PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=853-9P-F01)

Interfaces in PDB 6dpp crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.45 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 5 MM MG2+ AND 200 MM RB+ FOR 240 S AT 21 C

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`47`	`13`	`7676`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`46`	`13`	`7676`	`426.9`	`-0.6`	`0.542`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		C	`42`	`5`	`1547`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`14`	`7676`	`381.4`	`-2.6`	`0.578`	`7`	`0`	`0`	`0.056`
3	`3`		A	`41`	`12`	`7676`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`36`	`10`	`7676`	`318.1`	`2.0`	`0.687`	`2`	`5`	`0`	`0.000`
4	`4`		b	`29`	`2`	`696`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`15`	`7676`	`239.0`	`-5.5`	`0.277`	`6`	`0`	`0`	`0.084`
5	`5`		B	`22`	`3`	`1034`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`12`	`7676`	`224.8`	`-5.3`	`0.299`	`4`	`0`	`0`	`0.083`
6	`6`		B	`20`	`4`	`1034`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`1547`	`176.5`	`-2.4`	`0.532`	`7`	`0`	`0`	`0.420`
7	`7`		A	`17`	`4`	`7676`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`17`	`5`	`7676`	`143.5`	`-0.3`	`0.526`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
8	`8`		b	`16`	`2`	`696`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`3`	`1547`	`122.9`	`0.6`	`0.723`	`6`	`0`	`0`	`0.017`
9	`9`		[GOL]A:210	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`7676`	`103.0`	`-0.8`	`0.393`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
10	`10`		[EDO]A:213	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`7676`	`102.5`	`3.0`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[GOL]A:211	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`7676`	`99.2`	`0.4`	`0.633`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		C	`13`	`1`	`1547`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`12`	`1`	`1547`	`92.4`	`1.8`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`7676`	`91.3`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
14	`14`		[EDO]A:212	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`7676`	`89.3`	`2.8`	`0.464`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[EDO]A:214	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`7676`	`85.3`	`2.5`	`0.255`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		[EDO]A:215	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`1547`	`85.2`	`2.6`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		b	`13`	`1`	`696`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`14`	`1`	`1034`	`85.0`	`3.1`	`0.867`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`7676`	`78.1`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`19`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`7676`	`77.6`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	*Average:*													`77.9`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
19	`20`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`7676`	`75.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
20	`21`		[RB]C:201	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`1547`	`73.5`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.484`
21	`22`		b	`15`	`1`	`696`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`1034`	`69.1`	`-0.3`	`0.657`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
22	`23`		[CL]A:206	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`7676`	`68.1`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
23	`24`		[GOL]A:209	`4`	`1`	`220`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`1547`	`66.5`	`1.3`	`0.720`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[CL]A:207	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`7676`	`63.0`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
25	`26`		[GOL]A:209	`5`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7676`	`63.0`	`-0.2`	`0.587`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
26	`27`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`7676`	`61.1`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
27	`28`		[RB]C:201	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`1034`	`58.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.154`
28	`29`		A	`9`	`4`	`7676`	`f`	[EDO]A:214	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`4`	`1`	`187`	`58.1`	`1.2`	`0.726`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		[GOL]A:210	`6`	`1`	`218`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`7`	`3`	`7676`	`57.3`	`0.5`	`0.682`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`1034`	`50.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
31	`32`		C	`8`	`1`	`1547`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`7`	`1`	`1034`	`46.5`	`0.8`	`0.662`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		[EDO]A:215	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`7676`	`44.2`	`1.0`	`0.642`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		[EDO]B:101	`4`	`1`	`185`	`f`	[RB]C:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`42.9`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.124`
34	`35`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`696`	`42.6`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
	`36`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`696`	`35.5`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
	*Average:*													`39.1`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
35	`37`		[GOL]A:211	`4`	`1`	`217`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`6`	`2`	`7676`	`42.6`	`0.3`	`0.597`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`41.0`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
37	`39`		[EDO]B:101	`3`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1547`	`39.7`	`-0.6`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
38	`40`		[EDO]A:213	`3`	`1`	`183`	`f`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`3`	`1`	`7676`	`34.6`	`0.8`	`0.907`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
39	`41`		b	`6`	`2`	`696`	`◊`	[EDO]B:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`185`	`31.7`	`0.1`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[EDO]B:101	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1034`	`30.6`	`1.2`	`0.893`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		[GOL]A:211	`4`	`1`	`217`	`f`	[GOL]A:210	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`218`	`30.5`	`0.5`	`0.660`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
42	`44`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`696`	`30.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
43	`45`		[GOL]A:209	`3`	`1`	`220`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`696`	`28.8`	`0.5`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		A	`3`	`1`	`7676`	`◊`	[RB]C:201	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`216`	`28.3`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		A	`4`	`1`	`7676`	`◊`	[EDO]B:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`2`	`1`	`185`	`26.3`	`0.5`	`0.787`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[GOL]A:211	`4`	`1`	`217`	`f`	[CL]A:206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`25.9`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
47	`49`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`7676`	`25.7`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
48	`50`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`3`	`1`	`7676`	`25.7`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`7676`	`25.6`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
50	`52`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:204	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`23.3`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
51	`53`		C	`2`	`1`	`1547`	`◊`	[EDO]B:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`185`	`20.9`	`1.1`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`696`	`19.3`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
53	`55`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`696`	`17.3`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
54	`56`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1034`	`16.4`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
55	`57`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.4`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
56	`58`		b	`3`	`1`	`696`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`1547`	`13.7`	`-0.8`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
58	`60`		A	`4`	`2`	`7676`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`1034`	`11.6`	`0.4`	`0.668`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`61`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:202	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.5`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
60	`62`		C	`1`	`1`	`1547`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`7676`	`9.3`	`0.2`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`63`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.2`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
62	`64`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`7.0`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
63	`65`		[RB]b:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`6.7`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
64	`66`		[GOL]A:209	`1`	`1`	`220`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`1034`	`1.7`	`-0.0`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		b	`2`	`1`	`696`	`◊`	[RB]C:201	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`216`	`1.4`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		[EDO]B:101	`1`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:215	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`1.0`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		[EDO]A:215	`1`	`1`	`185`	`f`	[RB]C:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`0.8`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe