PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=781-0A-80N)

Interfaces in PDB 6dkc crystal.
Space symmetry group: P 3 2 1. Resolution: 2.90 Å

YEAST DDI2 CYANAMIDE HYDRATASE, T157V MUTANT, APO STRUCTURE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		I	`158`	`37`	`10403`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`155`	`37`	`10201`	`1424.1`	`-12.8`	`0.349`	`6`	`5`	`0`	`0.171`
	`2`		E	`150`	`36`	`10523`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`150`	`36`	`10425`	`1363.3`	`-14.9`	`0.210`	`7`	`3`	`0`	`0.171`
	`3`		G	`149`	`36`	`10297`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`152`	`36`	`10465`	`1354.1`	`-16.9`	`0.222`	`6`	`4`	`0`	`0.171`
	`4`		C	`145`	`35`	`10252`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`146`	`36`	`10184`	`1342.3`	`-18.5`	`0.129`	`6`	`4`	`0`	`0.171`
	`5`		A	`145`	`35`	`10298`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`146`	`35`	`10298`	`1330.9`	`-15.9`	`0.217`	`3`	`2`	`0`	`0.171`
	*Average:*													`1362.9`	`-15.8`	`0.226`	`6`	`4`	`0`	`0.171`
2	`6`		H	`75`	`16`	`10201`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`73`	`24`	`10465`	`678.8`	`-9.0`	`0.217`	`0`	`1`	`0`	`0.074`
	`7`		C	`69`	`23`	`10252`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`76`	`17`	`10298`	`666.1`	`-9.0`	`0.150`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
	`8`		E	`70`	`23`	`10523`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`74`	`18`	`10252`	`653.3`	`-8.4`	`0.152`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
	`9`		F	`73`	`16`	`10465`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`71`	`23`	`10425`	`651.1`	`-8.3`	`0.204`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
	`10`		B	`72`	`17`	`10184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`68`	`21`	`10298`	`642.0`	`-10.0`	`0.132`	`1`	`1`	`0`	`0.074`
	`11`		D	`77`	`18`	`10425`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`69`	`22`	`10184`	`639.4`	`-8.7`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
	`12`		I	`64`	`21`	`10403`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`73`	`17`	`10297`	`638.8`	`-8.6`	`0.146`	`1`	`1`	`0`	`0.074`
	`13`		G	`67`	`21`	`10297`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`71`	`17`	`10523`	`633.0`	`-8.0`	`0.191`	`1`	`1`	`0`	`0.074`
	*Average:*													`650.3`	`-8.7`	`0.171`	`1`	`1`	`0`	`0.074`
3	`14`		F	`59`	`20`	`10465`	`◊`	D	-y+1,x-y+1,z	`2_665`	`55`	`17`	`10425`	`584.5`	`-4.7`	`0.444`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
4	`15`		F	`49`	`15`	`10465`	`◊`	E	-y+1,x-y+1,z	`2_665`	`63`	`18`	`10523`	`534.5`	`-6.0`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`16`		H	`61`	`15`	`10201`	`◊`	A	-y+1,x-y+1,z-1	`2_664`	`51`	`19`	`10298`	`517.6`	`-4.7`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`17`		E	`23`	`8`	`10523`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`23`	`9`	`10252`	`219.6`	`2.2`	`0.786`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
7	`18`		H	`16`	`6`	`10201`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10297`	`115.5`	`-1.5`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`19`		F	`13`	`5`	`10465`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`10523`	`112.1`	`-1.4`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`20`		D	`14`	`5`	`10425`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10252`	`104.8`	`-1.6`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`21`		B	`13`	`5`	`10184`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`13`	`5`	`10298`	`100.9`	`-1.6`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`108.3`	`-1.6`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
8	`22`		[SO4]E:306	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`11`	`10523`	`115.1`	`-18.6`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
9	`23`		[SO4]C:305	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`10252`	`110.7`	`-17.3`	`0.710`	`1`	`0`	`0`	`0.065`
10	`24`		C	`12`	`5`	`10252`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`12`	`5`	`10252`	`104.8`	`-0.6`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`25`		[SO4]D:305	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`10425`	`103.7`	`-14.7`	`0.802`	`1`	`0`	`0`	`0.055`
12	`26`		[SO4]G:302	`5`	`1`	`185`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`10297`	`100.4`	`-16.0`	`0.777`	`2`	`0`	`0`	`0.096`
13	`27`		[SO4]A:303	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`10298`	`96.8`	`-12.7`	`0.959`	`3`	`0`	`0`	`0.146`
14	`28`		[SO4]E:303	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`10523`	`96.2`	`-12.9`	`0.958`	`2`	`0`	`0`	`0.050`
15	`29`		[SO4]B:304	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`10184`	`95.3`	`-12.4`	`0.962`	`2`	`0`	`0`	`0.049`
16	`30`		[SO4]C:302	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10252`	`95.2`	`-12.7`	`0.960`	`3`	`0`	`0`	`0.052`
17	`31`		[SO4]D:304	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10425`	`93.9`	`-12.2`	`0.960`	`3`	`0`	`0`	`0.049`
18	`32`		[SO4]F:304	`5`	`1`	`186`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10465`	`92.7`	`-12.3`	`0.962`	`2`	`0`	`0`	`0.076`
19	`33`		[SO4]C:304	`5`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`10252`	`88.4`	`-11.8`	`0.844`	`1`	`0`	`0`	`0.045`
20	`34`		[SO4]E:307	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10523`	`88.2`	`-12.2`	`0.880`	`3`	`0`	`0`	`0.049`
21	`35`		[SO4]E:302	`5`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`10523`	`86.0`	`-11.8`	`0.789`	`3`	`0`	`0`	`0.048`
22	`36`		[SO4]D:308	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`10425`	`85.4`	`-11.4`	`0.849`	`1`	`0`	`0`	`0.043`
23	`37`		[SO4]B:306	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10184`	`84.5`	`-11.9`	`0.865`	`2`	`0`	`0`	`0.047`
24	`38`		[SO4]D:303	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10425`	`84.5`	`-11.6`	`0.787`	`3`	`0`	`0`	`0.047`
25	`39`		[SO4]A:302	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`10298`	`84.5`	`-11.9`	`0.802`	`2`	`0`	`0`	`0.133`
26	`40`		[SO4]G:303	`4`	`1`	`186`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10297`	`83.9`	`-11.5`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
27	`41`		[SO4]C:303	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`10252`	`83.3`	`-11.7`	`0.718`	`1`	`0`	`0`	`0.045`
28	`42`		[SO4]B:303	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`10184`	`82.6`	`-12.2`	`0.676`	`1`	`0`	`0`	`0.046`
29	`43`		[SO4]E:305	`5`	`1`	`184`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10297`	`82.5`	`-11.5`	`0.683`	`1`	`0`	`0`	`0.068`
30	`44`		[SO4]F:303	`5`	`1`	`182`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`10465`	`82.3`	`-12.2`	`0.699`	`1`	`0`	`0`	`0.072`
31	`45`		[SO4]D:307	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10425`	`82.2`	`-11.7`	`0.835`	`3`	`0`	`0`	`0.047`
32	`46`		[SO4]C:306	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10252`	`79.7`	`-10.5`	`0.910`	`1`	`0`	`0`	`0.040`
33	`47`		[SO4]C:307	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`10252`	`78.2`	`-10.0`	`0.928`	`2`	`0`	`0`	`0.040`
34	`48`		[SO4]D:301	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10184`	`75.8`	`-10.5`	`0.687`	`1`	`0`	`0`	`0.040`
35	`49`		[SO4]E:304	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10523`	`74.2`	`-10.2`	`0.698`	`1`	`0`	`0`	`0.039`
36	`50`		[SO4]B:305	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`10184`	`73.1`	`-9.3`	`0.872`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
37	`51`		[SO4]A:304	`5`	`1`	`186`	`f`	C	y,x,-z+2	`4_557`	`11`	`4`	`10252`	`71.8`	`-10.0`	`0.647`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
38	`52`		[SO4]F:301	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10425`	`71.1`	`-9.7`	`0.627`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
39	`53`		[SO4]A:304	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10298`	`70.9`	`-9.0`	`0.922`	`2`	`0`	`0`	`0.010`
40	`54`		[SO4]D:301	`4`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`10425`	`70.1`	`-8.6`	`0.940`	`2`	`0`	`0`	`0.010`
41	`55`		[SO4]B:301	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10298`	`70.1`	`-9.6`	`0.672`	`1`	`0`	`0`	`0.105`
42	`56`		[SO4]B:301	`5`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`10184`	`70.0`	`-8.3`	`0.951`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
43	`57`		[SO4]F:301	`4`	`1`	`184`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`10465`	`69.3`	`-8.4`	`0.945`	`2`	`0`	`0`	`0.010`
44	`58`		[SO4]E:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10252`	`65.6`	`-7.9`	`0.936`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
45	`59`		[SO4]E:305	`5`	`1`	`184`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10523`	`60.6`	`-7.0`	`0.938`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
46	`60`		[SO4]D:306	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`10425`	`57.5`	`-8.0`	`0.704`	`1`	`0`	`0`	`0.031`
47	`61`		[ZN]H:500	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`10201`	`51.5`	`-40.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`62`		[ZN]C:301	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`10252`	`51.4`	`-39.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`63`		[ZN]G:301	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`10297`	`51.4`	`-38.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`64`		[ZN]E:301	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`10523`	`51.2`	`-39.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`65`		[ZN]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`10298`	`51.2`	`-40.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`66`		[ZN]B:302	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`10184`	`50.9`	`-38.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`67`		[ZN]F:302	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`10465`	`50.9`	`-39.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`68`		[ZN]I:500	`1`	`1`	`98`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`10403`	`50.6`	`-38.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	`69`		[ZN]D:302	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`10425`	`50.5`	`-38.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
	*Average:*													`51.1`	`-39.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.829`
48	`70`		[SO4]B:303	`5`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10298`	`48.9`	`-5.5`	`0.823`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
49	`71`		[SO4]A:302	`5`	`1`	`185`	`◊`	C	y,x,-z+2	`4_557`	`5`	`2`	`10252`	`45.7`	`-5.1`	`0.839`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`72`		[SO4]D:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10184`	`40.5`	`-5.1`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`43.1`	`-5.1`	`0.834`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
50	`73`		[SO4]F:303	`5`	`1`	`182`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10425`	`44.8`	`-4.8`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
51	`74`		[SO4]E:307	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`7`	`4`	`10252`	`44.0`	`-4.5`	`0.843`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`75`		[SO4]C:303	`5`	`1`	`186`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`10523`	`41.8`	`-5.1`	`0.794`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
53	`76`		[SO4]C:303	`4`	`1`	`186`	`f`	[SO4]C:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`41.6`	`-9.4`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
54	`77`		[SO4]D:304	`4`	`1`	`184`	`f`	[SO4]D:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`40.4`	`-9.1`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
55	`78`		[SO4]E:302	`4`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10297`	`40.2`	`-5.0`	`0.825`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
56	`79`		[SO4]E:303	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]E:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`40.0`	`-9.0`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
57	`80`		[SO4]A:303	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]A:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`38.2`	`-8.6`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
58	`81`		[SO4]F:304	`4`	`1`	`186`	`f`	[SO4]F:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`182`	`37.8`	`-8.5`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
59	`82`		[SO4]B:304	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]B:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`35.7`	`-7.9`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
60	`83`		I	`4`	`2`	`10403`	`◊`	A	-y+1,x-y+1,z-1	`2_664`	`3`	`1`	`10298`	`35.1`	`0.5`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`84`		[SO4]E:307	`3`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10252`	`32.8`	`-3.9`	`0.548`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
62	`85`		I	`3`	`2`	`10403`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10465`	`26.3`	`0.7`	`0.887`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		E	`2`	`1`	`10523`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10184`	`22.1`	`0.6`	`0.878`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		C	`1`	`1`	`10252`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10298`	`20.8`	`0.5`	`0.884`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`88`		G	`1`	`1`	`10297`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10425`	`18.2`	`0.4`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`21.8`	`0.5`	`0.886`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`89`		[SO4]B:301	`1`	`1`	`185`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`1`	`1`	`10298`	`22.6`	`-1.8`	`0.888`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
64	`90`		[SO4]E:304	`1`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10425`	`20.8`	`-1.7`	`0.878`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
65	`91`		[SO4]E:305	`1`	`1`	`184`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10465`	`16.1`	`-2.2`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
66	`92`		[SO4]F:301	`1`	`1`	`184`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10523`	`14.5`	`-2.0`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
67	`93`		[SO4]A:304	`1`	`1`	`186`	`◊`	B	y,x,-z+2	`4_557`	`1`	`1`	`10184`	`14.5`	`-2.0`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
68	`94`		[SO4]D:301	`1`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10252`	`13.6`	`-1.9`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
69	`95`		[SO4]C:306	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:304	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`7.9`	`-1.9`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
70	`96`		[SO4]C:307	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:304	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`7.6`	`-1.8`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
71	`97`		[SO4]D:305	`1`	`1`	`184`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10523`	`2.6`	`-0.3`	`0.871`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
72	`98`		[SO4]D:305	`1`	`1`	`184`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10465`	`1.8`	`-0.2`	`0.678`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`99`		[SO4]C:307	`1`	`1`	`185`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`1`	`1`	`10298`	`1.5`	`-0.1`	`0.898`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe