PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=267-01-7J4)

Interfaces in PDB 7lab

STRUCTURE OF SARS-COV-2 S PROTEIN IN COMPLEX WITH N-TERMINAL DOMAIN ANTIBODY DH1052

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`536`	`147`	`49441`	`◊`	C	`505`	`154`	`49248`	`4796.7`	`-55.8`	`0.037`	`28`	`6`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`500`	`150`	`49326`	`◊`	C	`546`	`152`	`49248`	`4780.7`	`-55.7`	`0.032`	`29`	`6`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`503`	`146`	`49441`	`◊`	B	`548`	`154`	`49326`	`4733.3`	`-57.2`	`0.031`	`32`	`8`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`4770.2`	`-56.2`	`0.033`	`30`	`7`	`0`	`0.000`
2	`4`		L	`208`	`60`	`11529`	`◊`	H	`199`	`57`	`11934`	`1848.2`	`-30.9`	`0.021`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	`5`		S	`204`	`58`	`11282`	`◊`	T	`190`	`59`	`11776`	`1841.1`	`-26.1`	`0.056`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`6`		X	`189`	`53`	`11274`	`◊`	Y	`182`	`54`	`11823`	`1757.9`	`-27.7`	`0.019`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1815.8`	`-28.3`	`0.032`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
3	`7`		H	`79`	`21`	`11934`	`◊`	C	`79`	`21`	`49248`	`786.8`	`-4.9`	`0.514`	`9`	`9`	`0`	`0.000`
	`8`		T	`73`	`21`	`11776`	`◊`	A	`69`	`20`	`49441`	`718.1`	`-8.0`	`0.302`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
	`9`		Y	`75`	`21`	`11823`	`◊`	B	`68`	`20`	`49326`	`668.2`	`-2.4`	`0.693`	`9`	`5`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`724.3`	`-5.1`	`0.503`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
4	`10`		L	`36`	`15`	`11529`	`◊`	C	`40`	`13`	`49248`	`358.3`	`-1.4`	`0.563`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		S	`39`	`11`	`11282`	`◊`	A	`40`	`12`	`49441`	`352.3`	`-0.6`	`0.625`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		X	`35`	`15`	`11274`	`◊`	B	`37`	`15`	`49326`	`328.6`	`-0.6`	`0.627`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`346.4`	`-0.9`	`0.605`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		A	`18`	`10`	`49441`	`c`	[NAG]A:1302	`12`	`1`	`360`	`158.8`	`3.7`	`0.428`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`14`		B	`16`	`9`	`49326`	`c`	[NAG]I:1	`12`	`1`	`361`	`146.4`	`3.3`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		C	`18`	`9`	`49248`	`c`	[NAG]K:1	`12`	`1`	`360`	`136.8`	`3.3`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`141.6`	`3.3`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`16`		B	`17`	`8`	`49326`	`c`	[NAG]B:1207	`10`	`1`	`364`	`145.8`	`3.8`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`17`		A	`19`	`9`	`49441`	`c`	[NAG]A:1305	`8`	`1`	`364`	`137.0`	`3.6`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`18`		C	`13`	`6`	`49248`	`c`	[NAG]C:1309	`8`	`1`	`366`	`135.3`	`3.6`	`0.562`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		A	`13`	`5`	`49441`	`c`	[NAG]A:1309	`8`	`1`	`367`	`121.4`	`3.1`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`128.4`	`3.4`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`20`		C	`16`	`5`	`49248`	`◊`	[NAG]U:1	`12`	`1`	`361`	`133.3`	`3.2`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		B	`15`	`5`	`49326`	`c`	[NAG]E:1	`12`	`1`	`366`	`130.2`	`3.2`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`131.8`	`3.2`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`22`		C	`12`	`7`	`49248`	`c`	[NAG]C:1305	`8`	`1`	`365`	`130.8`	`3.5`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`23`		C	`15`	`6`	`49248`	`c`	[NAG]C:1302	`10`	`1`	`357`	`130.1`	`3.1`	`0.469`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		A	`16`	`5`	`49441`	`◊`	[NAG]R:1	`12`	`1`	`361`	`126.9`	`2.9`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`25`		A	`14`	`6`	`49441`	`c`	[NAG]A:1310	`11`	`1`	`364`	`126.4`	`3.4`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`13`	`6`	`49248`	`c`	[NAG]C:1310	`12`	`1`	`364`	`126.4`	`3.4`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`126.4`	`3.4`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`27`		A	`15`	`7`	`49441`	`c`	[NAG]P:1	`13`	`1`	`365`	`125.9`	`3.0`	`0.266`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`28`		B	`15`	`6`	`49326`	`c`	[NAG]B:1208	`12`	`1`	`367`	`121.8`	`3.5`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`29`		B	`18`	`7`	`49326`	`c`	[NAG]J:1	`10`	`1`	`354`	`121.1`	`3.6`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`30`		B	`12`	`7`	`49326`	`c`	[NAG]B:1203	`8`	`1`	`360`	`118.9`	`3.4`	`0.527`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`31`		A	`13`	`5`	`49441`	`c`	[NAG]A:1307	`9`	`1`	`365`	`116.9`	`3.4`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`32`		C	`15`	`5`	`49248`	`c`	[NAG]C:1304	`10`	`1`	`366`	`113.1`	`3.7`	`0.455`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`33`		B	`14`	`5`	`49326`	`c`	[NAG]B:1202	`10`	`1`	`365`	`112.4`	`3.6`	`0.448`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`34`		B	`12`	`3`	`49326`	`c`	[NAG]B:1201	`10`	`1`	`364`	`109.2`	`2.7`	`0.376`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`35`		A	`12`	`5`	`49441`	`c`	[NAG]A:1304	`8`	`1`	`362`	`108.0`	`3.8`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		B	`13`	`5`	`49326`	`c`	[NAG]B:1209	`9`	`1`	`367`	`106.7`	`2.4`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`37`		C	`12`	`4`	`49248`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`366`	`106.1`	`2.3`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`38`		A	`10`	`3`	`49441`	`c`	[NAG]A:1311	`9`	`1`	`361`	`104.6`	`3.8`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`39`		C	`11`	`3`	`49248`	`c`	[NAG]C:1311	`7`	`1`	`364`	`100.4`	`3.2`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`40`		B	`9`	`3`	`49326`	`c`	[NAG]B:1204	`10`	`1`	`366`	`97.9`	`2.2`	`0.299`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`41`		B	`14`	`4`	`49326`	`c`	[NAG]B:1205	`10`	`1`	`363`	`97.8`	`2.1`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		C	`11`	`3`	`49248`	`c`	[NAG]C:1307	`9`	`1`	`364`	`94.6`	`2.3`	`0.392`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`96.2`	`2.2`	`0.362`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`43`		C	`11`	`5`	`49248`	`c`	[NAG]M:1	`11`	`1`	`355`	`94.6`	`3.2`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		A	`12`	`5`	`49441`	`c`	[NAG]Q:1	`10`	`1`	`367`	`94.4`	`2.7`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`45`		B	`12`	`5`	`49326`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`364`	`94.3`	`2.2`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`46`		C	`10`	`3`	`49248`	`c`	[NAG]C:1308	`7`	`1`	`367`	`91.7`	`4.2`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`47`		A	`9`	`3`	`49441`	`c`	[NAG]O:1	`9`	`1`	`363`	`88.1`	`1.8`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`48`		A	`14`	`3`	`49441`	`c`	[NAG]A:1301	`9`	`1`	`365`	`87.8`	`1.7`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`49`		C	`11`	`5`	`49248`	`c`	[NAG]N:1	`9`	`1`	`348`	`86.6`	`2.1`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`50`		A	`10`	`5`	`49441`	`c`	[NAG]A:1303	`6`	`1`	`366`	`85.0`	`2.5`	`0.501`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		C	`9`	`5`	`49248`	`c`	[NAG]C:1303	`7`	`1`	`366`	`79.9`	`2.6`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`82.4`	`2.5`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`52`		[NAG]G:1	`7`	`1`	`349`	`c`	[NAG]G:2	`10`	`1`	`359`	`84.3`	`2.7`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`355`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`350`	`75.9`	`2.1`	`0.107`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`80.1`	`2.4`	`0.104`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`54`		B	`11`	`4`	`49326`	`◊`	[NAG]I:2	`5`	`1`	`364`	`78.0`	`1.8`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		C	`9`	`3`	`49248`	`◊`	[NAG]K:2	`5`	`1`	`352`	`64.4`	`1.7`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.2`	`1.8`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`56`		[NAG]O:1	`8`	`1`	`363`	`c`	[NAG]O:2	`10`	`1`	`362`	`75.6`	`2.3`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		A	`9`	`5`	`49441`	`c`	[NAG]D:1	`7`	`1`	`367`	`75.4`	`2.5`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`58`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`354`	`c`	[NAG]J:2	`10`	`1`	`353`	`75.1`	`2.0`	`0.114`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`59`		A	`8`	`2`	`49441`	`c`	[NAG]A:1306	`7`	`1`	`363`	`74.8`	`1.9`	`0.415`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`60`		[NAG]D:1	`5`	`1`	`367`	`c`	[NAG]D:2	`10`	`1`	`358`	`74.7`	`1.7`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`61`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]Q:2	`9`	`1`	`362`	`73.8`	`2.2`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`62`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`348`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`360`	`73.8`	`1.9`	`0.103`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`63`		A	`12`	`4`	`49441`	`◊`	[NAG]P:2	`4`	`1`	`363`	`73.3`	`1.6`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`64`		C	`7`	`2`	`49248`	`c`	[NAG]C:1306	`9`	`1`	`366`	`72.7`	`2.4`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`65`		[NAG]P:1	`7`	`1`	`365`	`c`	[NAG]P:2	`8`	`1`	`363`	`72.2`	`1.8`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`66`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`358`	`72.1`	`1.4`	`0.092`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`67`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]R:2	`10`	`1`	`353`	`70.4`	`1.6`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`68`		[NAG]U:1	`7`	`1`	`361`	`c`	[NAG]U:2	`9`	`1`	`361`	`70.1`	`1.5`	`0.086`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`366`	`67.7`	`1.2`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.9`	`1.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`70`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]I:2	`9`	`1`	`364`	`68.6`	`1.8`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[NAG]K:1	`5`	`1`	`360`	`c`	[NAG]K:2	`10`	`1`	`352`	`67.0`	`1.5`	`0.107`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.8`	`1.6`	`0.098`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`72`		B	`10`	`4`	`49326`	`c`	[NAG]G:1	`7`	`1`	`349`	`65.1`	`1.8`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`73`		B	`7`	`2`	`49326`	`c`	[NAG]B:1206	`8`	`1`	`367`	`61.4`	`1.6`	`0.298`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`74`		A	`4`	`1`	`49441`	`c`	[NAG]A:1308	`6`	`1`	`368`	`57.9`	`1.7`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`75`		H	`6`	`2`	`11934`	`◊`	[NAG]C:1301	`5`	`1`	`366`	`50.6`	`0.5`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`76`		C	`4`	`2`	`49248`	`◊`	[NAG]U:2	`4`	`1`	`361`	`43.1`	`1.4`	`0.504`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		B	`3`	`1`	`49326`	`◊`	[NAG]E:2	`4`	`1`	`366`	`35.2`	`1.3`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`39.1`	`1.4`	`0.491`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`78`		A	`8`	`4`	`49441`	`◊`	[NAG]Q:2	`4`	`1`	`362`	`38.7`	`1.5`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`79`		C	`5`	`2`	`49248`	`◊`	[NAG]O:1	`2`	`1`	`363`	`36.6`	`1.2`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`80`		B	`4`	`2`	`49326`	`◊`	[NAG]J:2	`3`	`1`	`353`	`31.4`	`1.4`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`81`		B	`5`	`2`	`49326`	`◊`	[NAG]A:1309	`3`	`1`	`367`	`30.0`	`0.1`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		A	`4`	`2`	`49441`	`◊`	[NAG]C:1309	`4`	`1`	`366`	`14.0`	`0.2`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		C	`4`	`2`	`49248`	`◊`	[NAG]B:1207	`3`	`1`	`364`	`6.5`	`0.2`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`16.9`	`0.2`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`84`		A	`4`	`2`	`49441`	`◊`	[NAG]O:2	`4`	`1`	`362`	`26.8`	`1.0`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`85`		A	`3`	`1`	`49441`	`◊`	[NAG]C:1310	`3`	`1`	`364`	`21.1`	`0.9`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		B	`2`	`1`	`49326`	`◊`	[NAG]A:1310	`2`	`1`	`364`	`18.0`	`0.8`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.5`	`0.8`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`87`		A	`3`	`1`	`49441`	`◊`	[NAG]R:2	`1`	`1`	`353`	`20.9`	`0.6`	`0.600`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
66	`88`		C	`5`	`3`	`49248`	`◊`	[NAG]M:2	`3`	`1`	`350`	`20.8`	`0.2`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`89`		C	`3`	`1`	`49248`	`◊`	[NAG]B:1208	`4`	`1`	`367`	`19.2`	`0.8`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`90`		T	`3`	`2`	`11776`	`◊`	[NAG]A:1301	`2`	`1`	`365`	`19.0`	`0.5`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`91`		B	`3`	`1`	`49326`	`◊`	[NAG]C:1303	`4`	`1`	`366`	`18.6`	`-0.1`	`0.223`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`92`		C	`3`	`1`	`49248`	`◊`	[NAG]A:1303	`1`	`1`	`366`	`16.6`	`0.1`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`93`		A	`4`	`2`	`49441`	`◊`	[NAG]F:1	`1`	`1`	`364`	`14.7`	`0.4`	`0.670`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`94`		C	`2`	`2`	`49248`	`◊`	[NAG]N:2	`2`	`1`	`360`	`11.4`	`0.3`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe