PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=654-0D-DOM)

Interfaces in PDB 7ke8

SARS-COV-2 D614G 3 RBD DOWN SPIKE PROTEIN TRIMER WITHOUT THE P986-P987 STABILIZING MUTATIONS (S-GSAS-D614G SUB-CLASSIFICATION)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`592`	`165`	`49292`	`◊`	C	`616`	`173`	`49491`	`5470.6`	`-51.7`	`0.176`	`52`	`10`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`553`	`155`	`50089`	`◊`	B	`606`	`171`	`49292`	`5275.4`	`-55.4`	`0.092`	`53`	`9`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`590`	`170`	`50089`	`◊`	C	`537`	`155`	`49491`	`5131.1`	`-54.2`	`0.094`	`51`	`11`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`5292.4`	`-53.8`	`0.121`	`52`	`10`	`0`	`0.000`
2	`4`		C	`17`	`7`	`49491`	`c`	[NAG]C:1310	`11`	`1`	`366`	`145.9`	`5.0`	`0.520`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		C	`17`	`9`	`49491`	`c`	[NAG]Q:1	`13`	`1`	`366`	`137.9`	`2.6`	`0.249`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`15`	`8`	`50089`	`c`	[NAG]E:1	`13`	`1`	`364`	`134.7`	`2.6`	`0.249`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		B	`16`	`8`	`49292`	`c`	[NAG]M:1	`13`	`1`	`366`	`126.0`	`2.5`	`0.230`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`132.9`	`2.6`	`0.242`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		A	`15`	`8`	`50089`	`c`	[NAG]A:1302	`11`	`1`	`361`	`137.4`	`4.1`	`0.470`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`9`		A	`18`	`6`	`50089`	`c`	[NAG]G:1	`12`	`1`	`366`	`137.3`	`3.2`	`0.367`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		B	`18`	`5`	`49292`	`c`	[NAG]L:1	`12`	`1`	`364`	`135.6`	`2.7`	`0.331`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		C	`15`	`5`	`49491`	`c`	[NAG]P:1	`11`	`1`	`366`	`134.6`	`3.1`	`0.408`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`135.8`	`3.0`	`0.369`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`12`		C	`17`	`6`	`49491`	`c`	[NAG]C:1302	`10`	`1`	`362`	`131.9`	`3.4`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`13`		B	`16`	`8`	`49292`	`c`	[NAG]B:1311	`10`	`1`	`360`	`128.2`	`3.2`	`0.420`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		B	`13`	`6`	`49292`	`c`	[NAG]B:1303	`11`	`1`	`362`	`126.0`	`3.4`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`15`		C	`14`	`6`	`49491`	`c`	[NAG]C:1304	`11`	`1`	`364`	`121.9`	`3.0`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		A	`12`	`5`	`50089`	`c`	[NAG]A:1310	`10`	`1`	`364`	`121.5`	`2.9`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		A	`11`	`6`	`50089`	`c`	[NAG]A:1305	`9`	`1`	`367`	`120.2`	`3.3`	`0.485`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		C	`12`	`5`	`49491`	`c`	[NAG]C:1308	`8`	`1`	`364`	`117.0`	`2.7`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		A	`11`	`4`	`50089`	`c`	[NAG]A:1309	`7`	`1`	`365`	`112.6`	`2.6`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`114.8`	`2.7`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		B	`13`	`7`	`49292`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`361`	`115.9`	`3.3`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`21`		C	`13`	`4`	`49491`	`c`	[NAG]C:1305	`10`	`1`	`360`	`115.3`	`3.1`	`0.417`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`22`		B	`20`	`5`	`49292`	`c`	[NAG]B:1310	`9`	`1`	`367`	`115.2`	`3.0`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`23`		B	`11`	`5`	`49292`	`c`	[NAG]B:1307	`9`	`1`	`365`	`111.8`	`2.6`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`24`		A	`13`	`4`	`50089`	`c`	[NAG]A:1301	`10`	`1`	`366`	`108.8`	`2.3`	`0.317`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`25`		B	`14`	`5`	`49292`	`c`	[NAG]B:1308	`8`	`1`	`367`	`108.1`	`3.7`	`0.575`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		C	`13`	`4`	`49491`	`c`	[NAG]C:1306	`8`	`1`	`361`	`106.0`	`3.8`	`0.576`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		C	`10`	`4`	`49491`	`c`	[NAG]N:1	`10`	`1`	`367`	`103.8`	`1.7`	`0.258`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`28`		B	`12`	`4`	`49292`	`c`	[NAG]I:1	`10`	`1`	`369`	`103.1`	`1.7`	`0.278`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`29`		A	`14`	`6`	`50089`	`c`	[NAG]F:1	`11`	`1`	`366`	`102.7`	`2.7`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		B	`13`	`5`	`49292`	`c`	[NAG]K:1	`12`	`1`	`367`	`102.0`	`2.7`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`102.3`	`2.7`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`31`		A	`12`	`4`	`50089`	`c`	[NAG]A:1303	`7`	`1`	`365`	`101.2`	`3.5`	`0.608`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		A	`13`	`4`	`50089`	`c`	[NAG]A:1307	`10`	`1`	`367`	`99.7`	`2.5`	`0.349`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`33`		A	`14`	`4`	`50089`	`c`	[NAG]A:1304	`9`	`1`	`362`	`99.6`	`3.6`	`0.448`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`34`		B	`10`	`3`	`49292`	`c`	[NAG]B:1309	`8`	`1`	`366`	`97.8`	`3.2`	`0.505`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`35`		B	`12`	`3`	`49292`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`365`	`97.7`	`2.1`	`0.298`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
28	`36`		C	`13`	`6`	`49491`	`c`	[NAG]O:1	`10`	`1`	`364`	`96.9`	`2.5`	`0.343`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`37`		C	`12`	`4`	`49491`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`365`	`96.9`	`2.2`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`38`		A	`8`	`4`	`50089`	`c`	[NAG]D:1	`9`	`1`	`363`	`96.5`	`2.1`	`0.335`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		C	`9`	`3`	`49491`	`c`	[NAG]C:1307	`7`	`1`	`368`	`95.5`	`3.2`	`0.569`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`40`		A	`10`	`3`	`50089`	`c`	[NAG]A:1308	`9`	`1`	`364`	`93.9`	`3.8`	`0.448`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`41`		B	`10`	`3`	`49292`	`c`	[NAG]B:1305	`7`	`1`	`365`	`90.6`	`2.9`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`42`		B	`12`	`5`	`49292`	`c`	[NAG]J:1	`7`	`1`	`367`	`89.0`	`2.9`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		C	`9`	`3`	`49491`	`c`	[NAG]R:1	`6`	`1`	`365`	`84.5`	`2.9`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		A	`8`	`3`	`50089`	`c`	[NAG]H:1	`9`	`1`	`363`	`84.4`	`2.6`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`86.0`	`2.8`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		B	`9`	`2`	`49292`	`c`	[NAG]B:1304	`9`	`1`	`364`	`88.5`	`2.4`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		A	`8`	`2`	`50089`	`c`	[NAG]A:1311	`7`	`1`	`366`	`82.6`	`2.8`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`85.5`	`2.6`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`47`		C	`10`	`3`	`49491`	`c`	[NAG]C:1303	`9`	`1`	`365`	`84.8`	`2.0`	`0.323`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`48`		C	`8`	`3`	`49491`	`c`	[NAG]C:1311	`9`	`1`	`367`	`83.7`	`2.1`	`0.342`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`49`		C	`9`	`3`	`49491`	`c`	[NAG]C:1309	`8`	`1`	`365`	`77.6`	`2.4`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`50`		[NAG]O:1	`5`	`1`	`364`	`c`	[NAG]O:2	`9`	`1`	`367`	`75.0`	`2.0`	`0.128`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]J:1	`7`	`1`	`367`	`c`	[NAG]J:2	`10`	`1`	`365`	`74.4`	`1.9`	`0.087`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]F:1	`5`	`1`	`366`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`366`	`74.3`	`1.9`	`0.125`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`74.6`	`1.9`	`0.114`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`53`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`369`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`365`	`74.4`	`1.6`	`0.101`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`54`		[NAG]K:1	`7`	`1`	`367`	`c`	[NAG]K:2	`9`	`1`	`367`	`74.1`	`1.9`	`0.091`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`55`		[NAG]H:1	`7`	`1`	`363`	`c`	[NAG]H:2	`10`	`1`	`364`	`72.9`	`1.6`	`0.077`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`56`		[NAG]P:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]P:2	`9`	`1`	`364`	`72.8`	`1.8`	`0.108`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]Q:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]Q:2	`8`	`1`	`370`	`71.0`	`1.6`	`0.099`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`366`	`69.8`	`1.6`	`0.099`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.2`	`1.7`	`0.102`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`59`		[NAG]D:1	`7`	`1`	`363`	`c`	[NAG]D:2	`8`	`1`	`367`	`72.1`	`1.6`	`0.083`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`365`	`69.6`	`1.3`	`0.078`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[NAG]E:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]E:2	`10`	`1`	`365`	`69.4`	`1.5`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`70.4`	`1.5`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`62`		A	`11`	`2`	`50089`	`◊`	[NAG]I:1	`6`	`1`	`369`	`70.6`	`2.5`	`0.563`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		B	`8`	`2`	`49292`	`◊`	[NAG]N:1	`5`	`1`	`367`	`65.2`	`2.2`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.9`	`2.4`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`64`		C	`12`	`4`	`49491`	`◊`	[NAG]Q:2	`4`	`1`	`370`	`69.5`	`1.4`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		A	`11`	`4`	`50089`	`◊`	[NAG]E:2	`4`	`1`	`365`	`67.2`	`1.2`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		B	`13`	`4`	`49292`	`◊`	[NAG]M:2	`4`	`1`	`366`	`66.4`	`1.2`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.7`	`1.3`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`67`		[NAG]R:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]R:2	`9`	`1`	`366`	`68.9`	`1.4`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`68`		[NAG]L:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]L:2	`9`	`1`	`366`	`68.1`	`1.3`	`0.070`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NAG]G:1	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`367`	`68.0`	`1.4`	`0.085`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.0`	`1.4`	`0.078`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`70`		A	`7`	`2`	`50089`	`c`	[NAG]A:1306	`9`	`1`	`370`	`67.6`	`1.8`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`71`		B	`8`	`2`	`49292`	`c`	[NAG]B:1302	`7`	`1`	`370`	`65.8`	`1.7`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`72`		C	`6`	`3`	`49491`	`◊`	[NAG]P:2	`5`	`1`	`364`	`55.8`	`1.6`	`0.469`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`73`		C	`7`	`2`	`49491`	`◊`	[NAG]D:1	`5`	`1`	`363`	`53.8`	`1.9`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`74`		A	`6`	`2`	`50089`	`◊`	[NAG]G:2	`5`	`1`	`367`	`53.3`	`1.6`	`0.484`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		B	`5`	`2`	`49292`	`◊`	[NAG]L:2	`5`	`1`	`366`	`52.2`	`1.4`	`0.420`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`52.8`	`1.5`	`0.452`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
54	`76`		B	`5`	`2`	`49292`	`◊`	[NAG]A:1309	`6`	`1`	`365`	`51.5`	`0.4`	`0.217`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`77`		A	`5`	`2`	`50089`	`◊`	[NAG]C:1308	`6`	`1`	`364`	`48.8`	`0.4`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`78`		C	`3`	`1`	`49491`	`◊`	[NAG]A:1303	`5`	`1`	`365`	`47.1`	`0.7`	`0.286`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
57	`79`		A	`3`	`1`	`50089`	`◊`	[NAG]B:1309	`4`	`1`	`366`	`43.8`	`0.8`	`0.365`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
58	`80`		A	`6`	`2`	`50089`	`◊`	[NAG]D:2	`3`	`1`	`367`	`43.5`	`2.1`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`81`		B	`3`	`1`	`49292`	`◊`	[NAG]C:1307	`5`	`1`	`368`	`40.0`	`0.7`	`0.281`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
60	`82`		C	`5`	`2`	`49491`	`◊`	[NAG]B:1307	`4`	`1`	`365`	`39.7`	`0.0`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`83`		A	`4`	`3`	`50089`	`◊`	[NAG]B:1304	`2`	`1`	`364`	`31.3`	`0.9`	`0.682`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
62	`84`		C	`2`	`1`	`49491`	`◊`	[NAG]B:1303	`4`	`1`	`362`	`24.8`	`1.1`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`85`		A	`2`	`1`	`50089`	`◊`	[NAG]C:1304	`4`	`1`	`364`	`22.3`	`0.9`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`86`		B	`3`	`2`	`49292`	`◊`	[NAG]A:1310	`3`	`1`	`364`	`22.0`	`0.9`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`87`		B	`4`	`2`	`49292`	`◊`	[NAG]K:2	`3`	`1`	`367`	`21.3`	`0.8`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`88`		C	`4`	`2`	`49491`	`◊`	[NAG]O:2	`3`	`1`	`367`	`20.3`	`0.6`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		A	`3`	`1`	`50089`	`◊`	[NAG]F:2	`3`	`1`	`366`	`11.8`	`0.4`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`16.0`	`0.5`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`90`		B	`4`	`2`	`49292`	`◊`	[NAG]I:2	`3`	`1`	`365`	`17.3`	`0.4`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`91`		B	`1`	`1`	`49292`	`◊`	[NAG]C:1305	`2`	`1`	`360`	`14.9`	`-0.0`	`0.181`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`92`		A	`2`	`1`	`50089`	`◊`	[NAG]I:2	`1`	`1`	`365`	`8.2`	`0.4`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`93`		C	`2`	`2`	`49491`	`◊`	[NAG]A:1311	`2`	`1`	`366`	`7.0`	`0.2`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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