PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=953-91-22E)

Interfaces in PDB 6hu1 crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.00 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SCHISTOSOMA MANSONI HDAC8 COMPLEXED WITH A BENZOHYDROXAMATE INHIBITOR 10

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`117`	`38`	`17849`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`91`	`28`	`17623`	`1016.3`	`-10.8`	`0.103`	`9`	`5`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`84`	`27`	`17581`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`108`	`33`	`17787`	`876.5`	`-9.1`	`0.119`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`87`	`28`	`17787`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`102`	`34`	`17581`	`871.2`	`-9.9`	`0.128`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
	`4`		D	`87`	`28`	`17623`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`78`	`24`	`17849`	`764.2`	`-7.6`	`0.193`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`882.1`	`-9.4`	`0.136`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
2	`5`		D	`66`	`18`	`17623`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`54`	`16`	`17787`	`534.6`	`-0.4`	`0.673`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
3	`6`		C	`39`	`10`	`17849`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`57`	`17`	`17787`	`489.9`	`-2.7`	`0.437`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		C	`46`	`13`	`17849`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`37`	`10`	`17787`	`391.5`	`-1.5`	`0.446`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`440.7`	`-2.1`	`0.442`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		D	`28`	`7`	`17623`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`12`	`17787`	`327.6`	`-2.4`	`0.304`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`30`	`11`	`17849`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`17581`	`302.4`	`-2.0`	`0.304`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`315.0`	`-2.2`	`0.304`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
5	`10`		[GT2]C:504	`22`	`1`	`525`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`14`	`17849`	`295.9`	`-10.7`	`0.508`	`3`	`0`	`0`	`0.008`
	`11`		[GT2]A:504	`22`	`1`	`528`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`14`	`17581`	`294.5`	`-11.8`	`0.390`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
	`12`		[GT2]D:504	`22`	`1`	`527`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`14`	`17623`	`290.8`	`-10.8`	`0.440`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
	`13`		[GT2]B:504	`22`	`1`	`526`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`17787`	`290.5`	`-11.7`	`0.413`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`293.0`	`-11.2`	`0.438`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
6	`14`		C	`26`	`7`	`17849`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`32`	`11`	`17581`	`265.1`	`0.2`	`0.664`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
7	`15`		[DMF]B:506	`5`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`17787`	`145.0`	`3.6`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`16`		[GOL]C:511	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`17849`	`143.7`	`0.0`	`0.610`	`6`	`0`	`0`	`0.002`
9	`17`		[DMF]D:512	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`17623`	`143.0`	`3.1`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		[GOL]A:512	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`17581`	`142.9`	`-0.2`	`0.568`	`7`	`0`	`0`	`0.003`
	`19`		[GOL]D:513	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`17623`	`137.7`	`-0.1`	`0.604`	`9`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`140.3`	`-0.2`	`0.586`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
11	`20`		[DMF]D:507	`5`	`1`	`215`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`17623`	`142.5`	`2.8`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[DMF]D:508	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`17623`	`142.5`	`3.1`	`0.431`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[DMF]C:510	`5`	`1`	`214`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`17849`	`141.7`	`3.1`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[DMF]A:508	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`7`	`17581`	`140.8`	`3.2`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`141.7`	`3.1`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		[GOL]C:513	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`11`	`17849`	`142.2`	`-0.8`	`0.555`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
14	`25`		[GOL]D:514	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`17623`	`142.1`	`-0.6`	`0.508`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
15	`26`		[DMF]B:508	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`17787`	`141.8`	`3.2`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`27`		[GOL]B:513	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`17787`	`141.6`	`-0.3`	`0.560`	`8`	`0`	`0`	`0.002`
17	`28`		[DMF]C:509	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`17849`	`140.3`	`3.2`	`0.434`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`29`		D	`19`	`8`	`17623`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`22`	`6`	`17581`	`139.6`	`0.7`	`0.718`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
19	`30`		[GOL]C:512	`6`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`17849`	`139.0`	`-0.5`	`0.528`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`31`		[DMF]B:509	`5`	`1`	`213`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`8`	`17787`	`135.9`	`3.7`	`0.492`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`32`		[DMF]D:506	`5`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`17623`	`133.0`	`2.6`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		C	`14`	`5`	`17849`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`14`	`5`	`17581`	`127.2`	`-0.1`	`0.622`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`34`		D	`11`	`4`	`17623`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`6`	`17787`	`112.3`	`-0.3`	`0.580`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`119.7`	`-0.2`	`0.601`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
23	`35`		D	`20`	`8`	`17623`	`◊`	[DMF]B:512	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`217`	`125.9`	`3.6`	`0.492`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		[DMF]B:505	`5`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`17787`	`124.9`	`3.4`	`0.453`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`17849`	`119.5`	`3.7`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`122.2`	`3.5`	`0.467`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`38`		[DMF]D:511	`5`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`17623`	`124.2`	`2.8`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`39`		[DMF]A:510	`5`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`17581`	`122.4`	`3.7`	`0.474`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`40`		[DMF]C:505	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`17849`	`121.9`	`2.3`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		[DMF]B:507	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`17787`	`119.9`	`2.7`	`0.398`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`42`		[DMF]A:507	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17581`	`118.0`	`3.1`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`43`		[K]D:502	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17623`	`115.3`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`44`		[K]B:502	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17787`	`114.2`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`45`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17581`	`113.9`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`46`		[K]C:503	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17849`	`113.9`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	*Average:*													`114.3`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
31	`47`		[DMF]D:510	`5`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17623`	`114.1`	`2.8`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`48`		[DMF]B:511	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`17787`	`113.1`	`2.8`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`49`		[DMF]D:509	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`17623`	`111.3`	`1.5`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`50`		[DMF]C:508	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17849`	`103.2`	`2.1`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`51`		[DMF]A:506	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`17581`	`97.2`	`1.8`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`52`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`17581`	`97.2`	`2.2`	`0.373`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`53`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17623`	`94.3`	`2.4`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`54`		D	`16`	`6`	`17623`	`f`	[DMF]B:510	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`216`	`93.6`	`2.4`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`55`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`17849`	`85.0`	`0.4`	`0.178`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`56`		[DMF]A:511	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`17581`	`84.3`	`2.2`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		[DMF]B:510	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`17787`	`82.0`	`2.0`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`58`		[DMF]A:509	`4`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`17581`	`81.9`	`0.5`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`59`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17787`	`80.7`	`0.9`	`0.203`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`60`		[DMF]D:505	`5`	`1`	`215`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17623`	`77.5`	`2.0`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`61`		D	`10`	`3`	`17623`	`◊`	[DMF]A:509	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`217`	`74.6`	`2.1`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`62`		[DMF]A:511	`5`	`1`	`215`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`4`	`17787`	`72.5`	`2.6`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`63`		[GT2]C:504	`7`	`1`	`525`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17623`	`70.7`	`-0.7`	`0.744`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		C	`9`	`4`	`17849`	`◊`	[GT2]D:504	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`1`	`527`	`69.0`	`-0.4`	`0.731`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[GT2]B:504	`7`	`1`	`526`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17581`	`65.7`	`-0.2`	`0.739`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[GT2]A:504	`7`	`1`	`528`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`2`	`17787`	`62.1`	`0.0`	`0.715`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.9`	`-0.3`	`0.732`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`67`		C	`7`	`2`	`17849`	`f`	[DMF]D:505	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`215`	`62.4`	`1.1`	`0.259`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`68`		[DMF]C:505	`4`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17581`	`61.5`	`3.1`	`0.499`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`69`		D	`4`	`2`	`17623`	`f`	[DMF]B:505	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`217`	`49.3`	`1.0`	`0.267`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`217`	`f`	A	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`2`	`17581`	`38.5`	`-0.2`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`43.9`	`0.4`	`0.196`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`71`		[DMF]B:512	`5`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`17787`	`47.9`	`0.9`	`0.230`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`72`		[GOL]C:512	`3`	`1`	`221`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`9`	`4`	`17623`	`45.9`	`-0.2`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`73`		[GOL]D:514	`3`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`17849`	`43.2`	`-0.2`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`74`		D	`3`	`2`	`17623`	`f`	[DMF]B:511	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`216`	`38.7`	`1.3`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`75`		[ZN]D:501	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17623`	`38.0`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`76`		[ZN]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17581`	`37.1`	`-26.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`77`		[ZN]C:501	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17849`	`37.0`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`78`		[ZN]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17787`	`36.7`	`-26.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`37.2`	`-26.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
56	`79`		C	`7`	`3`	`17849`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`7`	`3`	`17787`	`34.1`	`0.4`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`80`		[GT2]A:504	`4`	`1`	`528`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.4`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`81`		[GT2]C:504	`5`	`1`	`525`	`f`	[ZN]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.4`	`-13.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`82`		[GT2]B:504	`4`	`1`	`526`	`f`	[ZN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.1`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`83`		[GT2]D:504	`4`	`1`	`527`	`f`	[ZN]D:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.0`	`-13.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`30.2`	`-13.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
58	`84`		[DMF]B:511	`1`	`1`	`216`	`f`	[DMF]B:510	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`216`	`29.4`	`1.0`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`85`		[DMF]D:510	`5`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`17581`	`27.6`	`0.6`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`86`		A	`3`	`3`	`17581`	`f`	[DMF]B:506	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`217`	`20.5`	`0.6`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`87`		[GOL]D:513	`1`	`1`	`218`	`f`	[DMF]D:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`18.5`	`0.3`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`88`		C	`1`	`1`	`17849`	`f`	[DMF]A:510	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`216`	`12.2`	`0.6`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`89`		[DMF]D:510	`1`	`1`	`217`	`f`	[DMF]A:509	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`217`	`5.4`	`0.4`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`90`		C	`1`	`1`	`17849`	`f`	[DMF]D:511	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`216`	`4.4`	`0.1`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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