PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=676-HP-55J)

Interfaces in PDB 5hdb crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.70 Å

INTEGRIN ALPHAIIBBETA3 IN COMPLEX WITH RO-435054

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`207`	`59`	`11796`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`208`	`56`	`11866`	`1977.5`	`-32.6`	`0.019`	`3`	`0`	`1`	`1.000`
	`2`		L	`201`	`58`	`11570`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`207`	`56`	`11890`	`1944.2`	`-32.4`	`0.019`	`5`	`0`	`1`	`1.000`
	*Average:*													`1960.8`	`-32.5`	`0.019`	`4`	`0`	`1`	`1.000`
2	`3`		D	`162`	`53`	`22652`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`193`	`51`	`19057`	`1757.0`	`-16.2`	`0.095`	`8`	`3`	`0`	`0.396`
	`4`		B	`157`	`50`	`22458`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`190`	`51`	`18982`	`1718.0`	`-16.0`	`0.104`	`10`	`4`	`0`	`0.396`
	*Average:*													`1737.5`	`-16.1`	`0.100`	`9`	`4`	`0`	`0.396`
3	`5`		A	`97`	`28`	`18982`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`102`	`30`	`19057`	`956.7`	`-6.6`	`0.293`	`3`	`0`	`0`	`0.043`
4	`6`		A	`85`	`30`	`18982`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`77`	`25`	`22652`	`693.5`	`-0.7`	`0.628`	`1`	`1`	`0`	`0.013`
	`7`		B	`62`	`20`	`22458`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`72`	`24`	`19057`	`601.9`	`-0.5`	`0.638`	`1`	`1`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`647.7`	`-0.6`	`0.633`	`1`	`1`	`0`	`0.013`
5	`8`		H	`65`	`15`	`11890`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`62`	`21`	`18982`	`568.0`	`-3.8`	`0.484`	`6`	`4`	`0`	`0.069`
	`9`		E	`64`	`14`	`11866`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`65`	`22`	`19057`	`567.4`	`-3.8`	`0.480`	`6`	`5`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`567.7`	`-3.8`	`0.482`	`6`	`5`	`0`	`0.069`
6	`10`		L	`43`	`12`	`11570`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`11`	`18982`	`351.4`	`-0.0`	`0.692`	`4`	`0`	`0`	`0.018`
	`11`		F	`41`	`12`	`11796`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`37`	`10`	`19057`	`342.4`	`-0.1`	`0.676`	`5`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`346.9`	`-0.1`	`0.684`	`5`	`0`	`0`	`0.018`
7	`12`		A	`30`	`10`	`18982`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`33`	`10`	`22458`	`316.8`	`1.8`	`0.798`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`13`		D	`27`	`10`	`22652`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`18982`	`229.4`	`-0.2`	`0.580`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		[5YB]D:501	`18`	`1`	`720`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`35`	`11`	`19057`	`228.9`	`-2.0`	`0.485`	`1`	`0`	`0`	`0.043`
	`15`		[5YB]B:2011	`16`	`1`	`721`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`35`	`11`	`18982`	`224.3`	`-1.4`	`0.542`	`2`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`226.6`	`-1.7`	`0.513`	`2`	`0`	`0`	`0.043`
10	`16`		L	`28`	`10`	`11570`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`26`	`8`	`19057`	`226.5`	`-0.4`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
11	`17`		[5YB]D:501	`20`	`1`	`720`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`22652`	`199.4`	`-3.4`	`0.431`	`3`	`0`	`0`	`0.091`
	`18`		[5YB]B:2011	`20`	`1`	`721`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`22458`	`197.6`	`-3.5`	`0.390`	`3`	`0`	`0`	`0.091`
	*Average:*													`198.5`	`-3.4`	`0.411`	`3`	`0`	`0`	`0.091`
12	`19`		E	`21`	`7`	`11866`	`◊`	E	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`21`	`7`	`11866`	`171.8`	`-2.2`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		D	`11`	`4`	`22652`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`20`	`6`	`11796`	`156.4`	`2.2`	`0.847`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`21`		[NAG]B:2009	`12`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`22458`	`150.9`	`4.7`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[NAG]D:510	`12`	`1`	`361`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`22652`	`150.0`	`4.7`	`0.486`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`150.4`	`4.7`	`0.469`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		L	`18`	`6`	`11570`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`15`	`5`	`22652`	`134.6`	`-1.2`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`24`		B	`17`	`4`	`22458`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`16`	`6`	`11796`	`126.7`	`-0.5`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`130.7`	`-0.8`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
16	`25`		D	`18`	`6`	`22652`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`22458`	`124.8`	`-1.2`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[NAG]B:2003	`7`	`1`	`356`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`22458`	`112.5`	`4.3`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[SO4]A:501	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18982`	`105.1`	`-16.3`	`0.664`	`1`	`0`	`0`	`0.315`
19	`28`		[NAG]D:505	`7`	`1`	`363`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`22652`	`104.4`	`3.6`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[SO4]C:501	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`19057`	`102.6`	`-14.1`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
21	`30`		[SO4]A:503	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`18982`	`102.1`	`-14.2`	`0.835`	`1`	`0`	`0`	`0.276`
22	`31`		[NAG]B:2004	`10`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`22458`	`101.7`	`2.7`	`0.368`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		[NAG]D:506	`9`	`1`	`360`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`22652`	`98.5`	`2.8`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		H	`11`	`6`	`11890`	`◊`	D	-x,-y+1,z	`2_565`	`11`	`3`	`22652`	`96.5`	`1.7`	`0.876`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`34`		[GOL]A:504	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18982`	`96.1`	`0.7`	`0.704`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`35`		A	`13`	`4`	`18982`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`16`	`5`	`11796`	`92.4`	`0.2`	`0.654`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`36`		[SO4]C:502	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`19057`	`86.1`	`-10.7`	`0.901`	`1`	`0`	`0`	`0.166`
28	`37`		[SO4]A:502	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`18982`	`78.5`	`-10.9`	`0.773`	`1`	`0`	`0`	`0.214`
29	`38`		[SO4]L:301	`5`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11570`	`74.6`	`-10.9`	`0.564`	`1`	`0`	`0`	`0.227`
30	`39`		[NAG]B:2010	`8`	`1`	`356`	`cf`	[NAG]B:2009	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`363`	`71.2`	`1.6`	`0.068`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`40`		[NAG]D:507	`8`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]D:506	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`360`	`71.0`	`1.6`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`41`		[NAG]B:2005	`9`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]B:2004	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`70.6`	`1.6`	`0.095`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`42`		[NAG]D:511	`9`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]D:510	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`68.9`	`1.2`	`0.060`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`43`		H	`11`	`7`	`11890`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`22652`	`68.6`	`0.9`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`44`		[NAG]B:2004	`6`	`1`	`362`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18982`	`68.5`	`0.5`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`45`		[NAG]D:506	`5`	`1`	`360`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`19057`	`66.9`	`0.5`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`46`		[BMA]B:2006	`6`	`1`	`295`	`cf`	[NAG]B:2005	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`63.8`	`1.4`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`47`		[BMA]D:508	`7`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]D:507	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`62.9`	`1.3`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`48`		[MAN]D:509	`7`	`1`	`294`	`cf`	[BMA]D:508	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`294`	`61.6`	`2.8`	`0.201`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`49`		[MAN]B:2007	`6`	`1`	`294`	`cf`	[BMA]B:2006	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`295`	`61.3`	`2.7`	`0.214`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`50`		[CL]C:504	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`19057`	`56.2`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
42	`51`		[CL]C:503	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`19057`	`51.9`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
43	`52`		[MAN]B:2008	`4`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]B:2006	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`295`	`50.4`	`2.5`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`53`		[MAN]B:2008	`6`	`1`	`290`	`f`	[NAG]B:2005	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`49.3`	`1.7`	`0.171`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`54`		C	`5`	`3`	`19057`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+2	`3_547`	`7`	`2`	`22458`	`48.9`	`0.5`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`55`		[MAN]D:509	`4`	`1`	`294`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`19057`	`48.5`	`1.0`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[CA]D:503	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`22652`	`47.9`	`-10.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.201`
48	`57`		[MAN]B:2007	`3`	`1`	`294`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`18982`	`41.0`	`1.0`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`58`		[MG]D:502	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`22652`	`40.3`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.137`
	`59`		[MG]B:2001	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`22458`	`40.2`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.137`
	*Average:*													`40.3`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.137`
50	`60`		H	`5`	`4`	`11890`	`◊`	H	-x,-y+1,z	`2_565`	`5`	`4`	`11890`	`38.6`	`1.3`	`0.913`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`61`		[5YB]D:501	`4`	`1`	`720`	`f`	[MG]D:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.0`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
	`62`		[5YB]B:2011	`3`	`1`	`721`	`f`	[MG]B:2001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`28.0`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
	*Average:*													`28.5`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
52	`63`		[SO4]A:502	`3`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`19057`	`27.1`	`-3.2`	`0.766`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
53	`64`		[MAN]D:509	`5`	`1`	`294`	`f`	[NAG]D:507	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`363`	`26.3`	`0.8`	`0.162`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`65`		[SO4]C:501	`4`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`22652`	`25.9`	`-3.3`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
55	`66`		[NAG]B:2005	`2`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`18982`	`25.9`	`1.6`	`0.782`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`67`		[NAG]D:511	`2`	`1`	`358`	`f`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`363`	`25.7`	`1.0`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`68`		[NAG]D:507	`2`	`1`	`363`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`19057`	`23.9`	`1.4`	`0.779`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`69`		D	`5`	`3`	`22652`	`◊`	D	-x,-y+1,z	`2_565`	`5`	`3`	`22652`	`21.7`	`0.0`	`0.604`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`70`		[5YB]B:2011	`2`	`1`	`721`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`22652`	`17.1`	`-0.1`	`0.626`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`71`		[MAN]B:2007	`3`	`1`	`294`	`f`	[NAG]B:2005	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`361`	`16.4`	`0.6`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`72`		[SO4]A:501	`3`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11890`	`13.0`	`-1.7`	`0.743`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
62	`73`		A	`2`	`2`	`18982`	`◊`	[CL]C:503	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`125`	`8.1`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
63	`74`		[NAG]B:2010	`1`	`1`	`356`	`f`	[NAG]B:2003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`356`	`5.9`	`0.3`	`0.202`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`75`		[NAG]D:510	`1`	`1`	`361`	`f`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`363`	`2.6`	`0.1`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`76`		L	`2`	`2`	`11570`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`2`	`2`	`11796`	`2.2`	`-0.1`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe