PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=276-I4-M3G)

Interfaces in PDB 6eph crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.70 Å

STRUCTURE OF THE EPSILON_1 / ZETA_1 ANTITOXIN TOXIN SYSTEM FROM NEISSERIA GONORRHOEAE IN COMPLEX WITH UNAM.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`190`	`49`	`21116`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`165`	`40`	`5457`	`1848.6`	`-21.3`	`0.131`	`19`	`1`	`0`	`0.318`
	`2`		F	`188`	`50`	`21080`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`164`	`37`	`5311`	`1822.5`	`-22.2`	`0.115`	`20`	`2`	`0`	`0.318`
	`3`		H	`187`	`48`	`21160`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`165`	`38`	`5495`	`1812.0`	`-22.8`	`0.094`	`21`	`1`	`0`	`0.318`
	`4`		D	`189`	`49`	`21040`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`160`	`38`	`5489`	`1799.5`	`-19.0`	`0.155`	`19`	`2`	`0`	`0.318`
	*Average:*													`1820.6`	`-21.3`	`0.124`	`20`	`2`	`0`	`0.318`
2	`5`		[EPZ]B:501	`42`	`1`	`795`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`75`	`33`	`21116`	`618.2`	`-6.1`	`0.366`	`16`	`0`	`0`	`0.182`
	`6`		[EPZ]H:501	`42`	`1`	`798`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`74`	`32`	`21160`	`612.7`	`-5.9`	`0.360`	`16`	`0`	`0`	`0.182`
	`7`		[EPZ]F:501	`42`	`1`	`799`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`78`	`33`	`21080`	`607.7`	`-6.3`	`0.360`	`17`	`0`	`0`	`0.182`
	`8`		[EPZ]D:501	`43`	`1`	`800`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`76`	`33`	`21040`	`607.5`	`-6.8`	`0.335`	`14`	`0`	`0`	`0.182`
	*Average:*													`611.5`	`-6.3`	`0.356`	`16`	`0`	`0`	`0.182`
3	`9`		D	`49`	`16`	`21040`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`16`	`21116`	`496.1`	`-4.4`	`0.187`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		H	`48`	`15`	`21160`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`48`	`16`	`21080`	`492.6`	`-4.7`	`0.164`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`494.4`	`-4.5`	`0.175`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`11`		H	`59`	`13`	`21160`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`49`	`13`	`21080`	`447.1`	`0.1`	`0.512`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`52`	`13`	`21116`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`46`	`12`	`21040`	`427.6`	`0.1`	`0.529`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		H	`44`	`13`	`21160`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`43`	`12`	`21080`	`333.6`	`-1.2`	`0.425`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		B	`42`	`12`	`21116`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`42`	`12`	`21040`	`316.9`	`-1.5`	`0.391`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`381.3`	`-0.6`	`0.464`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`15`		D	`43`	`14`	`21040`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`43`	`14`	`21116`	`417.5`	`-2.3`	`0.320`	`8`	`0`	`0`	`0.046`
	`16`		H	`43`	`13`	`21160`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`42`	`14`	`21080`	`402.6`	`-4.1`	`0.179`	`6`	`0`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`410.1`	`-3.2`	`0.250`	`7`	`0`	`0`	`0.046`
6	`17`		E	`34`	`6`	`5311`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`5489`	`239.4`	`1.0`	`0.780`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
7	`18`		G	`27`	`7`	`5495`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`9`	`5457`	`235.3`	`1.6`	`0.812`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
8	`19`		A	`26`	`8`	`5457`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`24`	`10`	`21116`	`228.6`	`-2.3`	`0.373`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`20`		F	`22`	`10`	`21080`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`23`	`6`	`5311`	`206.0`	`-3.4`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		D	`22`	`10`	`21040`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`23`	`6`	`5489`	`205.6`	`-3.5`	`0.214`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		G	`21`	`6`	`5495`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`20`	`9`	`21160`	`201.3`	`-3.5`	`0.188`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`210.4`	`-3.2`	`0.249`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`23`		H	`22`	`6`	`21160`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`5457`	`220.3`	`0.9`	`0.709`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
10	`24`		D	`16`	`5`	`21040`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`5311`	`214.8`	`-1.6`	`0.268`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
11	`25`		F	`18`	`6`	`21080`	`x`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`19`	`6`	`21080`	`173.7`	`2.0`	`0.772`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`26`		D	`18`	`6`	`21040`	`x`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`16`	`6`	`21040`	`165.6`	`2.0`	`0.779`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`27`		H	`17`	`6`	`21160`	`x`	H	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`19`	`6`	`21160`	`148.1`	`1.7`	`0.742`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	`28`		B	`15`	`5`	`21116`	`x`	B	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`18`	`6`	`21116`	`141.9`	`1.3`	`0.688`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`157.3`	`1.8`	`0.745`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
12	`29`		[FLC]D:504	`12`	`1`	`315`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`21040`	`162.9`	`0.5`	`0.420`	`5`	`0`	`0`	`0.018`
13	`30`		[FLC]F:504	`11`	`1`	`319`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`21080`	`149.8`	`0.5`	`0.464`	`4`	`0`	`0`	`0.013`
14	`31`		[SO4]H:503	`5`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`21160`	`122.6`	`-16.2`	`0.757`	`6`	`0`	`0`	`0.182`
15	`32`		[SO4]D:503	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`21040`	`122.2`	`-15.8`	`0.762`	`4`	`0`	`0`	`0.185`
16	`33`		[SO4]B:503	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`21116`	`120.6`	`-15.2`	`0.750`	`5`	`0`	`0`	`0.172`
17	`34`		[SO4]F:503	`5`	`1`	`185`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`21080`	`119.2`	`-15.7`	`0.771`	`5`	`0`	`0`	`0.182`
18	`35`		[SO4]F:502	`5`	`1`	`188`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`21080`	`106.0`	`-17.0`	`0.760`	`10`	`0`	`0`	`0.217`
19	`36`		[SO4]B:502	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`21116`	`103.9`	`-17.0`	`0.736`	`12`	`0`	`0`	`0.220`
20	`37`		[SO4]D:502	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`21040`	`102.9`	`-17.1`	`0.724`	`12`	`0`	`0`	`0.235`
21	`38`		[SO4]B:504	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`21116`	`102.5`	`-13.3`	`0.873`	`4`	`0`	`0`	`0.148`
22	`39`		[SO4]H:502	`5`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`21160`	`101.5`	`-17.0`	`0.741`	`10`	`0`	`0`	`0.207`
23	`40`		[SO4]H:504	`5`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`21160`	`100.4`	`-12.9`	`0.861`	`4`	`0`	`0`	`0.141`
24	`41`		H	`9`	`3`	`21160`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`21116`	`93.4`	`-1.8`	`0.140`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`42`		[SO4]H:505	`5`	`1`	`186`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`21160`	`61.9`	`-8.5`	`0.664`	`2`	`0`	`0`	`0.064`
26	`43`		D	`7`	`3`	`21040`	`f`	[SO4]B:505	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`187`	`61.2`	`-8.6`	`0.642`	`2`	`0`	`0`	`0.100`
27	`44`		[SO4]H:505	`5`	`1`	`186`	`f`	F	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`21080`	`59.5`	`-8.5`	`0.623`	`2`	`0`	`0`	`0.096`
28	`45`		[SO4]B:505	`5`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`21116`	`59.4`	`-8.2`	`0.654`	`2`	`0`	`0`	`0.062`
29	`46`		B	`5`	`2`	`21116`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`4`	`1`	`5489`	`40.1`	`0.5`	`0.720`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`47`		H	`5`	`2`	`21160`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`1`	`5311`	`39.6`	`0.5`	`0.683`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`48`		A	`4`	`1`	`5457`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`4`	`2`	`21040`	`35.6`	`0.7`	`0.769`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`49`		G	`3`	`1`	`5495`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`2`	`21080`	`35.2`	`0.5`	`0.741`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.6`	`0.6`	`0.728`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
30	`50`		[SO4]D:502	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`5489`	`30.9`	`-2.9`	`0.870`	`1`	`0`	`0`	`0.036`
31	`51`		[SO4]H:502	`4`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`5495`	`30.7`	`-2.9`	`0.875`	`1`	`0`	`0`	`0.032`
32	`52`		[SO4]F:502	`4`	`1`	`188`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`5311`	`29.6`	`-2.8`	`0.877`	`1`	`0`	`0`	`0.033`
33	`53`		[SO4]B:502	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`5457`	`28.6`	`-2.8`	`0.874`	`2`	`0`	`0`	`0.036`
34	`54`		F	`2`	`1`	`21080`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`21040`	`19.7`	`-0.1`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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