PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=713-9I-M41)

Interfaces in PDB 5dnm crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.81 Å

NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING ADDUCTS OF RUTHENIUM(II)-TOLUENE PTA COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`686`	`145`	`32026`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`678`	`145`	`32002`	`6395.9`	`-68.6`	`0.978`	`361`	`0`	`0`	`1.000`
2	`2`		F	`235`	`55`	`7684`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`264`	`59`	`8617`	`2513.1`	`-42.7`	`0.042`	`23`	`4`	`0`	`1.000`
	`3`		B	`233`	`52`	`6931`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`248`	`60`	`8594`	`2433.2`	`-38.2`	`0.068`	`19`	`4`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`2473.1`	`-40.5`	`0.055`	`21`	`4`	`0`	`1.000`
3	`4`		H	`254`	`63`	`8271`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`248`	`58`	`8886`	`2472.4`	`-46.0`	`0.025`	`20`	`6`	`0`	`0.724`
	`5`		D	`257`	`63`	`8168`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`244`	`60`	`8858`	`2468.0`	`-45.7`	`0.025`	`21`	`8`	`0`	`0.724`
	*Average:*													`2470.2`	`-45.8`	`0.025`	`21`	`7`	`0`	`0.724`
4	`6`		J	`101`	`19`	`32026`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`79`	`22`	`8594`	`790.9`	`-4.3`	`0.819`	`14`	`0`	`0`	`0.772`
	`7`		I	`102`	`19`	`32002`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`77`	`22`	`8617`	`761.0`	`-7.1`	`0.759`	`14`	`0`	`0`	`0.772`
	*Average:*													`776.0`	`-5.7`	`0.789`	`14`	`0`	`0`	`0.772`
5	`8`		I	`91`	`17`	`32002`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`76`	`24`	`8594`	`721.1`	`-10.8`	`0.599`	`14`	`0`	`0`	`0.996`
	`9`		J	`83`	`17`	`32026`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`73`	`20`	`8617`	`685.4`	`-13.1`	`0.499`	`14`	`0`	`0`	`0.996`
	*Average:*													`703.3`	`-11.9`	`0.549`	`14`	`0`	`0`	`0.996`
6	`10`		G	`60`	`16`	`8886`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`64`	`21`	`8594`	`663.2`	`-7.7`	`0.302`	`8`	`0`	`0`	`0.106`
	`11`		C	`62`	`17`	`8858`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`59`	`20`	`8617`	`647.4`	`-7.8`	`0.311`	`7`	`0`	`0`	`0.106`
	*Average:*													`655.3`	`-7.8`	`0.307`	`8`	`0`	`0`	`0.106`
7	`12`		E	`58`	`15`	`8617`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`14`	`8594`	`608.2`	`-9.8`	`0.234`	`2`	`4`	`0`	`0.074`
8	`13`		D	`54`	`13`	`8168`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`11`	`6931`	`494.5`	`-1.5`	`0.707`	`6`	`4`	`0`	`0.130`
	`14`		H	`48`	`12`	`8271`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`52`	`11`	`7684`	`470.6`	`-1.8`	`0.657`	`6`	`2`	`0`	`0.130`
	*Average:*													`482.6`	`-1.6`	`0.682`	`6`	`3`	`0`	`0.130`
9	`15`		I	`61`	`13`	`32002`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`46`	`18`	`8886`	`469.3`	`-4.2`	`0.655`	`14`	`0`	`0`	`0.404`
	`16`		J	`58`	`13`	`32026`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`45`	`16`	`8858`	`444.9`	`-5.6`	`0.616`	`9`	`0`	`0`	`0.404`
	*Average:*													`457.1`	`-4.9`	`0.636`	`12`	`0`	`0`	`0.404`
10	`17`		J	`58`	`13`	`32026`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`8271`	`448.9`	`-10.6`	`0.430`	`11`	`0`	`0`	`0.482`
	`18`		I	`57`	`14`	`32002`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`16`	`8168`	`414.9`	`-7.7`	`0.539`	`8`	`0`	`0`	`0.482`
	*Average:*													`431.9`	`-9.1`	`0.484`	`10`	`0`	`0`	`0.482`
11	`19`		J	`54`	`10`	`32026`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`45`	`17`	`6931`	`411.9`	`-8.3`	`0.466`	`7`	`0`	`0`	`0.446`
	`20`		I	`43`	`9`	`32002`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`42`	`14`	`7684`	`366.0`	`-7.8`	`0.395`	`8`	`0`	`0`	`0.446`
	*Average:*													`389.0`	`-8.1`	`0.431`	`8`	`0`	`0`	`0.446`
12	`21`		J	`52`	`11`	`32026`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`45`	`13`	`8886`	`385.4`	`-4.2`	`0.658`	`8`	`0`	`0`	`0.294`
	`22`		I	`53`	`12`	`32002`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`45`	`12`	`8858`	`376.3`	`-4.8`	`0.628`	`6`	`0`	`0`	`0.294`
	*Average:*													`380.9`	`-4.5`	`0.643`	`7`	`0`	`0`	`0.294`
13	`23`		C	`42`	`15`	`8858`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`48`	`12`	`7684`	`380.4`	`-4.8`	`0.324`	`4`	`0`	`0`	`0.257`
	`24`		G	`42`	`14`	`8886`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`45`	`12`	`6931`	`377.1`	`-4.6`	`0.335`	`5`	`0`	`0`	`0.257`
	*Average:*													`378.7`	`-4.7`	`0.329`	`5`	`0`	`0`	`0.257`
14	`25`		J	`40`	`7`	`32026`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`36`	`11`	`8168`	`329.3`	`-4.9`	`0.578`	`4`	`0`	`0`	`0.182`
	`26`		I	`36`	`6`	`32002`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`34`	`11`	`8271`	`301.3`	`-3.0`	`0.653`	`5`	`0`	`0`	`0.182`
	*Average:*													`315.3`	`-4.0`	`0.615`	`5`	`0`	`0`	`0.182`
15	`27`		J	`45`	`12`	`32026`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`33`	`13`	`7684`	`293.1`	`-1.8`	`0.709`	`3`	`0`	`0`	`0.040`
	`28`		I	`37`	`10`	`32002`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`6931`	`242.5`	`-0.9`	`0.739`	`4`	`0`	`0`	`0.040`
	*Average:*													`267.8`	`-1.3`	`0.724`	`4`	`0`	`0`	`0.040`
16	`29`		F	`31`	`8`	`7684`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`36`	`9`	`8858`	`271.8`	`0.4`	`0.702`	`2`	`4`	`0`	`0.003`
17	`30`		H	`35`	`11`	`8271`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`8`	`6931`	`264.3`	`-0.4`	`0.706`	`5`	`1`	`0`	`0.027`
	`31`		D	`31`	`9`	`8168`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`7`	`7684`	`231.4`	`-1.0`	`0.640`	`3`	`1`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`247.8`	`-0.7`	`0.673`	`4`	`1`	`0`	`0.027`
18	`32`		F	`29`	`7`	`7684`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`29`	`8`	`8168`	`250.4`	`0.3`	`0.701`	`3`	`1`	`0`	`0.004`
19	`33`		G	`21`	`7`	`8886`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`8858`	`164.6`	`1.0`	`0.761`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`34`		[RAX]G:202	`13`	`1`	`420`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`8886`	`140.9`	`0.8`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`35`		J	`17`	`3`	`32026`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`16`	`4`	`8168`	`115.7`	`-0.9`	`0.658`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
22	`36`		J	`13`	`3`	`32026`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`11`	`3`	`8594`	`111.5`	`-0.8`	`0.620`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`37`		[RAX]H:202	`12`	`1`	`418`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`8271`	`107.9`	`-0.2`	`0.175`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
24	`38`		E	`14`	`5`	`8617`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`10`	`3`	`8858`	`94.3`	`0.9`	`0.747`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`39`		[SO4]H:201	`5`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`8271`	`91.3`	`-14.2`	`0.806`	`5`	`0`	`0`	`0.511`
26	`40`		I	`11`	`3`	`32002`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`9`	`4`	`8168`	`90.7`	`-2.8`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
27	`41`		J	`13`	`1`	`32026`	`◊`	I	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`12`	`1`	`32002`	`82.2`	`2.7`	`0.846`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`42`		I	`12`	`3`	`32002`	`◊`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`13`	`5`	`32026`	`81.2`	`-0.8`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`43`		[SO4]D:1101	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`8168`	`67.9`	`-9.9`	`0.728`	`2`	`0`	`0`	`0.294`
30	`44`		J	`9`	`1`	`32026`	`x`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`10`	`1`	`32026`	`67.2`	`1.4`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`45`		E	`9`	`3`	`8617`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`4`	`8168`	`63.8`	`0.2`	`0.709`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`46`		[SO4]G:201	`4`	`1`	`186`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`8271`	`61.8`	`-8.4`	`0.764`	`3`	`0`	`0`	`0.105`
33	`47`		[SO4]G:201	`5`	`1`	`186`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8886`	`61.3`	`-9.3`	`0.741`	`5`	`0`	`0`	`0.446`
34	`48`		[RAX]G:202	`9`	`1`	`420`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8271`	`61.0`	`1.0`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`49`		D	`5`	`2`	`8168`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8886`	`59.2`	`-0.2`	`0.548`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
	`50`		H	`5`	`1`	`8271`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`8858`	`51.1`	`-0.5`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`55.2`	`-0.4`	`0.512`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
36	`51`		[RAX]H:202	`4`	`1`	`418`	`◊`	[RAX]G:202	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`420`	`58.3`	`2.2`	`0.343`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`52`		H	`8`	`2`	`8271`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`5`	`2`	`32002`	`57.8`	`-2.6`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
38	`53`		[SO4]D:1101	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8858`	`56.0`	`-8.4`	`0.725`	`5`	`0`	`0`	`0.137`
39	`54`		G	`4`	`2`	`8886`	`◊`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`8`	`2`	`32002`	`49.2`	`-1.0`	`0.509`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`55`		H	`4`	`2`	`8271`	`◊`	J	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`2`	`32026`	`44.9`	`0.1`	`0.598`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
41	`56`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8617`	`38.8`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.224`
42	`57`		G	`4`	`2`	`8886`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`8617`	`28.0`	`0.9`	`0.858`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		C	`1`	`1`	`8858`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8594`	`3.1`	`0.1`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.5`	`0.5`	`0.829`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`59`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`4`	`8168`	`27.1`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
44	`60`		[SO4]G:201	`3`	`1`	`186`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`32002`	`24.5`	`-3.8`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.147`
45	`61`		[SO4]D:1101	`4`	`1`	`186`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`32026`	`20.8`	`-3.1`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
46	`62`		J	`2`	`2`	`32026`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`8858`	`20.7`	`-0.4`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
47	`63`		[RAX]H:202	`4`	`1`	`418`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`8886`	`20.6`	`0.8`	`0.486`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`64`		I	`3`	`1`	`32002`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`1`	`8617`	`18.0`	`0.4`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`65`		I	`5`	`2`	`32002`	`◊`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`4`	`2`	`32026`	`14.2`	`-0.4`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`66`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`8858`	`13.6`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
51	`67`		I	`2`	`1`	`32002`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`2`	`1`	`6931`	`12.2`	`0.5`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`68`		[MG]E:1001	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`7684`	`12.0`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
53	`69`		J	`2`	`1`	`32026`	`x`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`32026`	`8.9`	`-0.2`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`70`		C	`2`	`2`	`8858`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`6931`	`8.1`	`0.4`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		G	`2`	`2`	`8886`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`7684`	`5.7`	`0.2`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`6.9`	`0.3`	`0.752`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`72`		[RAX]H:202	`1`	`1`	`418`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`32002`	`7.1`	`0.2`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`73`		[RAX]H:202	`1`	`1`	`418`	`◊`	J	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`32026`	`6.1`	`-0.1`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`74`		H	`3`	`3`	`8271`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`8168`	`4.4`	`0.2`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`75`		I	`2`	`1`	`32002`	`x`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`32002`	`3.4`	`-0.2`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`76`		[RAX]G:202	`1`	`1`	`420`	`f`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`32002`	`1.1`	`-0.1`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
60	`77`		[SO4]H:201	`1`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8886`	`0.6`	`-0.1`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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