PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=636-0D-MD3)

Interfaces in PDB 7mjj

CRYO-EM STRUCTURE OF THE SARS-COV-2 N501Y MUTANT SPIKE PROTEIN ECTODOMAIN BOUND TO FAB AB1 (CLASS 1)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`505`	`148`	`52595`	`◊`	C	`480`	`146`	`51869`	`4602.8`	`-44.4`	`0.164`	`47`	`11`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`443`	`130`	`52900`	`◊`	C	`485`	`141`	`51869`	`4332.9`	`-44.9`	`0.116`	`42`	`10`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`435`	`125`	`52595`	`◊`	B	`484`	`140`	`52900`	`4239.2`	`-43.0`	`0.133`	`40`	`8`	`0`	`0.000`
4	`4`		D	`181`	`48`	`10933`	`◊`	E	`182`	`52`	`11302`	`1619.7`	`-24.0`	`0.051`	`9`	`2`	`0`	`0.000`
	`5`		F	`181`	`48`	`11005`	`◊`	G	`186`	`52`	`11203`	`1607.8`	`-23.8`	`0.057`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1613.7`	`-23.9`	`0.054`	`9`	`2`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`79`	`26`	`52595`	`◊`	D	`74`	`23`	`10933`	`750.9`	`-3.3`	`0.663`	`21`	`1`	`0`	`0.000`
6	`7`		B	`78`	`25`	`52900`	`◊`	F	`75`	`23`	`11005`	`747.0`	`-3.5`	`0.649`	`19`	`1`	`0`	`0.000`
7	`8`		D	`40`	`15`	`10933`	`◊`	F	`41`	`15`	`11005`	`308.3`	`0.3`	`0.826`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
8	`9`		A	`33`	`12`	`52595`	`◊`	E	`30`	`10`	`11302`	`289.9`	`0.8`	`0.667`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		B	`31`	`12`	`52900`	`◊`	G	`30`	`10`	`11203`	`288.2`	`0.7`	`0.682`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		D	`21`	`6`	`10933`	`◊`	G	`20`	`5`	`11203`	`177.9`	`-1.2`	`0.381`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		B	`21`	`11`	`52900`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`364`	`155.6`	`4.0`	`0.472`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		C	`16`	`8`	`51869`	`c`	[NAG]C:1302	`10`	`1`	`361`	`149.9`	`3.6`	`0.431`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		A	`21`	`9`	`52595`	`c`	[NAG]A:1302	`13`	`1`	`362`	`144.2`	`4.2`	`0.430`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		B	`15`	`8`	`52900`	`c`	[NAG]B:1307	`10`	`1`	`357`	`140.9`	`3.2`	`0.428`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		A	`16`	`8`	`52595`	`c`	[NAG]A:1307	`10`	`1`	`355`	`139.8`	`3.1`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		A	`13`	`5`	`52595`	`c`	[NAG]L:1	`11`	`1`	`362`	`136.4`	`3.7`	`0.476`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		B	`13`	`5`	`52900`	`c`	[NAG]R:1	`11`	`1`	`364`	`136.1`	`3.6`	`0.440`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		A	`14`	`6`	`52595`	`c`	[NAG]I:1	`12`	`1`	`363`	`134.1`	`2.7`	`0.306`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		B	`16`	`7`	`52900`	`c`	[NAG]O:1	`12`	`1`	`364`	`133.9`	`2.7`	`0.306`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		C	`13`	`6`	`51869`	`c`	[NAG]U:1	`12`	`1`	`364`	`133.4`	`2.5`	`0.308`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		C	`13`	`5`	`51869`	`c`	[NAG]X:1	`11`	`1`	`364`	`132.0`	`3.6`	`0.466`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		C	`16`	`5`	`51869`	`c`	[NAG]T:1	`11`	`1`	`361`	`131.6`	`4.0`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		A	`15`	`6`	`52595`	`c`	[NAG]K:1	`11`	`1`	`361`	`130.5`	`3.4`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		B	`16`	`5`	`52900`	`c`	[NAG]N:1	`11`	`1`	`360`	`129.1`	`4.0`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		A	`15`	`4`	`52595`	`c`	[NAG]H:1	`11`	`1`	`360`	`127.9`	`4.0`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		C	`14`	`5`	`51869`	`c`	[NAG]W:1	`11`	`1`	`360`	`127.6`	`3.3`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		B	`14`	`6`	`52900`	`c`	[NAG]Q:1	`11`	`1`	`363`	`127.5`	`3.4`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		A	`18`	`7`	`52595`	`c`	[NAG]A:1306	`12`	`1`	`362`	`126.5`	`3.2`	`0.334`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		C	`19`	`7`	`51869`	`c`	[NAG]C:1306	`13`	`1`	`362`	`122.2`	`2.9`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		B	`16`	`7`	`52900`	`c`	[NAG]B:1306	`10`	`1`	`360`	`114.9`	`3.2`	`0.420`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`32`		A	`11`	`5`	`52595`	`c`	[NAG]A:1308	`9`	`1`	`363`	`113.3`	`3.2`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		C	`11`	`5`	`51869`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`365`	`111.4`	`3.0`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		C	`20`	`5`	`51869`	`c`	[NAG]C:1301	`12`	`1`	`361`	`110.8`	`3.0`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		B	`13`	`5`	`52900`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`363`	`108.1`	`3.0`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`36`		C	`13`	`7`	`51869`	`c`	[NAG]C:1307	`7`	`1`	`356`	`107.2`	`3.4`	`0.604`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		A	`13`	`3`	`52595`	`c`	[NAG]A:1301	`12`	`1`	`359`	`100.6`	`2.8`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		C	`11`	`4`	`51869`	`c`	[NAG]C:1305	`10`	`1`	`364`	`100.3`	`3.6`	`0.432`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		B	`12`	`4`	`52900`	`c`	[NAG]P:1	`10`	`1`	`356`	`100.2`	`3.0`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		A	`11`	`4`	`52595`	`c`	[NAG]J:1	`10`	`1`	`358`	`98.3`	`2.9`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		A	`12`	`4`	`52595`	`c`	[NAG]A:1304	`11`	`1`	`363`	`98.2`	`2.1`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		C	`12`	`4`	`51869`	`c`	[NAG]V:1	`10`	`1`	`358`	`98.2`	`2.8`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		B	`12`	`3`	`52900`	`c`	[NAG]B:1301	`11`	`1`	`360`	`97.4`	`2.7`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		A	`10`	`4`	`52595`	`c`	[NAG]A:1305	`10`	`1`	`363`	`96.3`	`3.5`	`0.429`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		B	`12`	`4`	`52900`	`c`	[NAG]B:1304	`10`	`1`	`362`	`94.4`	`1.9`	`0.283`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		C	`11`	`4`	`51869`	`c`	[NAG]C:1304	`10`	`1`	`364`	`93.4`	`1.9`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		C	`10`	`3`	`51869`	`c`	[NAG]C:1303	`11`	`1`	`361`	`91.5`	`2.2`	`0.247`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		B	`12`	`3`	`52900`	`c`	[NAG]B:1303	`11`	`1`	`362`	`90.3`	`2.1`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		B	`11`	`5`	`52900`	`c`	[NAG]B:1305	`9`	`1`	`365`	`89.3`	`2.7`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`50`		A	`8`	`3`	`52595`	`c`	[NAG]A:1303	`11`	`1`	`363`	`88.8`	`2.0`	`0.251`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`51`		[NAG]Y:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]Y:2	`10`	`1`	`362`	`74.5`	`1.9`	`0.093`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`361`	`74.3`	`1.8`	`0.106`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]I:2	`9`	`1`	`361`	`73.5`	`1.7`	`0.084`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`362`	`73.1`	`1.8`	`0.090`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]U:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]U:2	`10`	`1`	`362`	`72.4`	`1.5`	`0.085`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]S:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]S:2	`10`	`1`	`363`	`71.8`	`1.7`	`0.086`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]Q:2	`10`	`1`	`363`	`70.4`	`1.6`	`0.092`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.8`	`1.7`	`0.091`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`58`		[NAG]P:1	`6`	`1`	`356`	`c`	[NAG]P:2	`10`	`1`	`361`	`74.2`	`2.1`	`0.097`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[NAG]V:1	`5`	`1`	`358`	`c`	[NAG]V:2	`10`	`1`	`362`	`73.0`	`2.1`	`0.117`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]J:2	`9`	`1`	`362`	`72.8`	`2.0`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.3`	`2.1`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`61`		[NAG]H:1	`7`	`1`	`360`	`c`	[NAG]H:2	`8`	`1`	`358`	`71.3`	`1.5`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]X:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]X:2	`9`	`1`	`363`	`65.9`	`1.1`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]R:2	`9`	`1`	`361`	`65.7`	`1.2`	`0.075`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]N:2	`8`	`1`	`357`	`65.2`	`1.2`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]T:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]T:2	`8`	`1`	`357`	`64.1`	`1.0`	`0.081`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[NAG]L:1	`6`	`1`	`362`	`c`	[NAG]L:2	`9`	`1`	`360`	`63.5`	`0.9`	`0.080`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.9`	`1.1`	`0.081`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`67`		A	`8`	`4`	`52595`	`c`	[NAG]M:1	`9`	`1`	`362`	`71.2`	`1.7`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`68`		[NAG]W:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]W:2	`8`	`1`	`360`	`69.1`	`1.6`	`0.121`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]K:2	`8`	`1`	`360`	`67.2`	`1.4`	`0.095`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.1`	`1.5`	`0.108`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`70`		C	`7`	`3`	`51869`	`c`	[NAG]Y:1	`9`	`1`	`362`	`67.7`	`1.7`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`71`		B	`7`	`3`	`52900`	`c`	[NAG]S:1	`9`	`1`	`362`	`67.5`	`1.8`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`72`		C	`11`	`4`	`51869`	`◊`	[NAG]U:2	`4`	`1`	`362`	`65.4`	`1.2`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`73`		A	`10`	`4`	`52595`	`◊`	[NAG]I:2	`4`	`1`	`361`	`64.8`	`1.1`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`74`		B	`11`	`4`	`52900`	`◊`	[NAG]O:2	`4`	`1`	`362`	`63.4`	`1.0`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`75`		A	`6`	`3`	`52595`	`◊`	[NAG]K:2	`4`	`1`	`360`	`51.8`	`0.6`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`76`		C	`5`	`2`	`51869`	`◊`	[NAG]W:2	`4`	`1`	`360`	`50.8`	`0.6`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`77`		B	`5`	`2`	`52900`	`◊`	[NAG]Q:2	`4`	`1`	`363`	`48.3`	`0.5`	`0.299`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`78`		A	`4`	`2`	`52595`	`◊`	[NAG]L:2	`5`	`1`	`360`	`39.0`	`0.5`	`0.287`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`79`		C	`3`	`1`	`51869`	`◊`	[NAG]X:2	`4`	`1`	`363`	`38.3`	`0.5`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`80`		B	`3`	`1`	`52900`	`◊`	[NAG]R:2	`6`	`1`	`361`	`37.7`	`0.5`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`81`		C	`7`	`2`	`51869`	`◊`	[NAG]A:1304	`3`	`1`	`363`	`34.5`	`0.9`	`0.527`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`82`		B	`4`	`2`	`52900`	`◊`	[NAG]A:1308	`6`	`1`	`363`	`28.9`	`0.4`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`83`		A	`4`	`2`	`52595`	`◊`	[NAG]C:1308	`6`	`1`	`365`	`26.0`	`0.4`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`84`		C	`4`	`2`	`51869`	`◊`	[NAG]B:1308	`6`	`1`	`363`	`25.2`	`0.3`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`85`		C	`4`	`2`	`51869`	`◊`	[NAG]V:2	`1`	`1`	`362`	`24.2`	`1.1`	`0.794`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`86`		A	`4`	`2`	`52595`	`◊`	[NAG]J:2	`1`	`1`	`362`	`24.2`	`1.1`	`0.795`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`87`		B	`2`	`1`	`52900`	`◊`	[NAG]K:1	`4`	`1`	`361`	`22.2`	`0.9`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`88`		B	`4`	`2`	`52900`	`◊`	[NAG]P:2	`1`	`1`	`361`	`21.5`	`1.0`	`0.793`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`89`		C	`2`	`1`	`51869`	`◊`	[NAG]Q:1	`4`	`1`	`363`	`21.1`	`0.8`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`90`		A	`2`	`1`	`52595`	`◊`	[NAG]W:1	`3`	`1`	`360`	`21.0`	`0.8`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`91`		A	`3`	`1`	`52595`	`◊`	[NAG]H:2	`4`	`1`	`358`	`19.9`	`0.6`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`92`		A	`2`	`1`	`52595`	`◊`	[NAG]B:1305	`1`	`1`	`365`	`17.5`	`0.1`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`93`		B	`1`	`1`	`52900`	`◊`	[NAG]C:1305	`1`	`1`	`364`	`16.6`	`-0.1`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`94`		C	`3`	`1`	`51869`	`◊`	[NAG]T:2	`4`	`1`	`357`	`15.7`	`0.5`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`95`		C	`2`	`1`	`51869`	`◊`	[NAG]A:1305	`3`	`1`	`363`	`15.6`	`0.5`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`96`		B	`2`	`1`	`52900`	`◊`	[NAG]N:2	`3`	`1`	`357`	`8.3`	`0.3`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`97`		A	`1`	`1`	`52595`	`◊`	[NAG]M:2	`2`	`1`	`361`	`7.5`	`0.2`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`98`		B	`1`	`1`	`52900`	`◊`	[NAG]S:2	`2`	`1`	`363`	`6.2`	`0.2`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`99`		C	`1`	`1`	`51869`	`◊`	[NAG]Y:2	`1`	`1`	`362`	`3.3`	`0.1`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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