PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=967-H0-8L9)

Interfaces in PDB 6zoz

STRUCTURE OF DISULPHIDE-STABILIZED SARS-COV-2 SPIKE PROTEIN TRIMER (X1 DISULPHIDE-BOND MUTANT, S383C, D985C, K986P, V987P, SINGLE ARG S1/S2 CLEAVAGE SITE) IN LOCKED STATE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`669`	`182`	`53883`	`◊`	C	`674`	`192`	`53839`	`6264.0`	`-56.4`	`0.393`	`55`	`12`	`1`	`0.000`
	`2`		A	`667`	`188`	`53883`	`◊`	B	`676`	`184`	`53869`	`6260.1`	`-56.5`	`0.393`	`54`	`12`	`1`	`0.000`
	`3`		B	`664`	`188`	`53869`	`◊`	C	`672`	`182`	`53839`	`6231.5`	`-56.1`	`0.393`	`54`	`11`	`1`	`0.000`
	*Average:*											`6251.8`	`-56.3`	`0.393`	`54`	`12`	`1`	`0.000`
2	`4`		A	`23`	`10`	`53883`	`c`	[NAG]A:1302	`11`	`1`	`352`	`171.4`	`4.1`	`0.504`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		C	`24`	`10`	`53839`	`c`	[NAG]C:1302	`11`	`1`	`351`	`171.3`	`4.0`	`0.525`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`23`	`10`	`53869`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`351`	`170.4`	`4.0`	`0.516`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`171.0`	`4.0`	`0.515`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		C	`18`	`7`	`53839`	`c`	[NAG]C:1320	`10`	`1`	`353`	`146.6`	`3.5`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		B	`18`	`7`	`53869`	`c`	[NAG]B:1320	`11`	`1`	`354`	`146.0`	`3.5`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		A	`17`	`6`	`53883`	`c`	[NAG]A:1320	`10`	`1`	`354`	`145.9`	`3.5`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`146.2`	`3.5`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		B	`19`	`8`	`53869`	`c`	[NAG]B:1310	`13`	`1`	`363`	`136.1`	`2.0`	`0.215`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		A	`20`	`8`	`53883`	`c`	[NAG]A:1310	`13`	`1`	`363`	`136.0`	`1.9`	`0.214`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		C	`19`	`8`	`53839`	`c`	[NAG]C:1310	`13`	`1`	`362`	`135.3`	`1.9`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`135.8`	`1.9`	`0.217`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		A	`22`	`6`	`53883`	`c`	[NAG]A:1301	`12`	`1`	`355`	`133.1`	`2.3`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		C	`20`	`5`	`53839`	`c`	[NAG]C:1301	`12`	`1`	`356`	`132.7`	`2.3`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		B	`21`	`6`	`53869`	`c`	[NAG]B:1301	`12`	`1`	`357`	`132.7`	`2.2`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`132.9`	`2.3`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`16`		A	`16`	`5`	`53883`	`c`	[NAG]A:1315	`12`	`1`	`357`	`124.5`	`3.1`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		B	`16`	`5`	`53869`	`c`	[NAG]B:1315	`11`	`1`	`357`	`124.4`	`3.1`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		C	`17`	`5`	`53839`	`c`	[NAG]C:1315	`12`	`1`	`355`	`123.9`	`3.1`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`124.3`	`3.1`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`19`		B	`13`	`4`	`53869`	`c`	[NAG]B:1314	`9`	`1`	`362`	`121.3`	`3.5`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		A	`13`	`4`	`53883`	`c`	[NAG]A:1314	`9`	`1`	`362`	`120.2`	`3.5`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		C	`12`	`4`	`53839`	`c`	[NAG]C:1314	`9`	`1`	`363`	`120.1`	`3.5`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`120.5`	`3.5`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`22`		C	`10`	`4`	`53839`	`c`	[NAG]C:1321	`11`	`1`	`363`	`107.6`	`2.8`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		B	`10`	`4`	`53869`	`c`	[NAG]B:1321	`11`	`1`	`363`	`107.0`	`2.8`	`0.293`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		A	`10`	`4`	`53883`	`c`	[NAG]A:1321	`11`	`1`	`364`	`106.6`	`2.8`	`0.293`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`107.1`	`2.8`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`25`		C	`8`	`4`	`53839`	`c`	[NAG]C:1309	`10`	`1`	`357`	`104.1`	`3.1`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		B	`8`	`4`	`53869`	`c`	[NAG]B:1309	`10`	`1`	`357`	`103.6`	`3.1`	`0.411`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		A	`8`	`4`	`53883`	`c`	[NAG]A:1309	`10`	`1`	`357`	`103.3`	`3.1`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`103.7`	`3.1`	`0.404`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`28`		A	`12`	`3`	`53883`	`c`	[NAG]A:1305	`9`	`1`	`353`	`99.3`	`2.2`	`0.375`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		C	`12`	`3`	`53839`	`c`	[NAG]C:1305	`9`	`1`	`353`	`99.1`	`2.2`	`0.397`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		B	`12`	`3`	`53869`	`c`	[NAG]B:1305	`9`	`1`	`354`	`99.0`	`2.2`	`0.395`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`99.1`	`2.2`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`31`		A	`11`	`4`	`53883`	`c`	[NAG]A:1312	`9`	`1`	`360`	`96.4`	`2.8`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`11`	`4`	`53869`	`c`	[NAG]B:1312	`9`	`1`	`357`	`95.8`	`2.8`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		C	`11`	`4`	`53839`	`c`	[NAG]C:1312	`9`	`1`	`357`	`95.8`	`2.8`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`96.0`	`2.8`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`34`		A	`11`	`3`	`53883`	`c`	[NAG]A:1318	`9`	`1`	`363`	`86.2`	`2.1`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		C	`10`	`3`	`53839`	`c`	[NAG]C:1318	`9`	`1`	`362`	`86.2`	`2.1`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		B	`10`	`3`	`53869`	`c`	[NAG]B:1318	`8`	`1`	`363`	`85.8`	`2.1`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`86.1`	`2.1`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`37`		B	`9`	`3`	`53869`	`c`	[NAG]B:1303	`9`	`1`	`355`	`85.5`	`1.9`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		C	`9`	`3`	`53839`	`c`	[NAG]C:1303	`9`	`1`	`357`	`85.5`	`1.9`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		A	`9`	`3`	`53883`	`c`	[NAG]A:1303	`9`	`1`	`357`	`85.3`	`1.9`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`85.4`	`1.9`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`40`		B	`7`	`4`	`53869`	`c`	[NAG]B:1319	`7`	`1`	`358`	`85.3`	`3.4`	`0.601`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		C	`7`	`4`	`53839`	`c`	[NAG]C:1319	`8`	`1`	`356`	`84.7`	`3.4`	`0.472`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		A	`7`	`4`	`53883`	`c`	[NAG]A:1319	`7`	`1`	`356`	`84.3`	`3.4`	`0.601`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`84.8`	`3.4`	`0.558`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`43`		B	`11`	`5`	`53869`	`◊`	[NAG]C:1303	`5`	`1`	`357`	`84.2`	`3.1`	`0.768`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		C	`11`	`5`	`53839`	`◊`	[NAG]A:1303	`5`	`1`	`357`	`83.9`	`3.1`	`0.770`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		A	`11`	`5`	`53883`	`◊`	[NAG]B:1303	`5`	`1`	`355`	`83.7`	`3.1`	`0.767`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`83.9`	`3.1`	`0.768`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`46`		[NAG]A:1312	`7`	`1`	`360`	`c`	[NAG]A:1313	`10`	`1`	`361`	`80.0`	`2.0`	`0.088`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[NAG]C:1312	`7`	`1`	`357`	`c`	[NAG]C:1313	`10`	`1`	`361`	`79.9`	`2.1`	`0.088`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[NAG]B:1312	`7`	`1`	`357`	`c`	[NAG]B:1313	`10`	`1`	`362`	`79.9`	`2.0`	`0.086`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`80.0`	`2.0`	`0.087`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`49`		B	`9`	`3`	`53869`	`c`	[NAG]B:1307	`10`	`1`	`354`	`79.8`	`1.8`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		C	`8`	`3`	`53839`	`c`	[NAG]C:1307	`10`	`1`	`354`	`79.6`	`1.8`	`0.242`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		A	`9`	`3`	`53883`	`c`	[NAG]A:1307	`10`	`1`	`355`	`79.3`	`1.8`	`0.242`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`79.6`	`1.8`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`52`		B	`9`	`5`	`53869`	`c`	[NAG]B:1316	`9`	`1`	`360`	`76.0`	`2.0`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		C	`9`	`5`	`53839`	`c`	[NAG]C:1316	`9`	`1`	`361`	`75.9`	`2.0`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		A	`9`	`5`	`53883`	`c`	[NAG]A:1316	`8`	`1`	`360`	`75.4`	`2.0`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`75.8`	`2.0`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`55`		[NAG]A:1316	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]A:1317	`9`	`1`	`357`	`75.1`	`1.6`	`0.094`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]B:1316	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]B:1317	`8`	`1`	`359`	`75.0`	`1.6`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]C:1316	`6`	`1`	`361`	`c`	[NAG]C:1317	`8`	`1`	`359`	`74.4`	`1.6`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`74.8`	`1.6`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`58`		B	`8`	`4`	`53869`	`◊`	[NAG]C:1318	`6`	`1`	`362`	`72.9`	`2.4`	`0.518`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		C	`9`	`5`	`53839`	`◊`	[NAG]A:1318	`6`	`1`	`363`	`72.7`	`2.4`	`0.526`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		A	`8`	`4`	`53883`	`◊`	[NAG]B:1318	`6`	`1`	`363`	`72.0`	`2.4`	`0.521`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.5`	`2.4`	`0.522`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`61`		A	`7`	`3`	`53883`	`c`	[NAG]A:1306	`8`	`1`	`360`	`68.0`	`1.9`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		C	`7`	`3`	`53839`	`c`	[NAG]C:1306	`8`	`1`	`362`	`67.6`	`1.9`	`0.287`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		B	`7`	`3`	`53869`	`c`	[NAG]B:1306	`8`	`1`	`360`	`67.6`	`1.9`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.8`	`1.9`	`0.283`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`64`		[NAG]C:1303	`7`	`1`	`357`	`c`	[NAG]C:1304	`10`	`1`	`363`	`66.8`	`1.2`	`0.070`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]B:1303	`7`	`1`	`355`	`c`	[NAG]B:1304	`9`	`1`	`361`	`66.3`	`1.2`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[NAG]A:1303	`7`	`1`	`357`	`c`	[NAG]A:1304	`9`	`1`	`361`	`66.1`	`1.1`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.4`	`1.2`	`0.076`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`67`		C	`7`	`3`	`53839`	`c`	[NAG]C:1308	`8`	`1`	`357`	`66.2`	`2.1`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		B	`7`	`3`	`53869`	`c`	[NAG]B:1308	`8`	`1`	`356`	`65.9`	`2.1`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		A	`7`	`3`	`53883`	`c`	[NAG]A:1308	`8`	`1`	`357`	`65.7`	`2.2`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`65.9`	`2.1`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`70`		A	`11`	`4`	`53883`	`◊`	[NAG]A:1311	`6`	`1`	`354`	`63.3`	`1.0`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		C	`10`	`4`	`53839`	`◊`	[NAG]C:1311	`6`	`1`	`355`	`63.3`	`1.0`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		B	`11`	`4`	`53869`	`◊`	[NAG]B:1311	`6`	`1`	`355`	`63.3`	`1.0`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`63.3`	`1.0`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`73`		[NAG]C:1310	`4`	`1`	`362`	`c`	[NAG]C:1311	`8`	`1`	`355`	`63.1`	`1.1`	`0.123`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		[NAG]A:1310	`4`	`1`	`363`	`c`	[NAG]A:1311	`8`	`1`	`354`	`63.0`	`1.1`	`0.122`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		[NAG]B:1310	`4`	`1`	`363`	`c`	[NAG]B:1311	`8`	`1`	`355`	`63.0`	`1.1`	`0.122`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`63.0`	`1.1`	`0.122`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`76`		C	`3`	`1`	`53839`	`◊`	[NAG]A:1319	`5`	`1`	`356`	`45.9`	`0.6`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		A	`3`	`1`	`53883`	`◊`	[NAG]B:1319	`5`	`1`	`358`	`45.6`	`0.6`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		B	`3`	`1`	`53869`	`◊`	[NAG]C:1319	`5`	`1`	`356`	`45.1`	`0.6`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`45.6`	`0.6`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`79`		A	`5`	`2`	`53883`	`◊`	[NAG]C:1307	`4`	`1`	`354`	`44.3`	`1.1`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		B	`5`	`2`	`53869`	`◊`	[NAG]A:1307	`4`	`1`	`355`	`44.0`	`1.1`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`81`		C	`5`	`2`	`53839`	`◊`	[NAG]B:1307	`4`	`1`	`354`	`44.0`	`1.1`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`44.1`	`1.1`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`82`		C	`4`	`2`	`53839`	`◊`	[NAG]A:1304	`2`	`1`	`361`	`40.0`	`0.6`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		A	`4`	`2`	`53883`	`◊`	[NAG]B:1304	`2`	`1`	`361`	`39.9`	`0.6`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		B	`4`	`2`	`53869`	`◊`	[NAG]C:1304	`2`	`1`	`363`	`39.5`	`0.6`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`39.8`	`0.6`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`85`		A	`3`	`2`	`53883`	`◊`	[NAG]C:1309	`3`	`1`	`357`	`16.1`	`0.1`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		B	`3`	`2`	`53869`	`◊`	[NAG]A:1309	`3`	`1`	`357`	`15.8`	`0.1`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		C	`3`	`2`	`53839`	`◊`	[NAG]B:1309	`3`	`1`	`357`	`14.8`	`0.1`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`15.6`	`0.1`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`88`		A	`2`	`1`	`53883`	`◊`	[NAG]C:1314	`2`	`1`	`363`	`15.2`	`0.7`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		C	`2`	`1`	`53839`	`◊`	[NAG]B:1314	`1`	`1`	`362`	`14.7`	`0.7`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		B	`2`	`1`	`53869`	`◊`	[NAG]A:1314	`1`	`1`	`362`	`14.7`	`0.7`	`0.805`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`14.9`	`0.7`	`0.720`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`91`		C	`2`	`2`	`53839`	`◊`	[NAG]C:1313	`3`	`1`	`361`	`11.4`	`0.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		B	`2`	`2`	`53869`	`◊`	[NAG]B:1313	`3`	`1`	`362`	`11.4`	`0.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`93`		A	`2`	`2`	`53883`	`◊`	[NAG]A:1313	`3`	`1`	`361`	`11.4`	`0.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`11.4`	`0.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`94`		C	`1`	`1`	`53839`	`◊`	[NAG]C:1304	`1`	`1`	`363`	`1.8`	`0.0`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`95`		A	`1`	`1`	`53883`	`◊`	[NAG]A:1304	`1`	`1`	`361`	`1.8`	`0.0`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`96`		B	`1`	`1`	`53869`	`◊`	[NAG]B:1304	`1`	`1`	`361`	`1.7`	`0.0`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1.8`	`0.0`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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