PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=521-1C-913)

Interfaces in PDB 6vfr crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.79 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PROTOCADHERIN 18 EC1-EC4

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`192`	`61`	`24558`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`191`	`62`	`25112`	`1785.2`	`-17.3`	`0.127`	`5`	`4`	`0`	`0.028`
2	`2`		A	`76`	`23`	`25112`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`84`	`28`	`25112`	`713.3`	`-3.9`	`0.357`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`53`	`18`	`24558`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`52`	`18`	`24558`	`462.1`	`-6.1`	`0.203`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`40`	`11`	`25112`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`45`	`13`	`24558`	`369.0`	`-1.0`	`0.556`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`28`	`9`	`25112`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`27`	`7`	`24558`	`230.9`	`0.7`	`0.696`	`0`	`7`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`18`	`4`	`25112`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`17`	`4`	`25112`	`160.5`	`1.3`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`21`	`8`	`24558`	`◊`	A	-x,y-1,-z	`2_545`	`16`	`5`	`25112`	`143.6`	`1.0`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		[NAG]A:501	`10`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`25112`	`133.0`	`4.8`	`0.600`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[NAG]B:502	`10`	`1`	`352`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`24558`	`126.6`	`4.1`	`0.569`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`129.8`	`4.5`	`0.584`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		B	`12`	`5`	`24558`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`19`	`7`	`24558`	`132.4`	`-0.1`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[EDO]B:520	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`24558`	`107.9`	`3.2`	`0.439`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[EDO]A:522	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`25112`	`105.7`	`1.7`	`0.343`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[NAG]A:506	`9`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`25112`	`100.1`	`2.8`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[EDO]B:519	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`24558`	`99.2`	`2.3`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[EDO]A:519	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`25112`	`95.4`	`1.9`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[EDO]A:523	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`25112`	`94.3`	`3.0`	`0.613`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		[FUC]A:509	`9`	`1`	`278`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`25112`	`94.0`	`3.0`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[EDO]B:518	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`8`	`24558`	`91.6`	`2.6`	`0.470`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[EDO]A:520	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`8`	`25112`	`88.3`	`2.5`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[NAG]B:501	`7`	`1`	`350`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`24558`	`81.2`	`2.4`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[EDO]A:521	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`25112`	`78.9`	`1.8`	`0.255`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[NAG]B:504	`7`	`1`	`355`	`cf`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`352`	`77.5`	`2.0`	`0.143`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[NAG]A:508	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]A:507	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`73.6`	`1.6`	`0.070`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[NAG]A:502	`7`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`359`	`71.1`	`1.9`	`0.128`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[NAG]B:508	`8`	`1`	`350`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`24558`	`68.2`	`2.0`	`0.362`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		[FUC]A:505	`7`	`1`	`279`	`cf`	[NAG]A:506	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`359`	`67.6`	`1.8`	`0.098`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		[MAN]B:507	`7`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]B:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`292`	`64.5`	`3.0`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[NA]B:521	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`24558`	`64.5`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
	`29`		[NA]A:524	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`25112`	`64.1`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
	*Average:*													`64.3`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
28	`30`		[BMA]B:505	`7`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`355`	`61.7`	`1.2`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[NAG]A:507	`7`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`25112`	`58.9`	`1.5`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[EDO]A:522	`4`	`1`	`185`	`f`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`9`	`3`	`24558`	`58.8`	`1.6`	`0.845`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[NAG]A:507	`6`	`1`	`362`	`cf`	[FUC]A:509	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`278`	`58.4`	`2.2`	`0.180`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[EDO]A:520	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`24558`	`57.9`	`1.4`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[FUC]A:504	`7`	`1`	`281`	`cf`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`359`	`56.9`	`2.0`	`0.192`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[FUC]B:503	`5`	`1`	`280`	`cf`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`352`	`56.8`	`1.5`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[BMA]A:503	`5`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`362`	`56.2`	`1.1`	`0.162`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		A	`8`	`4`	`25112`	`f`	[EDO]A:521	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`184`	`54.3`	`1.0`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[MAN]B:506	`6`	`1`	`292`	`cf`	[BMA]B:505	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`292`	`54.1`	`2.2`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[EDO]B:518	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`25112`	`52.4`	`0.7`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[CA]B:513	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`24558`	`43.9`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
	`42`		[CA]A:514	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`25112`	`41.1`	`-11.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
	*Average:*													`42.5`	`-11.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
40	`43`		[CA]A:517	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`25112`	`42.3`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	`44`		[CA]B:515	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`24558`	`39.2`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	*Average:*													`40.7`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
41	`45`		[CA]A:512	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`25112`	`39.4`	`-11.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
	`46`		[CA]B:510	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`5`	`24558`	`38.9`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
	*Average:*													`39.2`	`-11.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
42	`47`		[MAN]B:506	`3`	`1`	`292`	`f`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`355`	`33.7`	`1.3`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`48`		[FUC]A:504	`3`	`1`	`281`	`f`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`362`	`32.7`	`1.8`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`49`		[NAG]A:508	`5`	`1`	`360`	`f`	[FUC]A:509	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`278`	`31.2`	`1.7`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[MAN]B:507	`4`	`1`	`292`	`f`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`355`	`30.4`	`0.8`	`0.189`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[NAG]B:504	`3`	`1`	`355`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`24558`	`28.1`	`1.0`	`0.520`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`52`		[FUC]B:503	`3`	`1`	`280`	`f`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`355`	`28.1`	`1.5`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`53`		A	`3`	`2`	`25112`	`f`	[EDO]A:523	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`2`	`1`	`184`	`27.6`	`0.7`	`0.898`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		[EDO]B:520	`2`	`1`	`186`	`f`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`2`	`1`	`24558`	`22.2`	`0.0`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[NA]A:524	`1`	`1`	`125`	`f`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`359`	`16.0`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`56`		[NA]B:521	`1`	`1`	`125`	`f`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`352`	`14.5`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`15.3`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
51	`57`		[EDO]A:523	`1`	`1`	`184`	`f`	[CA]A:515	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`13.2`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
52	`58`		[FUC]A:504	`5`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`25112`	`12.8`	`0.5`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`59`		A	`3`	`2`	`25112`	`◊`	B	x,y-1,z-1	`1_544`	`4`	`2`	`24558`	`12.7`	`0.0`	`0.600`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`60`		B	`2`	`1`	`24558`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`3`	`2`	`25112`	`12.2`	`0.3`	`0.690`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`61`		[CA]B:516	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:515	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.6`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
56	`62`		[CA]A:517	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:516	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.8`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
57	`63`		[CA]B:510	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.4`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
58	`64`		[CA]A:512	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:511	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`9.9`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
59	`65`		[CA]A:514	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:513	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`8.7`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
60	`66`		B	`2`	`1`	`24558`	`◊`	A	x,y-1,z-1	`1_544`	`2`	`1`	`25112`	`8.3`	`-0.3`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`67`		[EDO]B:520	`1`	`1`	`186`	`f`	[CA]B:512	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`7.7`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
62	`68`		[FUC]B:503	`2`	`1`	`280`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`24558`	`6.0`	`-0.2`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`69`		[CA]B:514	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:513	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`5.8`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
64	`70`		[NAG]A:502	`1`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`25112`	`3.9`	`0.2`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`71`		[FUC]A:509	`2`	`1`	`278`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`25112`	`3.3`	`0.2`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`72`		[FUC]A:505	`1`	`1`	`279`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`25112`	`1.7`	`0.1`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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