PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=115-9O-EDI)

Interfaces in PDB 7b9h crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.50 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE PDE4D CATALYTIC DOMAIN IN COMPLEX WITH GEBR- 42A

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`81`	`22`	`15509`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`77`	`21`	`15103`	`679.5`	`-3.3`	`0.428`	`15`	`10`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`64`	`19`	`15509`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`74`	`20`	`15103`	`620.0`	`-2.3`	`0.480`	`7`	`4`	`0`	`0.000`
3	`3`		[T3K]A:524	`28`	`1`	`610`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`23`	`15103`	`420.6`	`-7.9`	`0.345`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
4	`4`		[T3K]B:516	`28`	`1`	`614`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`54`	`19`	`15509`	`400.5`	`-8.6`	`0.226`	`2`	`0`	`0`	`0.019`
5	`5`		B	`35`	`10`	`15509`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`30`	`10`	`15103`	`318.0`	`-1.5`	`0.419`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		B	`29`	`8`	`15509`	`x`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`35`	`13`	`15509`	`317.7`	`-2.5`	`0.330`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
7	`7`		A	`24`	`8`	`15103`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`29`	`11`	`15509`	`250.4`	`-1.8`	`0.399`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`26`	`10`	`15103`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`21`	`6`	`15103`	`187.7`	`2.3`	`0.849`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`23`	`7`	`15103`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`19`	`5`	`15103`	`172.8`	`0.2`	`0.616`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
10	`10`		[EDO]B:515	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15509`	`113.0`	`3.1`	`0.434`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[EDO]A:520	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`15103`	`112.5`	`3.4`	`0.443`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		[EDO]A:511	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`15103`	`106.6`	`2.7`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		[EDO]A:517	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`15103`	`106.5`	`3.3`	`0.476`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		[EDO]A:507	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`15103`	`106.2`	`2.7`	`0.437`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[EDO]A:522	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`15103`	`102.3`	`1.9`	`0.374`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		[EDO]B:513	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15509`	`99.6`	`2.5`	`0.423`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[EDO]B:506	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15509`	`96.1`	`2.2`	`0.261`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		A	`15`	`7`	`15103`	`◊`	[EDO]B:512	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`4`	`1`	`185`	`94.8`	`3.0`	`0.507`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[EDO]A:518	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`15103`	`94.7`	`1.7`	`0.256`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		[EDO]B:509	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`8`	`15509`	`92.9`	`3.1`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`21`		[EDO]A:516	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`15103`	`92.6`	`3.2`	`0.535`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		[EDO]A:508	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15103`	`86.9`	`3.0`	`0.302`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
23	`23`		[EDO]A:514	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15103`	`86.6`	`2.4`	`0.286`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		[EDO]B:508	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15509`	`85.2`	`3.7`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		[EDO]B:505	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15509`	`82.9`	`3.0`	`0.300`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		[EDO]A:523	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15103`	`82.7`	`1.6`	`0.200`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		B	`12`	`4`	`15509`	`◊`	[EDO]A:513	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`186`	`82.3`	`1.9`	`0.209`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		[EDO]B:507	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`15509`	`81.6`	`2.2`	`0.277`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		[EDO]B:511	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`16`	`6`	`15103`	`81.0`	`1.6`	`0.233`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		[EDO]A:519	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`15103`	`78.6`	`2.2`	`0.249`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		[EDO]B:514	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15509`	`76.8`	`2.3`	`0.270`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`32`		[EDO]A:515	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15103`	`75.4`	`1.7`	`0.190`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`33`		[EDO]A:510	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15103`	`73.3`	`2.8`	`0.300`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`34`		[EDO]A:521	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15103`	`71.3`	`1.5`	`0.687`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`35`		[EDO]B:510	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`15509`	`66.8`	`2.0`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`36`		[EDO]A:509	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`9`	`2`	`15103`	`64.1`	`1.9`	`0.254`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`37`		[EDO]A:512	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`15103`	`63.8`	`2.1`	`0.277`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`38`		B	`9`	`3`	`15509`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`8`	`2`	`15103`	`61.3`	`0.6`	`0.707`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`39`		[EDO]B:511	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`15509`	`60.2`	`1.2`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`40`		[MG]B:502	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`15509`	`59.6`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`41`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`15103`	`50.2`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`54.9`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
41	`42`		B	`9`	`4`	`15509`	`f`	[EDO]A:512	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`184`	`57.0`	`1.5`	`0.666`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		[EDO]B:512	`3`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15509`	`56.6`	`1.5`	`0.231`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[EDO]A:509	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15103`	`54.0`	`0.9`	`0.798`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		[EDO]A:515	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`15509`	`51.1`	`0.2`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		[EDO]A:523	`4`	`1`	`186`	`f`	[EDO]A:521	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`49.5`	`2.3`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		[ZN]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15509`	`46.1`	`-33.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
	`48`		[ZN]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15103`	`39.7`	`-30.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
	*Average:*													`42.9`	`-31.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
47	`49`		B	`6`	`2`	`15509`	`◊`	[EDO]A:514	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`185`	`44.9`	`1.9`	`0.950`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		[EDO]B:505	`3`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15103`	`43.3`	`1.5`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		B	`6`	`3`	`15509`	`◊`	[EDO]A:515	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`184`	`43.3`	`0.3`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		[MG]B:503	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`10`	`5`	`15103`	`42.2`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		[EDO]A:508	`3`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15509`	`40.2`	`1.2`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		B	`5`	`2`	`15509`	`f`	[EDO]A:516	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`182`	`39.9`	`0.9`	`0.858`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`55`		[EDO]A:513	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15103`	`39.9`	`1.6`	`0.950`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		[EDO]B:507	`3`	`1`	`184`	`f`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`4`	`2`	`15103`	`39.2`	`2.3`	`0.986`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`57`		B	`4`	`1`	`15509`	`f`	[EDO]A:517	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`182`	`38.7`	`1.1`	`0.889`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`58`		[EDO]A:521	`3`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`15509`	`38.0`	`1.1`	`0.794`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[MG]B:504	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15509`	`37.9`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
58	`60`		[MG]A:505	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15103`	`37.1`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
59	`61`		[MG]B:503	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`15509`	`36.7`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
60	`62`		[MG]A:504	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15103`	`36.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
61	`63`		[MG]A:504	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`7`	`3`	`15103`	`32.6`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		[EDO]A:513	`3`	`1`	`186`	`◊`	[EDO]A:512	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`31.2`	`1.7`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		[MG]A:505	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`5`	`1`	`15103`	`28.0`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		A	`1`	`1`	`15103`	`◊`	[EDO]A:510	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`184`	`26.3`	`0.9`	`0.962`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		B	`2`	`1`	`15509`	`◊`	[EDO]B:509	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`184`	`25.7`	`0.8`	`0.927`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		[EDO]B:507	`3`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]A:516	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`182`	`24.0`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		[T3K]A:524	`2`	`1`	`610`	`f`	[EDO]A:518	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`23.7`	`0.8`	`0.923`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`70`		A	`4`	`1`	`15103`	`f`	[MG]A:506	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`98`	`21.6`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
69	`71`		[MG]B:504	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`4`	`2`	`15103`	`21.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`72`		[EDO]A:514	`2`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15509`	`21.1`	`1.4`	`0.991`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`73`		[EDO]A:509	`2`	`1`	`183`	`◊`	[EDO]A:510	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`184`	`20.4`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`74`		[T3K]A:524	`5`	`1`	`610`	`f`	[MG]A:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`18.1`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
73	`75`		[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`15103`	`16.7`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
74	`76`		[MG]A:506	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`15103`	`16.5`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`77`		[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`3`	`1`	`15509`	`16.1`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`78`		[MG]B:502	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`15.0`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
77	`79`		[EDO]A:509	`3`	`1`	`183`	`f`	[MG]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.8`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
78	`80`		[T3K]A:524	`2`	`1`	`610`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.5`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
79	`81`		[MG]A:502	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.8`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
80	`82`		B	`4`	`1`	`15509`	`◊`	[EDO]B:508	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`183`	`12.2`	`0.4`	`0.878`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`83`		[EDO]B:509	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]B:508	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`11.9`	`0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`84`		[T3K]A:524	`2`	`1`	`610`	`f`	[EDO]A:511	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`11.8`	`0.1`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`85`		[EDO]B:511	`3`	`1`	`185`	`f`	[MG]B:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.3`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
84	`86`		[EDO]B:515	`2`	`1`	`185`	`f`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`15103`	`5.1`	`0.1`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`87`		A	`2`	`1`	`15103`	`f`	[EDO]B:510	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`185`	`4.6`	`0.1`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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