PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=552-02-515)

Interfaces in PDB 7kea

SARS-COV-2 D614G 1-RBD-UP SPIKE PROTEIN TRIMER WITHOUT THE P986-P987 STABILIZING MUTATIONS (S-GSAS-D614G SUB CLASSIFICATION)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`517`	`154`	`48172`	`◊`	C	`488`	`139`	`47874`	`4648.0`	`-50.5`	`0.186`	`50`	`6`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`464`	`133`	`48172`	`◊`	B	`492`	`139`	`47410`	`4443.2`	`-57.8`	`0.096`	`43`	`7`	`0`	`0.000`
3	`3`		C	`471`	`140`	`47874`	`◊`	B	`430`	`123`	`47410`	`4111.2`	`-47.6`	`0.295`	`38`	`8`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`14`	`7`	`47410`	`c`	[NAG]B:1302	`13`	`1`	`358`	`142.3`	`3.1`	`0.304`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		C	`16`	`7`	`47874`	`c`	[NAG]L:1	`12`	`1`	`366`	`139.2`	`2.0`	`0.254`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`15`	`8`	`48172`	`c`	[NAG]E:1	`13`	`1`	`364`	`136.8`	`2.4`	`0.244`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`138.0`	`2.2`	`0.249`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		B	`16`	`7`	`47410`	`c`	[NAG]B:1310	`13`	`1`	`363`	`138.2`	`2.4`	`0.269`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		B	`18`	`6`	`47410`	`c`	[NAG]J:1	`11`	`1`	`363`	`137.0`	`3.3`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		A	`17`	`5`	`48172`	`c`	[NAG]G:1	`12`	`1`	`363`	`134.6`	`3.0`	`0.364`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		C	`17`	`6`	`47874`	`c`	[NAG]N:1	`12`	`1`	`366`	`134.3`	`2.6`	`0.341`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`134.5`	`2.8`	`0.352`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		A	`14`	`6`	`48172`	`c`	[NAG]A:1302	`11`	`1`	`363`	`133.8`	`2.8`	`0.364`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		C	`16`	`9`	`47874`	`c`	[NAG]C:1306	`8`	`1`	`359`	`131.6`	`3.5`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		A	`12`	`6`	`48172`	`c`	[NAG]A:1305	`9`	`1`	`362`	`131.1`	`3.6`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		B	`15`	`6`	`47410`	`c`	[NAG]B:1311	`11`	`1`	`366`	`126.4`	`3.0`	`0.401`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		A	`15`	`6`	`48172`	`c`	[NAG]A:1310	`10`	`1`	`364`	`120.5`	`3.0`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		C	`13`	`5`	`47874`	`c`	[NAG]C:1311	`11`	`1`	`366`	`120.0`	`3.1`	`0.381`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		A	`16`	`6`	`48172`	`c`	[NAG]A:1306	`12`	`1`	`366`	`119.6`	`2.6`	`0.297`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		C	`14`	`5`	`47874`	`c`	[NAG]C:1305	`9`	`1`	`362`	`119.3`	`3.2`	`0.454`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		C	`11`	`5`	`47874`	`c`	[NAG]C:1302	`9`	`1`	`358`	`114.5`	`2.6`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		C	`15`	`5`	`47874`	`c`	[NAG]C:1301	`10`	`1`	`367`	`110.7`	`2.5`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		B	`14`	`5`	`47410`	`c`	[NAG]B:1305	`11`	`1`	`364`	`109.8`	`3.3`	`0.395`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		A	`14`	`6`	`48172`	`c`	[NAG]A:1309	`8`	`1`	`365`	`108.3`	`2.5`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		C	`14`	`6`	`47874`	`c`	[NAG]C:1310	`9`	`1`	`354`	`108.0`	`2.9`	`0.451`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		A	`12`	`6`	`48172`	`c`	[NAG]F:1	`8`	`1`	`365`	`106.7`	`2.6`	`0.447`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		B	`10`	`4`	`47410`	`c`	[NAG]B:1309	`9`	`1`	`365`	`106.0`	`2.3`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		A	`12`	`4`	`48172`	`c`	[NAG]D:1	`11`	`1`	`369`	`105.7`	`2.1`	`0.269`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		B	`12`	`4`	`47410`	`c`	[NAG]B:1307	`10`	`1`	`365`	`103.5`	`2.0`	`0.282`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		A	`13`	`3`	`48172`	`c`	[NAG]A:1301	`10`	`1`	`365`	`102.3`	`1.8`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		B	`14`	`3`	`47410`	`c`	[NAG]B:1301	`12`	`1`	`366`	`101.4`	`1.5`	`0.223`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		C	`10`	`3`	`47874`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`366`	`100.5`	`2.0`	`0.345`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		A	`12`	`3`	`48172`	`c`	[NAG]A:1307	`9`	`1`	`361`	`93.3`	`2.1`	`0.378`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`96.9`	`2.1`	`0.362`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
29	`32`		C	`13`	`5`	`47874`	`c`	[NAG]M:1	`11`	`1`	`363`	`98.6`	`2.4`	`0.295`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`33`		B	`11`	`4`	`47410`	`c`	[NAG]B:1312	`9`	`1`	`365`	`98.2`	`2.4`	`0.346`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`34`		C	`7`	`3`	`47874`	`c`	[NAG]C:1304	`7`	`1`	`366`	`95.8`	`3.1`	`0.594`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`35`		C	`10`	`4`	`47874`	`c`	[NAG]C:1303	`7`	`1`	`368`	`95.7`	`3.1`	`0.580`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`36`		B	`10`	`3`	`47410`	`c`	[NAG]I:1	`12`	`1`	`366`	`95.5`	`2.5`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`37`		A	`12`	`4`	`48172`	`c`	[NAG]A:1304	`9`	`1`	`365`	`94.5`	`3.0`	`0.433`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`38`		B	`11`	`4`	`47410`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`367`	`94.2`	`2.5`	`0.442`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
36	`39`		B	`9`	`3`	`47410`	`c`	[NAG]B:1303	`10`	`1`	`365`	`93.8`	`1.6`	`0.262`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`40`		B	`9`	`3`	`47410`	`c`	[NAG]B:1304	`7`	`1`	`367`	`92.1`	`3.3`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`41`		A	`8`	`3`	`48172`	`c`	[NAG]A:1303	`9`	`1`	`366`	`91.1`	`2.7`	`0.406`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`42`		B	`10`	`3`	`47410`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`365`	`89.2`	`3.8`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`43`		B	`9`	`4`	`47410`	`c`	[NAG]K:1	`9`	`1`	`367`	`87.2`	`2.6`	`0.387`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`44`		A	`9`	`2`	`48172`	`c`	[NAG]A:1308	`8`	`1`	`368`	`84.6`	`3.6`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`45`		C	`5`	`2`	`47874`	`c`	[NAG]C:1307	`9`	`1`	`362`	`84.2`	`2.3`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		C	`10`	`5`	`47874`	`c`	[NAG]O:1	`8`	`1`	`364`	`80.1`	`2.3`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		A	`8`	`4`	`48172`	`c`	[NAG]H:1	`9`	`1`	`365`	`78.2`	`2.4`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`79.2`	`2.4`	`0.365`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		[NAG]K:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]K:2	`8`	`1`	`364`	`74.4`	`1.7`	`0.101`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		[NAG]F:1	`7`	`1`	`365`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`364`	`72.8`	`1.6`	`0.078`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`365`	`71.7`	`1.7`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]I:1	`5`	`1`	`366`	`c`	[NAG]I:2	`10`	`1`	`366`	`68.3`	`1.5`	`0.092`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]M:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]M:2	`9`	`1`	`365`	`67.7`	`1.5`	`0.091`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]H:1	`5`	`1`	`365`	`c`	[NAG]H:2	`8`	`1`	`365`	`67.5`	`1.1`	`0.101`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]L:1	`5`	`1`	`366`	`c`	[NAG]L:2	`8`	`1`	`363`	`67.4`	`1.4`	`0.103`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`369`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`365`	`66.3`	`1.2`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.8`	`1.4`	`0.092`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`56`		C	`6`	`2`	`47874`	`c`	[NAG]C:1312	`9`	`1`	`366`	`72.3`	`2.3`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`57`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]O:2	`10`	`1`	`364`	`72.2`	`1.7`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`58`		C	`10`	`4`	`47874`	`◊`	[NAG]L:2	`6`	`1`	`363`	`69.2`	`1.1`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`59`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`366`	`68.8`	`1.5`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`60`		A	`10`	`4`	`48172`	`◊`	[NAG]E:2	`5`	`1`	`365`	`67.7`	`1.2`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`61`		[NAG]J:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]J:2	`9`	`1`	`364`	`67.1`	`1.3`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]G:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`364`	`65.0`	`1.2`	`0.078`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.1`	`1.2`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`63`		C	`6`	`2`	`47874`	`c`	[NAG]C:1309	`6`	`1`	`367`	`62.1`	`1.6`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`64`		B	`7`	`3`	`47410`	`◊`	[NAG]J:2	`5`	`1`	`364`	`56.6`	`1.6`	`0.505`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
54	`65`		A	`7`	`3`	`48172`	`◊`	[NAG]G:2	`6`	`1`	`364`	`53.0`	`1.6`	`0.422`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		C	`5`	`2`	`47874`	`◊`	[NAG]N:2	`5`	`1`	`366`	`51.9`	`1.5`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`52.4`	`1.5`	`0.434`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`67`		C	`6`	`2`	`47874`	`◊`	[NAG]B:1309	`4`	`1`	`365`	`48.9`	`0.3`	`0.314`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`68`		A	`3`	`2`	`48172`	`◊`	[NAG]C:1310	`5`	`1`	`354`	`46.8`	`1.2`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`69`		C	`7`	`3`	`47874`	`◊`	[NAG]M:2	`5`	`1`	`365`	`45.8`	`1.7`	`0.523`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`70`		A	`4`	`1`	`48172`	`◊`	[NAG]B:1304	`5`	`1`	`367`	`44.2`	`0.8`	`0.372`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		C	`3`	`1`	`47874`	`◊`	[NAG]A:1303	`2`	`1`	`366`	`28.9`	`1.0`	`0.465`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`36.5`	`0.9`	`0.419`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`72`		B	`6`	`2`	`47410`	`◊`	[NAG]I:2	`4`	`1`	`366`	`43.8`	`1.6`	`0.615`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`73`		B	`2`	`2`	`47410`	`◊`	[NAG]A:1309	`4`	`1`	`365`	`37.2`	`-0.5`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`74`		C	`3`	`2`	`47874`	`◊`	[NAG]B:1311	`4`	`1`	`366`	`31.1`	`1.2`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`75`		A	`7`	`3`	`48172`	`◊`	[NAG]B:1303	`1`	`1`	`365`	`30.4`	`1.2`	`0.765`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`76`		A	`3`	`2`	`48172`	`◊`	[NAG]F:2	`1`	`1`	`364`	`22.1`	`0.4`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`77`		A	`3`	`2`	`48172`	`◊`	[NAG]C:1311	`3`	`1`	`366`	`20.2`	`0.8`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`78`		B	`2`	`1`	`47410`	`◊`	[NAG]A:1310	`4`	`1`	`364`	`20.0`	`0.9`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`79`		B	`2`	`1`	`47410`	`◊`	[NAG]C:1304	`3`	`1`	`366`	`19.1`	`1.2`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`80`		A	`3`	`2`	`48172`	`◊`	[NAG]D:2	`2`	`1`	`365`	`16.3`	`0.9`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`81`		A	`2`	`1`	`48172`	`◊`	[NAG]H:2	`1`	`1`	`365`	`5.8`	`0.2`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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