PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=766-0D-3P5)

Interfaces in PDB 7p77

SARS-COV-2 SPIKE PROTEIN IN COMPLEX WITH SYBODY#15 AND SYBODY#68 IN A 3UP CONFORMATION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`476`	`135`	`55178`	`◊`	E	`443`	`129`	`56082`	`4305.3`	`-44.9`	`0.277`	`32`	`8`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`443`	`124`	`55178`	`◊`	C	`478`	`130`	`55741`	`4279.9`	`-46.0`	`0.247`	`31`	`8`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`441`	`127`	`55741`	`◊`	E	`477`	`131`	`56082`	`4262.7`	`-42.5`	`0.359`	`33`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`4282.6`	`-44.4`	`0.294`	`32`	`7`	`0`	`0.000`
2	`4`		E	`105`	`33`	`56082`	`◊`	H	`105`	`26`	`6649`	`970.3`	`-1.7`	`0.635`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
	`5`		C	`93`	`31`	`55741`	`◊`	D	`99`	`26`	`6533`	`947.2`	`-2.0`	`0.600`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`97`	`31`	`55178`	`◊`	A	`102`	`25`	`6514`	`932.8`	`-1.5`	`0.650`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`950.1`	`-1.7`	`0.628`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
3	`7`		E	`60`	`17`	`56082`	`◊`	X	`60`	`17`	`6402`	`573.8`	`-5.6`	`0.342`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		B	`65`	`18`	`55178`	`◊`	W	`64`	`17`	`6412`	`570.0`	`-3.9`	`0.508`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`63`	`18`	`55741`	`◊`	Y	`60`	`17`	`6406`	`568.5`	`-5.5`	`0.362`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`570.8`	`-5.0`	`0.404`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		C	`18`	`7`	`55741`	`c`	[NAG]C:1309	`10`	`1`	`362`	`134.7`	`3.4`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`11`		E	`15`	`7`	`56082`	`c`	[NAG]E:1309	`10`	`1`	`360`	`133.7`	`3.5`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`15`	`7`	`55178`	`c`	[NAG]B:1309	`10`	`1`	`360`	`133.3`	`3.5`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`133.5`	`3.5`	`0.466`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`13`		B	`13`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`355`	`133.6`	`3.0`	`0.440`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		B	`14`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]B:1305	`11`	`1`	`360`	`133.4`	`3.2`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		C	`14`	`6`	`55741`	`c`	[NAG]C:1305	`11`	`1`	`358`	`126.7`	`3.1`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`130.1`	`3.2`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`16`		E	`17`	`7`	`56082`	`c`	[NAG]S:1	`13`	`1`	`364`	`132.9`	`3.0`	`0.304`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		B	`13`	`7`	`55178`	`c`	[NAG]G:1	`12`	`1`	`362`	`128.9`	`3.3`	`0.326`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`130.9`	`3.1`	`0.315`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`18`		C	`19`	`7`	`55741`	`c`	[NAG]C:1310	`9`	`1`	`357`	`131.2`	`3.9`	`0.577`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`19`		E	`18`	`6`	`56082`	`c`	[NAG]E:1305	`10`	`1`	`361`	`127.2`	`3.3`	`0.466`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		C	`13`	`5`	`55741`	`c`	[NAG]L:1	`12`	`1`	`358`	`125.8`	`2.5`	`0.327`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		C	`14`	`6`	`55741`	`c`	[NAG]M:1	`12`	`1`	`363`	`125.4`	`3.1`	`0.335`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		E	`16`	`5`	`56082`	`c`	[NAG]R:1	`12`	`1`	`360`	`125.3`	`3.0`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`23`		B	`18`	`6`	`55178`	`c`	[NAG]B:1304	`8`	`1`	`364`	`124.9`	`3.5`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`24`		E	`13`	`5`	`56082`	`c`	[NAG]E:1304	`10`	`1`	`357`	`117.8`	`2.4`	`0.321`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		C	`11`	`3`	`55741`	`c`	[NAG]C:1304	`11`	`1`	`356`	`110.3`	`2.3`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`114.0`	`2.4`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`26`		B	`16`	`7`	`55178`	`c`	[NAG]B:1310	`7`	`1`	`358`	`110.7`	`3.2`	`0.590`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`27`		E	`13`	`5`	`56082`	`c`	[NAG]V:1	`11`	`1`	`361`	`109.9`	`3.0`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`28`		B	`16`	`6`	`55178`	`c`	[NAG]J:1	`9`	`1`	`359`	`107.6`	`3.8`	`0.562`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`29`		B	`13`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]I:1	`11`	`1`	`359`	`106.0`	`3.3`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`30`		C	`14`	`5`	`55741`	`◊`	[NAG]P:1	`8`	`1`	`359`	`100.4`	`1.8`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		E	`12`	`5`	`56082`	`c`	[NAG]U:1	`10`	`1`	`360`	`99.7`	`2.9`	`0.366`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		C	`9`	`4`	`55741`	`c`	[NAG]N:1	`10`	`1`	`360`	`94.7`	`3.2`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`97.2`	`3.1`	`0.384`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		B	`11`	`4`	`55178`	`c`	[NAG]B:1307	`11`	`1`	`361`	`97.0`	`3.2`	`0.346`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		C	`11`	`4`	`55741`	`c`	[NAG]C:1307	`11`	`1`	`360`	`93.3`	`3.2`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		E	`12`	`4`	`56082`	`c`	[NAG]E:1307	`11`	`1`	`362`	`90.8`	`3.2`	`0.328`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`93.7`	`3.2`	`0.334`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`36`		E	`11`	`3`	`56082`	`c`	[NAG]E:1310	`7`	`1`	`362`	`91.5`	`3.3`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`37`		B	`9`	`5`	`55178`	`c`	[NAG]K:1	`10`	`1`	`360`	`86.8`	`2.4`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		C	`9`	`5`	`55741`	`◊`	[NAG]O:1	`8`	`1`	`362`	`60.9`	`1.2`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.8`	`1.8`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`39`		E	`8`	`3`	`56082`	`c`	[NAG]T:1	`7`	`1`	`362`	`86.2`	`2.7`	`0.544`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`40`		[NAG]T:1	`10`	`1`	`362`	`c`	[NAG]T:2	`8`	`1`	`357`	`84.3`	`1.8`	`0.073`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`41`		C	`10`	`3`	`55741`	`c`	[NAG]C:1306	`7`	`1`	`362`	`83.8`	`2.7`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		E	`10`	`3`	`56082`	`c`	[NAG]E:1306	`8`	`1`	`362`	`83.7`	`2.6`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		B	`9`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`362`	`78.5`	`2.5`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`82.0`	`2.6`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`44`		C	`7`	`3`	`55741`	`c`	[NAG]C:1301	`7`	`1`	`360`	`82.9`	`3.0`	`0.576`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		B	`7`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]B:1301	`6`	`1`	`357`	`80.8`	`3.0`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`81.8`	`3.0`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`46`		C	`11`	`3`	`55741`	`c`	[NAG]C:1303	`9`	`1`	`362`	`81.2`	`2.1`	`0.348`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		E	`12`	`4`	`56082`	`c`	[NAG]E:1303	`9`	`1`	`358`	`80.3`	`2.0`	`0.349`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		B	`11`	`3`	`55178`	`c`	[NAG]B:1303	`9`	`1`	`360`	`79.1`	`2.0`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`80.2`	`2.0`	`0.353`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`49`		[NAG]Q:1	`7`	`1`	`359`	`c`	[NAG]Q:2	`9`	`1`	`362`	`74.5`	`2.0`	`0.087`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`50`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`359`	`c`	[NAG]I:2	`9`	`1`	`361`	`73.4`	`2.0`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]V:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]V:2	`10`	`1`	`364`	`72.9`	`2.1`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]M:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`359`	`69.9`	`2.1`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.1`	`2.1`	`0.129`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`53`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`361`	`72.3`	`1.8`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]U:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]U:2	`9`	`1`	`364`	`71.9`	`1.9`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]K:1	`5`	`1`	`360`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`358`	`71.6`	`1.9`	`0.112`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]G:1	`5`	`1`	`362`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`362`	`71.3`	`1.9`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]O:1	`4`	`1`	`362`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`361`	`70.8`	`2.0`	`0.141`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NAG]S:1	`5`	`1`	`364`	`c`	[NAG]S:2	`9`	`1`	`362`	`70.7`	`1.6`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.4`	`1.9`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`59`		[NAG]J:1	`7`	`1`	`359`	`c`	[NAG]J:2	`10`	`1`	`364`	`71.2`	`1.5`	`0.077`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]T:2	`5`	`1`	`357`	`c`	[NAG]T:3	`8`	`1`	`358`	`68.8`	`1.6`	`0.121`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`70.0`	`1.6`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`61`		B	`9`	`5`	`55178`	`◊`	[NAG]E:1304	`6`	`1`	`357`	`70.7`	`2.1`	`0.466`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		E	`8`	`4`	`56082`	`◊`	[NAG]C:1304	`6`	`1`	`356`	`51.2`	`1.5`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`60.9`	`1.8`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`63`		[NAG]P:1	`5`	`1`	`359`	`c`	[NAG]P:2	`8`	`1`	`356`	`68.9`	`1.4`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`64`		[NAG]L:1	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]L:2	`10`	`1`	`360`	`68.4`	`1.4`	`0.081`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`355`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`363`	`67.7`	`1.3`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.1`	`1.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`66`		[NAG]G:2	`6`	`1`	`362`	`c`	[BMA]G:3	`7`	`1`	`291`	`62.5`	`0.9`	`0.098`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`67`		[NAG]V:2	`5`	`1`	`364`	`c`	[BMA]V:3	`7`	`1`	`293`	`60.6`	`1.2`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`68`		E	`5`	`2`	`56082`	`c`	[NAG]E:1308	`8`	`1`	`361`	`59.9`	`1.7`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		C	`6`	`3`	`55741`	`c`	[NAG]C:1308	`8`	`1`	`363`	`59.7`	`1.7`	`0.299`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		B	`5`	`2`	`55178`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`361`	`56.6`	`1.6`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`58.7`	`1.7`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`71`		[NAG]S:2	`6`	`1`	`362`	`c`	[BMA]S:3	`7`	`1`	`294`	`59.8`	`0.8`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`72`		[NAG]U:2	`5`	`1`	`364`	`c`	[BMA]U:3	`6`	`1`	`291`	`58.9`	`0.9`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`73`		[NAG]R:1	`9`	`1`	`360`	`c`	[BMA]R:2	`6`	`1`	`294`	`57.8`	`0.8`	`0.065`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`74`		B	`3`	`1`	`55178`	`c`	[NAG]B:1302	`9`	`1`	`357`	`54.7`	`1.6`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		C	`3`	`1`	`55741`	`c`	[NAG]C:1302	`8`	`1`	`357`	`54.6`	`1.5`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		E	`3`	`1`	`56082`	`c`	[NAG]E:1302	`9`	`1`	`357`	`54.5`	`1.6`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`54.6`	`1.6`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`77`		E	`10`	`3`	`56082`	`◊`	[NAG]S:2	`4`	`1`	`362`	`54.2`	`0.8`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`78`		E	`6`	`4`	`56082`	`◊`	[NAG]Q:1	`7`	`1`	`359`	`50.7`	`1.3`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`79`		B	`6`	`3`	`55178`	`◊`	[NAG]G:2	`4`	`1`	`362`	`47.0`	`0.7`	`0.343`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		C	`8`	`3`	`55741`	`◊`	[NAG]M:2	`6`	`1`	`359`	`42.8`	`0.8`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`44.9`	`0.7`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`81`		C	`3`	`1`	`55741`	`◊`	[NAG]L:2	`4`	`1`	`360`	`45.4`	`1.6`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`82`		C	`3`	`1`	`55741`	`◊`	[NAG]T:1	`6`	`1`	`362`	`45.0`	`-0.3`	`0.094`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`83`		B	`4`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]F:2	`5`	`1`	`363`	`35.4`	`1.1`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`84`		A	`4`	`3`	`6514`	`◊`	W	`5`	`3`	`6412`	`28.7`	`0.7`	`0.809`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`85`		H	`4`	`3`	`6649`	`◊`	X	`4`	`2`	`6402`	`27.8`	`0.7`	`0.815`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		D	`4`	`3`	`6533`	`◊`	Y	`4`	`2`	`6406`	`25.8`	`0.6`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.4`	`0.7`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`87`		E	`3`	`1`	`56082`	`◊`	[NAG]B:1306	`4`	`1`	`362`	`27.0`	`0.7`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`88`		B	`3`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]C:1301	`5`	`1`	`360`	`23.1`	`0.2`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		E	`1`	`1`	`56082`	`◊`	[NAG]B:1301	`1`	`1`	`357`	`1.1`	`0.0`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`12.1`	`0.1`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`90`		E	`5`	`2`	`56082`	`◊`	[NAG]U:2	`1`	`1`	`364`	`18.7`	`0.7`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`91`		E	`4`	`1`	`56082`	`◊`	[BMA]R:2	`3`	`1`	`294`	`18.4`	`0.4`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`92`		C	`2`	`1`	`55741`	`◊`	[NAG]E:1306	`1`	`1`	`362`	`17.6`	`1.0`	`0.855`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`93`		B	`2`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]C:1306	`1`	`1`	`362`	`5.5`	`0.3`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`11.5`	`0.7`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`94`		[NAG]T:1	`1`	`1`	`362`	`◊`	[NAG]T:3	`4`	`1`	`358`	`17.5`	`0.1`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`95`		C	`2`	`2`	`55741`	`◊`	[NAG]B:1304	`4`	`1`	`364`	`17.0`	`0.2`	`0.260`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`96`		B	`1`	`1`	`55178`	`◊`	[NAG]I:2	`1`	`1`	`361`	`12.6`	`0.6`	`0.835`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`97`		C	`1`	`1`	`55741`	`◊`	[NAG]N:2	`1`	`1`	`361`	`10.7`	`0.5`	`0.828`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`11.6`	`0.6`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`98`		E	`1`	`1`	`56082`	`◊`	[NAG]V:2	`1`	`1`	`364`	`4.8`	`0.2`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`99`		C	`1`	`1`	`55741`	`◊`	[NAG]T:2	`1`	`1`	`357`	`2.7`	`-0.0`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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