PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=827-IL-79N)

Interfaces in PDB 6ap1

VPS4P-VTA1P COMPLEX WITH PEPTIDE BINDING TO THE CENTRAL PORE OF VPS4P

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`199`	`64`	`18087`	`◊`	C	`191`	`51`	`17872`	`1853.5`	`-8.8`	`0.269`	`9`	`5`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`200`	`67`	`17765`	`◊`	B	`201`	`53`	`18087`	`1853.1`	`-6.9`	`0.363`	`13`	`2`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`196`	`63`	`17872`	`◊`	D	`196`	`51`	`18163`	`1822.9`	`-6.9`	`0.335`	`11`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1843.2`	`-7.5`	`0.322`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
2	`4`		D	`188`	`62`	`18163`	`◊`	E	`194`	`50`	`17586`	`1846.4`	`-9.1`	`0.291`	`12`	`1`	`0`	`0.000`
3	`5`		H	`83`	`21`	`3300`	`◊`	I	`84`	`22`	`3447`	`975.4`	`-17.1`	`0.097`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	`6`		P	`83`	`21`	`3296`	`◊`	Q	`82`	`21`	`3452`	`973.3`	`-17.0`	`0.097`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	`7`		R	`83`	`21`	`3296`	`◊`	S	`83`	`21`	`3445`	`972.7`	`-17.0`	`0.094`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	`8`		L	`82`	`21`	`3309`	`◊`	M	`82`	`22`	`3444`	`972.7`	`-17.0`	`0.091`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	`9`		N	`82`	`21`	`3305`	`◊`	O	`81`	`22`	`3447`	`972.6`	`-17.0`	`0.087`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	`10`		J	`82`	`21`	`3300`	`◊`	K	`80`	`21`	`3448`	`970.2`	`-17.0`	`0.086`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`972.8`	`-17.0`	`0.092`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
4	`11`		E	`93`	`30`	`17586`	`◊`	F	`87`	`24`	`16577`	`828.8`	`-5.7`	`0.324`	`7`	`5`	`0`	`0.000`
5	`12`		A	`80`	`27`	`17765`	`◊`	F	`90`	`27`	`16577`	`770.9`	`-4.1`	`0.363`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
6	`13`		D	`47`	`14`	`18163`	`◊`	N	`43`	`12`	`3305`	`393.3`	`-2.6`	`0.508`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		C	`43`	`13`	`17872`	`◊`	L	`43`	`12`	`3309`	`376.8`	`-1.8`	`0.577`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		A	`43`	`13`	`17765`	`◊`	H	`38`	`10`	`3300`	`341.4`	`-2.4`	`0.528`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		B	`43`	`14`	`18087`	`◊`	J	`38`	`11`	`3300`	`324.4`	`-1.8`	`0.594`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`347.6`	`-2.0`	`0.567`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`17`		E	`39`	`12`	`17586`	`◊`	P	`39`	`10`	`3296`	`355.8`	`-1.7`	`0.605`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
9	`18`		D	`59`	`20`	`18163`	`◊`	[ADP]D:701	`27`	`1`	`532`	`349.0`	`-4.6`	`0.442`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		B	`51`	`19`	`18087`	`◊`	[ADP]B:701	`27`	`1`	`533`	`323.1`	`-4.0`	`0.498`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`336.1`	`-4.3`	`0.470`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
10	`20`		E	`47`	`18`	`17586`	`◊`	[ADP]E:701	`26`	`1`	`547`	`342.8`	`-5.9`	`0.359`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
11	`21`		F	`36`	`12`	`16577`	`◊`	R	`36`	`10`	`3296`	`334.7`	`-1.9`	`0.558`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
12	`22`		A	`54`	`19`	`17765`	`◊`	[ADP]A:701	`27`	`1`	`536`	`324.6`	`-4.5`	`0.476`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		C	`53`	`18`	`17872`	`◊`	[ADP]C:701	`27`	`1`	`532`	`317.9`	`-4.2`	`0.462`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`321.2`	`-4.3`	`0.469`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		C	`33`	`9`	`17872`	`◊`	G	`27`	`6`	`1309`	`272.5`	`-2.6`	`0.345`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
14	`25`		D	`30`	`7`	`18163`	`◊`	G	`21`	`4`	`1309`	`241.4`	`-4.5`	`0.237`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`26`		A	`20`	`6`	`17765`	`◊`	S	`25`	`6`	`3445`	`204.7`	`0.1`	`0.668`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
16	`27`		B	`23`	`6`	`18087`	`◊`	G	`16`	`5`	`1309`	`198.9`	`-3.6`	`0.274`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`28`		A	`28`	`6`	`17765`	`◊`	G	`16`	`3`	`1309`	`190.0`	`-0.6`	`0.638`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
18	`29`		C	`19`	`6`	`17872`	`◊`	K	`21`	`5`	`3448`	`181.8`	`0.9`	`0.710`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`30`		B	`18`	`7`	`18087`	`◊`	I	`21`	`6`	`3447`	`159.9`	`0.6`	`0.710`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`31`		D	`17`	`6`	`18163`	`◊`	M	`19`	`5`	`3444`	`151.8`	`0.2`	`0.674`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`164.5`	`0.6`	`0.698`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
19	`32`		D	`13`	`4`	`18163`	`◊`	O	`13`	`4`	`3447`	`110.7`	`-0.1`	`0.631`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`33`		E	`10`	`3`	`17586`	`◊`	G	`9`	`2`	`1309`	`90.7`	`-2.2`	`0.237`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`34`		E	`9`	`4`	`17586`	`◊`	O	`14`	`2`	`3447`	`86.8`	`-0.2`	`0.625`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`35`		E	`9`	`5`	`17586`	`◊`	Q	`11`	`6`	`3452`	`85.6`	`0.9`	`0.779`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`36`		C	`18`	`10`	`17872`	`◊`	[BEF]C:702	`4`	`1`	`180`	`72.3`	`1.6`	`0.594`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
24	`37`		A	`18`	`9`	`17765`	`◊`	[BEF]A:702	`4`	`1`	`181`	`71.5`	`1.7`	`0.608`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
25	`38`		B	`18`	`10`	`18087`	`◊`	[BEF]B:702	`4`	`1`	`181`	`70.3`	`1.6`	`0.604`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
26	`39`		F	`5`	`2`	`16577`	`◊`	S	`6`	`4`	`3445`	`62.1`	`0.8`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`40`		D	`9`	`3`	`18163`	`◊`	[ADP]C:701	`7`	`1`	`532`	`59.6`	`-0.7`	`0.606`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		E	`8`	`3`	`17586`	`◊`	[ADP]D:701	`10`	`1`	`532`	`57.8`	`0.0`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		B	`7`	`3`	`18087`	`◊`	[ADP]A:701	`7`	`1`	`536`	`55.2`	`-1.1`	`0.586`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`57.5`	`-0.6`	`0.629`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`43`		C	`8`	`3`	`17872`	`◊`	[ADP]B:701	`7`	`1`	`533`	`58.2`	`-0.7`	`0.625`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`44`		G	`4`	`1`	`1309`	`c`	[ACE]G:0	`3`	`1`	`172`	`56.9`	`-0.2`	`0.834`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`45`		C	`6`	`2`	`17872`	`◊`	M	`6`	`3`	`3444`	`51.1`	`0.4`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		A	`6`	`2`	`17765`	`◊`	I	`5`	`3`	`3447`	`36.4`	`0.5`	`0.673`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		B	`3`	`2`	`18087`	`◊`	K	`3`	`2`	`3448`	`23.7`	`0.5`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`37.1`	`0.5`	`0.653`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`48`		G	`6`	`2`	`1309`	`c`	[NH2]G:173	`1`	`1`	`117`	`48.0`	`0.2`	`0.718`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`49`		[ADP]B:701	`4`	`1`	`533`	`◊`	[BEF]B:702	`4`	`1`	`181`	`47.7`	`-2.3`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`50`		[ADP]C:701	`4`	`1`	`532`	`◊`	[BEF]C:702	`4`	`1`	`180`	`46.9`	`-2.4`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`51`		[ADP]A:701	`4`	`1`	`536`	`◊`	[BEF]A:702	`4`	`1`	`181`	`45.7`	`-2.3`	`0.228`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`52`		A	`7`	`1`	`17765`	`◊`	[ACE]G:0	`3`	`1`	`172`	`41.8`	`-0.5`	`0.532`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`53`		D	`9`	`4`	`18163`	`◊`	[BEF]C:702	`4`	`1`	`180`	`35.8`	`0.9`	`0.487`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`54`		C	`8`	`3`	`17872`	`◊`	[BEF]B:702	`4`	`1`	`181`	`35.1`	`0.8`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`55`		B	`8`	`3`	`18087`	`◊`	[BEF]A:702	`3`	`1`	`181`	`34.4`	`0.8`	`0.104`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`56`		D	`7`	`3`	`18163`	`◊`	[MG]D:702	`1`	`1`	`98`	`33.8`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		A	`10`	`5`	`17765`	`◊`	[MG]A:703	`1`	`1`	`98`	`29.5`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		C	`9`	`4`	`17872`	`◊`	[MG]C:703	`1`	`1`	`98`	`29.1`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		B	`9`	`4`	`18087`	`◊`	[MG]B:703	`1`	`1`	`98`	`28.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`30.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`60`		[ADP]D:701	`4`	`1`	`532`	`◊`	[MG]D:702	`1`	`1`	`98`	`29.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[ADP]A:701	`5`	`1`	`536`	`◊`	[MG]A:703	`1`	`1`	`98`	`26.8`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[ADP]B:701	`4`	`1`	`533`	`◊`	[MG]B:703	`1`	`1`	`98`	`26.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[ADP]C:701	`5`	`1`	`532`	`◊`	[MG]C:703	`1`	`1`	`98`	`25.8`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.2`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`64`		F	`3`	`2`	`16577`	`◊`	Q	`4`	`3`	`3452`	`27.2`	`0.0`	`0.503`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`65`		E	`5`	`4`	`17586`	`◊`	[MG]D:702	`1`	`1`	`98`	`24.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		D	`6`	`4`	`18163`	`◊`	[MG]C:703	`1`	`1`	`98`	`20.7`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		C	`5`	`4`	`17872`	`◊`	[MG]B:703	`1`	`1`	`98`	`18.5`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		B	`4`	`3`	`18087`	`◊`	[MG]A:703	`1`	`1`	`98`	`16.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`20.0`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`69`		[BEF]A:702	`2`	`1`	`181`	`◊`	[MG]A:703	`1`	`1`	`98`	`22.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[BEF]B:702	`3`	`1`	`181`	`◊`	[MG]B:703	`1`	`1`	`98`	`22.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[BEF]C:702	`3`	`1`	`180`	`◊`	[MG]C:703	`1`	`1`	`98`	`21.4`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`21.9`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`72`		E	`4`	`2`	`17586`	`◊`	[NH2]G:173	`1`	`1`	`117`	`10.8`	`-0.0`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`73`		C	`1`	`1`	`17872`	`◊`	[NH2]G:173	`1`	`1`	`117`	`10.4`	`0.3`	`0.930`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`74`		D	`1`	`1`	`18163`	`◊`	[NH2]G:173	`1`	`1`	`117`	`7.8`	`-0.0`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`75`		A	`3`	`1`	`17765`	`◊`	E	`1`	`1`	`17586`	`7.0`	`-0.2`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`76`		A	`1`	`1`	`17765`	`◊`	R	`1`	`1`	`3296`	`0.5`	`0.0`	`0.679`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe