PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=196-H9-1L3)

Interfaces in PDB 5jwe crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.40 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF H-2DB IN COMPLEX WITH THE LCMV-DERIVED GP92-101 PEPTIDE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`128`	`33`	`6530`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`141`	`41`	`15048`	`1267.4`	`-9.1`	`0.300`	`18`	`2`	`0`	`0.327`
	`2`		F	`127`	`34`	`6431`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`134`	`40`	`15003`	`1239.9`	`-8.7`	`0.393`	`15`	`4`	`0`	`0.327`
	`3`		B	`126`	`34`	`6375`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`135`	`41`	`15572`	`1227.7`	`-8.5`	`0.367`	`17`	`2`	`0`	`0.327`
	`4`		D	`125`	`34`	`6511`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`136`	`39`	`15454`	`1188.8`	`-8.7`	`0.305`	`17`	`4`	`0`	`0.327`
	*Average:*													`1231.0`	`-8.8`	`0.342`	`17`	`3`	`0`	`0.327`
2	`5`		S	`67`	`10`	`1383`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`122`	`37`	`15048`	`852.1`	`-8.3`	`0.479`	`21`	`1`	`0`	`0.921`
	`6`		P	`66`	`10`	`1371`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`118`	`38`	`15572`	`848.3`	`-8.6`	`0.413`	`24`	`0`	`0`	`0.921`
	`7`		R	`69`	`10`	`1371`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`116`	`36`	`15003`	`844.4`	`-7.8`	`0.568`	`24`	`2`	`0`	`0.921`
	`8`		Q	`68`	`10`	`1377`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`117`	`38`	`15454`	`844.4`	`-8.2`	`0.427`	`24`	`0`	`0`	`0.921`
	*Average:*													`847.3`	`-8.2`	`0.472`	`23`	`1`	`0`	`0.921`
3	`9`		G	`77`	`19`	`15048`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`75`	`17`	`15454`	`631.5`	`-4.3`	`0.420`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
	`10`		E	`74`	`18`	`15003`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`76`	`17`	`15572`	`625.5`	`-4.6`	`0.464`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`628.5`	`-4.4`	`0.442`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
4	`11`		G	`66`	`18`	`15048`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`63`	`18`	`15572`	`621.6`	`-1.7`	`0.588`	`11`	`0`	`0`	`0.033`
	`12`		C	`63`	`18`	`15454`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`66`	`18`	`15003`	`614.3`	`-0.6`	`0.713`	`11`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`618.0`	`-1.1`	`0.650`	`11`	`0`	`0`	`0.033`
5	`13`		C	`60`	`17`	`15454`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`17`	`15572`	`473.6`	`-2.2`	`0.497`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`14`		F	`36`	`10`	`6431`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`38`	`12`	`15572`	`316.6`	`-3.4`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		C	`37`	`12`	`15454`	`◊`	H	x,y,z-1	`1_554`	`30`	`9`	`6530`	`274.6`	`-5.5`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		E	`16`	`5`	`15003`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`21`	`5`	`6375`	`141.8`	`-3.6`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		D	`10`	`4`	`6511`	`◊`	G	x,y,z-1	`1_554`	`15`	`4`	`15048`	`97.9`	`-1.7`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`207.8`	`-3.5`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`18`		F	`34`	`9`	`6431`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`28`	`8`	`15572`	`259.4`	`-2.9`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`19`		H	`24`	`7`	`6530`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`6`	`15454`	`197.2`	`-2.1`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`228.3`	`-2.5`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
8	`20`		B	`22`	`7`	`6375`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`15454`	`180.9`	`-1.0`	`0.458`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	`21`		D	`19`	`6`	`6511`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`15572`	`152.5`	`-0.8`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`166.7`	`-0.9`	`0.415`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
9	`22`		F	`20`	`6`	`6431`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`15048`	`153.7`	`0.1`	`0.676`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		H	`17`	`5`	`6530`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`15003`	`141.0`	`0.3`	`0.701`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`147.4`	`0.2`	`0.688`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`24`		E	`14`	`4`	`15003`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`6`	`15572`	`148.6`	`0.9`	`0.772`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		G	`12`	`5`	`15048`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`15454`	`123.1`	`0.1`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`135.9`	`0.5`	`0.676`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`26`		[GOL]B:105	`6`	`1`	`221`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`6375`	`128.6`	`-0.4`	`0.576`	`4`	`0`	`0`	`0.044`
12	`27`		[GOL]D:105	`6`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`6511`	`124.1`	`-0.2`	`0.621`	`6`	`0`	`0`	`0.055`
13	`28`		[GOL]E:301	`6`	`1`	`219`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`15003`	`113.7`	`-0.7`	`0.550`	`2`	`0`	`0`	`0.100`
14	`29`		[GOL]F:104	`6`	`1`	`221`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`6431`	`109.1`	`-0.0`	`0.624`	`4`	`0`	`0`	`0.028`
15	`30`		[GOL]G:302	`6`	`1`	`219`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`19`	`4`	`15048`	`108.9`	`-1.3`	`0.395`	`1`	`0`	`0`	`0.054`
16	`31`		[GOL]A:302	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`4`	`15572`	`108.1`	`-0.9`	`0.434`	`1`	`0`	`0`	`0.061`
17	`32`		[GOL]D:104	`6`	`1`	`220`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`6511`	`105.9`	`-0.2`	`0.571`	`2`	`0`	`0`	`0.020`
18	`33`		[GOL]B:104	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`6375`	`104.5`	`0.5`	`0.704`	`3`	`0`	`0`	`0.018`
19	`34`		[GOL]D:103	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`15454`	`104.2`	`-1.2`	`0.383`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
20	`35`		[GOL]H:106	`6`	`1`	`221`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`6530`	`103.3`	`-1.0`	`0.440`	`3`	`0`	`0`	`0.029`
21	`36`		[GOL]D:106	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`6511`	`103.0`	`-0.5`	`0.526`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
22	`37`		[GOL]B:103	`6`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`6375`	`102.8`	`0.6`	`0.724`	`5`	`0`	`0`	`0.032`
23	`38`		[GOL]C:301	`5`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`15454`	`100.4`	`-0.7`	`0.477`	`2`	`0`	`0`	`0.072`
24	`39`		[SO4]F:101	`5`	`1`	`186`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`6431`	`96.1`	`-13.4`	`0.869`	`2`	`0`	`0`	`0.222`
25	`40`		[SO4]H:101	`5`	`1`	`184`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`6530`	`95.8`	`-13.4`	`0.859`	`3`	`0`	`0`	`0.181`
26	`41`		[SO4]B:102	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`6375`	`92.2`	`-12.1`	`0.879`	`5`	`0`	`0`	`0.287`
27	`42`		G	`9`	`4`	`15048`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`15003`	`90.9`	`1.1`	`0.628`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`43`		[SO4]G:301	`5`	`1`	`184`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`15048`	`90.6`	`-12.6`	`0.649`	`1`	`0`	`0`	`0.401`
29	`44`		[SO4]D:101	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`6511`	`90.3`	`-11.9`	`0.869`	`4`	`0`	`0`	`0.261`
30	`45`		H	`6`	`1`	`6530`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`9`	`4`	`15572`	`84.8`	`-1.4`	`0.259`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
	`46`		C	`8`	`4`	`15454`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`5`	`1`	`6431`	`84.4`	`-1.4`	`0.218`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
	`47`		G	`11`	`4`	`15048`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`5`	`1`	`6375`	`81.2`	`-1.1`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
	`48`		D	`6`	`1`	`6511`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`11`	`4`	`15003`	`79.5`	`-1.2`	`0.380`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`82.5`	`-1.3`	`0.298`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
31	`49`		[GOL]H:105	`6`	`1`	`214`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`6530`	`79.7`	`0.3`	`0.681`	`3`	`0`	`0`	`0.013`
32	`50`		[SO4]B:101	`5`	`1`	`187`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`6375`	`76.8`	`-11.0`	`0.779`	`0`	`0`	`0`	`0.220`
33	`51`		[GOL]B:103	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15572`	`74.3`	`-1.1`	`0.385`	`2`	`0`	`0`	`0.089`
34	`52`		[SO4]H:103	`4`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`6530`	`73.0`	`-8.3`	`0.935`	`3`	`0`	`0`	`0.118`
35	`53`		[SO4]D:102	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`6511`	`72.4`	`-10.3`	`0.786`	`2`	`0`	`0`	`0.214`
36	`54`		[GOL]D:104	`5`	`1`	`220`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15454`	`71.7`	`-0.7`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
37	`55`		[GOL]A:302	`6`	`1`	`221`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`6375`	`70.8`	`0.3`	`0.671`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
38	`56`		[GOL]G:302	`4`	`1`	`219`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`6530`	`70.2`	`0.2`	`0.616`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
39	`57`		[GOL]F:104	`5`	`1`	`221`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15003`	`68.9`	`-0.3`	`0.582`	`2`	`0`	`0`	`0.018`
40	`58`		[SO4]F:103	`5`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`6431`	`68.3`	`-8.6`	`0.875`	`2`	`0`	`0`	`0.147`
41	`59`		[SO4]H:102	`4`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`6530`	`64.8`	`-8.9`	`0.785`	`1`	`0`	`0`	`0.115`
42	`60`		F	`6`	`4`	`6431`	`f`	[SO4]A:301	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`185`	`63.3`	`-7.3`	`0.956`	`4`	`0`	`0`	`0.140`
43	`61`		[SO4]F:102	`4`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`6431`	`62.2`	`-8.4`	`0.801`	`1`	`0`	`0`	`0.137`
44	`62`		[SO4]H:104	`5`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`6530`	`60.8`	`-7.0`	`0.942`	`4`	`0`	`0`	`0.108`
45	`63`		[GOL]D:103	`4`	`1`	`220`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`6511`	`58.4`	`0.4`	`0.688`	`3`	`0`	`0`	`0.018`
46	`64`		[GOL]E:301	`5`	`1`	`219`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`6431`	`52.3`	`0.1`	`0.676`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
47	`65`		[GOL]D:105	`4`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15454`	`51.5`	`0.2`	`0.659`	`2`	`0`	`0`	`0.014`
48	`66`		[SO4]H:104	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`15454`	`50.8`	`-5.5`	`0.931`	`2`	`0`	`0`	`0.036`
49	`67`		G	`8`	`4`	`15048`	`◊`	E	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`8`	`4`	`15003`	`48.9`	`-0.7`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
50	`68`		[GOL]G:303	`4`	`1`	`216`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`15048`	`48.2`	`0.7`	`0.575`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`69`		[GOL]G:303	`4`	`1`	`216`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`6530`	`45.6`	`-0.4`	`0.500`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
52	`70`		[SO4]A:301	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15572`	`44.7`	`-4.7`	`0.935`	`1`	`0`	`0`	`0.014`
53	`71`		[GOL]H:106	`3`	`1`	`221`	`f`	[GOL]G:303	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`216`	`41.6`	`-0.1`	`0.492`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
54	`72`		E	`5`	`2`	`15003`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`6375`	`41.5`	`-0.3`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		G	`4`	`1`	`15048`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`6511`	`37.2`	`0.6`	`0.782`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`39.4`	`0.1`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`74`		[GOL]B:105	`2`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15572`	`38.5`	`0.4`	`0.674`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
56	`75`		[SO4]G:301	`2`	`1`	`184`	`◊`	E	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`1`	`1`	`15003`	`22.0`	`-3.1`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
57	`76`		[GOL]D:106	`2`	`1`	`221`	`◊`	[GOL]D:103	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`220`	`21.3`	`0.4`	`0.691`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`77`		[GOL]H:106	`2`	`1`	`221`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`15454`	`21.0`	`-0.7`	`0.149`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
59	`78`		[GOL]B:104	`2`	`1`	`218`	`◊`	[GOL]A:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`221`	`20.8`	`0.2`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`79`		[GOL]D:106	`2`	`1`	`221`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`15454`	`20.3`	`0.1`	`0.697`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`80`		[SO4]H:103	`1`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15048`	`16.0`	`-1.9`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
62	`81`		[SO4]F:103	`3`	`1`	`184`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15003`	`14.9`	`-1.6`	`0.884`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
63	`82`		[GOL]G:303	`2`	`1`	`216`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`15454`	`13.6`	`-0.1`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`83`		G	`1`	`1`	`15048`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15572`	`11.7`	`-0.4`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		E	`2`	`2`	`15003`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`15454`	`3.9`	`-0.0`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`7.8`	`-0.2`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`85`		[GOL]B:104	`1`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15572`	`6.6`	`0.2`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe