PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=158-H8-I2A)

Interfaces in PDB 5a0q

CRYO-EM REVEALS THE CONFORMATION OF A SUBSTRATE ANALOGUE IN THE HUMAN 20S PROTEASOME CORE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`146`	`36`	`10216`	`◊`	B	`130`	`33`	`11142`	`1314.2`	`-14.5`	`0.139`	`13`	`5`	`0`	`0.000`
	`2`		O	`143`	`36`	`10214`	`◊`	P	`131`	`33`	`11151`	`1312.5`	`-14.5`	`0.137`	`13`	`5`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1313.4`	`-14.5`	`0.138`	`13`	`5`	`0`	`0.000`
2	`3`		Q	`143`	`36`	`13013`	`◊`	R	`126`	`31`	`11239`	`1289.4`	`-5.4`	`0.464`	`15`	`3`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`146`	`36`	`13016`	`◊`	D	`127`	`31`	`11229`	`1288.2`	`-5.4`	`0.463`	`15`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1288.8`	`-5.4`	`0.463`	`15`	`3`	`0`	`0.000`
3	`5`		B	`142`	`38`	`11142`	`◊`	C	`142`	`32`	`13016`	`1281.1`	`-11.0`	`0.299`	`16`	`3`	`0`	`0.000`
	`6`		P	`142`	`38`	`11151`	`◊`	Q	`142`	`32`	`13013`	`1279.4`	`-10.9`	`0.298`	`16`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1280.2`	`-10.9`	`0.299`	`16`	`3`	`0`	`0.000`
4	`7`		D	`137`	`34`	`11229`	`◊`	E	`106`	`24`	`11373`	`1077.6`	`-12.5`	`0.160`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		R	`137`	`34`	`11239`	`◊`	S	`105`	`24`	`11378`	`1075.9`	`-12.5`	`0.158`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1076.7`	`-12.5`	`0.159`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
5	`9`		T	`94`	`25`	`10402`	`◊`	U	`98`	`26`	`10342`	`869.0`	`-6.1`	`0.405`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		F	`93`	`25`	`10415`	`◊`	G	`95`	`26`	`10344`	`867.1`	`-6.8`	`0.361`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`868.1`	`-6.5`	`0.383`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
6	`11`		A	`101`	`24`	`10216`	`◊`	G	`91`	`27`	`10344`	`843.7`	`-8.3`	`0.294`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		O	`100`	`24`	`10214`	`◊`	U	`89`	`27`	`10342`	`843.0`	`-8.3`	`0.291`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`843.4`	`-8.3`	`0.292`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
7	`13`		S	`78`	`21`	`11378`	`◊`	T	`81`	`22`	`10402`	`786.0`	`-3.5`	`0.503`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		E	`79`	`21`	`11373`	`◊`	F	`83`	`22`	`10415`	`785.9`	`-3.5`	`0.508`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`786.0`	`-3.5`	`0.505`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		a	`78`	`23`	`9490`	`◊`	b	`81`	`23`	`9805`	`768.9`	`-3.9`	`0.478`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	`16`		M	`78`	`23`	`9476`	`◊`	N	`80`	`23`	`9800`	`767.8`	`-3.9`	`0.480`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`768.4`	`-3.9`	`0.479`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
9	`17`		K	`75`	`18`	`10330`	`◊`	Y	`75`	`18`	`10327`	`727.7`	`-6.5`	`0.286`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		W	`63`	`17`	`10096`	`◊`	M	`74`	`20`	`9476`	`686.9`	`-6.6`	`0.312`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		I	`65`	`17`	`10109`	`◊`	a	`73`	`20`	`9490`	`686.6`	`-6.7`	`0.320`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`686.8`	`-6.6`	`0.316`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		J	`69`	`22`	`9152`	`◊`	K	`70`	`21`	`10330`	`665.6`	`-5.6`	`0.409`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`21`		X	`70`	`22`	`9152`	`◊`	Y	`71`	`21`	`10327`	`664.6`	`-5.5`	`0.417`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`665.1`	`-5.5`	`0.413`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
12	`22`		Y	`68`	`14`	`10327`	`◊`	L	`69`	`13`	`9109`	`650.1`	`-0.7`	`0.638`	`7`	`7`	`0`	`0.000`
	`23`		K	`68`	`14`	`10330`	`◊`	Z	`67`	`13`	`9107`	`648.9`	`-0.7`	`0.640`	`7`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`649.5`	`-0.7`	`0.639`	`7`	`7`	`0`	`0.000`
13	`24`		V	`64`	`20`	`9053`	`◊`	b	`65`	`17`	`9805`	`645.9`	`-8.0`	`0.244`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	`25`		H	`64`	`20`	`9060`	`◊`	N	`65`	`17`	`9800`	`644.2`	`-8.0`	`0.242`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`645.1`	`-8.0`	`0.243`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
14	`26`		I	`71`	`22`	`10109`	`◊`	J	`76`	`21`	`9152`	`635.9`	`-9.0`	`0.259`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	`27`		W	`70`	`22`	`10096`	`◊`	X	`77`	`22`	`9152`	`635.2`	`-9.0`	`0.258`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`635.6`	`-9.0`	`0.258`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
15	`28`		E	`73`	`18`	`11373`	`◊`	L	`54`	`11`	`9109`	`593.4`	`-2.9`	`0.468`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	`29`		S	`74`	`18`	`11378`	`◊`	Z	`54`	`11`	`9107`	`591.9`	`-2.9`	`0.480`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`592.6`	`-2.9`	`0.474`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
16	`30`		V	`62`	`18`	`9053`	`◊`	W	`60`	`16`	`10096`	`550.3`	`-4.7`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		H	`62`	`18`	`9060`	`◊`	I	`60`	`16`	`10109`	`549.6`	`-4.7`	`0.524`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`550.0`	`-4.7`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`32`		K	`56`	`19`	`10330`	`◊`	L	`66`	`20`	`9109`	`536.5`	`-5.5`	`0.276`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`33`		Y	`57`	`19`	`10327`	`◊`	Z	`66`	`20`	`9107`	`535.4`	`-5.5`	`0.279`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`536.0`	`-5.5`	`0.277`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
18	`34`		X	`45`	`14`	`9152`	`◊`	L	`54`	`13`	`9109`	`525.5`	`-3.3`	`0.400`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		J	`46`	`14`	`9152`	`◊`	Z	`54`	`13`	`9107`	`524.7`	`-3.2`	`0.409`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`525.1`	`-3.3`	`0.404`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
19	`36`		Z	`55`	`16`	`9107`	`◊`	a	`58`	`20`	`9490`	`519.8`	`-3.7`	`0.358`	`8`	`2`	`0`	`0.000`
	`37`		L	`55`	`16`	`9109`	`◊`	M	`56`	`20`	`9476`	`519.8`	`-3.7`	`0.359`	`8`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`519.8`	`-3.7`	`0.358`	`8`	`2`	`0`	`0.000`
20	`38`		J	`51`	`13`	`9152`	`◊`	a	`57`	`16`	`9490`	`504.0`	`-2.2`	`0.524`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`39`		X	`51`	`13`	`9152`	`◊`	M	`57`	`16`	`9476`	`503.4`	`-2.2`	`0.523`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`503.7`	`-2.2`	`0.523`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
21	`40`		H	`53`	`14`	`9060`	`◊`	V	`55`	`14`	`9053`	`482.2`	`-7.0`	`0.238`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
22	`41`		Q	`49`	`14`	`13013`	`◊`	Y	`62`	`16`	`10327`	`464.0`	`-3.6`	`0.431`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		C	`49`	`14`	`13016`	`◊`	K	`62`	`16`	`10330`	`463.7`	`-3.6`	`0.432`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`463.8`	`-3.6`	`0.431`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
23	`43`		S	`46`	`14`	`11378`	`◊`	a	`51`	`16`	`9490`	`458.5`	`-0.5`	`0.649`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
	`44`		E	`47`	`14`	`11373`	`◊`	M	`51`	`16`	`9476`	`457.4`	`-0.5`	`0.649`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`458.0`	`-0.5`	`0.649`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
24	`45`		I	`54`	`13`	`10109`	`◊`	b	`47`	`11`	`9805`	`449.5`	`-2.9`	`0.595`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`46`		W	`54`	`13`	`10096`	`◊`	N	`47`	`11`	`9800`	`449.3`	`-2.9`	`0.596`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`449.4`	`-2.9`	`0.596`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
25	`47`		Q	`48`	`12`	`13013`	`◊`	X	`42`	`8`	`9152`	`428.8`	`-4.9`	`0.296`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		C	`48`	`12`	`13016`	`◊`	J	`41`	`8`	`9152`	`428.1`	`-4.9`	`0.287`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`428.5`	`-4.9`	`0.292`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`49`		O	`52`	`13`	`10214`	`◊`	W	`44`	`10`	`10096`	`425.7`	`-1.0`	`0.454`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		A	`52`	`13`	`10216`	`◊`	I	`42`	`10`	`10109`	`425.6`	`-1.1`	`0.453`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`425.7`	`-1.0`	`0.453`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`51`		P	`39`	`11`	`11151`	`◊`	X	`44`	`12`	`9152`	`418.4`	`-3.3`	`0.428`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	`52`		B	`39`	`11`	`11142`	`◊`	J	`45`	`12`	`9152`	`418.0`	`-3.3`	`0.434`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`418.2`	`-3.3`	`0.431`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
28	`53`		G	`49`	`13`	`10344`	`◊`	H	`43`	`13`	`9060`	`402.4`	`-3.2`	`0.425`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		U	`50`	`13`	`10342`	`◊`	V	`44`	`13`	`9053`	`402.2`	`-3.2`	`0.436`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`402.3`	`-3.2`	`0.431`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
29	`55`		D	`50`	`11`	`11229`	`◊`	K	`38`	`9`	`10330`	`397.1`	`-5.6`	`0.167`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		R	`50`	`11`	`11239`	`◊`	Y	`40`	`9`	`10327`	`396.5`	`-5.6`	`0.177`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`396.8`	`-5.6`	`0.172`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`57`		V	`49`	`18`	`9053`	`c`	[KNM]V:300	`30`	`1`	`691`	`382.5`	`1.3`	`0.441`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		H	`48`	`18`	`9060`	`c`	[KNM]H:300	`30`	`1`	`690`	`381.0`	`1.3`	`0.436`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`381.7`	`1.3`	`0.438`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`59`		A	`48`	`11`	`10216`	`◊`	H	`45`	`10`	`9060`	`378.3`	`-5.2`	`0.251`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		O	`48`	`11`	`10214`	`◊`	V	`46`	`10`	`9053`	`376.7`	`-5.1`	`0.265`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`377.5`	`-5.2`	`0.258`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
32	`61`		T	`42`	`12`	`10402`	`◊`	a	`40`	`10`	`9490`	`365.2`	`-5.2`	`0.218`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		F	`42`	`12`	`10415`	`◊`	M	`40`	`10`	`9476`	`363.7`	`-5.2`	`0.221`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`364.5`	`-5.2`	`0.219`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
33	`63`		I	`46`	`20`	`10109`	`c`	[KNM]I:300	`28`	`1`	`662`	`365.0`	`0.2`	`0.493`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		W	`45`	`19`	`10096`	`c`	[KNM]W:300	`28`	`1`	`662`	`364.6`	`0.2`	`0.478`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`364.8`	`0.2`	`0.486`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
34	`65`		B	`43`	`11`	`11142`	`◊`	I	`36`	`9`	`10109`	`351.2`	`-3.5`	`0.418`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		P	`42`	`11`	`11151`	`◊`	W	`37`	`9`	`10096`	`351.1`	`-3.5`	`0.425`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`351.1`	`-3.5`	`0.421`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`67`		V	`34`	`9`	`9053`	`◊`	N	`39`	`8`	`9800`	`336.3`	`-0.6`	`0.677`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	`68`		H	`34`	`9`	`9060`	`◊`	b	`39`	`8`	`9805`	`335.7`	`-0.5`	`0.677`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`336.0`	`-0.6`	`0.677`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
36	`69`		Z	`38`	`17`	`9107`	`c`	[KNM]Z:300	`27`	`1`	`648`	`332.1`	`-1.4`	`0.254`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		L	`37`	`16`	`9109`	`c`	[KNM]L:300	`27`	`1`	`649`	`330.9`	`-1.3`	`0.255`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`331.5`	`-1.3`	`0.255`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`71`		R	`35`	`9`	`11239`	`◊`	Z	`33`	`12`	`9107`	`319.2`	`-0.4`	`0.576`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`72`		D	`35`	`9`	`11229`	`◊`	L	`33`	`12`	`9109`	`317.2`	`-0.4`	`0.577`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`318.2`	`-0.4`	`0.576`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
38	`73`		T	`33`	`7`	`10402`	`◊`	b	`40`	`9`	`9805`	`314.4`	`-2.0`	`0.488`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`74`		F	`33`	`7`	`10415`	`◊`	N	`41`	`9`	`9800`	`314.0`	`-1.9`	`0.510`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`314.2`	`-1.9`	`0.499`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
39	`75`		U	`38`	`11`	`10342`	`◊`	b	`21`	`7`	`9805`	`274.8`	`-3.3`	`0.310`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		G	`37`	`11`	`10344`	`◊`	N	`21`	`7`	`9800`	`274.1`	`-3.3`	`0.307`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`274.4`	`-3.3`	`0.309`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`77`		Q	`16`	`3`	`13013`	`◊`	T	`19`	`5`	`10402`	`159.3`	`-0.2`	`0.548`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`78`		C	`16`	`3`	`13016`	`◊`	F	`18`	`5`	`10415`	`159.3`	`-0.2`	`0.541`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`159.3`	`-0.2`	`0.544`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
41	`79`		Q	`12`	`3`	`13013`	`◊`	U	`12`	`6`	`10342`	`122.0`	`0.2`	`0.563`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		C	`12`	`3`	`13016`	`◊`	G	`12`	`6`	`10344`	`121.7`	`0.2`	`0.564`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`121.8`	`0.2`	`0.563`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
42	`81`		I	`12`	`3`	`10109`	`◊`	[KNM]H:300	`5`	`1`	`690`	`88.2`	`3.2`	`0.836`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		W	`12`	`3`	`10096`	`◊`	[KNM]V:300	`5`	`1`	`691`	`87.9`	`3.2`	`0.836`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`88.1`	`3.2`	`0.836`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`83`		O	`9`	`5`	`10214`	`◊`	Q	`11`	`2`	`13013`	`82.1`	`-1.6`	`0.297`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		A	`9`	`5`	`10216`	`◊`	C	`11`	`2`	`13016`	`81.6`	`-1.6`	`0.299`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`81.9`	`-1.6`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`85`		a	`11`	`5`	`9490`	`◊`	[KNM]Z:300	`6`	`1`	`648`	`68.6`	`1.6`	`0.640`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		M	`11`	`5`	`9476`	`◊`	[KNM]L:300	`6`	`1`	`649`	`68.3`	`1.6`	`0.638`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`68.5`	`1.6`	`0.639`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`87`		X	`4`	`1`	`9152`	`◊`	[KNM]W:300	`6`	`1`	`662`	`50.4`	`1.8`	`0.747`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`88`		J	`4`	`1`	`9152`	`◊`	[KNM]I:300	`6`	`1`	`662`	`50.2`	`1.8`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`50.3`	`1.8`	`0.749`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`89`		B	`3`	`1`	`11142`	`◊`	G	`4`	`2`	`10344`	`27.6`	`0.3`	`0.740`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		P	`3`	`1`	`11151`	`◊`	U	`4`	`2`	`10342`	`27.6`	`0.3`	`0.741`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.6`	`0.3`	`0.740`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`91`		Q	`1`	`1`	`13013`	`◊`	S	`4`	`1`	`11378`	`19.8`	`0.3`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		C	`1`	`1`	`13016`	`◊`	E	`4`	`1`	`11373`	`19.5`	`0.3`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.6`	`0.3`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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