PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=255-9B-OP2)

Interfaces in PDB 6ok4 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.40 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DEHYDROGENASE (GAPDH) FROM CHLAMYDIA TRACHOMATIS WITH BOUND NAD

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`189`	`53`	`14759`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`182`	`52`	`14708`	`1836.3`	`-28.2`	`0.092`	`30`	`17`	`0`	`0.592`
	`2`		B	`192`	`53`	`14680`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`183`	`52`	`15005`	`1830.7`	`-28.8`	`0.090`	`30`	`18`	`0`	`0.592`
	*Average:*													`1833.5`	`-28.5`	`0.091`	`30`	`18`	`0`	`0.592`
2	`3`		C	`146`	`36`	`14708`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`145`	`36`	`15005`	`1332.4`	`-20.8`	`0.138`	`16`	`0`	`0`	`0.476`
	`4`		D	`145`	`36`	`14759`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`144`	`36`	`14680`	`1331.3`	`-21.7`	`0.146`	`15`	`0`	`0`	`0.476`
	*Average:*													`1331.8`	`-21.2`	`0.142`	`16`	`0`	`0`	`0.476`
3	`5`		[NAD]A:401	`40`	`1`	`833`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`73`	`31`	`15005`	`556.8`	`-6.5`	`0.476`	`4`	`0`	`0`	`0.285`
	`6`		[NAD]D:401	`41`	`1`	`832`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`75`	`32`	`14759`	`555.0`	`-6.9`	`0.488`	`4`	`0`	`0`	`0.285`
	`7`		[NAD]C:401	`41`	`1`	`835`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`74`	`31`	`14708`	`552.1`	`-6.6`	`0.511`	`4`	`0`	`0`	`0.285`
	`8`		[NAD]B:401	`41`	`1`	`835`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`72`	`30`	`14680`	`548.8`	`-6.6`	`0.532`	`4`	`0`	`0`	`0.285`
	*Average:*													`553.2`	`-6.6`	`0.502`	`4`	`0`	`0`	`0.285`
4	`9`		C	`49`	`14`	`14708`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`47`	`14`	`14680`	`376.8`	`-1.9`	`0.734`	`4`	`0`	`0`	`0.033`
	`10`		D	`48`	`14`	`14759`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`14`	`15005`	`371.5`	`-2.0`	`0.687`	`4`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`374.1`	`-2.0`	`0.711`	`4`	`0`	`0`	`0.033`
5	`11`		A	`36`	`10`	`15005`	`◊`	C	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`31`	`8`	`14708`	`321.8`	`2.2`	`0.918`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
6	`12`		C	`25`	`9`	`14708`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`7`	`14680`	`157.1`	`1.9`	`0.810`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		D	`16`	`6`	`14759`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`9`	`15005`	`149.1`	`1.6`	`0.789`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`153.1`	`1.8`	`0.799`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		[PEG]A:407	`7`	`1`	`255`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`15005`	`146.8`	`3.2`	`0.430`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		[PEG]B:408	`7`	`1`	`258`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`14680`	`139.7`	`3.4`	`0.420`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`16`		[PEG]C:409	`7`	`1`	`253`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`14708`	`139.2`	`4.5`	`0.547`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		[PEG]D:405	`7`	`1`	`254`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`14759`	`138.9`	`3.6`	`0.487`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		[EDO]B:402	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`14680`	`117.7`	`3.1`	`0.525`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`19`		[EDO]A:402	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`15005`	`107.5`	`2.6`	`0.487`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		[PO4]C:406	`5`	`1`	`190`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`13`	`14708`	`106.3`	`-7.2`	`0.692`	`4`	`0`	`0`	`0.128`
14	`21`		[PO4]A:404	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`12`	`15005`	`105.4`	`-7.1`	`0.669`	`3`	`0`	`0`	`0.120`
15	`22`		[EDO]D:402	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`14759`	`104.9`	`2.9`	`0.520`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`23`		[PO4]D:404	`5`	`1`	`190`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`12`	`14759`	`104.7`	`-7.1`	`0.692`	`3`	`0`	`0`	`0.142`
17	`24`		[PO4]B:407	`5`	`1`	`188`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`12`	`14680`	`104.0`	`-6.9`	`0.706`	`5`	`0`	`0`	`0.154`
18	`25`		[EDO]C:405	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`14708`	`99.0`	`2.4`	`0.473`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		[EDO]B:403	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`14680`	`97.4`	`3.2`	`0.550`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[EDO]B:406	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`14680`	`91.6`	`2.8`	`0.323`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
21	`28`		C	`13`	`4`	`14708`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`10`	`5`	`14759`	`88.4`	`0.7`	`0.794`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
22	`29`		A	`8`	`5`	`15005`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`14`	`5`	`14680`	`82.5`	`-0.5`	`0.542`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`30`		[EDO]C:408	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14708`	`81.4`	`1.9`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`31`		C	`8`	`3`	`14708`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`11`	`5`	`15005`	`80.2`	`-0.6`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`32`		[EDO]B:405	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14680`	`73.6`	`1.9`	`0.289`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`33`		[EDO]C:402	`3`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`14708`	`73.2`	`1.9`	`0.492`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`34`		[EDO]C:403	`4`	`1`	`182`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`14708`	`72.5`	`1.3`	`0.778`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		[EDO]D:403	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14759`	`71.1`	`1.7`	`0.854`	`4`	`0`	`0`	`0.002`
29	`36`		[EDO]B:404	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14680`	`69.8`	`1.6`	`0.898`	`5`	`0`	`0`	`0.010`
30	`37`		C	`13`	`7`	`14708`	`◊`	[EDO]B:404	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`184`	`65.9`	`2.5`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`38`		[EDO]D:403	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`6`	`15005`	`65.9`	`2.1`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`39`		[EDO]C:404	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`14708`	`64.1`	`2.4`	`0.336`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`40`		[EDO]A:406	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`15005`	`59.3`	`1.5`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`41`		[EDO]A:406	`3`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14759`	`58.6`	`1.4`	`0.271`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`15005`	`56.6`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
36	`43`		[EDO]A:403	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`15005`	`55.1`	`2.0`	`0.335`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		[PO4]C:407	`4`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14708`	`55.1`	`-2.8`	`0.870`	`2`	`0`	`0`	`0.052`
38	`45`		A	`10`	`4`	`15005`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`6`	`6`	`14759`	`54.6`	`0.8`	`0.831`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		[PO4]A:405	`4`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15005`	`54.3`	`-2.7`	`0.868`	`3`	`0`	`0`	`0.057`
40	`47`		[EDO]C:402	`3`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`15005`	`49.4`	`0.7`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		[NAD]C:401	`7`	`1`	`835`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`15005`	`49.2`	`-2.9`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`49`		[NAD]A:401	`7`	`1`	`833`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`14708`	`47.1`	`-2.8`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`50`		[NAD]D:401	`6`	`1`	`832`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`14680`	`43.7`	`-2.6`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`51`		[NAD]B:401	`5`	`1`	`835`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`14759`	`43.6`	`-2.6`	`0.238`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`45.9`	`-2.7`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
42	`52`		[EDO]B:406	`2`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`15005`	`45.9`	`1.0`	`0.494`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		[PO4]C:407	`5`	`1`	`188`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`4`	`15005`	`41.8`	`-1.9`	`0.950`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		C	`10`	`4`	`14708`	`◊`	[PO4]A:405	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`189`	`41.1`	`-2.0`	`0.953`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
45	`55`		[PO4]A:405	`4`	`1`	`189`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`14680`	`40.6`	`-1.8`	`0.926`	`1`	`0`	`0`	`0.030`
46	`56`		[PO4]C:407	`4`	`1`	`188`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14759`	`39.4`	`-1.7`	`0.928`	`1`	`0`	`0`	`0.028`
47	`57`		C	`6`	`3`	`14708`	`◊`	[EDO]A:403	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`183`	`37.6`	`1.1`	`0.953`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
48	`58`		[EDO]C:404	`3`	`1`	`185`	`◊`	[EDO]A:403	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`183`	`34.1`	`1.7`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`59`		[EDO]A:403	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14680`	`33.9`	`1.1`	`0.954`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`60`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`7`	`2`	`14708`	`30.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`61`		C	`4`	`2`	`14708`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`15005`	`29.2`	`2.2`	`0.994`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`62`		[EDO]C:404	`2`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`3`	`15005`	`28.4`	`1.2`	`0.675`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`63`		[EDO]C:404	`2`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14759`	`27.0`	`0.8`	`0.929`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
54	`64`		D	`1`	`1`	`14759`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`1`	`14680`	`24.0`	`-0.8`	`0.132`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`65`		[PO4]C:407	`3`	`1`	`188`	`◊`	[PO4]A:405	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`189`	`23.9`	`-2.2`	`0.982`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`66`		C	`4`	`2`	`14708`	`◊`	D	-x-1,y-1/2,-z-1/2	`3_444`	`3`	`1`	`14759`	`19.7`	`0.4`	`0.801`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`67`		[EDO]C:403	`2`	`1`	`182`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14759`	`18.7`	`0.3`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`68`		C	`2`	`1`	`14708`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`1`	`1`	`14680`	`14.4`	`0.1`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`69`		C	`1`	`1`	`14708`	`f`	[PEG]D:405	-x-1,y-1/2,-z-1/2	`3_444`	`1`	`1`	`254`	`14.1`	`-0.6`	`0.154`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
60	`70`		[PO4]A:405	`3`	`1`	`189`	`f`	[EDO]A:403	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`8.7`	`-0.3`	`0.996`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
61	`71`		[EDO]C:408	`1`	`1`	`186`	`f`	[EDO]C:405	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`8.1`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		[EDO]A:406	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14708`	`8.1`	`0.2`	`0.913`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		[PO4]C:407	`3`	`1`	`188`	`f`	[EDO]C:404	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`7.4`	`-0.2`	`0.996`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
64	`74`		[EDO]A:406	`1`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14680`	`5.9`	`0.1`	`0.902`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		B	`1`	`1`	`14680`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`1`	`1`	`14759`	`3.8`	`-0.1`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`76`		[EDO]C:402	`1`	`1`	`186`	`f`	[NAD]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`833`	`3.1`	`-0.1`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`77`		A	`1`	`1`	`15005`	`f`	[EDO]C:405	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`1`	`1`	`185`	`2.4`	`0.2`	`0.909`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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