
.משופרים, ובשימוש בהם בתחום הגנומיקה ההשוואתית
A csoport fő érdeklődési körébe a DNS- és aminosav-szekvenciák elemzésére szolgáló – az evolúció vizsgálatában alkalmazható – módszerek tartoznak. Korábbi munkáink ezen adatok filogenetikai elmzésének elméleti alapjaira – a létező módszerek megértésére és továbbfejlesztésére, valamint a már meglévő matematikai modellek pontosságát tesztelő statisztikai módszerek kidolgozására – irányultak. Újabb munkáink új és jobb matematikai modellek és módszerek kidolgozására, valamint ezen új modellek és módszerek összehasonlító genomikai vizsgálatokban való felhasználására koncentrálnak.
Siamo principalmente interessati ai metodi di analisi di sequenze di DNA e proteiche per lo studio dell’evoluzione. In passato ci siamo occupati delle basi teoriche delle analisi filogenetiche, con l’obiettivo di comprendere appieno e migliorare i metodi esistenti, e dello sviluppo di metodi statistici per valutare l’accuratezza dei modelli matematici attuali. Recentemente ci siamo concentrati sulla progettazione di nuovi, migliori, modelli matematici e sull’applicazione di questi modelli e metodi ai dati della genomica comparativa.
Nepali
हाम्रो मुख्य चासोका विषयहरू डिएनए र एमिनो एसिड सिक्वेन्स को विश्लेषण गर्ने तरिकाहरू मार्फत क्रमिक-विकासको बारेमा खोजी गर्नु हो। विगतमा हामीले सैद्धान्तिकरुपमा फाईलोजिनेटिक विश्लेषण गर्ने पद्धतिहरूमा थप नयाँ सुधार र यि गणितीय मोडेलहरूको सटिकता जाँच्ने सांख्यिकीय तरिकाहरूमा पनि काम गरेका थियौँ। अचेल हाम्रो काम मुलतः नयाँ र अझ उत्कृष्ट गणितीय मोडेल र तरिकाहरू प्रतिपादन गर्दै उक्त मोडेलहरू विभिन्न जिवहरूको तुलनात्मक जिनोमीक डाटामा प्रयोग गर्नु रहेको छ।
Polish
Głównym obszarem działalności grupy jest analiza sekwencji DNA i białek w celu badania ewolucji. Poprzednie działania grupy były skupione na teoretycznych podstawach analiz filogenetycznych i konstrukcji statystycznych metod oceny dokładności modeli matematycznych. Obecnie zajmujemy się rozwojem nowych, dokładniejszych modeli matematycznych i ich zastosowaniem do zbiorów danych z zakresu genomiki porównawczej.
Наши основные интересы – это разработка методов для анализа последовательностей ДНК и амино кислот с целью изучения эволюции. Наши предыдущие работы затрагивали теоретические основы кладистического анализа подобных данных, нацеленого на понимание и улучшение методов и на разработку статистических методов для тестирования точности современных математических моделей. Позднейшие работы сконцентрированы на разработке новых, лучших математических моделей и применение этих моделей и методов для сравнения геномных данных.
Nuestro principal interés es el estudio de la evolución a través del análisis de secuencias de ADN y amino ácidos. En el pasado hemos estudiado las bases teóricas del análisis filogenético de secuencias, con el fin de comprender y mejorar los métodos existentes. Hemos también desarrollado métodos estadísticos para poner a prueba la precisión de modelos matemáticos existentes. Recientemente nos hemos concentrado en desarrollar nuevos y mejores modelos matemáticos, y en la aplicación de estos modelos y métodos a datos de genómica comparativa.
Наші головні інтереси знаходяться в методах аналізу ДНК і послідовностей амінокислот з метою вивчення еволюції. Наша попередня робота була пов”язана з теоретичною основою філогенезу цих данних, націленою на розуміння і поліпшення методів, і на розробку статистичних методів для тестування точності сучасних математичних моделей. Більш недавня робота зосередилася на винаході нових, кращих математичних моделей і застосування цих моделей і методів для порівняння данних геномів.
Vietnamese
Mối quan tâm chính của chúng tôi là các phương pháp phân tích các chuỗi DNA và axit amin để nghiên cứu quá trình tiến hóa. Các nghiên cứu trước đây của chúng tôi tập trung vào cơ sở lý thuyết của phân tích phát sinh loài từ những dữ liệu này, nhằm hiểu và cải tiến các phương pháp hiện có, cũng như phát triển các phương pháp thống kê dùng để kiểm tra độ chính xác của các mô hình toán học hiện nay. Gần đây hơn, công việc của chúng tôi chủ yếu hướng đến việc xây dựng những mô hình toán học mới và tốt hơn, cũng như áp dụng các mô hình và phương pháp này vào dữ liệu so sánh hệ gen.