PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=727-IP-J5L)

Interfaces in PDB 5b2r crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.00 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE STREPTOCOCCUS PYOGENES CAS9 VQR VARIANT IN COMPLEX WITH SGRNA AND TARGET DNA (TGA PAM)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`612`	`60`	`16605`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`657`	`181`	`67633`	`5709.0`	`-119.6`	`0.337`	`104`	`0`	`0`	`0.133`
2	`2`		C	`176`	`27`	`6513`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`158`	`57`	`67633`	`1436.8`	`-12.2`	`0.694`	`15`	`0`	`0`	`0.025`
3	`3`		A	`116`	`22`	`16605`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`115`	`20`	`6513`	`1018.1`	`-8.1`	`0.899`	`44`	`0`	`0`	`0.142`
4	`4`		B	`88`	`31`	`67633`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`84`	`33`	`67633`	`714.5`	`-1.7`	`0.369`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
5	`5`		B	`59`	`19`	`67633`	`x`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`67`	`19`	`67633`	`589.1`	`0.0`	`0.645`	`13`	`4`	`0`	`0.000`
6	`6`		D	`54`	`5`	`2013`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`60`	`23`	`67633`	`559.0`	`-0.4`	`0.707`	`8`	`0`	`0`	`0.005`
7	`7`		B	`52`	`18`	`67633`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`58`	`20`	`67633`	`436.1`	`5.8`	`0.853`	`9`	`5`	`0`	`0.000`
8	`8`		D	`37`	`8`	`2013`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`36`	`8`	`6513`	`363.9`	`-2.9`	`0.652`	`17`	`0`	`0`	`0.974`
9	`9`		B	`32`	`9`	`67633`	`◊`	B	-x,y,-z+1	`2_556`	`33`	`9`	`67633`	`347.3`	`-1.4`	`0.470`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
10	`10`		A	`27`	`5`	`16605`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`16`	`4`	`67633`	`191.8`	`-2.9`	`0.723`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		B	`19`	`6`	`67633`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`19`	`6`	`67633`	`180.8`	`1.5`	`0.772`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		B	`21`	`7`	`67633`	`x`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`15`	`5`	`67633`	`152.3`	`-0.0`	`0.498`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
13	`13`		[K]B:1406	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`67633`	`127.7`	`-65.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
14	`14`		[K]A:103	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`16605`	`124.0`	`-69.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.356`
15	`15`		[K]B:1401	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`67633`	`119.6`	`-95.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
16	`16`		[K]A:102	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`67633`	`119.5`	`-70.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
17	`17`		[K]B:1402	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`67633`	`115.5`	`-82.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.111`
18	`18`		B	`9`	`4`	`67633`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`4`	`16605`	`112.9`	`2.3`	`0.905`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[K]B:1407	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`67633`	`110.0`	`-70.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
20	`20`		[K]B:1404	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`67633`	`107.7`	`-78.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
21	`21`		A	`15`	`1`	`16605`	`◊`	C	-x,y,-z	`2_555`	`13`	`1`	`6513`	`100.3`	`2.5`	`0.883`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		[K]B:1405	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`67633`	`99.9`	`-64.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
23	`23`		[EDO]B:1411	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`67633`	`99.7`	`4.7`	`0.812`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		[K]B:1403	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`67633`	`99.4`	`-75.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`25`		[K]A:108	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`67633`	`71.1`	`-41.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	*Average:*													`85.2`	`-58.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
25	`26`		[K]A:101	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`16605`	`97.3`	`-57.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.296`
26	`27`		[EDO]B:1409	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`67633`	`91.6`	`2.3`	`0.261`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[EDO]B:1410	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`67633`	`87.1`	`1.8`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[EDO]A:106	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`16605`	`81.7`	`1.2`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		[K]A:108	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16605`	`72.0`	`-41.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
30	`31`		[ACT]A:107	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`16605`	`71.6`	`-0.9`	`0.747`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
31	`32`		B	`7`	`3`	`67633`	`◊`	[K]B:1407	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`1`	`1`	`216`	`67.7`	`-36.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		[K]A:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`16605`	`67.7`	`-38.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
33	`34`		[EDO]A:106	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`67633`	`67.1`	`1.2`	`0.776`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		[K]A:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`67633`	`60.1`	`-30.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
35	`36`		[ACT]A:107	`3`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`67633`	`59.8`	`0.2`	`0.701`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		[K]A:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`2`	`67633`	`55.4`	`-32.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
37	`38`		[MG]A:104	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`16605`	`54.9`	`-8.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
38	`39`		[EDO]B:1409	`3`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`16605`	`50.7`	`1.9`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		[K]B:1406	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`16605`	`45.3`	`-24.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
40	`41`		[K]B:1403	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]A:108	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`44.4`	`-44.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
41	`42`		[MG]A:105	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`16605`	`43.0`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
42	`43`		[EDO]B:1411	`3`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`16605`	`41.5`	`-0.4`	`0.740`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
43	`44`		[MG]B:1408	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`67633`	`39.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
44	`45`		[K]B:1406	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`33.7`	`-33.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
45	`46`		[K]B:1402	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`6513`	`31.1`	`-15.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
46	`47`		[MG]B:1408	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`16605`	`28.6`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
47	`48`		[MG]A:105	`1`	`1`	`98`	`f`	[K]A:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`27.0`	`-14.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
48	`49`		[K]B:1401	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6513`	`27.0`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
49	`50`		[K]B:1403	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`16605`	`26.5`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
50	`51`		A	`4`	`1`	`16605`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`5`	`1`	`2013`	`23.1`	`0.0`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`52`		[MG]A:104	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`67633`	`17.4`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`53`		[ACT]A:107	`4`	`1`	`183`	`f`	[K]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`17.3`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
53	`54`		[MG]A:105	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`67633`	`13.4`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
54	`55`		[K]B:1402	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`16605`	`12.5`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
55	`56`		[EDO]B:1410	`2`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2013`	`10.4`	`-0.3`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
56	`57`		A	`2`	`1`	`16605`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`3`	`2`	`67633`	`6.5`	`-0.3`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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