PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=474-9H-4HN)

Interfaces in PDB 5dcc crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.45 Å

X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF A TEBIPENEM ADDUCT OF L,D TRANSPEPTIDASE 2 FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`88`	`29`	`16677`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+2	`2_547`	`89`	`31`	`16466`	`873.5`	`-15.1`	`0.027`	`4`	`0`	`0`	`0.142`
2	`2`		B	`53`	`15`	`16677`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`45`	`14`	`16466`	`470.7`	`2.8`	`0.875`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`42`	`12`	`16677`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`51`	`14`	`16466`	`447.8`	`1.7`	`0.820`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`459.2`	`2.3`	`0.847`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`54`	`15`	`16677`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`16466`	`436.5`	`-2.2`	`0.535`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
4	`5`		A	`41`	`16`	`16466`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`38`	`11`	`16466`	`372.8`	`0.8`	`0.572`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`40`	`14`	`16677`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`34`	`9`	`16677`	`348.5`	`1.1`	`0.628`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`360.7`	`1.0`	`0.600`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
5	`7`		[PGE]B:513	`10`	`1`	`333`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`33`	`14`	`16677`	`221.5`	`5.9`	`0.427`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		B	`28`	`9`	`16677`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`13`	`16466`	`219.1`	`-1.3`	`0.473`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		[58U]A:501	`13`	`1`	`344`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`13`	`16466`	`217.5`	`1.3`	`0.521`	`6`	`0`	`0`	`0.033`
	`10`		[58U]B:501	`13`	`1`	`344`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`40`	`14`	`16677`	`214.1`	`1.1`	`0.503`	`8`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`215.8`	`1.2`	`0.512`	`7`	`0`	`0`	`0.033`
8	`11`		[PGE]A:512	`9`	`1`	`331`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`16466`	`181.3`	`4.1`	`0.358`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		[PGE]B:514	`10`	`1`	`328`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`16677`	`171.0`	`4.2`	`0.289`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		[PGE]A:510	`9`	`1`	`329`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`16466`	`154.7`	`3.7`	`0.301`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		[PGE]B:512	`9`	`1`	`336`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`16677`	`140.2`	`1.9`	`0.150`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		[PGE]A:511	`9`	`1`	`318`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`16466`	`140.0`	`3.4`	`0.288`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[PGE]A:513	`9`	`1`	`331`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`16466`	`139.5`	`3.2`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[PEG]B:510	`7`	`1`	`260`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`16677`	`136.1`	`3.0`	`0.347`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[PEG]B:511	`7`	`1`	`258`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`16677`	`133.2`	`3.1`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		[SO4]A:504	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`11`	`16466`	`130.3`	`-19.6`	`0.652`	`3`	`0`	`0`	`0.176`
17	`20`		[PEG]A:509	`7`	`1`	`260`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`16466`	`116.5`	`2.5`	`0.306`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[GOL]B:515	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`16677`	`115.9`	`-0.5`	`0.553`	`5`	`0`	`0`	`0.023`
19	`22`		[GOL]A:515	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`16466`	`115.3`	`-1.3`	`0.462`	`3`	`0`	`0`	`0.022`
20	`23`		[EDO]A:516	`3`	`1`	`175`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`16466`	`109.3`	`3.0`	`0.287`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[PEG]B:509	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`16677`	`108.5`	`2.4`	`0.592`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[GOL]A:514	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`16466`	`108.2`	`0.9`	`0.756`	`5`	`0`	`0`	`0.011`
23	`26`		[EDO]B:517	`3`	`1`	`174`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`16677`	`105.0`	`3.4`	`0.300`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[GOL]B:516	`5`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`16677`	`101.3`	`-0.7`	`0.454`	`3`	`0`	`0`	`0.017`
25	`28`		[PGE]A:513	`8`	`1`	`331`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`16677`	`99.8`	`3.2`	`0.254`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`29`		[SO4]B:502	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`16677`	`95.1`	`-12.0`	`0.896`	`2`	`0`	`0`	`0.108`
27	`30`		[PEG]A:508	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`16466`	`94.8`	`2.0`	`0.538`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`31`		[PEG]B:508	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`16677`	`92.4`	`1.1`	`0.375`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`32`		[SO4]A:503	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`16466`	`90.3`	`-12.6`	`0.820`	`4`	`0`	`0`	`0.121`
30	`33`		[PEG]B:506	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`16677`	`89.3`	`0.8`	`0.374`	`3`	`0`	`0`	`0.004`
31	`34`		[SO4]B:504	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`16677`	`83.5`	`-11.0`	`0.811`	`3`	`0`	`0`	`0.104`
32	`35`		[SO4]A:506	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`16466`	`81.9`	`-9.9`	`0.872`	`1`	`0`	`0`	`0.088`
33	`36`		[PEG]A:507	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`16466`	`78.5`	`1.7`	`0.498`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`37`		[SO4]B:505	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`16677`	`77.8`	`-9.9`	`0.939`	`4`	`0`	`0`	`0.099`
35	`38`		[SO4]A:505	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`16466`	`77.7`	`-10.4`	`0.855`	`3`	`0`	`0`	`0.099`
36	`39`		[SO4]B:503	`5`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`16677`	`77.5`	`-7.2`	`0.942`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
37	`40`		[SO4]A:502	`5`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`16466`	`76.0`	`-8.0`	`0.935`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
38	`41`		[SO4]B:503	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`5`	`16466`	`72.3`	`-9.8`	`0.734`	`4`	`0`	`0`	`0.098`
39	`42`		B	`10`	`5`	`16677`	`f`	[SO4]A:502	x-1,y,z-1	`1_454`	`5`	`1`	`186`	`70.0`	`-9.7`	`0.702`	`3`	`0`	`0`	`0.093`
40	`43`		[GOL]B:516	`5`	`1`	`219`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+2	`2_547`	`9`	`3`	`16466`	`69.3`	`-0.9`	`0.404`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
41	`44`		[PEG]B:507	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`13`	`6`	`16466`	`59.7`	`1.4`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`45`		B	`14`	`5`	`16677`	`◊`	[SO4]A:506	x-1,y,z-1	`1_454`	`4`	`1`	`184`	`58.3`	`-8.0`	`0.653`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		[SO4]B:504	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`4`	`16466`	`54.0`	`-7.7`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`47`		B	`6`	`3`	`16677`	`f`	[PGE]A:512	-x,y-1/2,-z+2	`2_547`	`4`	`1`	`331`	`47.5`	`1.1`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		[PEG]B:507	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`16677`	`47.0`	`-0.6`	`0.221`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
46	`49`		[PEG]B:510	`4`	`1`	`260`	`f`	[SO4]B:502	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`43.7`	`-3.7`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
47	`50`		[PGE]A:510	`3`	`1`	`329`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`16677`	`36.9`	`-0.1`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
48	`51`		B	`4`	`1`	`16677`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+3	`2_548`	`5`	`1`	`16466`	`36.3`	`0.4`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`52`		[PGE]A:513	`5`	`1`	`331`	`f`	[PEG]B:506	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`33.9`	`1.6`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		B	`4`	`1`	`16677`	`f`	[PGE]A:511	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`318`	`31.4`	`0.8`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		[EDO]B:517	`3`	`1`	`174`	`f`	[58U]B:501	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`344`	`31.2`	`1.0`	`0.650`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		[PGE]A:511	`4`	`1`	`318`	`f`	[PEG]A:509	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`260`	`29.8`	`0.9`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		[GOL]B:515	`2`	`1`	`217`	`f`	[PGE]B:512	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`336`	`29.6`	`0.5`	`0.135`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		[PEG]A:509	`2`	`1`	`260`	`f`	[PEG]A:508	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`29.2`	`0.9`	`0.350`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		[EDO]A:516	`2`	`1`	`175`	`f`	[58U]A:501	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`344`	`27.3`	`0.7`	`0.679`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`59`		[SO4]B:504	`3`	`1`	`185`	`◊`	[SO4]B:503	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`24.3`	`-5.3`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`60`		[SO4]A:506	`3`	`1`	`184`	`◊`	[SO4]A:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`23.5`	`-5.5`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`61`		[PGE]B:514	`1`	`1`	`328`	`f`	[PEG]B:508	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`186`	`20.4`	`-0.2`	`0.209`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
59	`62`		A	`1`	`1`	`16466`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`16677`	`9.5`	`-0.3`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`63`		[GOL]A:514	`1`	`1`	`221`	`f`	[PEG]A:507	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`7.6`	`-0.1`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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