PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=875-9B-P33)

Interfaces in PDB 6tld crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.61 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SCHISTOSOMA MANSONI HDAC8 COMPLEXED WITH A TRIAZOLE HYDROXAMATE INHIBITOR 2

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`136`	`42`	`17097`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`105`	`33`	`18309`	`1143.8`	`-13.9`	`0.071`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`94`	`28`	`17864`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`118`	`38`	`17166`	`979.5`	`-14.4`	`0.044`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`106`	`34`	`18309`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`90`	`28`	`17097`	`925.5`	`-10.2`	`0.137`	`10`	`4`	`0`	`0.000`
	`4`		A	`89`	`28`	`17166`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`99`	`33`	`17864`	`853.8`	`-7.7`	`0.258`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`975.7`	`-11.5`	`0.127`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
2	`5`		D	`64`	`19`	`17097`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`55`	`17`	`17864`	`549.1`	`0.3`	`0.753`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
3	`6`		C	`66`	`18`	`18309`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`44`	`12`	`17864`	`543.4`	`-3.4`	`0.470`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		C	`41`	`11`	`18309`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`52`	`16`	`17864`	`485.7`	`-2.5`	`0.482`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`514.6`	`-2.9`	`0.476`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		C	`35`	`12`	`18309`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`34`	`9`	`17166`	`341.8`	`1.5`	`0.772`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
5	`9`		D	`29`	`7`	`17097`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`13`	`17864`	`337.3`	`-2.2`	`0.389`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		C	`37`	`13`	`18309`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`7`	`17166`	`302.6`	`-3.0`	`0.329`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`320.0`	`-2.6`	`0.359`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`11`		[NK5]C:504	`14`	`1`	`378`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`33`	`12`	`18309`	`213.5`	`2.8`	`0.199`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[NK5]A:504	`15`	`1`	`376`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`14`	`17166`	`213.1`	`0.9`	`0.070`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[NK5]B:504	`15`	`1`	`374`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`37`	`13`	`17864`	`212.5`	`1.3`	`0.128`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NK5]D:505	`15`	`1`	`379`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`35`	`13`	`17097`	`212.3`	`1.4`	`0.122`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`212.8`	`1.6`	`0.130`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`15`		C	`21`	`7`	`18309`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`9`	`17166`	`198.4`	`0.5`	`0.687`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`16`		D	`18`	`7`	`17097`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`8`	`17864`	`171.7`	`-1.1`	`0.507`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`185.1`	`-0.3`	`0.597`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
8	`17`		[DMF]A:507	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`17166`	`142.1`	`3.0`	`0.428`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`18`		[GOL]A:508	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`17166`	`140.4`	`-0.2`	`0.569`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
	`19`		[GOL]C:510	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`18309`	`137.2`	`-0.3`	`0.590`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`138.8`	`-0.2`	`0.580`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
10	`20`		[DMF]C:505	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`18309`	`139.8`	`3.5`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`21`		[GOL]B:512	`6`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`17864`	`139.4`	`-0.1`	`0.609`	`7`	`0`	`0`	`0.003`
	`22`		[GOL]D:513	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`17097`	`133.7`	`-0.0`	`0.612`	`9`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`136.5`	`-0.1`	`0.611`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
12	`23`		[DMF]D:510	`5`	`1`	`214`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`17097`	`138.8`	`3.2`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		[DMF]B:507	`5`	`1`	`214`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`17864`	`138.1`	`3.3`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`25`		[GOL]A:509	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`7`	`17864`	`128.9`	`-0.6`	`0.571`	`4`	`0`	`0`	`0.002`
15	`26`		[GOL]C:511	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`18309`	`128.7`	`-0.2`	`0.605`	`5`	`0`	`0`	`0.002`
16	`27`		[DMF]B:506	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`17864`	`126.4`	`2.4`	`0.395`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[DMF]D:507	`5`	`1`	`215`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`17097`	`119.7`	`2.9`	`0.446`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`123.1`	`2.6`	`0.420`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`29`		D	`19`	`8`	`17097`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`23`	`6`	`17166`	`125.8`	`-0.3`	`0.606`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
18	`30`		[DMF]B:508	`5`	`1`	`215`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`17864`	`124.3`	`3.8`	`0.489`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`31`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`18309`	`122.2`	`3.4`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`32`		[DMF]C:509	`5`	`1`	`214`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18309`	`120.3`	`3.2`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`33`		[DMF]B:505	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`17864`	`117.6`	`3.4`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`34`		[DMF]D:506	`5`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`17097`	`117.4`	`2.5`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`35`		[DMF]B:511	`5`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`5`	`17864`	`114.5`	`3.2`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		[K]D:504	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17097`	`114.2`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	`37`		[K]B:503	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17864`	`114.1`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	`38`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17166`	`113.7`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	`39`		[K]C:503	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`18309`	`113.3`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	*Average:*													`113.8`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
25	`40`		[DMF]C:508	`5`	`1`	`215`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`18309`	`113.2`	`2.5`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`41`		[DMF]B:510	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`17864`	`113.0`	`2.5`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`42`		[DMF]D:509	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`17097`	`111.4`	`2.9`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`43`		[DMF]D:512	`5`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`5`	`17097`	`110.8`	`2.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`44`		[DMF]D:508	`5`	`1`	`215`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17097`	`109.1`	`2.5`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`45`		[DMF]A:506	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`17166`	`105.7`	`2.2`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`46`		[DMF]A:510	`5`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`17864`	`103.9`	`2.2`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`47`		[DMF]B:509	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`17864`	`102.0`	`2.2`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`48`		[DMF]D:511	`5`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17097`	`91.2`	`2.0`	`0.368`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`49`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`215`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`17166`	`87.3`	`2.7`	`0.404`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`50`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18309`	`83.1`	`1.6`	`0.303`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`51`		[DMF]D:511	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18309`	`80.5`	`1.4`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`52`		[DMF]D:501	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`4`	`17864`	`75.2`	`1.5`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`53`		[NK5]A:504	`5`	`1`	`376`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`3`	`17864`	`72.7`	`2.9`	`0.700`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NK5]C:504	`4`	`1`	`378`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`17097`	`70.0`	`2.8`	`0.744`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NK5]B:504	`4`	`1`	`374`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17166`	`66.9`	`2.6`	`0.744`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		C	`10`	`3`	`18309`	`◊`	[NK5]D:505	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`1`	`379`	`65.1`	`2.6`	`0.744`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`68.7`	`2.7`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`57`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`2`	`17864`	`64.0`	`1.7`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`58`		[GOL]A:509	`4`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`17166`	`53.9`	`0.0`	`0.570`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`59`		[GOL]C:511	`4`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`10`	`4`	`17097`	`50.7`	`-0.0`	`0.584`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`60`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`218`	`f`	A	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`17166`	`48.6`	`1.0`	`0.233`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`61`		D	`4`	`2`	`17097`	`f`	[DMF]B:508	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`215`	`45.5`	`-0.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`62`		C	`6`	`2`	`18309`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`6`	`3`	`17864`	`36.4`	`0.3`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`63`		[ZN]C:501	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`18309`	`36.4`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`64`		[ZN]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17166`	`36.4`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`65`		[ZN]D:502	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17097`	`36.3`	`-26.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`66`		[ZN]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17864`	`36.2`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`36.3`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
46	`67`		[DMF]A:510	`3`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17166`	`34.1`	`-0.3`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`68`		[DMF]D:501	`2`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`17097`	`33.2`	`0.9`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`69`		[DMF]D:501	`3`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`17166`	`32.9`	`-0.1`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`70`		C	`4`	`1`	`18309`	`◊`	[DMF]D:512	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`218`	`32.5`	`0.6`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`71`		[NK5]C:504	`4`	`1`	`378`	`f`	[ZN]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.3`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`72`		[NK5]A:504	`4`	`1`	`376`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.0`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`73`		[NK5]B:504	`4`	`1`	`374`	`f`	[ZN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.0`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`74`		[NK5]D:505	`4`	`1`	`379`	`f`	[ZN]D:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`28.9`	`-13.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`29.5`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
51	`75`		[GOL]C:510	`1`	`1`	`219`	`◊`	[DMF]C:508	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`215`	`21.2`	`0.4`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`76`		D	`2`	`1`	`17097`	`◊`	[DMF]B:510	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`216`	`18.5`	`0.3`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`77`		[DMF]D:508	`4`	`1`	`215`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`17166`	`18.2`	`0.8`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`78`		A	`1`	`1`	`17166`	`◊`	[DMF]B:509	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`216`	`15.8`	`0.8`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`79`		[GOL]B:512	`1`	`1`	`220`	`f`	[DMF]B:510	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`216`	`15.8`	`0.3`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`80`		[GOL]D:513	`1`	`1`	`219`	`f`	[DMF]D:509	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`216`	`15.2`	`-0.0`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`81`		[GOL]A:508	`2`	`1`	`219`	`f`	[DMF]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`215`	`15.0`	`-0.1`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`82`		[DMF]D:512	`1`	`1`	`218`	`f`	[NK5]D:505	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`379`	`14.5`	`0.6`	`0.163`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`83`		[DMF]D:508	`1`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`18309`	`9.9`	`0.2`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`84`		[DMF]C:506	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`17864`	`8.2`	`0.4`	`0.703`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`85`		[DMF]C:509	`2`	`1`	`214`	`f`	B	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`17864`	`7.2`	`-0.1`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`86`		[DMF]A:510	`2`	`1`	`217`	`◊`	[NK5]B:504	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`374`	`6.1`	`0.1`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`87`		[DMF]C:508	`2`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`17166`	`5.4`	`-0.0`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`88`		A	`1`	`1`	`17166`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`17166`	`4.9`	`-0.0`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`89`		[GOL]A:508	`1`	`1`	`219`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`17864`	`2.6`	`0.1`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`90`		D	`1`	`1`	`17097`	`f`	[DMF]B:509	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`216`	`0.4`	`0.0`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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