PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=733-AM-0IE)

Interfaces in PDB 6ptr crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.75 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A DNAN SLIDING CLAMP (DNA POLYMERASE III SUBUNIT BETA) FROM BARTONELLA BIRTLESII BOUND TO GRISELIMYCIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`110`	`30`	`17516`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`113`	`29`	`17391`	`1112.9`	`-7.1`	`0.292`	`23`	`3`	`0`	`1.000`
2	`2`		A	`86`	`26`	`17391`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`74`	`19`	`17516`	`695.0`	`-0.3`	`0.613`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		Y	`45`	`10`	`1313`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`74`	`23`	`17516`	`651.5`	`-13.5`	`0.327`	`2`	`0`	`0`	`1.000`
	`4`		X	`48`	`10`	`1311`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`72`	`20`	`17391`	`614.3`	`-12.1`	`0.419`	`2`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`632.9`	`-12.8`	`0.373`	`2`	`0`	`0`	`1.000`
4	`5`		B	`49`	`18`	`17516`	`x`	B	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`37`	`12`	`17516`	`370.9`	`-2.3`	`0.289`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`38`	`14`	`17391`	`◊`	Y	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`31`	`9`	`1313`	`343.5`	`-7.9`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
6	`7`		B	`29`	`11`	`17516`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`27`	`8`	`17391`	`220.1`	`0.6`	`0.652`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		A	`20`	`5`	`17391`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`8`	`17516`	`211.7`	`-0.3`	`0.522`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
8	`9`		A	`20`	`8`	`17391`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z-1	`4_454`	`17`	`5`	`17516`	`179.5`	`-1.7`	`0.328`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		A	`20`	`11`	`17391`	`x`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`20`	`9`	`17391`	`139.2`	`-1.6`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[EDO]B:501	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`11`	`17516`	`121.6`	`4.0`	`0.674`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[EDO]A:503	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`17391`	`121.0`	`4.4`	`0.721`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[EDO]A:504	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`17391`	`112.6`	`3.6`	`0.461`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[EDO]A:502	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`17391`	`104.2`	`3.7`	`0.480`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[EDO]A:505	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`17391`	`82.9`	`2.3`	`0.261`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[IOD]B:502	`1`	`1`	`144`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`17516`	`78.7`	`-0.3`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	`17`		[IOD]A:508	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`17391`	`75.6`	`-0.4`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	*Average:*													`77.1`	`-0.4`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
16	`18`		[IOD]A:512	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`17391`	`78.6`	`-0.5`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.121`
17	`19`		[IOD]A:506	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17391`	`75.6`	`-0.0`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`20`		[IOD]B:505	`1`	`1`	`144`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17516`	`74.7`	`-0.1`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`75.2`	`-0.1`	`0.691`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
18	`21`		[EDO]A:501	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`17391`	`73.0`	`1.6`	`0.719`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[IOD]A:511	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17391`	`70.3`	`0.1`	`0.738`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		[IOD]B:503	`1`	`1`	`144`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`17516`	`68.4`	`-0.4`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
21	`24`		[IOD]B:504	`1`	`1`	`144`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17516`	`67.6`	`-0.2`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
	`25`		[IOD]A:510	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17391`	`67.2`	`-0.3`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
	*Average:*													`67.4`	`-0.3`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
22	`26`		[IOD]A:509	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17391`	`64.0`	`-0.4`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.110`
23	`27`		[ACE]X:1	`3`	`1`	`170`	`cf`	X	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1311`	`62.0`	`-1.1`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
24	`28`		[ACE]Y:1	`3`	`1`	`172`	`cf`	Y	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1313`	`58.2`	`-1.1`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.259`
25	`29`		B	`7`	`3`	`17516`	`◊`	[IOD]B:503	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`144`	`56.9`	`-0.0`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		[ACE]X:1	`3`	`1`	`170`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`17391`	`56.1`	`-0.5`	`0.569`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
27	`31`		[IOD]A:507	`1`	`1`	`144`	`f`	X	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`1311`	`52.6`	`-0.4`	`0.947`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
28	`32`		[IOD]A:509	`1`	`1`	`144`	`f`	Y	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`8`	`4`	`1313`	`50.8`	`-0.6`	`0.967`	`0`	`0`	`0`	`0.139`
29	`33`		[ACE]Y:1	`3`	`1`	`172`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`17516`	`50.6`	`-0.6`	`0.543`	`1`	`0`	`0`	`0.064`
30	`34`		A	`9`	`4`	`17391`	`◊`	[ACE]Y:1	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`1`	`172`	`50.0`	`-0.5`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
31	`35`		[IOD]A:507	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17391`	`39.9`	`0.4`	`0.885`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[IOD]A:512	`1`	`1`	`144`	`◊`	X	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`1311`	`30.9`	`-0.4`	`0.905`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
33	`37`		[ACE]X:1	`2`	`1`	`170`	`f`	[IOD]A:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`29.6`	`-0.4`	`0.943`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
34	`38`		[IOD]A:506	`1`	`1`	`144`	`f`	X	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1311`	`25.5`	`-0.3`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
	`39`		[IOD]B:505	`1`	`1`	`144`	`f`	Y	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1313`	`24.4`	`-0.3`	`0.757`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
	*Average:*													`25.0`	`-0.3`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
35	`40`		A	`1`	`1`	`17391`	`◊`	[IOD]B:505	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`144`	`14.1`	`0.2`	`0.928`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		A	`1`	`1`	`17391`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`17391`	`5.7`	`-0.0`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		A	`1`	`1`	`17391`	`f`	[EDO]A:504	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`1`	`1`	`185`	`3.3`	`0.1`	`0.860`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		[IOD]A:511	`1`	`1`	`144`	`f`	[IOD]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`0.5`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[IOD]A:510	`1`	`1`	`144`	`f`	[EDO]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`0.3`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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