PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=711-93-F8I)

Interfaces in PDB 6ctr crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.85 Å

TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER WITH CHF (R & S ISOMERS), BETA, GAMMA DCTP ANALOGUE

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		T	`80`	`8`	`3782`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`27`	`17229`	`686.8`	`-5.3`	`0.402`	`13`	`0`	`0`	`0.150`
`2`		P	`42`	`9`	`2190`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`43`	`10`	`3782`	`428.6`	`-5.3`	`0.566`	`23`	`0`	`0`	`0.874`
`3`		D	`40`	`4`	`1365`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`18`	`17229`	`398.0`	`-6.4`	`0.476`	`10`	`0`	`0`	`0.154`
`4`		[FF4]A:405	`29`	`1`	`560`	`f`	[F3C]A:404	x,y,z	`1_555`	`29`	`1`	`562`	`262.7`	`0.4`	`0.421`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`5`		A	`32`	`7`	`17229`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`7`	`17229`	`245.5`	`2.1`	`0.769`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
`6`		P	`25`	`3`	`2190`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`17`	`17229`	`240.8`	`-6.3`	`0.184`	`3`	`0`	`0`	`0.123`
`7`		D	`24`	`5`	`1365`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`24`	`5`	`3782`	`234.4`	`-3.7`	`0.558`	`16`	`0`	`0`	`0.674`
`8`		A	`22`	`9`	`17229`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`32`	`10`	`17229`	`231.9`	`5.1`	`0.937`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
`9`		A	`26`	`10`	`17229`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`29`	`12`	`17229`	`230.0`	`-2.4`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`10`		A	`25`	`9`	`17229`	`◊`	P	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`25`	`3`	`2190`	`222.5`	`2.3`	`0.652`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		A	`24`	`11`	`17229`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`20`	`7`	`17229`	`187.7`	`5.0`	`0.940`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
`12`		[F3C]A:404	`29`	`1`	`562`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`18`	`17229`	`175.1`	`1.1`	`0.583`	`10`	`0`	`0`	`0.053`
`13`		[FF4]A:405	`29`	`1`	`560`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`18`	`17229`	`172.2`	`0.7`	`0.539`	`9`	`0`	`0`	`0.053`
`14`		A	`15`	`8`	`17229`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`19`	`2`	`3782`	`159.2`	`-0.4`	`0.539`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		D	`14`	`1`	`1365`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`13`	`3`	`17229`	`114.0`	`2.3`	`0.807`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		T	`14`	`2`	`3782`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`12`	`3`	`17229`	`111.2`	`-1.0`	`0.524`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		[2DA]P:10	`10`	`1`	`446`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`17229`	`110.4`	`0.9`	`0.365`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		A	`15`	`5`	`17229`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`10`	`3`	`17229`	`107.6`	`-1.9`	`0.231`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		[2DA]P:10	`16`	`1`	`446`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`2190`	`100.6`	`2.3`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`20`		[F3C]A:404	`15`	`1`	`562`	`◊`	[2DA]P:10	x,y,z	`1_555`	`16`	`1`	`446`	`65.9`	`2.0`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`21`		[FF4]A:405	`15`	`1`	`560`	`◊`	[2DA]P:10	x,y,z	`1_555`	`16`	`1`	`446`	`65.8`	`2.0`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`22`		[2DA]P:10	`6`	`1`	`446`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`3782`	`65.0`	`-0.5`	`0.401`	`3`	`0`	`0`	`0.103`
`23`		[CL]A:403	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`17229`	`62.6`	`-9.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.149`
`24`		A	`6`	`2`	`17229`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`9`	`2`	`3782`	`62.0`	`-2.1`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`25`		[NA]D:101	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17229`	`57.8`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.143`
`26`		[NA]P:401	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17229`	`57.1`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.143`
`27`		[F3C]A:404	`4`	`1`	`562`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3782`	`36.6`	`-0.3`	`0.481`	`3`	`0`	`0`	`0.023`
`28`		[FF4]A:405	`4`	`1`	`560`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3782`	`36.5`	`-0.3`	`0.488`	`3`	`0`	`0`	`0.023`
`29`		[NA]D:101	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1365`	`33.3`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
`30`		[NA]P:401	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2190`	`33.0`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.077`
`31`		[NA]A:401	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17229`	`30.9`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
`32`		[MG]T:101	`1`	`1`	`98`	`f`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3782`	`29.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
`33`		D	`5`	`1`	`1365`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`2`	`1`	`3782`	`24.5`	`-0.2`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`34`		[MG]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17229`	`23.1`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
`35`		A	`4`	`1`	`17229`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`17229`	`22.9`	`-0.1`	`0.589`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`36`		[MG]T:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1365`	`22.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.159`
`37`		[NA]A:401	`1`	`1`	`125`	`◊`	[2DA]P:10	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`446`	`20.9`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
`38`		[F3C]A:404	`6`	`1`	`562`	`f`	[NA]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`19.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
`39`		[FF4]A:405	`6`	`1`	`560`	`f`	[NA]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`19.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
`40`		[F3C]A:404	`5`	`1`	`562`	`f`	[MG]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
`41`		[FF4]A:405	`5`	`1`	`560`	`f`	[MG]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
`42`		[NA]A:401	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.3`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
`43`		[MG]T:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`17229`	`9.4`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
`44`		A	`3`	`2`	`17229`	`◊`	T	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`3782`	`8.5`	`-0.4`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`45`		[CL]A:403	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3782`	`6.4`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
`46`		A	`2`	`1`	`17229`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`17229`	`2.6`	`-0.1`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`47`		A	`1`	`1`	`17229`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2190`	`1.8`	`-0.1`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`48`		[F3C]A:404	`1`	`1`	`562`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2190`	`0.9`	`0.0`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`49`		[FF4]A:405	`1`	`1`	`560`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2190`	`0.9`	`0.0`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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