PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=442-08-3KA)

Interfaces in PDB 5e30 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.70 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF H5 HEMAGGLUTININ Q226L MUTANT FROM THE INFLUENZA VIRUS A/DUCK/EGYPT/10185SS/2010 (H5N1) WITH LSTC

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`297`	`79`	`12506`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`227`	`54`	`17077`	`2509.0`	`-30.5`	`0.051`	`36`	`6`	`1`	`1.000`
	`2`		F	`283`	`77`	`12399`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`220`	`56`	`17060`	`2426.6`	`-31.1`	`0.034`	`32`	`3`	`1`	`1.000`
	`3`		B	`275`	`76`	`12454`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`217`	`55`	`17057`	`2423.5`	`-31.8`	`0.027`	`33`	`4`	`1`	`1.000`
	*Average:*													`2453.0`	`-31.1`	`0.037`	`34`	`4`	`1`	`1.000`
2	`4`		F	`150`	`36`	`12399`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`153`	`45`	`12454`	`1417.7`	`-9.3`	`0.458`	`13`	`6`	`0`	`1.000`
	`5`		D	`149`	`42`	`12506`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`143`	`34`	`12454`	`1379.7`	`-11.3`	`0.366`	`14`	`8`	`0`	`1.000`
	`6`		F	`139`	`42`	`12399`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`136`	`34`	`12506`	`1340.0`	`-13.0`	`0.254`	`11`	`7`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1379.1`	`-11.2`	`0.359`	`13`	`7`	`0`	`1.000`
3	`7`		E	`50`	`17`	`17060`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`41`	`12`	`17077`	`401.1`	`2.0`	`0.791`	`7`	`0`	`0`	`0.044`
	`8`		C	`48`	`15`	`17077`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`41`	`11`	`17057`	`386.6`	`1.6`	`0.776`	`11`	`0`	`0`	`0.044`
	`9`		E	`41`	`12`	`17060`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`16`	`17057`	`385.4`	`0.5`	`0.697`	`9`	`0`	`0`	`0.044`
	*Average:*													`391.0`	`1.4`	`0.755`	`9`	`0`	`0`	`0.044`
4	`10`		A	`40`	`15`	`17057`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`34`	`13`	`17077`	`327.0`	`-0.1`	`0.625`	`4`	`4`	`0`	`0.136`
5	`11`		B	`32`	`9`	`12454`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`29`	`10`	`17057`	`300.2`	`0.1`	`0.679`	`4`	`0`	`0`	`0.094`
6	`12`		F	`28`	`6`	`12399`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`8`	`17057`	`291.6`	`-0.8`	`0.594`	`5`	`2`	`0`	`0.067`
	`13`		B	`28`	`6`	`12454`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`17077`	`259.4`	`-1.8`	`0.475`	`5`	`2`	`0`	`0.067`
	`14`		D	`28`	`6`	`12506`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`28`	`7`	`17060`	`253.5`	`-2.4`	`0.388`	`4`	`2`	`0`	`0.067`
	*Average:*													`268.2`	`-1.7`	`0.486`	`5`	`2`	`0`	`0.067`
7	`15`		D	`40`	`11`	`12506`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`5`	`17057`	`271.0`	`-4.1`	`0.127`	`2`	`0`	`0`	`0.095`
	`16`		F	`36`	`12`	`12399`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`5`	`17077`	`268.4`	`-5.6`	`0.064`	`3`	`0`	`0`	`0.095`
	`17`		B	`36`	`12`	`12454`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`24`	`5`	`17060`	`255.4`	`-4.0`	`0.147`	`3`	`0`	`0`	`0.095`
	*Average:*													`264.9`	`-4.6`	`0.113`	`3`	`0`	`0`	`0.095`
8	`18`		[SIA]C:1006	`18`	`1`	`436`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`37`	`14`	`17077`	`239.3`	`-2.3`	`0.331`	`7`	`0`	`0`	`0.592`
	`19`		[SIA]E:1005	`18`	`1`	`435`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`17060`	`230.9`	`-3.0`	`0.222`	`6`	`0`	`0`	`0.592`
	`20`		[SIA]A:2004	`19`	`1`	`435`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`13`	`17057`	`227.8`	`-3.2`	`0.207`	`5`	`0`	`0`	`0.592`
	*Average:*													`232.7`	`-2.8`	`0.253`	`6`	`0`	`0`	`0.592`
9	`21`		E	`23`	`8`	`17060`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`32`	`9`	`17077`	`238.6`	`0.6`	`0.693`	`4`	`2`	`0`	`0.031`
	`22`		A	`21`	`6`	`17057`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`29`	`7`	`17060`	`227.3`	`0.3`	`0.654`	`4`	`1`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`232.9`	`0.5`	`0.674`	`4`	`2`	`0`	`0.031`
10	`23`		[NAG]A:2001	`11`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17057`	`133.7`	`3.8`	`0.455`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		[NAG]C:1002	`11`	`1`	`363`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17077`	`126.8`	`3.9`	`0.444`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]E:1002	`11`	`1`	`363`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17060`	`126.6`	`3.7`	`0.457`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`129.0`	`3.8`	`0.452`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`26`		[NAG]E:1001	`8`	`1`	`359`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`17060`	`93.3`	`2.8`	`0.439`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`27`		[NAG]C:1001	`9`	`1`	`360`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`17077`	`84.0`	`2.2`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`28`		F	`14`	`3`	`12399`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`10`	`3`	`17077`	`78.6`	`-1.3`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
14	`29`		[GAL]C:1007	`7`	`1`	`294`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`17077`	`77.2`	`1.7`	`0.298`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[GAL]A:2005	`6`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`17057`	`74.1`	`1.5`	`0.310`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`75.7`	`1.6`	`0.304`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`31`		[SIA]C:1006	`9`	`1`	`436`	`f`	[NAG]C:1008	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`72.6`	`2.7`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[SIA]E:1005	`9`	`1`	`435`	`f`	[NAG]E:1007	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`70.6`	`2.4`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`71.6`	`2.6`	`0.378`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`33`		[FUL]A:2002	`7`	`1`	`283`	`cf`	[NAG]A:2001	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`362`	`70.9`	`2.0`	`0.121`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[FUL]E:1003	`8`	`1`	`282`	`cf`	[NAG]E:1002	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`70.8`	`2.1`	`0.120`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.8`	`2.1`	`0.121`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`35`		F	`8`	`5`	`12399`	`◊`	[NAG]C:1008	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`1`	`362`	`69.8`	`1.5`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`36`		[GAL]C:1007	`6`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]C:1008	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`68.7`	`1.5`	`0.130`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`37`		[GAL]E:1006	`6`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]E:1007	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`67.4`	`1.5`	`0.128`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`38`		F	`9`	`4`	`12399`	`◊`	[GAL]C:1009	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`7`	`1`	`308`	`67.3`	`1.3`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`39`		[GAL]E:1006	`5`	`1`	`293`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`17060`	`67.2`	`1.5`	`0.351`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`40`		[GAL]A:2005	`6`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:2006	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`66.9`	`1.4`	`0.107`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`41`		[NAG]E:1004	`10`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]E:1002	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`363`	`66.3`	`1.0`	`0.066`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`42`		[NAG]A:2003	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]A:2001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`66.2`	`1.2`	`0.075`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`43`		[GAL]C:1009	`6`	`1`	`308`	`cf`	[NAG]C:1008	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`66.2`	`2.6`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`44`		[FUL]C:1004	`6`	`1`	`283`	`cf`	[NAG]C:1002	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`65.9`	`1.9`	`0.129`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`45`		[GAL]A:2007	`6`	`1`	`307`	`cf`	[NAG]A:2006	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`360`	`64.0`	`2.2`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`46`		[FUL]E:1003	`6`	`1`	`282`	`f`	[NAG]E:1004	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`361`	`63.9`	`2.4`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`47`		[NAG]C:1005	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]C:1002	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`363`	`63.6`	`1.1`	`0.065`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`48`		[GAL]E:1008	`8`	`1`	`307`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`17060`	`63.1`	`2.2`	`0.453`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`49`		[FUL]C:1004	`6`	`1`	`283`	`f`	[NAG]C:1005	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`362`	`63.0`	`2.4`	`0.121`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`50`		[FUL]A:2002	`7`	`1`	`283`	`f`	[NAG]A:2003	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`360`	`62.8`	`2.4`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`51`		[SIA]A:2004	`8`	`1`	`435`	`f`	[NAG]A:2006	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`60.7`	`2.5`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`52`		[GAL]E:1008	`5`	`1`	`307`	`cf`	[NAG]E:1007	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`361`	`60.3`	`2.2`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`53`		[NAG]C:1008	`7`	`1`	`362`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`17077`	`58.9`	`1.9`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]E:1007	`7`	`1`	`361`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`17060`	`49.3`	`1.3`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.1`	`1.6`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`55`		[GAL]A:2005	`4`	`1`	`292`	`cf`	[SIA]A:2004	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`435`	`56.8`	`2.3`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`56`		[GAL]E:1006	`4`	`1`	`293`	`cf`	[SIA]E:1005	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`435`	`56.1`	`2.1`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[GAL]C:1007	`4`	`1`	`294`	`cf`	[SIA]C:1006	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`436`	`55.5`	`2.2`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.8`	`2.1`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`58`		[GAL]A:2007	`6`	`1`	`307`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`17057`	`54.6`	`1.4`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`59`		[FUC]C:1003	`7`	`1`	`283`	`cf`	[NAG]C:1002	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`363`	`52.7`	`2.3`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`60`		[GAL]C:1009	`7`	`1`	`308`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`17077`	`48.1`	`0.6`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`61`		[FUL]A:2002	`5`	`1`	`283`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17057`	`45.7`	`1.2`	`0.346`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[FUL]E:1003	`5`	`1`	`282`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17060`	`37.4`	`0.8`	`0.330`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`41.6`	`1.0`	`0.338`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`63`		[NAG]C:1005	`5`	`1`	`362`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17077`	`44.4`	`1.5`	`0.448`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`64`		[FUC]C:1003	`4`	`1`	`283`	`f`	[NAG]C:1005	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`42.6`	`2.2`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`65`		[FUL]C:1004	`4`	`1`	`283`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`17057`	`42.6`	`0.2`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`66`		[FUL]A:2002	`4`	`1`	`283`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`17060`	`41.9`	`0.5`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`67`		[GAL]E:1008	`6`	`1`	`307`	`◊`	[FUC]C:1003	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`283`	`41.8`	`0.3`	`0.065`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`68`		[NAG]A:2003	`6`	`1`	`360`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`17057`	`38.9`	`1.4`	`0.417`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		[NAG]E:1004	`5`	`1`	`361`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`17060`	`38.8`	`1.3`	`0.435`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`38.9`	`1.4`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`70`		[NAG]A:2006	`5`	`1`	`360`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`17057`	`38.5`	`1.3`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`71`		[NAG]C:1002	`2`	`1`	`363`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`17057`	`36.4`	`1.2`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		[NAG]A:2001	`1`	`1`	`362`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17060`	`35.9`	`1.3`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.1`	`1.3`	`0.645`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`73`		[FUL]C:1004	`3`	`1`	`283`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17077`	`35.6`	`0.7`	`0.503`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`74`		[NAG]E:1002	`1`	`1`	`363`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`17077`	`34.1`	`1.1`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`75`		[GAL]E:1008	`2`	`1`	`307`	`◊`	[NAG]C:1005	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`362`	`27.5`	`-0.1`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
53	`76`		[FUL]E:1003	`2`	`1`	`282`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17077`	`24.8`	`0.1`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`77`		[FUC]C:1003	`4`	`1`	`283`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`17077`	`17.6`	`0.3`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`78`		[NAG]A:2006	`3`	`1`	`360`	`◊`	[NAG]E:1004	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`361`	`14.3`	`0.6`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`79`		[NAG]E:1007	`1`	`1`	`361`	`◊`	[NAG]C:1005	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`362`	`12.8`	`0.6`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`80`		[GAL]A:2007	`1`	`1`	`307`	`◊`	[NAG]E:1004	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`361`	`12.4`	`0.0`	`0.140`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`81`		B	`5`	`3`	`12454`	`◊`	[GAL]A:2007	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`307`	`11.2`	`0.1`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`82`		E	`1`	`1`	`17060`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`1`	`17077`	`7.0`	`0.0`	`0.580`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`83`		[NAG]A:2001	`2`	`1`	`362`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`17077`	`5.6`	`0.2`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`84`		[NAG]A:2003	`1`	`1`	`360`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`17077`	`5.0`	`0.1`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`85`		[SIA]A:2004	`1`	`1`	`435`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`17060`	`4.8`	`-0.0`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		[SIA]E:1005	`1`	`1`	`435`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`17077`	`4.8`	`-0.1`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.8`	`-0.0`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
63	`87`		F	`2`	`2`	`12399`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`2`	`2`	`17060`	`2.3`	`-0.0`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`88`		[GAL]C:1009	`1`	`1`	`308`	`f`	[SIA]C:1006	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`436`	`2.2`	`0.1`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`89`		F	`1`	`1`	`12399`	`◊`	[GAL]C:1007	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`294`	`1.6`	`0.0`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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