PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=162-P2-6BD)

Interfaces in PDB 6vxx

STRUCTURE OF THE SARS-COV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN (CLOSED STATE)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`501`	`150`	`49789`	`◊`	C	`521`	`156`	`49805`	`4673.4`	`-52.8`	`0.023`	`41`	`8`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`499`	`151`	`49798`	`◊`	B	`526`	`156`	`49789`	`4671.4`	`-52.9`	`0.023`	`41`	`8`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`526`	`156`	`49798`	`◊`	C	`499`	`150`	`49805`	`4670.2`	`-52.8`	`0.024`	`41`	`8`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`4671.7`	`-52.8`	`0.023`	`41`	`8`	`0`	`0.000`
2	`4`		C	`14`	`8`	`49805`	`c`	[NAG]C:1307	`11`	`1`	`365`	`143.3`	`3.7`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`14`	`8`	`49789`	`c`	[NAG]B:1307	`11`	`1`	`366`	`143.2`	`3.7`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`14`	`8`	`49798`	`c`	[NAG]A:1307	`11`	`1`	`366`	`143.1`	`3.7`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`143.2`	`3.7`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		C	`17`	`6`	`49805`	`c`	[NAG]C:1302	`11`	`1`	`360`	`136.4`	`4.2`	`0.495`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		B	`16`	`6`	`49789`	`c`	[NAG]B:1302	`11`	`1`	`360`	`136.1`	`4.2`	`0.509`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		A	`16`	`6`	`49798`	`c`	[NAG]A:1302	`11`	`1`	`361`	`135.7`	`4.2`	`0.484`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`136.0`	`4.2`	`0.496`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		A	`14`	`5`	`49798`	`c`	[NAG]A:1317	`13`	`1`	`367`	`131.8`	`3.4`	`0.352`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`14`	`5`	`49789`	`c`	[NAG]B:1317	`13`	`1`	`367`	`131.6`	`3.3`	`0.338`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		C	`14`	`5`	`49805`	`c`	[NAG]C:1317	`13`	`1`	`366`	`130.9`	`3.3`	`0.338`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`131.4`	`3.3`	`0.343`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		C	`17`	`9`	`49805`	`c`	[NAG]C:1312	`12`	`1`	`368`	`125.9`	`2.9`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		A	`17`	`9`	`49798`	`c`	[NAG]A:1312	`12`	`1`	`367`	`125.6`	`2.9`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		B	`16`	`9`	`49789`	`c`	[NAG]B:1312	`12`	`1`	`366`	`125.0`	`2.9`	`0.307`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`125.5`	`2.9`	`0.296`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`16`		C	`14`	`5`	`49805`	`c`	[NAG]C:1316	`12`	`1`	`364`	`124.2`	`3.8`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		B	`14`	`5`	`49789`	`c`	[NAG]B:1316	`12`	`1`	`363`	`123.6`	`3.8`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		A	`14`	`5`	`49798`	`c`	[NAG]A:1316	`12`	`1`	`365`	`123.2`	`3.7`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`123.7`	`3.8`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`19`		B	`17`	`6`	`49789`	`c`	[NAG]B:1306	`11`	`1`	`366`	`115.0`	`3.6`	`0.436`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		C	`16`	`6`	`49805`	`c`	[NAG]C:1306	`11`	`1`	`367`	`114.9`	`3.7`	`0.437`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		A	`17`	`6`	`49798`	`c`	[NAG]A:1306	`11`	`1`	`367`	`114.5`	`3.6`	`0.436`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`114.8`	`3.6`	`0.436`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`22`		B	`12`	`4`	`49789`	`c`	[NAG]B:1311	`9`	`1`	`367`	`112.8`	`2.9`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		A	`12`	`4`	`49798`	`c`	[NAG]A:1311	`9`	`1`	`368`	`111.6`	`2.9`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		C	`12`	`4`	`49805`	`c`	[NAG]C:1311	`9`	`1`	`367`	`111.5`	`2.9`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`112.0`	`2.9`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`25`		B	`13`	`5`	`49789`	`c`	[NAG]B:1314	`11`	`1`	`366`	`111.1`	`2.9`	`0.329`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		A	`13`	`5`	`49798`	`c`	[NAG]A:1314	`11`	`1`	`368`	`110.7`	`2.9`	`0.362`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		C	`13`	`5`	`49805`	`c`	[NAG]C:1314	`11`	`1`	`366`	`109.7`	`2.9`	`0.328`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`110.5`	`2.9`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`28`		B	`12`	`3`	`49789`	`c`	[NAG]B:1310	`7`	`1`	`367`	`101.5`	`4.1`	`0.700`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		A	`12`	`3`	`49798`	`c`	[NAG]A:1310	`7`	`1`	`366`	`101.5`	`4.2`	`0.682`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		C	`13`	`3`	`49805`	`c`	[NAG]C:1310	`7`	`1`	`366`	`100.8`	`4.1`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`101.2`	`4.1`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`31`		C	`8`	`3`	`49805`	`c`	[NAG]C:1305	`7`	`1`	`366`	`99.7`	`3.8`	`0.666`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`9`	`3`	`49789`	`c`	[NAG]B:1305	`7`	`1`	`365`	`99.6`	`3.8`	`0.663`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		A	`9`	`3`	`49798`	`c`	[NAG]A:1305	`7`	`1`	`365`	`98.9`	`3.8`	`0.664`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`99.4`	`3.8`	`0.664`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`34`		A	`14`	`6`	`49798`	`c`	[NAG]A:1309	`9`	`1`	`369`	`97.6`	`2.6`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		B	`13`	`6`	`49789`	`c`	[NAG]B:1309	`9`	`1`	`370`	`96.8`	`2.6`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		C	`14`	`6`	`49805`	`c`	[NAG]C:1309	`9`	`1`	`370`	`96.5`	`2.6`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`97.0`	`2.6`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`37`		A	`10`	`4`	`49798`	`c`	[NAG]A:1303	`11`	`1`	`367`	`95.6`	`2.1`	`0.250`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		C	`10`	`4`	`49805`	`c`	[NAG]C:1303	`11`	`1`	`366`	`94.9`	`2.1`	`0.251`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		B	`10`	`4`	`49789`	`c`	[NAG]B:1303	`11`	`1`	`364`	`94.8`	`2.1`	`0.264`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`95.1`	`2.1`	`0.255`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`40`		C	`11`	`4`	`49805`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`366`	`84.5`	`1.9`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		B	`11`	`4`	`49789`	`c`	[NAG]B:1301	`9`	`1`	`367`	`84.4`	`2.0`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		A	`11`	`4`	`49798`	`c`	[NAG]A:1301	`9`	`1`	`367`	`83.9`	`2.0`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`84.3`	`2.0`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`43`		C	`7`	`2`	`49805`	`c`	[NAG]C:1321	`7`	`1`	`367`	`74.5`	`2.6`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		B	`7`	`2`	`49789`	`c`	[NAG]B:1321	`7`	`1`	`365`	`73.5`	`2.6`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		A	`7`	`2`	`49798`	`c`	[NAG]A:1321	`7`	`1`	`366`	`73.2`	`2.6`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.8`	`2.6`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`46`		A	`8`	`4`	`49798`	`c`	[NAG]A:1319	`9`	`1`	`369`	`74.1`	`2.3`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		B	`8`	`4`	`49789`	`c`	[NAG]B:1319	`9`	`1`	`369`	`73.3`	`2.2`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		C	`8`	`4`	`49805`	`c`	[NAG]C:1319	`9`	`1`	`368`	`73.2`	`2.2`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.5`	`2.2`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`49`		[NAG]B:1319	`6`	`1`	`369`	`c`	[NAG]B:1320	`9`	`1`	`364`	`72.5`	`2.2`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NAG]A:1319	`6`	`1`	`369`	`c`	[NAG]A:1320	`9`	`1`	`364`	`72.5`	`2.3`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]C:1319	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]C:1320	`9`	`1`	`365`	`71.7`	`2.2`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.2`	`2.2`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`52`		[NAG]C:1303	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]C:1304	`9`	`1`	`368`	`71.8`	`1.9`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]A:1303	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]A:1304	`9`	`1`	`368`	`71.2`	`1.9`	`0.086`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]B:1303	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]B:1304	`9`	`1`	`368`	`71.0`	`1.8`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`71.3`	`1.9`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`55`		[NAG]B:1314	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]B:1315	`8`	`1`	`367`	`70.4`	`1.6`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]C:1314	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]C:1315	`8`	`1`	`366`	`70.3`	`1.5`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]A:1314	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]A:1315	`9`	`1`	`367`	`70.2`	`1.6`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NAG]A:1312	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]A:1313	`8`	`1`	`366`	`67.6`	`1.5`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[NAG]C:1317	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]C:1318	`8`	`1`	`366`	`66.8`	`1.3`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]B:1312	`6`	`1`	`366`	`c`	[NAG]B:1313	`8`	`1`	`366`	`66.8`	`1.5`	`0.112`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[NAG]C:1312	`6`	`1`	`368`	`c`	[NAG]C:1313	`8`	`1`	`367`	`66.7`	`1.4`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]B:1317	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]B:1318	`8`	`1`	`368`	`66.4`	`1.3`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[NAG]A:1317	`6`	`1`	`367`	`c`	[NAG]A:1318	`8`	`1`	`368`	`66.2`	`1.3`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`67.9`	`1.4`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`64`		C	`6`	`1`	`49805`	`c`	[NAG]C:1308	`9`	`1`	`369`	`63.4`	`1.7`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		B	`5`	`1`	`49789`	`c`	[NAG]B:1308	`9`	`1`	`366`	`62.7`	`1.7`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		A	`5`	`1`	`49798`	`c`	[NAG]A:1308	`8`	`1`	`366`	`62.1`	`1.7`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`62.7`	`1.7`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`67`		B	`8`	`2`	`49789`	`◊`	[NAG]C:1303	`3`	`1`	`366`	`59.3`	`1.8`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		A	`9`	`2`	`49798`	`◊`	[NAG]B:1303	`3`	`1`	`364`	`59.2`	`1.8`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		C	`9`	`2`	`49805`	`◊`	[NAG]A:1303	`3`	`1`	`367`	`59.0`	`1.8`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`59.2`	`1.8`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`70`		A	`8`	`3`	`49798`	`◊`	[NAG]A:1313	`4`	`1`	`366`	`56.9`	`0.9`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		C	`8`	`3`	`49805`	`◊`	[NAG]C:1313	`4`	`1`	`367`	`56.8`	`0.9`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		B	`9`	`3`	`49789`	`◊`	[NAG]B:1313	`4`	`1`	`366`	`56.5`	`0.9`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`56.7`	`0.9`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`73`		B	`4`	`1`	`49789`	`◊`	[NAG]B:1318	`4`	`1`	`368`	`38.4`	`1.2`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		C	`4`	`1`	`49805`	`◊`	[NAG]C:1318	`4`	`1`	`366`	`38.1`	`1.2`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		A	`4`	`1`	`49798`	`◊`	[NAG]A:1318	`4`	`1`	`368`	`37.9`	`1.2`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`38.1`	`1.2`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`76`		B	`5`	`2`	`49789`	`◊`	[NAG]B:1315	`3`	`1`	`367`	`29.7`	`1.1`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		A	`5`	`2`	`49798`	`◊`	[NAG]A:1315	`3`	`1`	`367`	`29.6`	`1.1`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		C	`5`	`2`	`49805`	`◊`	[NAG]C:1315	`3`	`1`	`366`	`29.5`	`1.1`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`29.6`	`1.1`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`79`		C	`2`	`1`	`49805`	`◊`	[NAG]C:1304	`1`	`1`	`368`	`20.8`	`1.3`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		B	`2`	`1`	`49789`	`◊`	[NAG]B:1304	`1`	`1`	`368`	`20.7`	`1.3`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`81`		A	`2`	`1`	`49798`	`◊`	[NAG]A:1304	`1`	`1`	`368`	`20.7`	`1.3`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`20.7`	`1.3`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`82`		B	`1`	`1`	`49789`	`◊`	[NAG]A:1316	`2`	`1`	`365`	`18.6`	`0.8`	`0.570`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		A	`1`	`1`	`49798`	`◊`	[NAG]C:1316	`2`	`1`	`364`	`18.4`	`0.8`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		C	`1`	`1`	`49805`	`◊`	[NAG]B:1316	`2`	`1`	`363`	`18.3`	`0.8`	`0.569`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`18.4`	`0.8`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`85`		A	`3`	`3`	`49798`	`◊`	[NAG]B:1321	`2`	`1`	`365`	`17.6`	`0.4`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		B	`3`	`3`	`49789`	`◊`	[NAG]C:1321	`2`	`1`	`367`	`17.4`	`0.4`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		C	`3`	`3`	`49805`	`◊`	[NAG]A:1321	`2`	`1`	`366`	`17.3`	`0.4`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.4`	`0.4`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`88`		B	`2`	`1`	`49789`	`◊`	[NAG]C:1305	`4`	`1`	`366`	`12.9`	`0.0`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		A	`2`	`1`	`49798`	`◊`	[NAG]B:1305	`4`	`1`	`365`	`12.7`	`0.0`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		C	`2`	`1`	`49805`	`◊`	[NAG]A:1305	`4`	`1`	`365`	`12.6`	`0.0`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`12.8`	`0.0`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`91`		B	`2`	`1`	`49789`	`◊`	[NAG]A:1311	`3`	`1`	`368`	`9.0`	`-0.2`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		A	`2`	`1`	`49798`	`◊`	[NAG]C:1311	`3`	`1`	`367`	`9.0`	`-0.1`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`93`		C	`2`	`1`	`49805`	`◊`	[NAG]B:1311	`3`	`1`	`367`	`8.8`	`-0.1`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`8.9`	`-0.1`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe