PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=474-08-IP6)

Interfaces in PDB 6ibr crystal.
Space symmetry group: P 32 2 1. Resolution: 2.02 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ALPHA-GALACTOSIDASE A IN COMPLEX WITH ALPHA-GALACTOSE CONFIGURED CYCLOPHELLITOL EPOXIDE LWA481

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`100`	`33`	`15586`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`99`	`31`	`15535`	`928.1`	`-9.6`	`0.200`	`16`	`6`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`59`	`18`	`15586`	`◊`	A	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`62`	`17`	`15535`	`586.8`	`-10.1`	`0.046`	`5`	`0`	`0`	`0.023`
3	`3`		B	`59`	`16`	`15586`	`◊`	A	y-1,x+1,-z	`4_465`	`43`	`12`	`15535`	`480.7`	`-1.5`	`0.374`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`54`	`16`	`15535`	`x`	A	y-1,x,-z	`4_455`	`54`	`19`	`15535`	`426.6`	`1.2`	`0.777`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
5	`5`		[HBE]A:523	`12`	`1`	`303`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`15535`	`197.4`	`4.8`	`0.407`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		[HBE]B:520	`12`	`1`	`303`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`16`	`15586`	`196.2`	`4.6`	`0.398`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`196.8`	`4.7`	`0.402`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		[NAG]B:501	`11`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`15586`	`168.2`	`4.5`	`0.521`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		[NAG]A:501	`12`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`15535`	`167.3`	`4.4`	`0.495`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[NAG]A:504	`11`	`1`	`364`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`15535`	`160.5`	`5.3`	`0.618`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[PEG]A:520	`7`	`1`	`262`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`15535`	`158.7`	`4.5`	`0.537`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[NAG]B:507	`9`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`15586`	`155.6`	`4.8`	`0.655`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		B	`16`	`6`	`15586`	`◊`	A	y-1,x,-z	`4_455`	`19`	`7`	`15535`	`148.1`	`-3.0`	`0.158`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[EDO]A:514	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`15535`	`115.1`	`3.5`	`0.652`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[PEG]A:521	`7`	`1`	`264`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`15535`	`111.2`	`2.0`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[NAG]A:507	`11`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`15535`	`109.7`	`2.8`	`0.319`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]B:505	`11`	`1`	`354`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15586`	`104.4`	`2.8`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`107.0`	`2.8`	`0.345`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		[EDO]A:517	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`15535`	`108.8`	`3.7`	`0.502`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[EDO]B:511	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`15586`	`106.6`	`3.0`	`0.444`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		[ACT]B:518	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`15586`	`105.8`	`-0.5`	`0.662`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
18	`20`		[ACT]A:522	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`15535`	`104.3`	`-1.0`	`0.587`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
19	`21`		[EDO]A:518	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15535`	`103.6`	`3.0`	`0.317`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[EDO]B:512	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`15586`	`103.3`	`3.6`	`0.513`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[PEG]B:514	`7`	`1`	`262`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`15535`	`101.9`	`2.6`	`0.390`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		[EDO]A:513	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`15535`	`101.5`	`3.1`	`0.465`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		[PEG]A:519	`7`	`1`	`260`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`15586`	`101.0`	`1.7`	`0.229`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		[SO4]A:509	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15535`	`99.3`	`-14.9`	`0.778`	`4`	`0`	`0`	`0.103`
25	`27`		[SO4]B:508	`5`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`15586`	`98.1`	`-14.8`	`0.788`	`4`	`0`	`0`	`0.066`
26	`28`		[EDO]A:516	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15535`	`97.7`	`2.5`	`0.464`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[PEG]B:514	`7`	`1`	`262`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`15586`	`97.0`	`2.6`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		[PEG]A:519	`7`	`1`	`260`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`15535`	`91.2`	`1.7`	`0.236`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[SO4]B:509	`5`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`15586`	`89.9`	`-13.6`	`0.841`	`6`	`0`	`0`	`0.065`
30	`32`		[SO4]B:510	`5`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`15586`	`89.1`	`-14.1`	`0.688`	`4`	`0`	`0`	`0.063`
31	`33`		[SO4]A:512	`5`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`15535`	`88.4`	`-13.5`	`0.736`	`3`	`0`	`0`	`0.092`
32	`34`		[SO4]A:511	`5`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15535`	`88.2`	`-12.8`	`0.909`	`5`	`0`	`0`	`0.093`
33	`35`		[ACT]B:516	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`15586`	`87.5`	`-0.0`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[EDO]B:513	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`15586`	`78.9`	`1.8`	`0.239`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[NAG]A:502	`8`	`1`	`366`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`15535`	`78.1`	`2.4`	`0.431`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[ACT]B:515	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15586`	`77.9`	`2.1`	`0.894`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[NAG]B:502	`7`	`1`	`360`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`15586`	`76.7`	`2.3`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[EDO]A:515	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15535`	`75.8`	`1.1`	`0.208`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[NAG]B:502	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]B:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`74.8`	`1.6`	`0.094`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[NAG]A:502	`10`	`1`	`366`	`cf`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`74.8`	`1.9`	`0.087`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`74.8`	`1.8`	`0.090`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`43`		[EDO]A:515	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	y-1,x,-z	`4_455`	`16`	`4`	`15535`	`74.7`	`2.1`	`0.468`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`44`		B	`11`	`5`	`15586`	`x`	B	-x-1,-x+y-1,-z-1/3	`6_444`	`9`	`7`	`15586`	`74.5`	`0.5`	`0.736`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
42	`45`		[NAG]A:505	`10`	`1`	`369`	`cf`	[NAG]A:504	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`71.1`	`1.6`	`0.089`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		[NAG]A:508	`10`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]A:507	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`69.1`	`1.6`	`0.087`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`47`		[NAG]B:506	`10`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]B:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`354`	`67.7`	`1.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		[ACT]B:519	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15586`	`66.6`	`-0.4`	`0.525`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
46	`49`		[SO4]A:510	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`15535`	`65.2`	`-7.4`	`0.943`	`4`	`0`	`0`	`0.057`
47	`50`		B	`9`	`4`	`15586`	`◊`	[NAG]A:502	y-1,x,-z	`4_455`	`3`	`1`	`366`	`62.3`	`1.7`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`51`		[ACT]B:517	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15586`	`62.1`	`-0.7`	`0.586`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
49	`52`		[BMA]B:503	`8`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`61.7`	`1.3`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		[BMA]A:506	`6`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]A:505	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`369`	`60.3`	`1.6`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		[BMA]A:503	`7`	`1`	`295`	`cf`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`366`	`59.9`	`1.4`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		[MAN]B:504	`6`	`1`	`294`	`cf`	[BMA]B:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`291`	`58.5`	`2.4`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		B	`10`	`3`	`15586`	`◊`	[NAG]A:501	y-1,x,-z	`4_455`	`5`	`1`	`361`	`55.2`	`1.5`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		[NAG]A:508	`5`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15535`	`50.3`	`1.3`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		[NAG]B:506	`4`	`1`	`358`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`15586`	`42.2`	`0.9`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`59`		[NAG]A:505	`5`	`1`	`369`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`15535`	`37.8`	`0.4`	`0.325`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`60`		[EDO]B:512	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`15535`	`37.4`	`0.2`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`61`		B	`4`	`1`	`15586`	`◊`	B	y-1,x+1,-z	`4_465`	`4`	`1`	`15586`	`30.5`	`0.1`	`0.682`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`62`		B	`2`	`2`	`15586`	`◊`	[PEG]A:521	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`2`	`1`	`264`	`29.7`	`0.8`	`0.467`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
60	`63`		B	`2`	`1`	`15586`	`◊`	[EDO]A:516	y-1,x,-z	`4_455`	`2`	`1`	`185`	`28.2`	`1.0`	`0.847`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`64`		A	`5`	`2`	`15535`	`◊`	[SO4]A:512	y-1,x,-z	`4_455`	`3`	`1`	`183`	`25.5`	`-3.1`	`0.835`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
62	`65`		[MAN]B:504	`3`	`1`	`294`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`15586`	`23.4`	`1.0`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`66`		B	`2`	`1`	`15586`	`◊`	[BMA]A:503	y-1,x,-z	`4_455`	`2`	`1`	`295`	`15.6`	`0.1`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`67`		[ACT]B:519	`1`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15535`	`12.6`	`0.0`	`0.670`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`68`		[BMA]A:503	`1`	`1`	`295`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`15535`	`12.4`	`0.4`	`0.560`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`69`		[EDO]A:518	`1`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:517	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`11.4`	`0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`70`		[BMA]B:503	`2`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15586`	`9.5`	`0.4`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`71`		[MAN]B:504	`1`	`1`	`294`	`f`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`360`	`8.2`	`0.2`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`72`		[ACT]B:516	`2`	`1`	`182`	`◊`	B	-x-1,-x+y-1,-z-1/3	`6_444`	`1`	`1`	`15586`	`6.4`	`0.1`	`0.778`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`73`		A	`1`	`1`	`15535`	`◊`	A	y-1,x+1,-z	`4_465`	`1`	`1`	`15535`	`5.5`	`0.4`	`0.893`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`74`		A	`1`	`1`	`15535`	`◊`	[SO4]A:510	y-1,x,-z	`4_455`	`1`	`1`	`183`	`2.7`	`-0.2`	`0.912`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`75`		[PEG]A:521	`1`	`1`	`264`	`f`	[SO4]A:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`2.2`	`-0.2`	`0.535`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
73	`76`		B	`1`	`1`	`15586`	`◊`	[NAG]A:508	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`1`	`1`	`362`	`0.8`	`0.0`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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