PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=157-01-OA2)

Interfaces in PDB 5fbb crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.75 Å

S1 NUCLEASE FROM ASPERGILLUS ORYZAE IN COMPLEX WITH PHOSPHATE AND ADENOSINE 5'-MONOPHOSPHATE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`77`	`26`	`10856`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`63`	`20`	`10779`	`644.4`	`-2.3`	`0.516`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`63`	`19`	`10856`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`74`	`25`	`10779`	`631.9`	`-2.7`	`0.504`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`638.2`	`-2.5`	`0.510`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
2	`3`		A	`39`	`13`	`10779`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`38`	`15`	`10856`	`317.9`	`-0.6`	`0.579`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`30`	`11`	`10856`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`29`	`13`	`10856`	`234.7`	`1.8`	`0.851`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		A	`30`	`14`	`10779`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`26`	`9`	`10779`	`230.5`	`1.2`	`0.781`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`232.6`	`1.5`	`0.816`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		[AMP]A:701	`22`	`1`	`474`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`10779`	`230.7`	`-0.3`	`0.501`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
	`7`		[AMP]B:701	`21`	`1`	`472`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`12`	`10856`	`228.1`	`-0.6`	`0.453`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`229.4`	`-0.5`	`0.477`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
5	`8`		A	`27`	`9`	`10779`	`x`	A	x-1,y-1,z	`1_445`	`28`	`9`	`10779`	`212.7`	`-1.4`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		[NAG]A:501	`13`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`10779`	`181.3`	`3.6`	`0.360`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		A	`25`	`8`	`10779`	`◊`	[ETE]A:1101	x-1,y-1,z	`1_445`	`13`	`1`	`437`	`176.5`	`-3.0`	`0.355`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		[NAG]A:502	`13`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`10779`	`161.9`	`3.7`	`0.326`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		[BTB]A:1002	`10`	`1`	`340`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`10779`	`140.8`	`2.5`	`0.094`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		[BTB]B:1002	`11`	`1`	`346`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`10856`	`139.4`	`2.8`	`0.138`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		[ETE]A:1101	`9`	`1`	`437`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`10779`	`129.1`	`-0.3`	`0.614`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		B	`19`	`7`	`10856`	`◊`	[BTB]A:1002	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`1`	`340`	`115.2`	`2.8`	`0.177`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[BTB]B:1002	`9`	`1`	`346`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`10779`	`114.9`	`2.7`	`0.201`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[BTB]A:1001	`7`	`1`	`346`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`10779`	`98.8`	`2.2`	`0.222`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[BTB]B:1001	`7`	`1`	`346`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`3`	`10779`	`98.2`	`2.6`	`0.255`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		B	`10`	`3`	`10856`	`◊`	[BTB]A:1001	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`1`	`346`	`97.3`	`2.2`	`0.218`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[BTB]B:1001	`7`	`1`	`346`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`10856`	`97.0`	`1.7`	`0.122`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		A	`9`	`3`	`10779`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`14`	`7`	`10856`	`91.9`	`0.0`	`0.453`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[PO4]A:601	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`11`	`10779`	`84.1`	`-6.6`	`0.205`	`5`	`0`	`0`	`0.005`
20	`23`		[PO4]B:601	`5`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`12`	`10856`	`83.6`	`-6.6`	`0.250`	`6`	`0`	`0`	`0.006`
21	`24`		[NAG]A:502	`8`	`1`	`361`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`3`	`10779`	`80.2`	`1.2`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[BTB]B:1001	`5`	`1`	`346`	`◊`	[AMP]A:701	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`1`	`474`	`52.2`	`1.6`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[BTB]A:1001	`5`	`1`	`346`	`◊`	[AMP]B:701	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`472`	`50.1`	`1.8`	`0.187`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		B	`8`	`5`	`10856`	`◊`	[AMP]B:701	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`472`	`49.3`	`-0.9`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[AMP]A:701	`5`	`1`	`474`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`10779`	`45.9`	`-1.0`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`47.6`	`-1.0`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`29`		[NA]A:802	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`10779`	`44.0`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
26	`30`		B	`4`	`1`	`10856`	`◊`	A	x-1,y-1,z-1	`1_444`	`5`	`2`	`10779`	`43.8`	`-0.7`	`0.297`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[NA]A:801	`1`	`1`	`125`	`f`	[AMP]A:701	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`474`	`39.1`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`32`		[NA]B:801	`1`	`1`	`125`	`f`	[AMP]B:701	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`472`	`38.5`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`38.8`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
28	`33`		B	`6`	`3`	`10856`	`x`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`6`	`4`	`10856`	`38.9`	`-0.5`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`34`		[ETE]A:1101	`6`	`1`	`437`	`f`	[NA]A:802	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`38.8`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
30	`35`		[NAG]A:502	`3`	`1`	`361`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`5`	`2`	`10856`	`37.5`	`1.5`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`36`		[NA]B:801	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`10856`	`37.3`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`37`		[NA]A:801	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`10779`	`36.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`36.9`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
32	`38`		[ZN]B:403	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`10856`	`35.2`	`-24.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`39`		[ZN]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`10779`	`34.9`	`-24.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`35.1`	`-24.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
33	`40`		[BTB]A:1002	`4`	`1`	`340`	`f`	[CA]A:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`33.0`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`41`		[BTB]B:1002	`4`	`1`	`346`	`f`	[CA]B:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`32.6`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`42`		[BTB]A:1001	`4`	`1`	`346`	`f`	[CA]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`30.0`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`43`		[BTB]B:1001	`4`	`1`	`346`	`f`	[CA]B:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`29.8`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`31.4`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
34	`44`		[ZN]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10779`	`32.7`	`-24.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`45`		[ZN]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`8`	`10856`	`32.3`	`-24.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`32.5`	`-24.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
35	`46`		B	`6`	`3`	`10856`	`◊`	[NA]B:801	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`125`	`30.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[NA]A:801	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`10779`	`28.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`29.5`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`48`		[ZN]B:401	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10856`	`29.9`	`-22.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`49`		[ZN]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`10779`	`29.8`	`-22.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`29.9`	`-22.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
37	`50`		[CA]A:901	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`10779`	`28.0`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`51`		[CA]B:901	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10856`	`27.3`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`27.6`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
38	`52`		A	`7`	`3`	`10779`	`◊`	[NA]A:802	x-1,y-1,z	`1_445`	`1`	`1`	`125`	`27.4`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`53`		[CA]A:903	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10779`	`27.3`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
40	`54`		[CA]A:902	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10779`	`26.7`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`55`		[CA]B:902	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10856`	`24.9`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`25.8`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
41	`56`		[PO4]A:601	`3`	`1`	`189`	`cf`	[ZN]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.2`	`-11.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`57`		[PO4]B:601	`3`	`1`	`189`	`f`	[ZN]B:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.2`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`23.7`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
42	`58`		[PO4]B:601	`3`	`1`	`189`	`f`	[ZN]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.9`	`-11.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
43	`59`		[PO4]A:601	`3`	`1`	`189`	`f`	[ZN]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.7`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`60`		[PO4]B:601	`3`	`1`	`189`	`f`	[ZN]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.6`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`23.6`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
44	`61`		[PO4]A:601	`3`	`1`	`189`	`f`	[ZN]A:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.9`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
45	`62`		B	`3`	`1`	`10856`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`1`	`10779`	`16.1`	`-0.1`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		B	`3`	`1`	`10856`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`10779`	`15.9`	`-0.1`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`16.0`	`-0.1`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`64`		[CA]A:903	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`2`	`10856`	`12.1`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`65`		[ZN]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.5`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
48	`66`		[CA]A:903	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10856`	`11.4`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`67`		[ZN]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.4`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
50	`68`		[BTB]B:1001	`3`	`1`	`346`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`10779`	`11.1`	`-0.3`	`0.043`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`69`		[CA]B:902	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`10779`	`11.0`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		B	`3`	`2`	`10856`	`◊`	[CA]A:902	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`85`	`8.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`9.6`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`71`		[AMP]B:701	`1`	`1`	`472`	`f`	[ZN]B:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.3`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`72`		[AMP]A:701	`1`	`1`	`474`	`f`	[ZN]A:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.2`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`10.2`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
53	`73`		B	`3`	`1`	`10856`	`◊`	[CA]A:901	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`85`	`9.0`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		[CA]B:901	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`1`	`10779`	`8.3`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`8.7`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`75`		B	`3`	`1`	`10856`	`◊`	[AMP]A:701	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`474`	`6.6`	`-0.2`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		[AMP]B:701	`1`	`1`	`472`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10779`	`6.2`	`-0.2`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`6.4`	`-0.2`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`77`		[ZN]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`5.5`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
56	`78`		[ZN]B:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`5.5`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
57	`79`		[AMP]B:701	`1`	`1`	`472`	`f`	[PO4]B:601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`189`	`4.5`	`-0.0`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`80`		[BTB]A:1001	`2`	`1`	`346`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`10856`	`4.4`	`-0.0`	`0.201`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`81`		[AMP]A:701	`1`	`1`	`474`	`f`	[PO4]A:601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`189`	`4.0`	`-0.0`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`82`		A	`1`	`1`	`10779`	`◊`	[ETE]A:1101	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`437`	`0.8`	`-0.0`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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