PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=131-IO-HM6)

Interfaces in PDB 6dbj

CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS NICKED DNA INTERMEDIATES

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`194`	`50`	`25912`	`◊`	C	`200`	`51`	`25878`	`1905.1`	`-18.0`	`0.102`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`194`	`51`	`25912`	`◊`	B	`199`	`52`	`16665`	`1816.6`	`-7.9`	`0.300`	`30`	`10`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`188`	`51`	`25878`	`◊`	D	`198`	`53`	`16810`	`1812.3`	`-11.4`	`0.283`	`29`	`11`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1814.4`	`-9.6`	`0.292`	`30`	`11`	`0`	`0.000`
3	`4`		A	`109`	`37`	`25912`	`◊`	G	`106`	`14`	`7425`	`894.1`	`-7.2`	`0.657`	`19`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		C	`110`	`37`	`25878`	`◊`	F	`103`	`13`	`7435`	`879.9`	`-7.1`	`0.655`	`18`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`887.0`	`-7.1`	`0.656`	`19`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		G	`78`	`16`	`7425`	`◊`	I	`79`	`16`	`3827`	`771.9`	`-8.6`	`0.753`	`40`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		F	`76`	`16`	`7435`	`◊`	J	`76`	`16`	`3816`	`771.8`	`-9.2`	`0.721`	`42`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`771.9`	`-8.9`	`0.737`	`41`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		A	`70`	`18`	`25912`	`◊`	D	`79`	`21`	`16810`	`684.3`	`-0.4`	`0.658`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`72`	`18`	`25878`	`◊`	B	`72`	`21`	`16665`	`674.9`	`-0.2`	`0.709`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`679.6`	`-0.3`	`0.683`	`11`	`2`	`0`	`0.000`
6	`10`		E	`68`	`14`	`3642`	`◊`	F	`70`	`15`	`7435`	`664.1`	`-6.2`	`0.658`	`34`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		H	`67`	`14`	`3635`	`◊`	G	`71`	`15`	`7425`	`659.0`	`-5.7`	`0.676`	`34`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`661.5`	`-6.0`	`0.667`	`34`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		A	`61`	`20`	`25912`	`◊`	I	`62`	`6`	`3827`	`540.7`	`-5.9`	`0.699`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		C	`62`	`20`	`25878`	`◊`	J	`63`	`6`	`3816`	`520.7`	`-5.7`	`0.699`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`530.7`	`-5.8`	`0.699`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		A	`69`	`25`	`25912`	`◊`	H	`61`	`6`	`3635`	`537.9`	`0.6`	`0.808`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		C	`72`	`23`	`25878`	`◊`	E	`60`	`6`	`3642`	`536.9`	`-2.6`	`0.690`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`537.4`	`-1.0`	`0.749`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
9	`16`		A	`55`	`17`	`25912`	`◊`	E	`58`	`6`	`3642`	`519.2`	`-5.7`	`0.534`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		C	`56`	`17`	`25878`	`◊`	H	`58`	`5`	`3635`	`510.4`	`-5.8`	`0.542`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`514.8`	`-5.8`	`0.538`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		A	`58`	`19`	`25912`	`◊`	F	`55`	`9`	`7435`	`471.7`	`-8.9`	`0.428`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`60`	`19`	`25878`	`◊`	G	`55`	`10`	`7425`	`462.7`	`-9.4`	`0.402`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`467.2`	`-9.1`	`0.415`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		D	`28`	`8`	`16810`	`◊`	F	`38`	`8`	`7435`	`264.3`	`-2.0`	`0.718`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		B	`27`	`7`	`16665`	`◊`	G	`37`	`7`	`7425`	`253.0`	`-2.2`	`0.702`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`258.7`	`-2.1`	`0.710`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
12	`22`		D	`30`	`11`	`16810`	`◊`	J	`31`	`5`	`3816`	`239.6`	`-4.3`	`0.479`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		B	`29`	`11`	`16665`	`◊`	I	`29`	`5`	`3827`	`222.0`	`-4.0`	`0.439`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`230.8`	`-4.2`	`0.459`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		C	`7`	`5`	`25878`	`◊`	[CA]C:1102	`1`	`1`	`85`	`32.4`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		A	`9`	`5`	`25912`	`◊`	[CA]A:1102	`1`	`1`	`85`	`32.3`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`32.3`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`26`		A	`10`	`6`	`25912`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`30.9`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		C	`10`	`6`	`25878`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`30.5`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`30.7`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`28`		F	`9`	`3`	`7435`	`◊`	[CA]C:1102	`1`	`1`	`85`	`28.2`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		G	`7`	`2`	`7425`	`◊`	[CA]A:1102	`1`	`1`	`85`	`27.3`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.7`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`30`		J	`2`	`1`	`3816`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`20.2`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		I	`3`	`1`	`3827`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`19.7`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.9`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`32`		G	`3`	`1`	`7425`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`17.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		F	`3`	`1`	`7435`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`17.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`34`		[CA]A:1102	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`6.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`35`		[CA]C:1102	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`5.6`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe