PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=915-04-D86)

Interfaces in PDB 6dpl crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.45 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 K196A IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 10 MM MG2+ AND 200 MM RB+ FOR 720 S AT 21 C

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`45`	`13`	`7551`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`44`	`13`	`7551`	`429.3`	`-0.3`	`0.535`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		C	`40`	`5`	`1549`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`46`	`12`	`7551`	`382.3`	`-2.9`	`0.538`	`7`	`0`	`0`	`0.057`
3	`3`		A	`38`	`12`	`7551`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`38`	`12`	`7551`	`323.6`	`2.0`	`0.683`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
4	`4`		b	`31`	`2`	`704`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`37`	`16`	`7551`	`238.2`	`-4.6`	`0.410`	`5`	`0`	`0`	`0.074`
5	`5`		B	`22`	`3`	`1033`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`35`	`14`	`7551`	`217.1`	`-5.0`	`0.277`	`3`	`0`	`0`	`0.074`
6	`6`		B	`20`	`4`	`1033`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`1549`	`175.4`	`-2.1`	`0.529`	`8`	`0`	`0`	`0.274`
7	`7`		A	`17`	`4`	`7551`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`18`	`5`	`7551`	`146.0`	`-0.3`	`0.495`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
8	`8`		b	`17`	`2`	`704`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`3`	`1549`	`126.8`	`0.8`	`0.752`	`6`	`0`	`0`	`0.014`
9	`9`		[GOL]A:212	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`7551`	`123.4`	`-1.0`	`0.443`	`2`	`0`	`0`	`0.022`
10	`10`		[GOL]A:211	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`7551`	`101.8`	`-0.5`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
11	`11`		[GOL]A:217	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`7551`	`100.4`	`-0.1`	`0.485`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
12	`12`		[RB]A:206	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`7551`	`94.9`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
13	`13`		C	`13`	`1`	`1549`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`13`	`1`	`1549`	`92.1`	`2.0`	`0.739`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		[GOL]A:213	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`7551`	`91.0`	`0.0`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[EDO]A:219	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`7551`	`89.9`	`2.4`	`0.247`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		A	`18`	`5`	`7551`	`◊`	[GOL]A:216	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`5`	`1`	`218`	`89.0`	`-0.6`	`0.434`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[EDO]A:214	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`7551`	`89.0`	`2.8`	`0.455`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		b	`13`	`1`	`704`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`15`	`1`	`1033`	`85.8`	`3.2`	`0.880`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[GOL]A:216	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`2`	`7551`	`85.7`	`-1.0`	`0.413`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
20	`20`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`7551`	`84.1`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	`21`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`7551`	`78.7`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
	*Average:*													`81.4`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.126`
21	`22`		[EDO]A:218	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`7551`	`82.7`	`1.3`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[EDO]A:215	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`1549`	`81.9`	`2.4`	`0.282`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[RB]C:101	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`1549`	`81.5`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.340`
24	`25`		[EDO]A:220	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`12`	`6`	`7551`	`75.6`	`2.6`	`0.289`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		b	`14`	`1`	`704`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`1033`	`70.3`	`-1.2`	`0.587`	`1`	`0`	`0`	`0.025`
26	`27`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`7551`	`68.6`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
27	`28`		[GOL]A:210	`4`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`1549`	`66.7`	`1.3`	`0.717`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[CL]A:207	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`7551`	`66.1`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
29	`30`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`7551`	`63.4`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
30	`31`		[RB]C:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`1033`	`61.6`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.110`
31	`32`		[GOL]A:210	`4`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7551`	`61.0`	`-0.1`	`0.584`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
32	`33`		[CL]A:209	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`7551`	`60.1`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
33	`34`		[GOL]A:211	`4`	`1`	`219`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`7`	`3`	`7551`	`57.2`	`0.7`	`0.705`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`1033`	`51.1`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
35	`36`		[EDO]A:219	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`1033`	`50.4`	`1.5`	`0.765`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		[EDO]A:215	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`7551`	`49.1`	`1.0`	`0.611`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`1549`	`48.7`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.118`
38	`39`		[GOL]A:213	`4`	`1`	`219`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`7`	`3`	`7551`	`48.1`	`0.0`	`0.588`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`46.7`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
40	`41`		C	`7`	`1`	`1549`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`7`	`1`	`1033`	`45.7`	`0.7`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[EDO]A:220	`3`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`7551`	`44.5`	`1.8`	`0.940`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1033`	`44.3`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
43	`44`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`704`	`41.2`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
	`45`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`704`	`28.1`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
	*Average:*													`34.7`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
44	`46`		[GOL]A:212	`3`	`1`	`217`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`4`	`1`	`7551`	`37.2`	`0.7`	`0.778`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		[GOL]A:213	`2`	`1`	`219`	`f`	[GOL]A:211	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`219`	`34.8`	`0.3`	`0.614`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
46	`48`		[GOL]A:210	`3`	`1`	`219`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`704`	`34.6`	`0.4`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`704`	`32.4`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
48	`50`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`704`	`27.6`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
49	`51`		[CL]A:209	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`3`	`1`	`7551`	`26.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`7551`	`25.2`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
51	`53`		[GOL]A:213	`2`	`1`	`219`	`f`	[CL]A:207	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`23.7`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
52	`54`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`7551`	`23.2`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
53	`55`		A	`4`	`4`	`7551`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`4`	`1`	`1033`	`19.9`	`0.2`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`704`	`19.2`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
55	`57`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`704`	`18.8`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
56	`58`		[EDO]A:220	`1`	`1`	`185`	`◊`	[EDO]A:214	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`2`	`1`	`184`	`17.3`	`0.8`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1033`	`17.2`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
58	`60`		[EDO]A:220	`2`	`1`	`185`	`f`	[GOL]A:213	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`219`	`16.1`	`0.6`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`61`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:204	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`15.9`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
60	`62`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.5`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
61	`63`		A	`1`	`1`	`7551`	`◊`	[RB]C:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`216`	`14.4`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.6`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
63	`65`		b	`3`	`1`	`704`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`1549`	`13.5`	`-0.8`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:202	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.7`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
65	`67`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.6`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
66	`68`		C	`1`	`1`	`1549`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`7551`	`7.2`	`0.1`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`6.8`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
68	`70`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`6.5`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
69	`71`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`1033`	`6.0`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
70	`72`		[GOL]A:217	`1`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`1549`	`5.3`	`-0.2`	`0.297`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
71	`73`		A	`3`	`1`	`7551`	`◊`	[RB]A:206	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`1`	`1`	`216`	`4.0`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`74`		[GOL]A:210	`1`	`1`	`219`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`1033`	`2.6`	`0.1`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`75`		[EDO]A:220	`1`	`1`	`185`	`f`	[CL]A:207	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`2.2`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`76`		[EDO]A:219	`1`	`1`	`185`	`f`	[CL]A:208	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`2.0`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`2.1`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
74	`77`		b	`2`	`1`	`704`	`◊`	[RB]C:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`216`	`1.9`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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