PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=311-4B-585)

Interfaces in PDB 5wpb crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.55 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT 3-(3-(PYRIDIN-2-YLMETHOXY)QUINOXALIN-2- YL)PROPANOIC ACID BOUND IN THE UBIQUITIN BINDING POCKET OF THE HDAC6 ZINC-FINGER DOMAIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`37`	`12`	`5540`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`32`	`10`	`5540`	`328.2`	`-2.1`	`0.669`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
2	`2`		[B8P]A:1304	`23`	`1`	`516`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`15`	`5540`	`320.6`	`0.6`	`0.306`	`4`	`0`	`0`	`0.015`
3	`3`		A	`32`	`10`	`5540`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`36`	`13`	`5540`	`291.9`	`-7.5`	`0.117`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`37`	`11`	`5540`	`x`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`25`	`9`	`5540`	`262.0`	`-2.6`	`0.462`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`13`	`4`	`5540`	`◊`	[B8P]A:1304	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`10`	`1`	`516`	`98.1`	`2.5`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`7`	`2`	`5540`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`14`	`6`	`5540`	`95.8`	`-1.3`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		[UNX]A:1309	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`5540`	`75.3`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
8	`8`		[UNX]A:1313	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`5540`	`71.1`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
9	`9`		[UNX]A:1307	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`5540`	`67.2`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
10	`10`		[UNX]A:1321	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`5540`	`66.5`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
11	`11`		[UNX]A:1306	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`5540`	`63.9`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
12	`12`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`5540`	`62.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`13`		[UNX]A:1310	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`5540`	`61.1`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	*Average:*													`62.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
13	`14`		[UNX]A:1315	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`5540`	`57.5`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
14	`15`		[UNX]A:1318	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`5540`	`53.7`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
15	`16`		[UNX]A:1308	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`7`	`5`	`5540`	`50.8`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
16	`17`		A	`8`	`4`	`5540`	`f`	[UNX]A:1311	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`129`	`48.2`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
17	`18`		[UNX]A:1305	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`5540`	`44.6`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
18	`19`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`f`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`10`	`4`	`5540`	`43.8`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
19	`20`		[UNX]A:1308	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`5540`	`42.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[UNX]A:1317	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`5540`	`42.1`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[UNX]A:1319	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`3`	`5540`	`39.7`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
22	`23`		A	`7`	`3`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1321	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`129`	`39.2`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`6`	`4`	`5540`	`39.2`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
24	`25`		[UNX]A:1320	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`5540`	`38.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
25	`26`		[UNX]A:1319	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`5540`	`37.7`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`5540`	`35.6`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.7`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[UNX]A:1311	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`5540`	`36.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[UNX]A:1307	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1306	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`36.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
28	`30`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1310	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`33.4`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
29	`31`		A	`5`	`3`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1305	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`129`	`33.0`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`5540`	`31.1`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		A	`1`	`1`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1320	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`30.1`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		A	`2`	`1`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1315	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`129`	`27.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[UNX]A:1311	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`5540`	`21.2`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[UNX]A:1319	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1312	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`20.9`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`5540`	`20.6`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1317	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`129`	`20.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		A	`2`	`2`	`5540`	`f`	[UNX]A:1317	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`129`	`19.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
38	`40`		[UNX]A:1319	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`5`	`3`	`5540`	`18.5`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		A	`3`	`2`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1317	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`129`	`16.3`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[UNX]A:1313	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`2`	`5540`	`15.0`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		A	`2`	`1`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1314	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`129`	`12.3`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		[UNX]A:1313	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1310	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`11.6`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
43	`45`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1311	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`11.6`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		A	`4`	`2`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1317	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`11.6`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		A	`2`	`1`	`5540`	`◊`	[UNX]A:1318	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`9.8`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1315	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`129`	`7.6`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
47	`49`		[UNX]A:1308	`1`	`1`	`129`	`f`	[ZN]A:1301	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`98`	`7.5`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
48	`50`		[UNX]A:1318	`1`	`1`	`129`	`f`	[ZN]A:1302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`5.1`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
49	`51`		[ZN]A:1303	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`5540`	`3.4`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
50	`52`		[UNX]A:1319	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1317	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`129`	`2.2`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		[UNX]A:1320	`1`	`1`	`129`	`f`	[B8P]A:1304	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`516`	`0.5`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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