PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=768-H5-FAA)

Interfaces in PDB 5eek crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 1.59 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF DANIO RERIO HISTONE DEACETYLASE 6 CATALYTIC DOMAIN 2 IN COMPLEX WITH TRICHOSTATIN A

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`35`	`10`	`13491`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`35`	`10`	`13491`	`321.9`	`2.6`	`0.826`	`6`	`8`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`36`	`11`	`13491`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`39`	`13`	`13491`	`298.0`	`-0.3`	`0.551`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`32`	`10`	`13491`	`x`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`31`	`10`	`13491`	`276.3`	`-0.5`	`0.525`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
4	`4`		[TSN]A:2004	`22`	`1`	`548`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`18`	`13491`	`268.7`	`-2.6`	`0.144`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
5	`5`		A	`19`	`4`	`13491`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`19`	`5`	`13491`	`169.8`	`-0.6`	`0.421`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`15`	`6`	`13491`	`◊`	A	-x,-y,z	`2_555`	`15`	`6`	`13491`	`164.1`	`-2.5`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		[K]A:2003	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`13491`	`117.5`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
8	`8`		[EDO]A:2040	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`13491`	`94.0`	`2.8`	`0.476`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		[IOD]A:2025	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`13491`	`93.3`	`-0.5`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		[IOD]A:2016	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`13491`	`89.4`	`-0.7`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[IOD]A:2013	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13491`	`86.0`	`0.1`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		[IOD]A:2005	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`13491`	`84.1`	`-0.2`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		[IOD]A:2037	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`13491`	`76.5`	`-0.1`	`0.678`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		[IOD]A:2035	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`13491`	`76.1`	`-0.6`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[IOD]A:2011	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13491`	`76.0`	`0.2`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		A	`8`	`3`	`13491`	`◊`	[GOL]A:2038	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`5`	`1`	`218`	`75.7`	`1.3`	`0.791`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[IOD]A:2019	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`13491`	`74.7`	`-0.1`	`0.688`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		[IOD]A:2012	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`13491`	`74.4`	`0.0`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[IOD]A:2017	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13491`	`69.5`	`-0.5`	`0.561`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		[IOD]A:2008	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`13491`	`67.8`	`-0.3`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[IOD]A:2014	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`13491`	`61.0`	`-0.0`	`0.721`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`64.4`	`-0.2`	`0.678`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[IOD]A:2022	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`13491`	`67.5`	`0.6`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[IOD]A:2007	`1`	`1`	`144`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`13491`	`65.0`	`-0.1`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[IOD]A:2010	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`13491`	`64.1`	`-0.1`	`0.678`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[IOD]A:2020	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13491`	`63.4`	`-0.2`	`0.664`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		[IOD]A:2021	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`13491`	`61.6`	`-0.4`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		[IOD]A:2027	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13491`	`60.6`	`-0.2`	`0.614`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[NH4]A:2034	`1`	`1`	`117`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`13491`	`59.9`	`0.9`	`0.762`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[IOD]A:2018	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`13491`	`59.0`	`0.0`	`0.746`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		[NH4]A:2031	`1`	`1`	`117`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`13491`	`58.9`	`0.9`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		[GOL]A:2038	`4`	`1`	`218`	`f`	[TSN]A:2004	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`548`	`58.6`	`0.0`	`0.411`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`32`		[IOD]A:2006	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`13491`	`57.9`	`-0.4`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		[IOD]A:2015	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`13491`	`56.4`	`-0.1`	`0.705`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		[CL]A:2029	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13491`	`55.6`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
34	`35`		[IOD]A:2024	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`13491`	`55.1`	`-0.5`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`36`		[IOD]A:2036	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13491`	`55.1`	`-0.1`	`0.674`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		A	`11`	`5`	`13491`	`◊`	[IOD]A:2023	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`144`	`54.1`	`-0.3`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		[EDO]A:2039	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`13491`	`53.4`	`1.6`	`0.805`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		[IOD]A:2026	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`13`	`4`	`13491`	`52.9`	`-0.3`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		[NH4]A:2028	`1`	`1`	`117`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13491`	`52.7`	`1.2`	`0.878`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		[IOD]A:2026	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`13491`	`52.7`	`0.2`	`0.801`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[NH4]A:2032	`1`	`1`	`117`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`13491`	`51.1`	`0.5`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		[NH4]A:2030	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`13491`	`49.4`	`0.4`	`0.709`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[NH4]A:2033	`1`	`1`	`117`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`13491`	`46.5`	`0.3`	`0.671`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		[IOD]A:2023	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`13491`	`46.0`	`-0.5`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		[IOD]A:2009	`1`	`1`	`144`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13491`	`42.5`	`-0.3`	`0.581`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		[NH4]A:2028	`1`	`1`	`117`	`f`	[IOD]A:2022	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`38.8`	`0.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		A	`9`	`2`	`13491`	`◊`	[IOD]A:2015	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`144`	`38.7`	`-0.0`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		[NH4]A:2032	`1`	`1`	`117`	`f`	[IOD]A:2012	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`37.4`	`0.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`50`		A	`6`	`2`	`13491`	`◊`	[TSN]A:2004	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`7`	`1`	`548`	`36.9`	`0.9`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`51`		A	`5`	`2`	`13491`	`◊`	[IOD]A:2009	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`144`	`35.3`	`0.1`	`0.758`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`52`		[ZN]A:2001	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`7`	`13491`	`35.1`	`-25.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
52	`53`		[NH4]A:2034	`1`	`1`	`117`	`f`	[IOD]A:2035	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`34.4`	`0.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`54`		[IOD]A:2018	`1`	`1`	`144`	`f`	[TSN]A:2004	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`548`	`33.2`	`0.5`	`0.756`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`55`		[IOD]A:2024	`1`	`1`	`144`	`f`	[IOD]A:2023	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`33.1`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`56`		[IOD]A:2006	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`5`	`2`	`13491`	`32.7`	`-0.3`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`57`		[IOD]A:2014	`1`	`1`	`144`	`f`	[IOD]A:2008	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`30.3`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`58`		[TSN]A:2004	`4`	`1`	`548`	`f`	[ZN]A:2001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.2`	`-13.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
58	`59`		[IOD]A:2009	`1`	`1`	`144`	`f`	[TSN]A:2004	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`548`	`30.1`	`0.5`	`0.793`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`60`		[NH4]A:2030	`1`	`1`	`117`	`◊`	[IOD]A:2006	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`30.1`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`61`		[NH4]A:2033	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`2`	`13491`	`30.0`	`0.4`	`0.792`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`62`		[IOD]A:2027	`1`	`1`	`144`	`f`	A	-x,-y,z	`2_555`	`6`	`2`	`13491`	`29.9`	`-0.3`	`0.537`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`63`		[NH4]A:2030	`1`	`1`	`117`	`f`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`4`	`1`	`13491`	`29.2`	`0.3`	`0.710`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`64`		[NH4]A:2031	`1`	`1`	`117`	`f`	[IOD]A:2005	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`29.1`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`65`		[EDO]A:2039	`3`	`1`	`183`	`f`	[IOD]A:2018	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`28.0`	`0.8`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`66`		[NH4]A:2033	`1`	`1`	`117`	`f`	[IOD]A:2020	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`27.1`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`67`		[IOD]A:2036	`1`	`1`	`144`	`◊`	[IOD]A:2027	-x,-y,z	`2_555`	`1`	`1`	`144`	`26.3`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`68`		A	`7`	`3`	`13491`	`◊`	[IOD]A:2024	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`144`	`26.2`	`-0.2`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`69`		[IOD]A:2015	`1`	`1`	`144`	`f`	[TSN]A:2004	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`548`	`26.1`	`-0.1`	`0.584`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`70`		[IOD]A:2026	`1`	`1`	`144`	`◊`	[CL]A:2029	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`125`	`25.5`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`71`		A	`6`	`3`	`13491`	`◊`	[CL]A:2029	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`125`	`25.4`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`72`		[IOD]A:2020	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`13491`	`23.8`	`-0.1`	`0.656`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`73`		[IOD]A:2036	`1`	`1`	`144`	`f`	A	-x,-y,z	`2_555`	`2`	`2`	`13491`	`22.8`	`-0.3`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`74`		[IOD]A:2009	`1`	`1`	`144`	`f`	[IOD]A:2008	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`17.5`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`75`		[IOD]A:2011	`1`	`1`	`144`	`◊`	[IOD]A:2024	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`144`	`15.8`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`76`		[EDO]A:2039	`1`	`1`	`183`	`f`	[GOL]A:2038	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`218`	`12.7`	`-0.0`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`77`		[EDO]A:2040	`2`	`1`	`184`	`f`	[IOD]A:2010	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`144`	`12.3`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`78`		[GOL]A:2038	`2`	`1`	`218`	`f`	[IOD]A:2018	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`10.4`	`-0.2`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`79`		[IOD]A:2007	`1`	`1`	`144`	`x`	[IOD]A:2006	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`8.2`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`80`		[IOD]A:2036	`1`	`1`	`144`	`◊`	[IOD]A:2035	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`7.2`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`81`		[IOD]A:2011	`1`	`1`	`144`	`◊`	[IOD]A:2023	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`144`	`6.8`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`82`		A	`1`	`1`	`13491`	`◊`	[IOD]A:2010	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`144`	`6.7`	`0.1`	`0.912`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`83`		[GOL]A:2038	`2`	`1`	`218`	`f`	[IOD]A:2009	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`144`	`6.2`	`-0.1`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`84`		A	`1`	`1`	`13491`	`◊`	[IOD]A:2027	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`144`	`6.2`	`0.1`	`0.892`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`85`		[IOD]A:2011	`1`	`1`	`144`	`◊`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`13491`	`2.9`	`-0.0`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`86`		[EDO]A:2039	`1`	`1`	`183`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`1`	`1`	`13491`	`1.9`	`0.1`	`0.889`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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