PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=155-9J-06K)

Interfaces in PDB 5u1c

STRUCTURE OF TETRAMERIC HIV-1 STRAND TRANSFER COMPLEX INTASOME

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`214`	`53`	`14998`	`◊`	D	`228`	`53`	`11417`	`1989.0`	`-20.5`	`0.196`	`22`	`13`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`215`	`53`	`15008`	`◊`	B	`228`	`54`	`11422`	`1983.7`	`-20.0`	`0.209`	`23`	`13`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1986.4`	`-20.2`	`0.202`	`23`	`13`	`0`	`0.000`
2	`3`		A	`118`	`30`	`15008`	`◊`	C	`117`	`30`	`14998`	`1065.4`	`-1.0`	`0.745`	`16`	`6`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`120`	`39`	`14998`	`◊`	E	`100`	`8`	`3524`	`979.4`	`-11.6`	`0.433`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		A	`121`	`40`	`15008`	`◊`	I	`99`	`8`	`3527`	`977.8`	`-11.4`	`0.438`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`978.6`	`-11.5`	`0.435`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		A	`65`	`24`	`15008`	`◊`	F	`73`	`14`	`6002`	`577.2`	`-6.4`	`0.639`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		C	`64`	`24`	`14998`	`◊`	J	`72`	`14`	`6000`	`575.4`	`-6.3`	`0.636`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`576.3`	`-6.3`	`0.638`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		E	`48`	`11`	`3524`	`◊`	F	`49`	`12`	`6002`	`489.6`	`-7.8`	`0.593`	`20`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		I	`48`	`11`	`3527`	`◊`	J	`49`	`12`	`6000`	`487.9`	`-7.8`	`0.594`	`20`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`488.7`	`-7.8`	`0.593`	`20`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		C	`47`	`14`	`14998`	`◊`	F	`48`	`6`	`6002`	`431.1`	`-1.4`	`0.758`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		A	`48`	`14`	`15008`	`◊`	J	`49`	`6`	`6000`	`430.3`	`-1.4`	`0.762`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`430.7`	`-1.4`	`0.760`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		H	`40`	`8`	`1916`	`◊`	J	`38`	`9`	`6000`	`369.0`	`-3.8`	`0.657`	`21`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		G	`40`	`8`	`1914`	`◊`	F	`39`	`9`	`6002`	`367.9`	`-3.8`	`0.658`	`21`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`368.5`	`-3.8`	`0.657`	`21`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		F	`38`	`6`	`6002`	`◊`	J	`37`	`6`	`6000`	`321.0`	`-3.2`	`0.700`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
9	`15`		C	`40`	`16`	`14998`	`◊`	I	`34`	`5`	`3527`	`316.0`	`-1.5`	`0.704`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		A	`39`	`16`	`15008`	`◊`	E	`34`	`5`	`3524`	`315.8`	`-1.5`	`0.703`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`315.9`	`-1.5`	`0.703`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		A	`32`	`9`	`15008`	`◊`	G	`29`	`3`	`1914`	`244.3`	`-3.6`	`0.528`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		C	`32`	`9`	`14998`	`◊`	H	`29`	`3`	`1916`	`243.3`	`-3.5`	`0.528`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`243.8`	`-3.5`	`0.528`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`19`		C	`13`	`3`	`14998`	`◊`	B	`21`	`4`	`11422`	`145.6`	`0.0`	`0.646`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		A	`13`	`3`	`15008`	`◊`	D	`20`	`4`	`11417`	`145.4`	`-0.0`	`0.640`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`145.5`	`0.0`	`0.643`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		B	`13`	`6`	`11422`	`◊`	I	`15`	`5`	`3527`	`138.9`	`-4.7`	`0.318`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		D	`13`	`6`	`11417`	`◊`	E	`15`	`5`	`3524`	`138.9`	`-4.6`	`0.319`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`138.9`	`-4.6`	`0.318`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`23`		G	`12`	`1`	`1914`	`◊`	J	`17`	`1`	`6000`	`102.7`	`0.5`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		H	`12`	`1`	`1916`	`◊`	F	`17`	`1`	`6002`	`102.3`	`0.5`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`102.5`	`0.5`	`0.725`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`25`		D	`4`	`1`	`11417`	`◊`	I	`6`	`2`	`3527`	`47.2`	`0.1`	`0.638`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		B	`3`	`1`	`11422`	`◊`	E	`6`	`2`	`3524`	`47.0`	`0.1`	`0.640`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`47.1`	`0.1`	`0.639`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
15	`27`		A	`5`	`3`	`15008`	`◊`	[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`36.5`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		C	`5`	`3`	`14998`	`◊`	[MG]C:501	`1`	`1`	`98`	`36.2`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`36.4`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`29`		J	`1`	`1`	`6000`	`◊`	[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`25.3`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		F	`1`	`1`	`6002`	`◊`	[MG]C:501	`1`	`1`	`98`	`24.9`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`25.1`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`31`		G	`4`	`1`	`1914`	`◊`	[MG]A:501	`1`	`1`	`98`	`20.2`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		H	`4`	`1`	`1916`	`◊`	[MG]C:501	`1`	`1`	`98`	`19.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`33`		C	`2`	`1`	`14998`	`◊`	[ZN]A:500	`1`	`1`	`98`	`2.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		A	`2`	`1`	`15008`	`◊`	[ZN]C:500	`1`	`1`	`98`	`1.9`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1.9`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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