PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=816-B1-026)

Interfaces in PDB 5jjk crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 3.15 Å

PROTEIN/NUCLEIC ACID COMPLEX 2

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`172`	`45`	`19322`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`161`	`43`	`19086`	`1583.2`	`4.5`	`0.835`	`24`	`23`	`0`	`0.000`
	`2`		D	`175`	`45`	`18594`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`160`	`44`	`19322`	`1562.9`	`3.6`	`0.774`	`22`	`23`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`179`	`47`	`19086`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`153`	`44`	`18880`	`1557.3`	`4.4`	`0.844`	`22`	`20`	`0`	`0.000`
	`4`		E	`164`	`43`	`16725`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`163`	`43`	`18594`	`1528.6`	`4.6`	`0.862`	`23`	`19`	`0`	`0.000`
	`5`		F	`129`	`34`	`18519`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`141`	`37`	`18880`	`1279.6`	`7.0`	`0.854`	`18`	`17`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1502.3`	`4.8`	`0.834`	`22`	`20`	`0`	`0.000`
2	`6`		F	`120`	`31`	`18519`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`113`	`32`	`16725`	`1046.5`	`1.9`	`0.784`	`15`	`10`	`0`	`0.000`
3	`7`		[ADP]C:1000	`27`	`1`	`553`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`19322`	`316.4`	`-7.9`	`0.226`	`13`	`0`	`0`	`0.055`
	`8`		[ADP]D:1000	`27`	`1`	`553`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`42`	`14`	`18594`	`313.9`	`-7.9`	`0.236`	`11`	`0`	`0`	`0.055`
	`9`		[ADP]A:1000	`26`	`1`	`554`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`13`	`18880`	`310.8`	`-8.0`	`0.208`	`12`	`0`	`0`	`0.055`
	`10`		[ADP]B:1000	`26`	`1`	`553`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`43`	`13`	`19086`	`310.8`	`-7.7`	`0.230`	`12`	`0`	`0`	`0.055`
	`11`		[ADP]E:1000	`26`	`1`	`553`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`16725`	`305.7`	`-7.8`	`0.239`	`11`	`0`	`0`	`0.055`
	`12`		[ADP]F:1000	`27`	`1`	`554`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`40`	`12`	`18519`	`300.7`	`-6.7`	`0.317`	`12`	`0`	`0`	`0.055`
	*Average:*													`309.7`	`-7.7`	`0.243`	`12`	`0`	`0`	`0.055`
4	`13`		D	`34`	`15`	`18594`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`30`	`11`	`18519`	`273.3`	`5.7`	`0.923`	`5`	`5`	`0`	`0.000`
5	`14`		B	`24`	`7`	`19086`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`41`	`14`	`16725`	`271.5`	`1.5`	`0.761`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
6	`15`		E	`22`	`7`	`16725`	`x`	E	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`7`	`16725`	`248.3`	`-4.1`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`16`		B	`23`	`6`	`19086`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`23`	`8`	`19086`	`230.3`	`-1.8`	`0.170`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		C	`20`	`5`	`19322`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`6`	`19322`	`214.9`	`-1.8`	`0.112`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`18`		D	`20`	`5`	`18594`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`8`	`18594`	`209.4`	`-3.3`	`0.074`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		F	`21`	`6`	`18519`	`x`	F	x-1,y,z	`1_455`	`28`	`10`	`18519`	`203.3`	`-1.3`	`0.439`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`20`		A	`19`	`5`	`18880`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`7`	`18880`	`193.0`	`-0.7`	`0.422`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`210.2`	`-1.8`	`0.243`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
8	`21`		D	`27`	`10`	`18594`	`◊`	F	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`23`	`8`	`18519`	`221.7`	`0.8`	`0.670`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`22`		G	`23`	`7`	`1652`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`19322`	`215.8`	`-2.9`	`0.547`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`23`		G	`23`	`7`	`1652`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`19086`	`213.3`	`-2.5`	`0.577`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
11	`24`		G	`22`	`5`	`1652`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`16725`	`196.4`	`-3.4`	`0.471`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`25`		G	`19`	`4`	`1652`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`18594`	`176.1`	`-3.2`	`0.435`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
13	`26`		B	`17`	`6`	`19086`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`14`	`6`	`18594`	`158.9`	`1.8`	`0.808`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
14	`27`		G	`18`	`5`	`1652`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`18880`	`140.2`	`-2.9`	`0.433`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`28`		[ADP]F:1000	`13`	`1`	`554`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`18880`	`134.9`	`-1.6`	`0.608`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`29`		C	`11`	`4`	`19322`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`15`	`5`	`18880`	`122.8`	`2.6`	`0.880`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
17	`30`		[ADP]A:1000	`11`	`1`	`554`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`19086`	`106.3`	`-1.3`	`0.641`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[ADP]B:1000	`11`	`1`	`553`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`19322`	`104.2`	`-1.3`	`0.632`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[ADP]C:1000	`11`	`1`	`553`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18594`	`95.7`	`-1.1`	`0.658`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[ADP]D:1000	`11`	`1`	`553`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`16725`	`95.1`	`-0.9`	`0.675`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`100.3`	`-1.2`	`0.652`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`34`		B	`12`	`4`	`19086`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`11`	`3`	`18519`	`104.8`	`-0.5`	`0.451`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`35`		[BEF]E:1002	`4`	`1`	`182`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`16725`	`95.3`	`1.4`	`0.597`	`5`	`0`	`0`	`0.003`
	`36`		[BEF]F:1002	`4`	`1`	`181`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`18519`	`90.8`	`2.1`	`0.652`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
	`37`		[BEF]D:1002	`4`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`18594`	`88.4`	`2.6`	`0.702`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
	`38`		[BEF]B:1002	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`19086`	`87.1`	`2.3`	`0.684`	`5`	`0`	`0`	`0.003`
	`39`		[BEF]C:1002	`4`	`1`	`181`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`19322`	`83.0`	`2.2`	`0.660`	`3`	`0`	`0`	`0.003`
	`40`		[BEF]A:1002	`4`	`1`	`182`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`18880`	`80.6`	`2.0`	`0.650`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`87.5`	`2.1`	`0.658`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
20	`41`		[ADP]E:1000	`8`	`1`	`553`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18519`	`72.3`	`-0.3`	`0.677`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`42`		C	`7`	`1`	`19322`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`6`	`1`	`18519`	`55.3`	`-0.1`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`43`		B	`7`	`3`	`19086`	`◊`	E	x-1,y,z-1	`1_454`	`7`	`3`	`16725`	`53.7`	`0.6`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`44`		G	`9`	`2`	`1652`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`18519`	`53.6`	`-0.7`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`45`		A	`5`	`2`	`18880`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`2`	`16725`	`45.0`	`-0.1`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`46`		[BEF]E:1002	`4`	`1`	`182`	`f`	[ADP]E:1000	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`553`	`43.2`	`-2.0`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`47`		[BEF]F:1002	`4`	`1`	`181`	`f`	[ADP]F:1000	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`554`	`41.1`	`-1.9`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`48`		[BEF]D:1002	`4`	`1`	`183`	`f`	[ADP]D:1000	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`553`	`40.9`	`-2.0`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`49`		[BEF]A:1002	`4`	`1`	`182`	`f`	[ADP]A:1000	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`554`	`40.6`	`-2.0`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`50`		[BEF]C:1002	`4`	`1`	`181`	`f`	[ADP]C:1000	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`553`	`40.4`	`-2.0`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`51`		[BEF]B:1002	`4`	`1`	`182`	`f`	[ADP]B:1000	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`553`	`40.2`	`-2.0`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`41.1`	`-2.0`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
26	`52`		[MG]F:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18519`	`37.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`53`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`16725`	`36.0`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`54`		[MG]A:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18880`	`35.1`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`55`		[MG]B:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`19086`	`35.0`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`56`		[MG]D:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`18594`	`35.0`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`57`		[MG]C:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`19322`	`34.6`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	*Average:*													`35.6`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
27	`58`		[BEF]B:1002	`4`	`1`	`182`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`19322`	`37.6`	`1.1`	`0.554`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[BEF]C:1002	`4`	`1`	`181`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`18594`	`37.1`	`1.1`	`0.573`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[BEF]A:1002	`4`	`1`	`182`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`19086`	`36.8`	`1.0`	`0.546`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[BEF]D:1002	`4`	`1`	`183`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`16725`	`35.6`	`0.9`	`0.541`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.8`	`1.0`	`0.553`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`62`		[BEF]E:1002	`3`	`1`	`182`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`18519`	`31.8`	`1.5`	`0.122`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`63`		[BEF]F:1002	`3`	`1`	`181`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`18880`	`31.8`	`1.2`	`0.118`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`64`		B	`5`	`3`	`19086`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`2`	`18594`	`28.8`	`0.0`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`65`		[MG]D:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]D:1000	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`553`	`26.1`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
	`66`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]E:1000	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`553`	`26.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
	`67`		[MG]C:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]C:1000	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`553`	`25.7`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
	`68`		[MG]A:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]A:1000	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`554`	`25.7`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
	`69`		[MG]B:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]B:1000	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`553`	`25.4`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
	`70`		[MG]F:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]F:1000	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`554`	`25.4`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
	*Average:*													`25.7`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
32	`71`		[BEF]E:1002	`2`	`1`	`182`	`f`	[MG]E:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.7`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`72`		[BEF]F:1002	`2`	`1`	`181`	`f`	[MG]F:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.6`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`73`		[BEF]A:1002	`2`	`1`	`182`	`f`	[MG]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.8`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`74`		[BEF]B:1002	`2`	`1`	`182`	`f`	[MG]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.5`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`75`		[BEF]D:1002	`2`	`1`	`183`	`f`	[MG]D:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.4`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`76`		[BEF]C:1002	`2`	`1`	`181`	`f`	[MG]C:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`19.9`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
33	`77`		[MG]C:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`18594`	`6.5`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`78`		[MG]B:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`19322`	`6.5`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`18519`	`5.9`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		[MG]A:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`19086`	`4.8`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`81`		[MG]F:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`18880`	`4.3`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		[MG]D:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`16725`	`3.7`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`5.0`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe