PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=452-H0-AF1)

Interfaces in PDB 6g7x crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.76 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF H. PYLORI PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE SOAKED IN PO4

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`174`	`45`	`11081`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`174`	`44`	`11101`	`1706.9`	`-18.6`	`0.233`	`27`	`8`	`0`	`0.000`
	`2`		E	`172`	`45`	`11023`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`168`	`43`	`11081`	`1698.9`	`-18.3`	`0.268`	`27`	`8`	`0`	`0.000`
	`3`		F	`170`	`45`	`11150`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`171`	`44`	`11085`	`1691.2`	`-17.9`	`0.203`	`28`	`8`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1699.0`	`-18.2`	`0.235`	`27`	`8`	`0`	`0.000`
2	`4`		D	`167`	`41`	`11081`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`167`	`41`	`11085`	`1564.5`	`-26.2`	`0.033`	`4`	`0`	`0`	`1.000`
	`5`		E	`168`	`42`	`11023`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`166`	`41`	`11101`	`1553.9`	`-26.1`	`0.037`	`4`	`0`	`0`	`1.000`
	`6`		F	`166`	`41`	`11150`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`168`	`41`	`11081`	`1548.9`	`-26.3`	`0.035`	`4`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1555.8`	`-26.2`	`0.035`	`4`	`0`	`0`	`1.000`
3	`7`		D	`30`	`9`	`11081`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`31`	`9`	`11085`	`266.1`	`-2.7`	`0.460`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
4	`8`		A	`27`	`6`	`11085`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`31`	`9`	`11023`	`253.6`	`-0.1`	`0.719`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`9`		B	`26`	`8`	`11101`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`33`	`9`	`11150`	`248.9`	`-0.4`	`0.693`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	`10`		D	`33`	`9`	`11081`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`25`	`6`	`11081`	`248.6`	`-0.8`	`0.688`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`250.4`	`-0.4`	`0.700`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
5	`11`		E	`20`	`8`	`11023`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`17`	`8`	`11101`	`185.8`	`1.4`	`0.848`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
6	`12`		A	`17`	`5`	`11085`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`15`	`6`	`11101`	`146.9`	`-1.2`	`0.527`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`15`	`6`	`11085`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`17`	`5`	`11081`	`145.4`	`-1.0`	`0.573`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`14`		B	`17`	`5`	`11101`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`6`	`11081`	`140.8`	`0.6`	`0.692`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`144.4`	`-0.5`	`0.597`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
7	`15`		[IMD]A:302	`5`	`1`	`199`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`11085`	`137.1`	`3.2`	`0.388`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`16`		[IMD]B:302	`5`	`1`	`197`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`11101`	`136.1`	`3.1`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`17`		[IMD]F:301	`5`	`1`	`198`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`11150`	`134.0`	`3.4`	`0.367`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		[IMD]E:301	`5`	`1`	`197`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`11023`	`132.5`	`2.8`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`19`		[IMD]C:302	`5`	`1`	`198`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`11081`	`131.7`	`3.1`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`20`		[IMD]D:301	`5`	`1`	`198`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`11081`	`131.0`	`3.5`	`0.379`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`21`		F	`17`	`5`	`11150`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`12`	`4`	`11081`	`113.3`	`-0.1`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		F	`9`	`5`	`11150`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`11081`	`107.3`	`1.2`	`0.832`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		E	`12`	`4`	`11023`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11081`	`103.0`	`1.2`	`0.848`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		B	`9`	`5`	`11101`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`11085`	`102.8`	`1.4`	`0.873`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		F	`11`	`4`	`11150`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11023`	`101.1`	`1.0`	`0.831`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`12`	`4`	`11081`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11085`	`97.4`	`1.0`	`0.829`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		C	`12`	`5`	`11081`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11101`	`88.3`	`1.0`	`0.845`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`100.0`	`1.1`	`0.843`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`28`		E	`11`	`5`	`11023`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`15`	`5`	`11085`	`102.5`	`0.2`	`0.683`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`29`		[IMD]D:302	`5`	`1`	`199`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`11085`	`98.5`	`1.2`	`0.254`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[IMD]F:302	`5`	`1`	`198`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`11081`	`94.2`	`1.2`	`0.196`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`96.3`	`1.2`	`0.225`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`31`		[PO4]F:305	`5`	`1`	`188`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`11150`	`98.4`	`-6.2`	`0.703`	`3`	`0`	`0`	`1.000`
18	`32`		[PO4]E:305	`5`	`1`	`190`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`11023`	`98.3`	`-6.2`	`0.720`	`4`	`0`	`0`	`0.329`
19	`33`		[PO4]D:304	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`11081`	`97.0`	`-5.9`	`0.748`	`7`	`0`	`0`	`1.000`
20	`34`		[IMD]E:302	`5`	`1`	`197`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`11101`	`96.8`	`1.1`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`35`		[IMD]B:305	`5`	`1`	`200`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`11101`	`95.6`	`2.6`	`0.235`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`36`		[IMD]A:301	`5`	`1`	`198`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`11081`	`94.5`	`0.9`	`0.180`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`37`		[IMD]B:301	`5`	`1`	`196`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`11023`	`94.2`	`1.0`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`38`		[IMD]A:303	`5`	`1`	`196`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`11085`	`93.9`	`3.1`	`0.256`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`39`		[PO4]A:304	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`11085`	`93.3`	`-5.6`	`0.751`	`4`	`0`	`0`	`0.244`
26	`40`		[IMD]B:303	`5`	`1`	`197`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`11101`	`93.2`	`3.5`	`0.300`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`41`		[IMD]C:303	`5`	`1`	`197`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`11081`	`92.7`	`3.5`	`0.302`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`42`		[IMD]C:301	`5`	`1`	`198`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`11150`	`92.7`	`0.9`	`0.158`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`43`		[PO4]C:305	`5`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`11081`	`91.7`	`-5.6`	`0.773`	`5`	`0`	`0`	`0.304`
30	`44`		[PO4]B:306	`5`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`11101`	`89.2`	`-5.4`	`0.776`	`5`	`0`	`0`	`0.798`
31	`45`		[IMD]F:304	`5`	`1`	`197`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`11150`	`88.2`	`2.9`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`46`		[IMD]D:303	`5`	`1`	`197`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`11081`	`88.0`	`3.1`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`47`		[IMD]E:303	`5`	`1`	`199`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`11023`	`87.9`	`3.5`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`48`		[IMD]E:304	`5`	`1`	`198`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`11023`	`87.7`	`2.3`	`0.232`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`49`		[IMD]F:303	`5`	`1`	`197`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`11150`	`86.0`	`3.2`	`0.262`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`50`		[IMD]B:304	`5`	`1`	`197`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`11085`	`83.3`	`2.6`	`0.244`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`51`		[IMD]C:304	`5`	`1`	`199`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11081`	`81.9`	`2.9`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`52`		D	`9`	`4`	`11081`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`5`	`11150`	`74.4`	`0.2`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		F	`8`	`4`	`11150`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`5`	`11023`	`57.6`	`0.7`	`0.796`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		D	`9`	`3`	`11081`	`◊`	E	x-1,y,z-1	`1_454`	`7`	`3`	`11023`	`56.1`	`-0.5`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.7`	`0.2`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`55`		[IMD]C:304	`5`	`1`	`199`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11085`	`63.1`	`1.7`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`56`		[IMD]B:304	`5`	`1`	`197`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11101`	`60.8`	`1.8`	`0.149`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		[IMD]C:301	`5`	`1`	`198`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11081`	`57.7`	`1.9`	`0.174`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`58`		[IMD]A:301	`5`	`1`	`198`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11085`	`57.3`	`1.9`	`0.169`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`59`		[IMD]B:301	`5`	`1`	`196`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11101`	`56.9`	`1.9`	`0.115`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[IMD]E:302	`5`	`1`	`197`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11023`	`55.6`	`1.8`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`56.2`	`1.8`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`61`		[IMD]F:302	`5`	`1`	`198`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11150`	`56.2`	`2.0`	`0.171`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[IMD]D:302	`5`	`1`	`199`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11081`	`55.4`	`1.2`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.8`	`1.6`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`63`		[IMD]E:304	`3`	`1`	`198`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11081`	`56.1`	`1.7`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`64`		[IMD]F:304	`5`	`1`	`197`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11023`	`55.9`	`2.1`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`65`		[IMD]B:305	`3`	`1`	`200`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`11081`	`49.0`	`1.0`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`66`		[PO4]E:305	`4`	`1`	`190`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11101`	`39.6`	`-0.9`	`0.964`	`2`	`0`	`0`	`0.072`
49	`67`		[PO4]F:305	`4`	`1`	`188`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11081`	`37.3`	`-0.8`	`0.961`	`2`	`0`	`0`	`0.065`
50	`68`		[PO4]A:304	`4`	`1`	`187`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11081`	`37.0`	`-0.9`	`0.959`	`1`	`0`	`0`	`0.045`
51	`69`		[PO4]D:304	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11085`	`36.5`	`-0.9`	`0.954`	`2`	`0`	`0`	`0.059`
52	`70`		[PO4]B:306	`4`	`1`	`189`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11023`	`35.7`	`-1.0`	`0.956`	`2`	`0`	`0`	`0.076`
53	`71`		[PO4]C:305	`4`	`1`	`188`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11150`	`35.2`	`-0.7`	`0.955`	`3`	`0`	`0`	`0.080`
54	`72`		B	`5`	`2`	`11101`	`f`	[IMD]C:303	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`197`	`31.2`	`0.9`	`0.202`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`73`		[IMD]C:304	`4`	`1`	`199`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`11150`	`29.6`	`0.9`	`0.119`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`74`		[PO4]C:305	`4`	`1`	`188`	`f`	[IMD]F:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`198`	`28.5`	`-1.0`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
57	`75`		[PO4]B:306	`3`	`1`	`189`	`f`	[IMD]E:302	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`197`	`28.2`	`-0.7`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.077`
58	`76`		[PO4]F:305	`4`	`1`	`188`	`f`	[IMD]C:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`198`	`27.8`	`-0.7`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.174`
59	`77`		[PO4]A:304	`3`	`1`	`187`	`f`	[IMD]D:302	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`199`	`27.7`	`-1.1`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
60	`78`		[PO4]E:305	`4`	`1`	`190`	`f`	[IMD]B:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`196`	`26.3`	`-0.6`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
61	`79`		B	`5`	`3`	`11101`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`3`	`11023`	`24.3`	`-0.8`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`80`		[IMD]B:304	`2`	`1`	`197`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11081`	`24.2`	`1.1`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`81`		[PO4]D:304	`4`	`1`	`187`	`f`	[IMD]A:301	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`198`	`23.8`	`-0.5`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
64	`82`		[IMD]F:302	`5`	`1`	`198`	`f`	[IMD]C:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`198`	`23.3`	`1.2`	`0.029`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`83`		[IMD]E:302	`5`	`1`	`197`	`f`	[IMD]B:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`197`	`23.2`	`1.2`	`0.029`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`84`		[IMD]E:304	`2`	`1`	`198`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11101`	`22.8`	`1.1`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`85`		[IMD]A:303	`2`	`1`	`196`	`f`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`1`	`11081`	`22.6`	`0.4`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`86`		D	`3`	`1`	`11081`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`4`	`1`	`11081`	`22.2`	`-0.4`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`87`		[IMD]E:301	`3`	`1`	`197`	`f`	[IMD]B:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`196`	`22.1`	`0.9`	`0.024`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`88`		[IMD]D:301	`2`	`1`	`198`	`f`	[IMD]A:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`198`	`20.9`	`1.1`	`0.053`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`89`		A	`3`	`2`	`11085`	`f`	[IMD]B:303	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`197`	`20.7`	`0.3`	`0.124`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`90`		[IMD]D:302	`5`	`1`	`199`	`f`	[IMD]A:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`199`	`20.5`	`0.9`	`0.025`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`91`		[IMD]F:301	`2`	`1`	`198`	`f`	[IMD]C:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`198`	`19.7`	`1.1`	`0.053`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`92`		[IMD]B:305	`2`	`1`	`200`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`11023`	`19.0`	`0.9`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`93`		[IMD]F:304	`3`	`1`	`197`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`11081`	`18.5`	`0.6`	`0.169`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`94`		A	`1`	`1`	`11085`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`2`	`11081`	`10.5`	`-0.1`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`95`		E	`1`	`1`	`11023`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`11081`	`4.2`	`-0.0`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`96`		D	`3`	`2`	`11081`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`2`	`11150`	`3.2`	`-0.1`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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